Nome: Bruno Hideki Amadeu Ogata

Atividade 1
Sequência 1, SARS-Covid-2 da China:

In [16]: #Biblioteca Biopython

import Bio
from Bio import SeqIO

#Biblioteca para converter String em sequencia para saida com SeqIO

from Bio.SeqRecord import SeqRecord
from Bio.Seq import Seq

#Código para ler o primeiro arquivo fasta e contar os nucleotídeos A, C, G e T dessa sequência

seq1 = (SeqIO.read('SARS-CoV-2 NC_045512 China.fasta', 'fasta'))

dna1 = str(seq1.seq)

print(f'A: {dna1.count("A")} \nC: {dna1.count("C")} \nG: {dna1.count("G")} \nT: {dna1.count("T")}')

A: 8954
C: 5492
G: 5863
T: 9594
Sequência 2, SARS-Covid-2 do Brasil:

In [19]: #Código para ler o segundo arquivo fasta e contar os nucleotídeos A, C, G e T dessa sequência

seq2 = SeqIO.read('SARS-CoV-2 MT126808.1 Brazil.fasta', 'fasta')

dna2 = str(seq2.seq)

print(f'A: {dna2.count("A")} \nC: {dna2.count("C")} \nG: {dna2.count("G")} \nT: {dna2.count("T")}')

A: 8927
C: 5492
G: 5861
T: 9596
Sequência 3, SARS-Covid-2 do Chile:

In [14]: #Código para ler o terceiro arquivo fasta e contar os nucleotídeos A, C, G e T dessa sequência

seq3 = SeqIO.read('SARS-CoV-2 MW672138.1 Chile.fasta', 'fasta')

dna3 = str(seq3.seq)

print(f'A: {dna3.count("A")} \nC: {dna3.count("C")} \nG: {dna3.count("G")} \nT: {dna3.count("T")}')

A: 8876
C: 5461
G: 5836
T: 9551