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Raças autóctones na

Produção Animal Biológica


- Ações de Seleção -
Nuno Carolino

nuno.carolino@iniav.pt

I Fórum Ibérico sobre Produção Animal Biológica N.Carolino


1 a 2 de junho de 2017, Auditório do INIAV, I.P., Oeiras, Portugal INIAV
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Produção Animal Biológica
Produção animal ligada à terra

Ampla diversidade biológica


Capacidade de adaptação dos animais às
condições locais
Elevado grau de bem-estar dos animais

Vitalidade e resistência às doenças


Qualidade dos produtos e práticas
tradicionais de produção

N.Carolino
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PORTUGAL
Área Territorial:
91 000 km2
Habitantes:
10 341 974
PIB:
184 931 Milh €

http://www.pordata.pt/Portugal

Biodiversidade dos Países Mediterrâneos


Uma das 25 regiões do mundo com a categoria
de “hotspots” de biodiversidade
50 Raças Autóctones
(bovinos, ovinos, caprinos, suínos, galinhas e equídeos)

+
11 Raças Autóctones de Cães
N.Carolino
Cincotta et al., 2000. Nature 404, 990-992 (27 April 2000) INIAV
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Situação das Raças Autóctones !?
A defesa e melhoramento do património genético
animal é uma prioridade ! (NOVAGRI, PAMAF, AGRO,
PRODER, PDR2020)
Gestão dos LG’s, Programas de Conservação e de
RGAn Melhoramento - Ass. de Criadores (Serv. Oficiais)
50 Cada raça Um Programa de
Melhoramento/Conservação
Agrupamento de Produtores e Produtos
Certificados (DOP e IGP)

quinta-feira, 8 de
junho de 2017
10:00
30 DOP, 18 IGP + 41 (2 DOP + 39 IGP) N.Carolino
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Situação das Raças Autóctones !?

N.Carolino
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Reg CE
nº455/2002

42/50
Risco de extinção N.Carolino
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N.Carolino
Cimeira de Joanesburgo, 2002 INIAV
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Sustentabilidade das Raças Autóctones

Conservação

Melhoramento

Mercado

N.Carolino
The Second Report on the State of the World’s Animal Genetic Resources for Food and Agriculture (FAO, 2015) INIAV
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50

Ação 7.8 – RECURSOS GENÉTICOS


Operação 7.8.1 MANUTENÇÃO DE RAÇAS AUTÓCTONES EM RISCO
Criadores da raças autóctones ameaçadas

Operação 7.8.3 CONSERVAÇÃO E MELHORAMENTO DE RECURSOS GENÉTICOS ANIMAIS


Associações de Criadores
N.Carolino
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Manutenção Progresso
Variabilidade
Genética
+ Genético

120♀ 30000♀
N.Carolino
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Ações de Melhoramento (Seleção) e de
Conservação nas Raças Autóctones

Seleção
Conservação

Antagónicas
Compatíveis &
Complementares

N.Carolino
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Melhoramento Genético

Seleção Aplicação dos princípios da


Genética (mendeliana,
quantitativa e molecular) no
sentido de selecionar e utilizar os

vs animais que melhor servem os


objetivos do criador:
Eficiência produtiva, qualidade
dos produtos, trabalho, bem-estar

Cruzamentos animal, resistência a doenças,


lazer, etc.

Logo percebi que a seleção era a pedra-chave do sucesso do homem para obter raças úteis de
animais e plantas
Darwin, 1837 N.Carolino
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Melhoramento Genético
(Seleção)
Dificuldades !!!
Tipo de característica
Poligénicos / Falta de Informação sobre
a ação dos genes
Transmissibilidade (h2) 2
h =
σ2
A

Efeitos ambientais
2
Aσ +σ 2
E

Modo de ação dos genes


Avaliadas em apenas um sexo
Vários registos ao longo da vida
Medidos demasiado tarde
Medidos post-mortem
Difíceis de serem medidos
Intensidade de Seleção (i)
Precisão (rAP)
Questões de logística !!! N.Carolino
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Ovinos (Lacaune - França e Espanha)
Prod. Leite, %Gord e %Prot Prolificidade

+0.016/ano

1960-2000
Barillet, C. Marie, M. Jacquin, G. Lagriffoul and J. M. Astruc, 2001. The French Lacaune
dairy sheep breed: use in France and abroad in the last 40 years. Livestock Production
Science, Volume 71, Issue 1, September 2001, Pages 17-29

Perret G., Bodin L., Mercadier M., Scheme for genetic improvement of reproductive
abilities in Lacaune sheep, in: 43rd Annual meeting of the EAAP, 1992,
Madrid, Spain.

N.Carolino
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Cabra Nubiana (EUA)

N.Carolino
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Bovinos (Holstein – USA)

Mrode, 2013
Bovinos (Holstein - Canada)

N.Carolino
Beavers and Doormaal, 2016 INIAV
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Melhoramento Genético por Seleção

N.Carolino
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Bovinos (Angus - EUA)

N.Carolino
J. K. Smith and S. P. Greiner , 2016 INIAV
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Codorniz - Peso 28d

225

200

150

125

100

75

Marks (1990 e 1996). Poultry Science 75:1198-1203


5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60

Generation

Rocha et al., 2015 N.Carolino


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Melhoramento Genético
(Seleção) 1-2%/ano !?

Progresso Genético de
características de interesse

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Programas de
Melhoramento por Seleção

Reprodutores selecionados anualmente:


Animais geneticamente superiores
N.Carolino
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Objetivos de Melhoramento
(Programas de Seleção)

+
+
Borregos
+ Lã
+ Função
+Longevidade

Partos

+ kg /
Carne

Peso ao desmame Peso carcaça


Produção Leite Funcionalidade
Prolificidade TB e TP
Intervalo Partos /Fertilidade IC/GMD N.Carolino
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Metodologias de Seleção
(Seleção de Machos e Fêmeas)

Avaliação Morfológica
Performance Individual (PL, GMD, etc.)
Informação Familiar (PL, GMD, etc.)
Teste de Descendência
Índices de Selecção

Avaliação Genética /(MAS e Genómica)

N.Carolino
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Metodologias de Seleção
(Seleção de Machos e Fêmeas)

Avaliação Morfológica Inscrição no Livro Genealógico (LA)

+ Teste de Descendência

Avaliação Genética /(MAS e Genómica)

N.Carolino
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Metodologias de Seleção
Avaliação Morfológica Morfologia ≠ Funcionalidade

Rubi Ruhão
72.0 pontos 94.5 pontos

N.Carolino
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Metodologias de Seleção
Avaliação Genética
1. Mertolenga - 2003
2. Alentejana - 2003
3. Barrosã – 2008
4. Serra da Estrela - 2009
5. Serrana - 2010
6. Cachena - 2010
7. Serpentina – 2010
8. Arouquesa - 2010

1994 2003 9.
10.
CG Bragançana – 2010
Marinhoa – 2010
11. Mirandesa – 2010
12. Garrano – 2011
13. Lusitano - 2011
14. Bordaleira EM – 2012
15. Churra do Minho - 2012
16. Bov. Preta – 2012
17. Campaniça - 2012
18. CG Mirandesa - 2012
2009 ……. 2010 19. Merino Branco – 2012
20. Merino Preta - 2012
21. Cabra Algarvia - 2012
22. CT Quente – 2013
BLUP – Animal Model 23. Charnequeira - 2013
24. Saloia - 2013
 X′ X X′ Z  b   X′ y 
 Z′X Z′Z + A −1λ  a  =  Z′ y 
2010-2015 25.
26.
27.
Minhota - 2013
Maronesa - 2013
Suína Alentejana – 2013
     28. Churra Badana - 2014
29. Ramo Grande – 2015
Charles Roy Henderson (1911-1989) 30. Bísaro – 2015
31. Garvonesa - 2015
N.Carolino
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Avaliação Genética
Estimativa do valor genético
BLUP - Modelo Animal
Best Linear Unbiased Prediction Charles Roy Henderson (1911-1989)

 X′ X X′ Z  b   X′ y  Registos
 Z′ X Z′ Z + A −1λ  a  =  Z′ y  Produtivos
    

Matriz de
Parentesco
Genealogias

N.Carolino
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Melhoramento Animal - Seleção
(Sequência de ações)

N.Carolino
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Seleção de Reprodutores
(Seleção de Machos e Fêmeas)
Raça Mertolenga

N.Carolino
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Seleção de Reprodutores
(Seleção de Machos e Fêmeas)

Raça Lusitana

N.Carolino
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Seleção de Reprodutores
(Seleção de Machos e Fêmeas)
Raça Alentejana

N.Carolino
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Seleção de Reprodutores
(Seleção de Machos e Fêmeas)
Raça Alentejana

Fêmeas

N.Carolino
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Ações de Melhoramento nas Raças Autóctones

Registos Fenotípicos Valor Genético


Genealogias Performance

N.Carolino
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Ações de Melhoramento nas Raças Autóctones

Registos Fenotípicos Valor Genético/ Genómico


Genealogias Performance
Informação Genómica

2009
“Regiões”, Ferramentas de análise > 22000 genes
(Marcadores), Genomas de referência N.Carolino
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http://www.bovinegenome.org/ 34/ 43
“Ferramentas Moleculares”
Controlo de filiação/identidade
Marcadores Moleculares
Características de interesse (qualidade leite, carne, conformação)
Características indesejáveis (resistência/suscetibilidade scrapie,
PSS, prognatismo, nanismo, etc. )

Seleção genómica Deteção de SNPs, desenvolvimento de


SNP chips, re-secuenciação de genomas ,
Seleção genómica + QTLs Genome Wide Association Studies (GWAS)
OvineSNP50 BeadChip
54,000 SNP’s

50K, 80K or 777K 50K SNP, International Goat Genome Consortium


N.Carolino
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Seleção Assistida por Marcadores (MAS)
n Marcadores genéticos utilizados em Programas de Seleção
Bov. Bov.
Suínos Ovinos Aves
leite carne
Defeitos congénitos 6 3 1
Aparência 1 3 2
Qualidade do leite 3
Qualidade da carne 3 8
Ingestão 1
Resistência a doenças 2 1 1
Reprodução 3 3
Crescimento e composição 2 5 2
Quant. e composição do leite 5

Dekkers, 2004

N.Carolino
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Seleção Assistida por Marcadores (MAS)
Marcadores Genéticos
• Associações entre polimorfismos
genéticos e o desenvolvimento muscular
e aspetos qualitativos da carne

Genética • Miostatina (8 SNP) (Crom. 2)


Genes Conhecidos Desenvolvimento muscular

VG’s • Calpaína/calpastatina (5+2 SNP)


Tenrura (Crom. 29/ 7)

• Leptina (6 SNP)
Variabilidade (Crom. 4)
Total Gordura intra-muscular
Suculência

SNP (Single Nucleotide Polymorphism) N.Carolino


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Seleção de Reprodutores
(Seleção de Machos e Fêmeas)
Raça Mertolenga

N.Carolino
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Seleção de Reprodutores
(Seleção de Machos e Fêmeas)

Caprinos - Identificação de genes de interesse


Caseínas
Genes CSN1S1, CSN1S2, CSN2 e CSN3

•Composição proteica do leite


•Características tecnológicas e rendimento
queijeiro
• Caseínas (alfaS1)
• Caseínas (K)

N.Carolino
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Seleção Assistida por Marcadores (MAS)
Marcadores Genéticos
Gene do Halotano (nn) - Síndrome da Susceptibilidade ao Stress em Suínos (PSS)
Homozigóticos recessivos (nn) Heterozigóticos recessivos (Nn)
Morte Prematura > Taxas de Crescimento
Rigidez Muscular > % Musculo e > Rendimento
Dispneia < % Gordura
Hipertermia
Congestão subscutânea Incidência de PSS
Cianose das mucosas < 2% Large White, Yorshire e Duroc
Carnes PSE (Pale, Soft, Exudative) 25% Landrace
50-90% Landrace Belga e Alemão
90-100% Peitrain
Anomalia autossómica recessiva
• Cromossoma 6
• Mutação pontual no gene Recetor da rianodina (RYR1)
• Citosina (C) ⇒ Timina (T) - posição 1843
•3 genótipos distintos (NN, Nn e nn)
• Animais suscetíveis - genótipo recessivo nn

N.Carolino
Fujii et al., 1991 INIAV
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Genome-Wide association studies for wool traits in Chinese Merino Sheep
PLoS One. 2014 September 2014 | Volume 9 | Issue 9 | e107101.

Fiber diameter

Association mapping of the mutation responsible for low milk fat content
Scientific Reports 5:8484 · February 2015

Milk fat content

N.Carolino
INIAV
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Seleção Genómica/Valor Genómico

aló ão
Informação

a
ne aç
gic
Produtiva

Ge orm
Inf
VGen
mi o
nó açã

• Variabilidade Genética
ca
Ge rm

• Pesquisar marcadores
o

genéticos associados Cada marcador


Inf

• Construção de 1 fator de ponderação


equação de predição
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2020

Raças Autóctones 2019


2018
2017
Melhoramento Genético 2016
2015
Conservação 2014
2013
Modos de Produção 2012
2011
2010
2009
2008
2007
2006
2005
50
2004
2003
2002
2001
2000
1999
1998
1997
1996
1995
1994
1993
1992
1991
1990
1989
1988

Obrigado
1987
1986
1985
1984
1983
1982
1981
1980
1979
1978
1977
1976
1975
1974
1973
1972
1971 N.Carolino
INIAV
1970 43/ 43

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