Atividade sobre Hipótese do “Mundo do RNA” e Expressão gênica

Sobre a hipótese“Mundo do RNA” Assista os vídeos baixo.

https://www.youtube.com/watch?v=K1xnYFCZ9Yg&ab_channel=StatedClearly
https://www.youtube.com/watch?v=MPzWrv6l9l0&ab_channel=iBiologyTechniques

1. Em síntese, o que diz a hipótese de um mundo de RNA no início da vida?

É a ideia de que antes das células vivas, o código genético e o ciclo
gene/proteína, cadeias de um químico chamado RNA se formaram naturalmente.
Uma vez formadas, algumas dessas cadeias foram capazes de funcionar como
enzimas e foram capazes de evoluir fazendo cópias de si mesmas com pequenas
modificações acidentais.

2. Defina a transcrição.
A transcrição é um processo pelo qual ocorre a síntese de RNA a partir das
informações contidas no DNA. Nesse processo, uma cadeia de DNA é transcrita
em uma molécula de RNA simples, que se torna complementar à cadeia de
DNA.
 
3. Os RNA são divididos em RNA codificador (RNAm) e RNA não codificador
(ncRNA). Quais são os tipos de RNA, além dos três já conhecidos, e suas
respectivas funções?
RNA mensageiro: Os mRNA são responsáveis por carregar a informação
genética, determinando, portanto, a sequência de aminoácidos de uma proteína.
RNA transportador: O tRNA é responsável por carregar os aminoácidos que
formarão a proteína a ser sintetizada.
RNA ribossômico: O rRNA garante a formação do ribossomo, organela que
serve de local para a síntese de proteínas.

4. Dentre os ncRNA, os microRNA tem sido considerados muito importantes.  O

que são? Descreva seu mecanismo de ação.
MicroRNAs (miRNAs) são pequenos RNAs não-codantes, conservados ao
longo da evolução, capazes de regular a expressão gênica através da degradação
ou repressão da tradução de moléculas-alvo de RNA mensageiro. A expressão
dos miRNAs se apresenta desregulada em diversos processos patológicos,
incluindo o câncer.
O mecanismo de ação principal assenta no emparelhamento perfeito ou
imperfeito entre as extremidades do miRNA e do mRNA alvo. O miRNA
maduro pode inibir a tradução através do emparelhamento imperfeito com a
extremidade 3’-UTR do mRNA alvo ou impedir a tradução através do
emparelhamento perfeito com a extremidade 3’-UTR ou com regiões
codificantes do mRNA alvo.
5. O que é a região promotora e qual é sua função?
A região promotora é uma região do DNA que inicia a transcrição de um
determinado gene. Ela contém locais de reconhecimento para a RNA polimerase
ou suas proteínas auxiliares se ligarem. O DNA se abre na região promotora
para que a RNA polimerase possa começar a transcrição
 
6. O que são os enhancers?
Os enhancers são sequências de DNA, os quais apresentam a função de
aumentar a afinidade da maquinaria de transcrição por um certo promotor, e
assim, garantir maior estabilidade.

7. Defina fator de transcrição.

O fator de transcrição são proteínas envolvidas na regulação da transcrição, que
atuam se ligando ao DNA de células eucarióticas, permitindo que a enzima RNA
polimerase se ligue devidamente ao DNA. Devido ao grande número desses
fatores e suas respectivas propriedades particulares, é crucial que somente os
fatores apropriados se aproximem do sítio de início transcricional dos genes
alvo, o que é determinado pela sequência específica de bases da região do DNA.

8. Diferencie introns e exons

Tanto os introns quanto os exons são sequências de nucleotídeos no gene.
Introns são sequências de bases de DNA que não codificam diretamente as
proteínas, sendo transcritas, mas não traduzidas, mas que participam ativamente
do controle de expressão gênica.
Exons são sequências de bases de DNA que são transcritas e efetivamente
traduzidas, correspondendo à informação genética que realmente codifica a
sequência de aminoácidos da proteína.

9. O que é splicing? E splicing alternativo?

O splicing consiste na retirada dos íntrons de um RNA precursor, de forma a
produzir um RNA mensageiro funcional.
O splicing alternativo é um processo pelo qual os exons de um transcrito
primário são ligados de diferentes maneiras durante o processamento do RNA,
levando à síntese de proteínas distintas, através desse processo, podem ser feitas
combinações, embaralhamento dos éxons, para a formação de diferentes
proteínas a partir de um único gene. Explicando, por exemplo, o motivo de não
existir a relação direta entre o número de genes de uma espécie e sua
complexidade.

10. Quais são e para que servem as modificações 5´e 3´do RNAm?
A remoção de íntrons e a adição de um revestimento (cap) especial em 5′ e uma
cauda de nucleotídios adenina em 3′.
Nessas modificações, cada íntron é cortado em cada extremidade, e essas
extremidades do íntron quase sempre apresentam GU na extremidade 5′ e AG na
extremidade 3′ (a regra GU–AG). Outro sítio invariante é um resíduo A (o ponto
de ramificação A) entre 15 e 45 nucleotídios upstream do sítio de corte 3′. Os
nucleotídios que flanqueiam os nucleotídios altamente conservados também são
conservados, mas em menor grau. Essas modificações são necessárias para a
ligação da molécula de RNA mensageiro ao ribossomo, para o início da
 transcrição. A cauda poli-A estabiliza a molécula.

11. Defina a tradução e dê os codons de início e término da tradução?

A tradução consiste em decodificar um RNA mensageiro e usar sua informação
para produzir um polipeptídeo ou cadeia de aminoácidos.
Códons de início: AUG, AUC, UCG.
Códon de término: UAG, UGA, UAA.

12. O que são modificações pós-traducionais que ocorrem nos polipeptídeos? Cite
algumas modificações. Por que essas modificações são tão importantes?
Modificações pós-traducionais (MPTs) são eventos de processamento covalente
que mudam as propriedades das proteínas por clivagem proteolítica ou por
adição de um grupo químico a um ou mais aminoácidos. Alguns exemplos de
modificações pós-traducionais incluem a fosforilação, acetilação, alquilação,
metilação, sulfatação, isoprenilação, glicilação, ubiquitinação e formação de
pontes dissulfeto.
Estas modificações são importantes porque podem determinar a atividade, a
localização, e interações com outras proteínas. Um exemplo disso é a regulação
da função de PCNA (antígeno nuclear de proliferação celular) por meio da
adição e da remoção de monômeros de ubiquitina, que ilustra a importância das
modificações pós-traducionais em eucariotos. Se o dano da base no
filamento-molde não for rapidamente corrigido, a forquilha de replicação parada
sinalizará a ativação da via de morte celular.