Em 1847 foi publicado seu primeiro romance, Obyknovennaia istoriia
(História Comum), que retrata os conflitos entre o excessivo romantismo de
um nobre jovem russo, recém chegado em São Petersburgo vindo das províncias, e da emergente classe comercial da capital imperial com seu sóbrio pragmatismo. Foi seguido por Ivan Savvich Podjábrin (1848), um esboço psico-naturalista. Entre 1852 e 1855 Goncharov viajou para Inglaterra, África, Japão, e de volta para a Rússia através da Sibéria como secretário do Almirante Ievfimi Putiátin. Suas anotações, uma crônica da viagem, «A Fragata Palas», se publicou em 1858. Seu romance de maior sucesso, «Oblómov», foi publicado o ano seguinte, no qual a personagem principal, Oblómov, foi comparado ao Hamlet de Shakespeare que responde "Não!" à questão "Ser ou não ser?". Fiódor Dostoiévski, entre outros, considerava Gontcharov um grande e notável autor.
Sendo um conservador moderado no coração, Gontcharov cumprimentou
as reformas de 1861, abraçou a bem divulgada ideia de que "o próprio governo chegou agora para liderar o progresso", e encontrou-se em oposição aos democratas revolucionários. No verão de 1862 ele se tornou um editor do periódico Severnaya potchta, e um funcionário do ministério do Interior.
Foi descoberto mais tarde que no início dos anos 1840 Gontcharov estava trabalhando em uma novela chamada As pessoas adultas; manuscritos que foram perdidos.
Em 1867, Gontcharov aposentou-se de seu posto como censor do governo
e, em seguida, publicou seu último romance - Obryv (O Precipício) (1869), que é a história de uma rivalidade romântica entre três homens e prevê uma condenação ao niilismo em defesa dos valores religiosos e morais da velha Rússia. Gontcharov também escreveu contos, críticas, artigos (incluindo um famoso ensaio de 1871 sobre Griboiédov «Горе от ума» (O Mal da Razão), e algumas memórias que só foram publicados postumamente, em 1919. Ele passou o resto de seus dias solitário devido a críticas negativas a alguns de seus trabalhos. Gontcharov nunca se casou e morreu em St. Petersburg, em 1891.