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PEREZ T., SARTORETTO S., SOLTAN D., CAPO S., FOURT M., DUTRIEUX E.,
VACELET J., HARMELIN J.G., REBOUILLON P. (2000). Etude bibliographique sur les
bioindicateurs de l’état du milieu marin. Système d’évaluation de la Qualité des Milieux
littoraux – Volet biologique. Rapport Agences de l’Eau, 4 fascicules, 642 pp. + 1 Cd-rom.
Etude bibliographique sur les bioindicateurs de l’état du milieu marin SEQ littoral – Volet bio
CONCLUSIONS Agences de l’Eau
CONCLUSIONS
5. GLOSSAIRE.............................................................................................................................................. 637
Etude bibliographique sur les bioindicateurs de l’état du milieu marin SEQ littoral – volet bio 608
CONCLUSIONS Agences de l’Eau
1. RAPPEL
Ce fascicule est la conclusion de l’étude bibliographique sur les bioindicateurs de l’état du
milieu marin. Son objectif est de présenter une synthèse de l’état de l’art développé dans les
fascicules 2 et 3. Les informations obtenues au cours de cette étude sont autant que possible
regroupées dans des vues schématiques pour une compréhension globale de ces résultats. Les
diagrammes présentés ont été en partie inspirés par des ouvrages de références (Blandin,
1986, Lagadic et al., 1997, 1998, Phillips & Rainbow, 1993), des présentations réalisées par
des experts à l’occasion d’une réunion internationale (Fascule 1 ; Annexe II) et parfois édités
sur internet (e.g. www.esd.ornl.gov/programs/bioindicators).
Ce fascicule de synthèse reprendra les traits majeurs des résultats obtenus lors de cette étude
bibliographique, et les articulera en présentant dans un premier temps les grands concepts
d’utilisation des bioindicateurs, dans un second temps l’état des connaissances en matière
d’outils de bioévaluation, et enfin nos recommandations quant à la réalisation d’un système
idéal d’évaluation de la qualité des eaux littorales.
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CONCLUSIONS Agences de l’Eau
Piscivores Omnivores
CONTAMINANTS
Planctonophages Détritivores
Zooplancton Invertébrés
benthiques
Algues Détritus
Apports de matière
organique
Réponses intégrées
Succès de
Croissance reproduction
Réponse au niveau de la
population
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CONCLUSIONS Agences de l’Eau
Le diagramme précédent montre que l’emploi d’indicateurs écologiques permet une bonne
évaluation des effets à long terme sur les populations et / ou les communautés, et que les
marqueurs biochimiques et moléculaires sont les plus à même de donner une réponse précoce
à un stress. Cependant les liens symbolisés par cette figure entre les différentes réponses
biologiques, qui s’expriment, suivant le stress, depuis l’heure jusqu’à l’année, ne sont que très
rarement connus.
Etude bibliographique sur les bioindicateurs de l’état du milieu marin SEQ littoral – volet bio 611
CONCLUSIONS Agences de l’Eau
Si ces connaissances sont suffisantes, il est alors possible d’utiliser les mesures d’effet au
niveau infra-individuel (marqueurs physiologiques, biochimiques voire moléculaires) pour
évaluer et surtout prévenir précocement les impacts de la contamination.
L'intérêt de la mise en place de grilles de qualité, utilisant une collection de bioindicateurs,
repose sur la nécessité de prendre en compte des effets de la contamination sur
l'environnement à court, moyen et long terme, et de définir les liens existant entre effets
toxicologiques et écologiques.
EVALUATION DE LA QUALITE DE
L’ENVIRONNEMENT
Succès d’une
population
Structure des
populations
Reproduction
ECHELLE DE
TEMPS
Physiologie
Croissance
années Métabolisme
mois
Biochimie
jours
Histopathologie
heures Molécules
STRESS ENVIRONNEMENTAL
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CONCLUSIONS Agences de l’Eau
Ainsi, les bioindicateurs peuvent être utilisés dans des programmes de surveillance des
milieux aquatiques pour :
identifier les relations de cause à effet entre les facteurs d’altération et les effets
biologiques ;
Face à un stress, l’état physiologique d’un organisme peut être caractérisé par trois niveaux
majeurs de stress. Ces niveaux sont déterminés en fonction des dommages causés par les
facteurs de stress :
Mort
DESTABILISATION
Dommages importants
Maladie
non réparables 3
Dommages réparables 2
Réparation
Santé Stress 1
Ok
Etude bibliographique sur les bioindicateurs de l’état du milieu marin SEQ littoral – volet bio 613
CONCLUSIONS Agences de l’Eau
Les techniques biologiques d’évaluation peuvent être utilisées pour caractériser l’état
physiologique des organismes dans chacun des 3 niveaux de stress. Les indicateurs de niveau
1 sont les plus sensibles et les plus précoces.
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CONCLUSIONS Agences de l’Eau
Aucune de ces approches ne se suffit à elle-même pour fournir des informations fiables et
complètes sur l'état de l'environnement. Il est aujourd'hui admis que c'est de l'association de
ces différentes approches biologiques couplées avec des mesures de paramètres physico-
chimiques que dépend une évaluation pertinente de la qualité de l'environnement marin.
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CONCLUSIONS Agences de l’Eau
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CONCLUSIONS Agences de l’Eau
Avant de les employer, on doit bien connaître les cinétiques d'accumulation, et en particulier
maîtriser les facteurs influençant sur l'absorption ou l'élimination des contaminants
(température et salinité de l'eau, métabolisme de l'organisme utilisé).
Une question que l'on peut se poser est : "indicateurs de quoi". En effet, les polluants
occupent tous les compartiments du milieu marin : l'eau, les sédiments, le compartiment
biologique. Du mode de vie de l'organisme dépend l'image qu'il va donner de la
contamination. Une algue est susceptible d’accumuler les polluants sous forme dissoute et va
intégrer une tendance générale de contamination du milieu. Parmi les filtreurs, les bivalves
sont les organismes sentinelles les plus évidents. Le mode de fonctionnement de ces
organismes est bien connu, et leur emploi comme organisme sentinelle est internationalement
admis. Généralement, ils reflètent bien les niveaux de contamination observés dans l'eau ou
les sédiments, mais leur mode de vie leur confère une plus grande capacité à mesurer des
phénomènes relativement courts et marqués, plutôt que de grandes tendances spatiales ou
temporelles. Parmi les inconvénients de l’utilisation des bivalves dans les réseaux de
surveillance, on peut citer leur durée de vie trop courte, et leur métabolisme fluctuant qui peut
influencer l'accumulation des contaminants.
Pour pallier aux limites d’utilisation des populations sauvages de bivalves, l’IFREMER et
l’Agence de l’Eau RMC ont développé un programme de transplantation de moules en
Méditerranée. Les campagnes de 1996 et 1998 ont permis l’élaboration et la validation des
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CONCLUSIONS Agences de l’Eau
Les spongiaires sont aussi des filtreurs actif, mais utilisent une plus large gamme de
particules que les mollusques bivalves. Leur régime alimentaire est composé majoritairement
de bactéries de moins de 2 µm mais aussi de matières organiques dissoutes. Les spongiaires
peuvent donc refléter les niveaux de contamination, à la fois des compartiments dissous et
particulaires. Plusieurs exemples ont montré le potentiel de ces organismes comme
indicateurs écologiques, bioaccumulateurs de polluants et matrice de recherche de marqueurs
biochimiques. Compte tenu de leur large distribution géographique et bathymétrique, de leur
faible niveau de différentiation tissulaire, de leur capacité à capter à la fois du dissous et du
particulaire, ces organismes peuvent apporter des informations complémentaires des bivalves
et peut-être pallier à certaines de leurs limites (Perez, 2000a et b).
D'autres organismes intervenant à un niveau plus avancé du réseau trophique peuvent aussi
jouer un rôle dans l'évaluation de la qualité de l'environnement. Ce rôle peut être joué par
d'autres filtreurs, utilisant du phyto- ou du zooplancton pour se nourrir (cnidaires et crustacés
cirripèdes) ou par des organismes brouteurs, racleurs, prédateurs, nécrophages (échinodermes,
vers polychètes, crustacés décapodes, poissons, etc.). On a alors une bio-concentration de la
pollution dans les échelons supérieurs du réseau trophique. Les questions que l’on se pose
alors doivent être : (i) veut-on déterminer précocement les niveaux de contamination à l’aide
de « pièges à particules biologiques » ? (ii) veut-on avoir une idée de l’impact de cette
contamination sur l’ensemble du réseau trophique ?
De notre point de vue, les organismes sentinelles doivent être utilisés pour déterminer le plus
tôt possible une contamination. Mesurer les niveaux de contamination d’organismes situés à
des échelons élevés des réseaux trophiques n’a d’intérêt que pour des raisons de santé
publique ou pour contribuer à l’étude de l’impact de la pollution sur l’ensemble d’un
écosystème.
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CONCLUSIONS Agences de l’Eau
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CONCLUSIONS Agences de l’Eau
1 : applicable
BIOACCUMULATEURS DE CONTAMINANTS 2 : à développer
MANCHE & ATLANTIQUE 3 : prometteur
MEDITERRANEE 4 : à rechercher
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Caractère opérationnel
TBT – moules
Organo-
Moules (Mytilus sp.), poissons (Gadus morhua, Limanda limanda, Platichtys flesus,
callionymus lyra), mammifères marins (lard de différentes espèces dont Tursiops truncatus)
métabolites, pesticides
PCB, DDT et
Moules (Mytilus sp.), poissons (différentes espèces commerciales, dont Mullus barbatus et
Serranus sp.), mammifères marins (lard de différentes espèces dont Tursiops truncatus)
Moules (Mytilus sp.), poissons (Gadus morhua, Limanda limanda, Platichtys flesus,
Hydrocarbures (dont PAH
callionymus lyra), mammifères marins (autopsie de différentes espèces dont Tursiops truncatus)
et métabolites)
Moules (Mytilus sp.), poissons (différentes espèces commerciales, dont Mullus barbatus et
Serranus sp.), mammifères marins (autopsie de différentes espèces dont Tursiops truncatus)
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CONCLUSIONS Agences de l’Eau
• L'indice trophique (IT) de Word (1990), développé pour évaluer l'impact de la pollution
organique sur les milieux côtiers californiens et repris pour une application en milieux
côtiers britanniques (Codling et Ashley, 1992) apparaît comme le plus opérationnel. L'IT
fait aujourd'hui l'objet d'une adaptation au contexte méditerranéen. Il a déjà été appliqué
avec succès à l'impact de l'émissaire de la station d'épuration de Toulon au cap Sicié
(champ proche) et à la qualité des fonds du golfe d'Aigues Mortes (champ moyen) où il
permet de mettre en évidence des gradients d'enrichissement organique. Cet indice peut
être considéré aujourd'hui comme opérationnel. Son adaptation à une zone donnée
suppose simplement d'attribuer les espèces rencontrées à un groupe trophique. Cet indice
est probablement mieux adapté à l’étude de gradients prononcés qu’à des études en
champs moyen ou lointain1.
1
Champ proche = zone présentant un gradient de pollution très prononcé dont on peut clairement identifier la source ; champ moyen = zone
sous influence de plusieurs sources de pollution ; champ lointain = zone dont le niveau de pollution correspond au bruit de fond.
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CONCLUSIONS Agences de l’Eau
• Le travail sur les foraminifères du LEBIM : malgré leur petite taille, ces protozoaires
benthiques peuvent être de bons candidats pour l’évaluation de la qualité des substrats
meubles. Certaines espèces sont considérées comme cosmopolites, et le groupe est bien
représenté dans toutes les aires géographiques. Cette approche peut s’avérer très utile en
milieu portuaire et estuarien ; elle est d’ailleurs régulièrement employée sur la façade
Atlantique. Un indice appelé « indice de confinement » (Debenay, 1995) est opérationnel
en milieu tropical et nécessiterait une adaptation pour être appliquée en aires tempérées.
En substrats durs, plusieurs approches ont été développées, sans être par la suite normalisées :
• L’indice IAP de Bellan (1980, 1984) utilisant les Polychètes, appliqué à de nombreuses
reprises sur le littoral français, et principalement sur le champ proche ;
• L’indice amphipodes de Bellan-Santini (1981) mis au point en Méditerranée,
• L’indice IP proposé par Belsher (1979) pour les macroalgues en Méditerranée.
Une démarche similaire est en cours dans le cadre d’un programme national sur les
bioindicateurs de substrats durs, et concerne les grands bryozoaires « ascophores dressés ».
Les poissons sont les organismes qui suscitent le plus grand intérêt des usagers de la mer. Ils
sont couramment employés pour des dosages de contaminants ou des mesures d’effets
biologiques. Cependant, leur utilisation pour une évaluation écologique de la qualité du milieu
marin n’est pas aisée, compte tenu de l’interaction de nombreux facteurs sur la composition
des peuplements (effort des pêches professionnelle et amateur, fréquentation, pollution,
facteurs physico-chimiques, migrations, etc.). A ce jour, aucune méthode d’évaluation par les
peuplements de poissons n’est opérationnelle.
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CONCLUSIONS Agences de l’Eau
Enfin, la valeur du patrimoine sous-marin est aujourd'hui intégrée dans la plupart des études
conduisant à la mise en place de schémas d'aménagement du littoral, de contrats de baies ou
d'observatoire du littoral. Pourtant les approches méthodologiques proposées conduisent
rarement au développement ou à l'utilisation de véritables outils standardisés d'évaluation puis
de suivi. Chaque équipe d'intervenants possède sa propre approche, basée la plupart du temps
sur des inventaires plus ou moins exhaustifs d’espèces remarquables et / ou déterminantes,
et excluant généralement une vision globale et intégrée de ce patrimoine. Il semble donc
nécessaire aujourd'hui d'établir les bases d'une véritable évaluation du patrimoine sous-marin,
en s’appuyant sur des outils fiables permettant le suivi de sa dégradation ou de sa restauration.
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CONCLUSIONS Agences de l’Eau
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Phytoplancton
Zooplancton
Macro-échinodermes
Foraminifères
Macroalgues
Spongiaires
Bryozoaires
Gorgonaires
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CONCLUSIONS Agences de l’Eau
Les biomarqueurs peuvent être classés selon deux approches (cf. fasc. 2) :
Les marqueurs d’exposition et les marqueurs d’effets,
Les marqueurs de qualité générale et les marqueurs spécifiques d’un contaminant.
Une bonne évaluation de la qualité par les biomarqueurs passe par la validation d’un certain
nombre d’entre eux. De nombreuses réunions d’experts ont lieu chaque année, et permettent
de valider régulièrement l’intérêt de nouvelles techniques. La plus récente s’est déroulée à
Copenhague en novembre 1998. Cette réunion a permis de valider les techniques les plus
prometteuses et a donné lieu à une proposition de programme d’application pilote du concept
de biomarqueurs. Ce programme sera proposé pour un financement européen dans le courant
de l’année 1999. Au niveau national aussi, certaines techniques vont faire l’objet d’une
application pilote dans le cadre du RNO. Seront étudiés durant deux années dans la moule :
Cytochrome P4501A (BaP hydroxylase), Acétylcholinestérase, Stabilité lysosomale, Adduits
à l’ADN, Indice de condition, Malformation des gonades, et système MXR.
Compte tenu des programmes d’intercalibration de ces méthodes en cours et des applications
pilotes à venir, les diagrammes qui suivent font la synthèse de ce qui pourrait être
Etude bibliographique sur les bioindicateurs de l’état du milieu marin SEQ littoral – volet bio 625
CONCLUSIONS Agences de l’Eau
opérationnel à court ou moyen terme. Autant que faire se peut, la distinction de niveau
d’opérationnalité des méthodes sera aussi faite en fonction de la façade maritime, et surtout
des modèles animaux utilisables (cf. fascicule 3).
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Caractère
Test Comète – moules et hépatocytes de poissons opérationnel
Génotoxixité
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CONCLUSIONS Agences de l’Eau
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Caractère
Métallothionéines – poissons (Flet, limande, dragonnet, hépatocytes) opérationnel
Métaux lourds
hépatocytes)
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CONCLUSIONS Agences de l’Eau
Caractère
Métallothionéines – poissons (rascasses, sars) opérationnel
Métaux lourds
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CONCLUSIONS Agences de l’Eau
4. RECOMMANDATIONS
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CONCLUSIONS Agences de l’Eau
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CONCLUSIONS Agences de l’Eau
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CONCLUSIONS Agences de l’Eau
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CONCLUSIONS Agences de l’Eau
APPROCHE ECOLOGIQUE
Macroalgues
Bryozoaires
Ascidies
Echinodermes
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CONCLUSIONS Agences de l’Eau
DE NOUVEAUX
BIOACCUMULATEURS
Des candidats
Remarque : les espèces proposées sont d’une part très bien réparties sur l’ensemble du
littoral français, et ont d’autre part fait l’objet de plusieurs études écotoxicologiques.
RECHERCHES DE BIOMARQUEURS
Etude bibliographique sur les bioindicateurs de l’état du milieu marin SEQ littoral – volet bio 634
CONCLUSIONS Agences de l’Eau
4.4. PERSPECTIVES
L’ensemble de ces documents (fasc. 1 à 4) a présenté des techniques et des organismes qui ont
un rôle à jouer dans la création du SEQ littoral.
De même que le concept d’une espèce unique pour la surveillance de l’environnement marin a
été abandonné, une évaluation précise et globale de l’état santé de l’environnement marin
requiert plusieurs techniques, s’adressant à différents niveaux, de la molécule jusqu’à
l’écosystème. L’idéal serait de réussir à combiner ces différentes approches de manière à
mieux comprendre les mécanismes de perturbation voire de disparition des écosystèmes.
L’enjeu d’un tel système d’évaluation réside dans sa pérennité, la précocité et la sensibilité de
l’information qu’il donne. Avec l’optimisation des structures d’assainissement des eaux usées,
la qualité des milieux récepteurs s’améliore, mais les polluants encore présents sont de plus en
plus insidieux, et parfois véhiculés par des particules très fines. Il convient donc de mettre en
œuvre des outils offrant une bonne sensibilité face à ce type de pollution et de s’intéresser aux
effets qu’elle peut avoir.
Un des problèmes à résoudre avant d’appliquer en routine de tels outils réside dans la
compréhension des liens existants entre les différents niveaux de perturbation.
Exemple : liens entre l’affection d’une fonction enzymatique à la modification d’un comportement voire de la
composition d’un peuplement.
Etude bibliographique sur les bioindicateurs de l’état du milieu marin SEQ littoral – volet bio 635
CONCLUSIONS Agences de l’Eau
un impact majeur sur les référentiels des outils biologiques envisageables dans le cadre d’un
réseau de surveillance.
S’il veut donner la meilleure image possible de la qualité de l’environnement littoral, le SEQ
doit permettre aux approches biologiques les plus prometteuses de combler les déficits en
connaissance et de leur faire passer le cap de la haute technicité.
Etude bibliographique sur les bioindicateurs de l’état du milieu marin SEQ littoral – volet bio 636
CONCLUSIONS Agences de l’Eau
5. GLOSSAIRE
Acétylcholinestérase (AChE) : enzyme jouant un rôle primordial dans la transmission de
l’influx nerveux. De nombreux contaminants neurotoxiques peuvent être impliqués dans les
phénomène d’inhibition de cette enzyme.
Altéragène : entité susceptible d’entraîner chez les organismes vivants une altération des
fonctions biologiques au niveau biochimique, cellulaire, histologique, individuel ou
biocénotique.
Etude bibliographique sur les bioindicateurs de l’état du milieu marin SEQ littoral – volet bio 637
CONCLUSIONS Agences de l’Eau
Caging : méthode consistant à placer en milieu naturel des organismes vivants confinés en
cage de manière à réaliser par la suite des dosages de contaminants ou de biomarqueurs.
Carcinogène : qualifie tout facteur qui provoque le cancer et qui peut être de nature physique,
chimique, bactérienne ou virale.
Coenenchyme : chez les Gorgonaires, c’est le tissu vivant couvrant le squelette corné ou
calcaire. Il comprend notamment l’ensemble des polypes qui forment la colonie.
Etage littoral : espace vertical du domaine benthique où règnent des conditions relativement
homogènes auxquelles correspond un peuplement donné. Quelque soit la région du globe, on
rencontre un schéma d’étagement très constant et l’on distingue d’une manière générale :
- un étage supralittoral au dessus du niveau atteint par les hautes mers et les vagues mais
recevant les embruns,
- un étage médiolittoral soumis à une humectation périodique en raison des marées et des
vagues,
Etude bibliographique sur les bioindicateurs de l’état du milieu marin SEQ littoral – volet bio 638
CONCLUSIONS Agences de l’Eau
Heat Shock Protein (HSP) ou protéine de choc thermique : de la famille des protéines
inductibles par un stress (HSP, Ubiquitine, Métallothionéines, P-glycoprotéines du MXR,
etc.) présentes chez tous les organismes vivants (de la bactérie aux mammifères supérieurs) et
induites par des stress thermiques ou par des altéragènes (métaux, PCB, virus, parasite, etc.).
Hémolymphe : terme générique utilisé pour désigner le liquide du milieu intérieur (« sang »)
des invertébrés.
Imposex : apparition de caractères sexuels mâles (pénis) chez les femelles de mollusques
gastéropodes, induite par la contamination par le TBT.
Etude bibliographique sur les bioindicateurs de l’état du milieu marin SEQ littoral – volet bio 639
CONCLUSIONS Agences de l’Eau
Lymphocystis : Maladie virale reconnaissable par la présence de nodules sur le corps, les
nageoires et parfois dans la bouche des poissons.
Lysosome : organite cellulaire polymorphe des cellules animales et végétales. Les lysosomes
sont limités par une membrane lipoprotéique et contiennent des enzymes (hydrolases).
Neurotoxique : qualifie l’action d’une substance toxique agissant sur le système nerveux.
Oncogène : gène qui après altération devient capable de transformer une cellule normale en
cellule tumorale.
Etude bibliographique sur les bioindicateurs de l’état du milieu marin SEQ littoral – volet bio 640
CONCLUSIONS Agences de l’Eau
Rhizome : tige des végétaux vasculaires, rampante et souvent enfoncée dans le substrat.
Stress : ensemble de perturbations biologiques provoquées par une agression quelconque sur
un organisme et des réponses de celui-ci.
Test « Stress sur Stress » : temps de survie à l’air ; technique de mesure de l’état de stress
global d’un lot de moules.
Etude bibliographique sur les bioindicateurs de l’état du milieu marin SEQ littoral – volet bio 641
CONCLUSIONS Agences de l’Eau
Xénobiotique : molécule non produite par les organismes vivants, provenant des activités
humaines, présente dans le milieu extérieur et susceptible d’être accumulée par ces
organismes et / ou d’y provoquer des altérations d’ordre, biologique, physiologique et
biochimique.
Etude bibliographique sur les bioindicateurs de l’état du milieu marin SEQ littoral – volet bio 642