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Do Gene à Vida

Profa. Débora Trichez


dtbiol@gmail.com
Moodle: Do Gene à Vida
Senha: ebio1684
PLANO DE ENSINO
1 – IDENTIFICAÇÃO Cronograma de Atividades
MODULO: SISTEMAS BIOLÓGICOS GV – 01-2020 Turma A e B
Professor: Débora Trichez
Disciplina: Do Gene à Vida Encontros DATA ATIVIDADES

Código da Semestre no
Apresentação da disciplina
Disciplina: Fluxograma: Modalidade: Número de Créditos: 2 1 09/Mar
Organização do Núcleo Eucariótico
170984 2º Obrigatória · teóricos: 2
2 16/ Mar O cromossomo Eucariótico
· práticos: 0
Pré-Requisito(s): Co-Requisito(s): 3 23/ Mar Replicação, Transcrição e Tradução
Do átomo à célula
4 30/ Mar Ciclo celular: regulação e controle

2 – EMENTA
5 13/Abril Prova 1
Estudo do fluxo da informação genética nos sistemas biológicos. Compreensão do Mecanismo de
controle e regulação do Ciclo Celular e da divisão Celular: Mitose e Meiose; Concepção da genética
6 20/Abril Divisão celular: mitose e meiose
desde e os mecanismos mendelianos ao estudo da Teoria Cromossômica da Herança e dos
mecanismos moleculares de variabilidade genética.
7 27/Abril Envelhecimento e morte celular

3 – OBJETIVOS 8 04/Maio Anomalias cromossômicas Numéricas e Estruturais


Dar ao aluno bases sólidas para o conhecimento da genética em humanos, para serem capazes de
entender/reconhecer a importância do bom funcionamento orgânico ao nível macromolecular bem 9 11/Maio Introdução à Genética mendeliana
como para permitir que identifiquem/interpretem causas das doenças genéticas, com vistas a
promover uma intervenção esclarecida em saúde. 10 18/Maio Prova 2

11 25/Maio Herança não mendeliana


7- AVALIAÇÃO
A avaliação do conhecimento adquirido se dará por meio de 3 provas escritas (P) abrangendo 12 01/Jun Padrões de herança
conhecimentos adquiridos nas aulas, cuja média integrará 90% da média final na disciplina. Os 10%
restantes da média corresponderão à entrega e apresentação de seminário/trabalho. 13 08/Jun Genoma humano/ Ciências Ômicas (Seminários)
Excepcionalmente, para quem não puder comparecer a uma das provas por motivos de saúde
(atestado médico obrigatório) ou outros casos atendidos em lei, será realizada uma única prova 14 15/Jun Regulação expressão gênica em procariotos e eucariotos
substitutiva ao final de disciplina e em horário a combinar, versando sobre todo o conteúdo da
disciplina e que poderá tão somente preencher a lacuna de uma das provas faltantes. 15 22/Jun Epigenética

16 29/Jun Prova 3
PLANO DE ENSINO
1 – IDENTIFICAÇÃO Cronograma de Atividades
MODULO: SISTEMAS BIOLÓGICOS GV – 01-2020 Turma C e D
Professor: Débora Trichez
Disciplina: Do Gene à Vida Encontros DATA ATIVIDADES
Código da Semestre no
Apresentação da disciplina
Disciplina: Fluxograma: Modalidade: Número de Créditos: 2 1 11/Mar
Organização do Núcleo Eucariótico
170984 2º Obrigatória · teóricos: 2
2 18/Mar O cromossomo Eucariótico
· práticos: 0
Pré-Requisito(s): Co-Requisito(s): 3 25/Mar Replicação, Transcrição e Tradução
Do átomo à célula
4 01/Abril Ciclo celular: regulação e controle

2 – EMENTA
5 08/Abril Prova 1
Estudo do fluxo da informação genética nos sistemas biológicos. Compreensão do Mecanismo de
controle e regulação do Ciclo Celular e da divisão Celular: Mitose e Meiose; Concepção da genética
6 15/Abril Divisão celular: mitose e meiose
desde e os mecanismos mendelianos ao estudo da Teoria Cromossômica da Herança e dos
mecanismos moleculares de variabilidade genética.
7 22/Abril Envelhecimento e morte celular

3 – OBJETIVOS 8 29/Abril Anomalias cromossômicas Numéricas e Estruturais


Dar ao aluno bases sólidas para o conhecimento da genética em humanos, para serem capazes de
entender/reconhecer a importância do bom funcionamento orgânico ao nível macromolecular bem 9 06/Maio Introdução à Genética mendeliana
como para permitir que identifiquem/interpretem causas das doenças genéticas, com vistas a
promover uma intervenção esclarecida em saúde. 10 13/Maio Prova 2

11 20/Maio Herança não mendeliana


7- AVALIAÇÃO
A avaliação do conhecimento adquirido se dará por meio de 3 provas escritas (P) abrangendo 12 27/Maio Padrões de herança
conhecimentos adquiridos nas aulas, cuja média integrará 90% da média final na disciplina. Os 10%
restantes da média corresponderão à entrega e apresentação de seminário/trabalho. 13 03/Jun Genoma humano/Ciências Ômicas (Seminários)
Excepcionalmente, para quem não puder comparecer a uma das provas por motivos de saúde
(atestado médico obrigatório) ou outros casos atendidos em lei, será realizada uma única prova 14 10/Jun Regulação expressão gênica em procariotos e eucariotos
substitutiva ao final de disciplina e em horário a combinar, versando sobre todo o conteúdo da
disciplina e que poderá tão somente preencher a lacuna de uma das provas faltantes. 15 17/Jun Epigenética

16 24/Jun Prova 3
Núcleo eucariótico e
ácidos nucleicos
Qual é a importância do
compartimento nuclear?

Poros nucleares Cromossomos

Nucléolo

Envelope nuclear Cromatina


Funções do núcleo eucariótico
O núcleo é uma organela altamente
especializada que funciona como centro de
processamento e de administração da célula.
Possui duas funções principais:

• Armazenar o material hereditário


(DNA organizado em cromossomos)

• Coordenar as atividades celulares:


crescimento, metabolismo, síntese proteica
e reprodução (divisão celular)
Processos que ocorrem no núcleo

•Síntese de DNA (replicação);

•Síntese de RNA (transcrição);

•Processamento de RNA (splicing);

•Montagem das subunidades ribossomais.


Características do núcleo

• Envelope nuclear formado por duas


membranas concêntricas;

• Poros que regulam a passagem seletiva de


moléculas;

• Contém DNA, organizado em cromatina e


formando os cromossomos;

• Contém proteínas, que entre muitas


funções ajudam a manter os cromossomos;

• Compartimentos subnucleares com funções Cromatina


definidas.
A estrutura do núcleo é dinâmica!
• Depende da fase do ciclo celular

Figura 1.32 - Célula em


interfase (I), célula em
anáfase (A). Raiz de
cebola.

• Depende do tipo de célula


Figura 1.26 -
Neurônio do gânglio Figura 1.28 -
sensitivo. Núcleo Neutrófilo com
esférico, claro núcleo lobulado,
(eucromático), com heterocromático e
nucléolo com cromatina
proeminente. sexual.

Atlas biocel-UFRGS
Todas as células eucariontes contém
um núcleo?
Todas as células eucariontes contém
um núcleo?

• Em geral, as células eucariontes são mononucleadas


Todas as células eucariontes contém
um núcleo?

• Células anucleadas - ex: hemáceas


Todas as células eucariontes contém
um núcleo?

• Células multinucleadas - ex: Célula muscular estriada esquelética.


Quais são as
estruturas do núcleo?
Envelope nuclear
• Define o compartimento nuclear
• Duas membranas concêntricas e contínuas
• Membrana nuclear interna:
• Contém sítios de ligação para a lâmina nuclear (rede
de filamentos) e cromatina.

• Membrana nuclear externa:


• É contínua à membrana nuclear interna
• Apresenta ribossomos aderidos à face citoplasmática
→ envolvidos na síntese de proteínas (similar ao RE)
• Espaço perinuclear: espaço entre as membranas
interna e externa
• Membranas nucleares interna e externa e o
espaço perinuclear são contínuas à membrana e
o lúmen do retículo endoplasmático (RE)!
Lâmina nuclear
Proteína lamina - filamento intermediário

Funções:
- Suporte e estabilidade ao envelope nuclear
- Sítio de ancoragem da cromatina
Lâmina nuclear
Os filamentos intermediários da lâmina nuclear se dissociam e se reagrupam a cada
divisão celular.
- Fosforilação das laminas e das nucleoporinas por kinases
-> Desorganização das estruturas

- Desfosforilação -> reassociação das laminas.


• Cada um dos 46 cromossomos (em interfase) em uma célula humana
tende a ocupar seu próprio território dentro do núcleo; isto é, os
cromossomos não estão completamente emaranhados entre si
• Os cromossomos são intimamente associados à lâmina nuclear
Complexos do poro nuclear
Complexos do poro nuclear (NPCs, do inglês nuclear pore complexes)
• Perfuram o envelope nuclear
• É um complexo proteico composto por muitas proteínas diferentes, chamadas
nucleoporinas
• Controlam o tráfego de moléculas entre o núcleo e o citoplasma
• Pequenas moléculas solúveis (até 5 kDa): difusão livre e rápida
• Macromoléculas (grandes proteínas e RNAs): difusão lenta e controlada!
• Malha emaranhada de nucleoporinas desordenadas bloqueiam a difusão passiva de
macromoléculas grandes através do poro
Fluxo controlado de proteínas e RNAs através dos Complexos de Poro Nuclear
(transporte seletivo)
Histonas
RNA polimerase
DNA polimerase
Proteínas dos ribossomos
Reguladores de transcrição

mRNA
tRNA
rRNA (subunidades ribossomais)

Replicação do DNA e transcrição: sempre realizadas dentro do núcleo!

Tradução: sempre realizada no citoplasma!


Complexos do poro nuclear
• Importação controlada de proteínas citosólicas para o núcleo é mediada por
Importinas (proteína citosólicas solúveis)

• Exportação controlada de RNAs para o citoplasma é mediada por Exportinas

• Projeções proteicas do NPC (Fibras citosólicas e cesta nuclear)


Estão envolvidas no reconhecimento e
tráfego de macromoléculas.
As importinas se ligam à suas
proteínas-carga no citosol,
liberam-nas no núcleo e são
então exportadas de volta ao
citosol para serem reutilizadas,
enquanto as exportinas
funcionam de modo inverso

Importação e exportação envolve


gasto de energia! (hidrólise de
GTP)

As proteínas são transportadas na


forma enovelada através dos
NPCs! (diferente do que ocorre
na importação de proteínas para
o retículo endoplasmático,
situação em que passam na
forma desenovelada)
DNA: principal componente do núcleo,
é a molécula que abriga a informação genética
Características dos ácidos nucleicos
• DNA: Ácido desoxi-ribonucleico • RNA: Ácido ribonucleico
• Polímero de desoxiribonucleotídeos • Polímero de ribonucleotídeos
• Pentose: desoxi-ribose • Pentose: ribose
• Bases nitrogenadas: • Bases nitrogenadas:
• Purinas: A e G • Purinas: A e G
• Pirimidinas: C e T • Pirimidinas: C e U
• Fita dupla, antiparalelas • Fita simples

Nucleotídeos:
monômeros que compõem
o DNA e RNA
• BASES
NITROGENADAS

PURINAS

PIRIMIDINAS

(DNA) (RNA)
• PENTOSES (monossacarídeos de 5 carbonos)

ÁCIDO RIBONUCLÉICO – RNA


ÁCIDO DESOXIRRIBONUCLÉICO – DNA
• Ácidos nucleicos:
• POLÍMEROS DE Ligação fosfodiéster: ligação
NUCLEOTÍDEOS covalente entre o grupo fosfato
(acoplado ao carbono 5’) de um
nucleotídeo e o grupamento
hidroxila do carbono 3’ do açúcar de
outro nucleotídeo
Ligação
fosfodiéster
Esta ligação é muito forte e por esta
razão o DNA é notavelmente estável.
O DNA pode ser fervido e até
autoclavado sem degradar!

Que tipo de ligação ocorre


entre os nucleotídeos para
formar as cadeias?
• Ácidos nucleicos:
• POLÍMEROS DE 5’
NUCLEOTÍDEOS

Ligação
fosfodiéster
3’

Os ácidos nucleicos são polarizados,


ou seja, as extremidades das cadeias
de DNA ou RNA não são as mesmas.
Uma extremidade da cadeia possui
um carbono 5’ (ligado ao um grupo
fosfato) e a outra um carbono 3’ livre
DNA As bases nitrogenadas não se pareiam ao
• Fitas antiparalelas, complementares acaso! (A=T; G=C)

• Dupla hélice Purina Pirimidina


• Ligações de hidrogênio mantém as
fitas unidas
Na dupla-hélice de DNA, os esqueletos de pentose-fosfato
(hidrofílicos) ficam expostos ao solvente (água) e as bases

DNA nitrogenadas (hidrofóbicas) ficam “enterradas” no interior da dupla-


hélice com menor contato com a água

• PAREAMENTO DE
BASES
As bases nitrogenadas estão mais
PORÇÃO PARA INTERAÇÃO COM
expostas ao solvente no sulco maior PROTEÍNAS
da dupla-hélice

Dupla hélice:
orientação à direita,
completando uma
volta a cada 10
pares de base.
Sobre o pareamento complementar do DNA fita dupla...

1. Regras de Chargaff (estudos de Erwin Chargaff)


- DNA consiste de 50% purinas e 50% pirimidinas

- Quantidade de A = Quantidade de T
Quantidade de G = Quantidade de C

- % GC varia de uma espécie para outra


• Sequência de bases nitrogenadas varia de uma espécie para
outra
Sobre o modelo de dupla hélice do DNA...

2. X-ray diffraction studies - Rosalind Franklin & Maurice Wilkins

Conclusão – O DNA é uma estrutura helicoidal


regularidades distintas, 0.34 nm & 3.4 nm.
Sobre o modelo de dupla hélice do DNA...
3. A estrutura do DNA – James Watson & Francis Crick
Modelo Dupla Hélice do DNA : Seis características principais

1. Duas cadeias polinucleotídicas arranjadas em dupla-hélice no sentido horário.

2. As cadeias nucleotídicas são anti-paralelas

3. As “espinhas dorsais” pentose-fosfato estão por fora da dupla hélice, e as bases nitrogenadas
orientadas para dentro do eixo central.

4. Os pares de base complementares das fitas opostas são mantidas unidas por pontes de
hidrogênio.

A pareia com T (2 ligações-H), e G pareia com C (3 ligações-H).


ex., 5’-TATTCCGA-3’
3’-ATAAGGCT-5’

5. Os pares de base distam 0.34 nm. Uma volta completa da hélice requer 3.4 nm (10
bases/volta).

6. As “espinhas dorsais” pentose-fosfato não estão igualmente espaçadas, resultando em sulcos


maior e menor
Prêmio Nobel de Medicina
ou Fisiologia

James D. Francis H. Maurice H. F.


Watson Crick Wilkins

E quanto a?
Rosalind Franklin
RNA
• É UMA FITA SIMPLES!
Existem vários tipos de
RNA nas células
eucarióticas

Todos fita simples

Podem apresentar
estrutura secundária
(dobramentos e
pareamentos internos)
3 tipos principais de RNA
• RNA ribossômico
• Compõe os ribossomos (ribonucleoproteínas)
• RNA transportador
• Transporta aminoácidos até os ribossomos
• Fazem a “leitura” de um código (sequência de nucleotídeos) e o
“traduz” para outro (sequência de aminoácidos)
• RNA mensageiro
• Atua como intermediário entre a informação genética contida
no DNA e a sequência de aminoácidos de uma proteína
Problema:

O genoma humano (3.4 Gb divididos em 46 cromossomos lineares) pode chegar a 2.3 metros se esticado
linearmente! O núcleo tem somente cerca de 6 mm de diâmetro.

Soluções:

A complexa tarefa de compactar o DNA é realizada por proteínas especializadas que se ligam ao DNA e fazem
seu enovelamento, gerando uma série de espirais e alças ordenadas com níveis crescentes de organização e
evitam que o DNA se torne um emaranhado desordenado.

Cada cromossomo em uma célula eucariótica consiste em uma única e enorme molécula de DNA linear
juntamente com proteínas (Histonas) que enovelam e empacotam a fina fita de DNA em uma estrutura mais
compacta.

Além das proteínas envolvidas na compactação, os cromossomos estão associados a várias outras proteínas e
a diversas moléculas de RNA.

Cromatina: DNA + proteínas + RNA


Em quantidades aprox. iguais Componente minoritário
Proteínas são responsáveis pela compactação do DNA!
DNA + PROTEÍNAS = CROMATINA
Empacotamento do DNA dentro dos cromossomos:

Voltas de DNA ao redor das


Nível 1 histonas para criar a estrutura do
nucleossomo.

Nucleossomos
conectados por fio
Nível 2 de DNA como colar
de contas (beads on
a string).

Empacotamento dos
Nível 3 nucleossomos numa fibra
cromatínica de 30-nm.

Formação das
Nível 4
alças de DNA.
Histonas
Proteínas cerne do nucleossomo

• Nucleossomo: primeiro nível de compactação


• Histonas : aminoácidos positivamente carregados (lisina e arginina)

Cromatina - nível “Colar de pérolas”


Histona H1
Mantém os nucleossomos
unidos na fibra de 30 nm
• Eucromatina
• Heterocromatina
• Heterocromatina: região de cromatina mais
compactada, onde os genes não estão sendo
transcritos (quiescentes).
Heterocromatina constitutiva
DNA altamente repetitivo não-codificante (centrômeros e
telômeros); Repetições em tandem; Permanece condensada
durante todo o ciclo celular; Geralmente não apresenta
genes.
Heterocromatina facultativa
Região que contém genes, mas na forma inativa;
Condensação da cromatina impede acesso das enzimas de
transcrição aos genes; Heterocromatina reprime expressão
gênica; Aparece em apenas um cromossomo do par
homólogo (ex: cromossomo X em mulheres).

• Eucromatina: região mais relaxada, contém


genes que estão sendo expressos.
- DNA menos densamente empacotado;
- Maioria dos genes estão na eucromatina.
Exemplo de heterocromatina facultativa
Cromossomo X – Corpúsculo de Barr
Nucléolo
• Região no núcleo com coloração mais densa
(quando visualizado por técnicas de microscopia);

• Não é delimitado por membrana;

• Sede da síntese de rRNA e montagem das


subunidades ribossomais;

• Genes transcritos pela pol I;

• Os rRNAs são agrupados com proteínas


ribossomais para formar as subunidades maior e
menor.
• O genoma contém inúmeras cópias dos genes que
codificam RNA ribossômico, distribuído em 10 Cromossomos fazendo “loop”, resultando no
cromossomos diferentes, mas eles normalmente agrupamento de genes que codificam rRNA em uma
apresentam-se juntos em um único nucléolo mesma região do núcleo (o nucléolo)

• Os trechos dos cromossomos que contém os


genes que codificam rRNA são chamados de
Regiões Organizadoras de Nucléolo (RONs)

• Esses dez cromossomos contribuem com alças de


DNA (contendo os genes rRNA) para o nucléolo

• O nucléolo é uma região onde os genes que


codificam para o rRNA (RONs), em diferentes
cromossomos, se concentram
Nucléolo
Envelope nuclear
• Região de intensa síntese de rRNA e de montagem
de ribossomos
Em Procariotos:
Problema:

O genoma de E. coli (4.6 Mb, correspondente a um


cromossomo circular), quando medido linearmente, pode
chegar a 1.000 vezes o tamanho da célula de E. coli.

Solução
A dupla hélice de DNA enrola-se sobre o seu
Super-helicoidização próprio eixo, num processo controlado por
enzimas (Topoisomerases)
REVISÃO
Q01. Quais estruturas compõem o núcleo?

Q02. Uma determinada espécie apresenta 30% de adenina do total de bases


do seu genoma. Qual a proporção relativa estimada de guanina, timina e
citosina está presente nesta amostra de DNA?

Q03. Dada a sequência de DNA: 5´AAT GCG ATC GAC 3´, pergunta-se: Qual é a
sequência de bases da fita complementar?

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