BOLETÍN MENSUAL DICIEMBRE 2010
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR
FACULTAD DE CIENCIAS - UAEM
Este boletín inicia entre nosotros, profesores
y estudiantes, con la intención de compartir
lo que hacemos día a día y de nutrirnos de
información relevante para el desarrollo de
nuestro trabajo. En los últimos años nuestra
área ha gozado de un importante incre-
mento en el número de alumnos que
ingresan, este aumento debe ir acompa-
ñado de una creciente unión entre todos
nosotros para fortalecer nuestras activi-
dades como Profesores-Investigadores pero
también como estudiantes, estudiantes que
vean que lo verdaderamente importante no
es pasar materias sino acumular herramien-
tas que les permitan como profesionales
descubir, entender y manipular procesos
biológicos.
Si tienes alguna información que consi-
deres incide para fortalecernos como depar-
tamento envíalo a duncker@uaem.mx para
publicarlo en este boletín, que es de profe-
sores y alumnos.
ARTICULOS CIENTÍFICOS DE INTERÉS
TOP 7 EN INMUNOLOGÍA haz click
Stress in Biomedical Research:
Six Impossible Things
Douglas R. Green
Molecular Cell 40, October 22, 2010
Link a un interesante y divertido artículo
que habla sobre el estrés que causa ser
un investigador biomédico (enviado por
Dra. Nina Pastor).
KL Olszewski et al. Branched tricarboxylic
acid metabolism in Plasmodium falci-
parum. Nature 466, 774-778 (5 August
2010).
En la mayor parte de los seres vivos,
varios de los procesos químicos princi-
pales involucrados en convertir los nutri-
entes en energía estan unidos a través
del ciclo tricarboxílico. Recientemente se
ha descubierto que el parásito Plasmo-
dium falciparum que causa la malaria usa
una vía metabólica ramificada en vez de
un ciclo, esta vía no ha sido detectada
previamente en otros organismos.
EVENTOS CIENTÍFICOS 2011
Keystone Symposia
Gordon Conferences
l
Eventos del Laboratorio Europeo de
Biología Molecular
Curso- Taller, "Detección de Organismos
Genéticamente Modificados (OGM)".
UAM-Iztapalapa. 10-17 Enero
BIOINFORMATICS 2011 - International
Conference on Bioinformatics Models,
Methods and Algorithms
Roma, Italia. 26-29 Enero
RNAi2011 Oxford, UK. 29-31 Marzo
The 21st Annual Meeting of the Society
for Virology. Freiburg, Alemania
23-26 Marzo
18th Plant Biology Symposium. Univer-
sity Park, USA. 18-21 Mayo
16th edition of the European Carbohy-
drate Symposium (EUROCARB)
Sorrento, Italia. 3-7 Julio
15th International Congress of Mucosal
Immunology. París, Francia. 5-9 Julio
Plant Biology 2011
Minneapolis, USA. 6-11 Agosto
pXVth International Congress of Virology.
Sapporo, Japón. 11-16 Septiembre
12th International Congress of Human
Genetics. Montreal, Canadá. 11-15 Oct
7th International Conference on Proteo-
glycans. Sidney, Australia. 16-21 Octubre
13th IUBMB Conference and 3rd National
Meeting of the Signal Transduction
Branch of the Sociedad Mexicana de Bio-
química. Cell Signaling Networks Confe-
rence Mérida, Yucatan. 22-27 Octubre
 LA VIDA EN LOS LABS
LABORATORIO DE VIROLOGÍA
Dr. Ramón González García Conde
Página web
Lic. en C. Elizabeth Castillo. Doctorado en
Ciencias. FC- UAEM. Análisis del mecanismo
de exportación selectiva de los mRNA virales
tardíos, en células no transformadas, infecta-
das con adenovirus.
Lic. en C. Margarita Valdés. Maestría en
Ciencias Bioq. IBT-UNAM. Reorganización
de estructuras celulares como consecuencia
de la infección por Ad5 en células humanas no
transformadas.
Azul Guzmán. Tesis de Licenciatura. Fac.
de Ciencias Biológicas, UAEM. Papel de la
fosforilación de la E1B 55 kDa en el ciclo de
replicación de adenovirus.
Melissa Navarro. Tesis de Licenciatura.
Facultad de Ciencias, UAEM. Señalización
de IRF3 en la activación de PML en células
infectadas con adenovirus.
Paloma Hidalgo. Tesis de Licenciatura.
Facultad de Ciencias, UAEM. Análisis de
ácidos nucleicos en los centros de replicación
de adenovirus.
Dipl. biol. Melanie Schmid. Doctorado.
Estancia de Investigación. Department of
Molecular Virology. Heinrich-Pette-
Institut Alemania. Vía de exportación selec-
tiva de los mRNA virales por las E1B 55 kDa y
E4 Orf6 de adenovirus.
Beatriz Roncero. Licenciatura. Estancia de
Investigación. Universidad Pablo de Ola-
vide, España. Análisis de proteínas en los
centros de replicación de adenovirus.
Vacantes para estudiantes de Maestría o
Doctorado.
-Diseño y construcción de recombinantes
de adenovirus con alteraciones dirigidas
en los oncogenes E1B y E4.
-Regulación postranscripcional por los
oncogenes E1B y E4 de adenovirus.
d Vacantes para Tesis de Licenciatura
LABORATORIO DE HEMOGLOBINAS
Dr. Raúl Arredondo Peter
Página web
Mariel Ruiz Kubli. Tesis de Licenciatura
Facultad de Ciencias, UAEM. Análisis de la
estructura y expresión de los genes de hemo-
globina 3 y 4 del arroz (Oryza sativa) var. Mo-
relos.
Fernando Martínez. Tesis de Licenciatura
Facultad de Ciencias, UAEM. Análisis de los
genes de hemoglobina en el genoma del
musgo Physcomitrella patens.
Saraí Castro Bustos. Tesis de Licenciatura.
Facultad de Ciencias Biológicas, UAEM.
Detección de iso-hemoglobinas en los órga-
nos del arroz (Oryza sativa) mediante enfoque
isoeléctrico y Western blot.
Gustavo Rodríguez Alonso. Tesis de
Licenciatura. Facultad de Ciencias-UAEM.
Determinación de la variabilidad de los genes
de hemoglobina 1 a 5 en el arroz (Oryza
sativa) var. Morelos.
LABORATORIO DE GLICOBIOLOGÍA
Dr. Iván Martínez Duncker
Página web
M.B. Roberta Salinas Marín
Doctorado en Ciencias - UAEM
Efecto del Knock down del gen que codifica
para el transportador de CMP-Ácido siálico
sobre el perfil de sialilación celular en la línea
celular de hepatocarcinoma humano Hep G2
Lic. en C. Enrique Villanueva Cabello
Doctorado en Ciencias - UAEM
Efecto de la hiperamonemia sobre la siali-
lación celular en Linfocitos T CD4+ murinos.
L. en C. Tania Villanueva Cabello
Maestría en Ciencias Bioq. IBT-UNAM
Estudio Integral de la maquinaria de siali-
lación celular durante la activación y polar-
ización de linfocitos humanos T CD4+ naive.
Kathya Gutiérrez Huante
Maestría en Ciencias - UAEM
Caracterización funcional de la proteína
humana SLC35B4 en el transporte de GDP-
Fucosa en el Retículo endoplásmico.
Alejandro Olea. Tesis de Licenciatura
Efecto de la hiperamonemia sobre la siali-
lación celular en neutrófilos humanos
Regulación de la enzima GNE durante la acti-
vación de linfocitos T CD4+ naive humanos
 LA VIDA EN LOS LABS
LABORATORIO DE INMUNOLOGÍA
Dra. Angélica Santana Calderón
Lic. en M. Ariel Galindo Albarrán. Doc-
torado en Ciencias. FC- UAEM. Regulacíon
epigenética durante la activación de linfocitos
T CD8 neonatales
Lic. en C. Otoniel Rodríguez Jorge. Mae-
stría en Ciencias. FC-UAEM. Caracter-
ización de la expresión de Receptores tipo Toll
(TLRs) en membrana plasmática de linfocitos
T de neonato y adulto. Un enfoque en la regu-
lación de su expresión por las señales de CD43
y el efecto que esto tiene sobre la función de
los linfocitos T.
Zeferino Galarza Brito. Maestría. Inmuno-
biología de linfocitos T neonatales. Caracte-
rización de la proliferación, proporcion de ERT
y repertorio inmunológico de linfocitos T neo-
natales en comparación con linfocitos T de
adultos.
Rosario Labastida Conde. Tesis de Licen-
ciatura. Facultad de Ciencias, UAEM.
Localización en la membrana celular de los
receptores TLR5, IL-4Ra, el TCR e IFNgRa en
función de las señales del (co-receptor) CD43
en linfocitos T de neonatos y adultos huma-
nos.
Vacantes. Consultar Boletín Enero 2011
LABORATORIO DE FISIOLOGÍA Y
DESARROLLO VEGETAL
Dra. Verónica Lira Ruan (Katerina)
Kenya León Carbajal. Licenciatura. Facul-
tad de Ciencias Biológicas, UAEM. Empleo
del musgo Physcomitrella patens para la
expresión heteróloga de proteínas; el caso de
la peroxidasa versátil de Bjerkandera adusta.
Tenemos sitio para 1-2 estudiantes de licen-
ciatura para que desarrollen investigación
en un proyecto sobre la generación y efecto
del óxido nítrico en el desarrollo del musgo
Physcomitrella patens.
El interés del laboratorio es estudiar la gen-
eración enzimática del gas óxido nítrico
(NO) en plantas. El NO es un gas que fun-
ciona como regulador del crecimiento y el
desarrollo en plantas y animales.
Sin embargo, el origen enzimático del NO en
las plantas es un tema de debate, ya que no
ha sido posible establecer sin lugar a dudas
cuantos y cuales enzimas participan en la
generación de NO en las plantas superiores.
Además, la manera en que el NO actúa
durante el crecimiento y el desarrollo de las
plantas es una materia de gran desarrollo en
la actualidad. En mi laboratorio abordamos
estos temas con un enfoque nuevo, investiga-
mos los orígenes y función del NO en musgos
que son los representantes actuales de las
primeras plantas terrestres. Esto agrega un
elemento evolutivo al desarrollo de esta línea
de investigación que la hace aún más intere-
sante.
LABORATORIO
Dra. Nina Pastor Colón
Hay dos líneas de investigación:
a) reconocimiento específico entre pro-
teínas y DNA: en colaboración con Javier
Aguilar y Verónica Narváez, se busca un(a)
estudiante de licenciatura interesado(a) en
ingeniería de proteínas. Se trata de hacer
mutaciones puntuales en la proteína de
unión a la caja TATA (TBP), para lograr un
cambio de especificidad, y que reconozca
cajas TATA diferentes en una o dos posicio-
nes. Estas mutaciones fueron predichas en
la tesis doctoral de César Millán, y ahora se
trata de hacerlas en el laboratorio.
En colaboración con Carlos Amero, inicia-
mos un proyecto sobre la dinámica de dos
recombinasas (la de Cre y la del fago
lambda), las cuales son homólogas estruc-
turales pero aparentemente tienen dinámi-
cas diferentes. Para este proyecto se solici-
tan estudiantes de licenciatura o posgrado
interesados en aprender a hacer dinámicas
moleculares y a analizar las propiedades
estructurales y dinámicas de proteínas.
b) plegamiento y estabilidad de proteí-
nas: en colaboración con Alejandro Fernán-
dez de la Fac. de Medicina-UNAM, estudia-
mos la estabilidad y ruta de plegamiento del
dominio variable de cadena ligera de inmu-
noglobulinas humanas. Estos dominios se
expresan en exceso en pacientes con
 LA VIDA EN LOS LABS
amiloidosis de cadena ligera, formando
fibras amiloides que se depositan en
corazón, riñón e hígado, matando al paci-
ente al año del diagnóstico. No se sabe por
qué este dominio cambia de conformación,
y el proyecto busca caracterizar la estruc-
tura y dinámica de las semillas de estas
fibras. En el laboratorio hacemos simulacio-
nes de la ruta de desplegamiento, y en la Fac.
de Medicina se hacen los experimentos de
biología molecular y bioquímica correspon-
dientes. Se buscan estudiantes de licencia-
tura o posgrado, que les gusten las proteí-
nas y las computadoras. Es indispensable
que sepan linux (o alguno de sus seme-
jantes ... no Windows), y que les apasionen
las estructuras y los mecanismos molecula-
res.
LABORATORIO DE BIOLOGÍA DEL
DESARROLLO
Dr. Javier Aguilar Fuentes
Ulises Moreno Celis. Facultad de Nu-
trición, UV. Búsqueda de grupos de neuronas
que inervan el corazón en líneas trangénicas
de Drosophila.
Eutimio Fernando Aponte Sánchez. Fac-
ultad de Ciencias, UAEM. Bases genéticas
de la función neuronal que controla el ritmo y
la frecuencia cardíaca.
Sandra Rivera Gutiérrez. Facultad de
Arquitectura, UAEM. La Arquitectura Neuro-
nal que regula el ritmo y la frecuencia car-
diaca de Drosophila.
Erick Fernando Sánchez Castillo. Facultad
de Ciencias Biológicas, UAEM. Bases gené-
ticas y moleculares de la regeneración.
Rogelio Pérez Reyes. Facultad de Ciencias
Biológicas, UAEM. Búsqueda de fármacos
antiarritmicos utilizando a la optogenética.
Marco Antonio Rosales Vega. Facultad de
Ciencias, UAEM. Control optogénico de la
función neuronal que regula el ritmo y
frecuencia cardiaca.
Lic en C Genómicas Sofía González Sali-
nas. Estudiante de Doctorado. Instituto
de Neurociencias, UNAM. Drosophila siente
el miedo de igual manera que el humano.
Biól. Raúl García Sánchez. Técnico aca-
démico, UAEM. Generación de líneas mu-
tantes de Drosophila mediante la movili-
zación de tranposones.
Se solicitan estudiantes para desarrollar
tesis de licenciatura y posgrado en los
temas antes mencionados y en los que se
enlistan a continuación:
“Secuenciación de sitios que aumentan
los niveles de transcripción de genes
neuronales (“enhancers”) en el genoma
de Drosophila”.
“Neuropéptidos que despiertan una
atracción sexual casi fatal.
Una de la principales causas de muerte
en los países desarrollados y en México
son las enfermedades del corazón
(cardiopatías). El mal pronóstico de las
cardiopatías y la falta de opciones tera-
péuticas o un mal tratamiento para esta-
bilizar la salud del individuo llevan a una
muerte anticipada. Existen evidencias
que sugieren que las cardiopatías son
causadas por defectos genéticos. Sin em-
bargo, las dificultades inherentes a hacer
experimentos genéticos en modelos de
mamíferos restringen fuertemente la po-
sibilidad de identificar a estos genes.
Además, las arritmias adquiridas y he-
reditarias de los mamíferos conducen a
una muerte súbita haciendo el estudio de
las interacciones genéticas o enferme-
dades poligénicas muy difícil. Reciente-
mente se han empezado a incluir en estos
estudios a C. elegans y Drosophila (la
mosca de fruta). El corazón de la mosca
ha sido un excelente modelo para el estu-
dio del desarrollo del sistema cardiovas-
cular. En este modelo se descubrió el gen
maestro tinman que determina el desar-
rollo del corazón. Interesantemente, tam-
bién el gen homólogo a tinman en el
humano es el factor determinante del de-
sarrollo del corazón.
 LA VIDA EN LOS LABS
Además, Drosophila posee la mayoría, si no es que todos, los neurotrans-
misores y moléculas involucradas en la liberación y reciclaje de vesículas sináp-
ticas, los receptores y canales involucrados en la neurotransmisión y en los me-
canismos de transducción de señales relacionados con la función neuronal y
cardíaca en vertebrados. Lo anterior prueba que la arquitectura molecular del
sistema nervioso y cardíaco de vertebrados e invertebrados se comparte am-
pliamente. Aún cuando se sabe que hay muchas proteínas y metabolitos
homólogos entre un modelo animal como la mosca de la fruta y el humano se
desconoce mucho de las bases genéticas de las funciones celulares. Por tal
razón nuestro grupo de trabajo tiene como objetivo fundamental descubrir las
bases genéticas y moleculares de la función neuronal que controla el ritmo y
frecuencia cardiaca.

Por otra parte, la susceptibilidad a determinados fármacos depende de facto-

res genéticos y ambientales, así como a las complejas interacciones entre éstos.
El componente genético es posiblemente multigénico y heterogéneo, ha-
ciendo que la identificación de “genes específicos de respuesta ante fármacos“
sea una tarea difícil. Esta complejidad aunada al alto costo de los estudios en
humanos ha llevado a la implementación de modelos animales para evaluar el
efecto de fármacos. Los estudios con modelos mamíferos han permitido la
identificación de blancos moleculares, sistemas neuroquímicos y regiones
cerebrales que regulan algunas de las propiedades de los fármacos. En la ac-
tualidad se han empezado a incluir en estos estudios a animales invertebrados
como Drosophila. La mosca de la fruta provee información sobre los mecanis-
mos básicos del efecto de los fármacos debido a una fácil manipulación gené-
tica, anatomía simple y a su similitud molecular con los mamíferos. Además, el
análisis farmacológico de un gran número de animales genéticamente idénti-
cos reduce la variabilidad y permite encontrar observaciones que alcanzan la
significancia estadística. Por tales motivos otro objetivo de nuestro laboratorio
es buscar masivamente compuestos derivatizados de fármacos antiarrítmicos
ya existentes y fármacos no caracterizados con un efecto antiarrítmico en la
mosca de la fruta.

¡Suerte a todos en sus examenes departamentales!

!Ricas Vacaciones y Feliz Año!

Nos vemos en Enero 2011