Biologia Computacional

1- Quais características diferenciam os organismos vivos dos organismos

inanimados?

R: A matéria inanimada não usa a energia de forma sistemática para manter a sua
estrutura ou para realizar qualquer tipo de trabalho .A matéria inanimada tende a se
degenerar em um estado mais desordenado (entropia), alcançando um equilíbrio com seu
meio ambiente. Os organismos vivos extraem, transformam e usam a energia que
encontram no meio ambiente, os quais são capazes de se autorreplicar e automontar,
propriedade conhecida como quinta-essência do estado vivo. Além disso, os organismos
vivos apresentam altíssimo grau de complexidade química e organização, possuindo
estruturas celulares internas intrincadas e uma infinidade de moléculas complexas.

2- O que é biologia computacional?

R: Biologia Computacional é a área de estudo que se ocupa de ministrar técnicas
computacionais com o intuito de solucionar problemáticas ligadas á biologia. Esse ramo
da ciência vem tomando expansão e cresce no intuito de auxiliar na computação de
dados biológicos (bioquímicos, genéticos).

3- Cite duas áreas da biologia que estão crescendo com o uso de computadores.

R: As áreas que mais estão crescendo com o uso de computadores são as áreas
genômica e proteômica.

4- O que é o DNA e como sua estrutura física é mantida?

R: O (Ácido Desoxirribonucleico) ,DNA é um polímero orgânico longo, fino e estável, que

apresenta uma estrutura conhecida como dupla hélice, a qual é mantida pela
complementaridade de pontes de hidrogênio entre pirimidinas e purinas.

5- Do que é composto o DNA?

R: É composto de vários genes, e cada um desses genes consiste é um pequeno

fragmento informativo que leva a uma função.

6- Como é formado o RNA e qual a sua função?

R: O RNA é formado a partir do processo de transcrição do DNA. Na maioria das vezes, o

RNA é uma molécula intermediária que leva a informação do núcleo do citoplasma da
célula e a transforma em proteínas por meio de um último processo chamado tradução.

7-A partir do que são formadas as proteínas?

R: Elas são foramadas a partir dos aminoácidos.

8- Cite e caracterize as estruturas de uma proteína.

R: A estrutura primária de uma proteína é formada pelas ligações peptídicas entre dois ou
mais aminoácidos, formando um peptídeo ou um polipeptídeo. Já as estruturas
secundárias caracterizam-se por serem formadas por ligações de hidrogênio entre átomos
da cadeia principal, formando as estruturas α-hélice ou folhas-β. A estrutura terciária, ou
tridimensional, é constituída do redobramento das estruturas secundárias em
determinadas posições espaciais cruciais a função intrínseca da proteína. Por fim, quando
duas ou mais estruturas tridimensionais se juntam para desempenhar uma função, temos
uma estrutura quaternária.

9- Ao analisar a similaridade de uma sequência proteica desconhecida

comparando-a a uma sequência já conhecida, precisamos do conceito de
alinhamento. Explique esse conceito.

R: Se tivermos duas sequências e colocarmos uma sobre outra, os aminoácidos

correspondentes levam à similaridade. Assim, quanto maior o número de aminoácidos
correspondentes, mais similares são as sequências.

10- Cite dois métodos de análise de sequência proteica que chegam a estabelecer a
estrutura terciária de uma proteína. Também cite uma similaridade entre os
métodos.

R: Pode-se citar a cristalografia seguida por difração de raios X e a Ressonância

Magnética Nuclear (RMN). Nesses dois métodos é necessário o uso de grande
quantidade de proteína.

11- Quais são as três abordagens para a modelagem teórica de proteínas?

R: As três abordagens são: modelagem por homologia, por comparação e a Ab-initio.

12- Explique a modelagem teórica de proteínas pela abordagem da homologia.

R: Dada uma sequência de resíduos de aminoácidos, cuja estrutura 3D é conhecida, uma

busca em um banco de dados de proteína é executada e, se uma proteína homóloga para
sua sequência for encontrada, pode-se transferir as coordenadas atômicas da proteína
homóloga e dar uma “forma” provável da estrutura 3D da sua sequência.

13- Algumas proteínas precisam de algo além de suas estruturas estáveis e de seus
aminoácidos para funcionarem, e uma dessas estruturas pode ser o Peptídeo Sinal
(PS). Explique o que é um PS.

R: uma proteína é produzida no retículo endoplasmático rugoso, no entanto, ela pode

trabalhar em outras partes da célula, sendo necessário o transporte dessa proteína para
outra organela. Assim, o peptídeo sinal funciona como uma chave, indicando, abrindo
portas e conduzindo a proteína à sua zona de atuação.

14- O que é a árvore da vida?

R: É uma relação entre a origem e vida existente no planeta, demonstrada em uma árvore
que reúne seres com características semelhantes em um único ramo.

15- Que métodos podem ser utilizados para a construção de uma árvore
filogenética?

R: Para a construção de uma árvore filogenética, pode ser obtida por meio de métodos
geométricos e métodos probabilísticos.