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DIRECCIN GENERAL ACADMICA MODALIDAD PRESENCIAL PLAN DOCENTE DE MATERIA A.

DATOS BSICOS DEL PROFESOR

Nombres y Apellido del tutor: Mara Lorena Riofro Guamn Correo electrnico: mlriofrio@utpl.edu.ec CITTES / Departamento: Centro de Biologa Celular y Molecular Telfono: 2570275 Extensin: 2905-2520 Horario de tutora personalizada: Martes Mircoles 17h30-18h30 B. DATOS BSICOS DE LA MATERIA

rea Acadmica: Biolgica Escuela: Biologa Nombre de la Materia: Tcnicas Moleculaes Semestre en el que se imparte: Sexto Periodo: Abril-Agosto 2010 Tipo de materia: Troncal de Carrera Nmero de crditos UTPL - ECTS: 4 crditos Da y horario de clases presenciales: Martes 15-17h30 Nro. de Aula: Conocimientos previos recomendados: El profesional en formacin debe tener conocimientos previos de Biologa Celuar y Molecular 1 y 2, Qumica Orgnica e Inorgnica, Gentica 1 y 2 y Bioqumica. C. COMPETENCIAS A DESARROLLAR (expresados como resultados de aprendizaje) Competencias especficas de la materia Aplicar los conocimientos terico-prcticos en tcnicas moleculares para la solucin de problemas biolgicos. Conocer metodologas para la extraccin, cuantificacin, caracterizacin y medicin de biomolculas. Conocer los principales marcadores moleculres y estar en capacidad de aplicarlos a estudios de diversidad y diagnstico molecular. Estar en capacidad de manipular material gentico y biomolculas en general. Capacidad de utilizar de forma segura los materiales y reactivos de laboratorio considerando sus caractersticas fsicas y qumicas y los posibles riegos asociados. Aplicar diferentes tcnicas y metodologas de la gentica moderna, tiles en el planteameinto de preguntas de biologa evolutiva y desarrollo de proyectos investigativos encamindados a contestarlos. Competencias especficas de la Carrera 1. Capacidad para reconocer y analizar problemas y planificar estrategias para su solucin. 2. Capacidad de obtener informacin (bsquedas bibliogrficas), incluyendo el manejo de recursos informticos (internet), procesadores de texto, bases de datos, etc. 3. Capacidad de interpretar y discutir informacin, evaluando su significancia y relacionndolos con las teoras apropiadas 4. Conocimiento de las fronteras actuales de la investigacin y desarrollo en biologa, ecologa, biotecnologa y gestin ambiental

5. Habilidad para la presentacin de informacin cientfica ante diferentes audiencias tanto en forma oral como escrita. 6. Capacidad para comprender y aplicar conceptos, principios y teoras fundamentales de biologa, ecologa, biologa molecular, biotecnologa y gestin ambiental. 7. Capacidad para la planificacin, el diseo y la ejecucin de proyectos de investigacin. 8. Habilidad para desarrollar, utilizar y aplicar tcnicas de biologa, ecologa, biologa molecular, biotecnologa y gestin ambiental. 9. Manejo de estadstica y de tcnicas actualizadas de la informtica para el anlisis de datos 10. Conocimiento del ingls para bsqueda, anlisis, aplicacin y transferencia de informacin cientfica y tcnica. 11. Conocimiento particular de un campo especfico de la biologa, ecologa, biotecnologa o de la gestin ambiental. 12. Habilidad para participar en equipos de trabajo inter y transdisciplinares. 13. Conocimiento de otras disciplinas cientficas que permitan la comprensin de la biologa, el manejo y conservacin de los recursos naturales 14. Dominio de las Buenas Prcticas de campo y laboratorio. 15. Capacidad para plantear y ejecutar programas de conservacin 16. Capacidad de reconocer e identificar la biodiversidad local 17. Conocimiento, comprensin y habilidad para aplicar las herramientas de gestin ambiental 18. Aplicar la filosofa del desarrollo sustentable. Competencias genricas de la UTPL 1. Vivencia de los valores universales del Humanismo Cristiano 2. Capacidad de abstraccin, anlisis y sntesis 3. Capacidad de aplicar los conocimientos en la prctica 4. Conocimiento sobre el rea de estudio y la profesin 5. Capacidad de comunicacin oral y escrita 6. Capacidad de investigacin 7. Habilidades para buscar, procesar y analizar informaciones procedentes de fuentes diversas 8. Capacidad de aprender a aprender como poltica de formacin continua 9. Capacidad crtica y autocrtica 10. Capacidad para identificar, plantear y resolver problemas 11. Capacidad creativa e innovadora 12. Capacidad para organizar y planificar el tiempo 13. Capacidad de adaptacin al cambio 14. Capacidad para tomar decisiones 15. Capacidad de trabajo en equipo 16. Habilidades interpersonales 17. Capacidad de motivar y conducir hacia metas comunes 18. Habilidad para trabajar en forma autnoma 19. Capacidad para formular, disear y gestionar proyectos 20. Compromiso con la calidad 21. Capacidad de comunicacin en el segundo idioma 22. Habilidades en el uso de las tecnologas TICS 23. Habilidad para trabajar en contextos internacionales 24. Responsabilidad social y compromiso ciudadano 25. Compromiso con la preservacin del medio ambiente 26. Capacidad para conocer, valorar y fortalecer la identidad nacional 27. Valoracin y respeto por la diversidad y multiculturalidad 28. Compromiso tico 29. Capacidad de emprendimiento 30. Motivacin del logro D. CONTENIDOS Y PLANIFICACIN GENERAL DE LA MATERIA

PRIMER BIMESTRE
ACTIVIDADES PRESENCIALES CAPTULO CONTENIDOS
SEMANA

(con profesor) Actividad


Nro. de horas

CAPITULO 1 TIPOS DE ADN.

Contenido 1.1 Estructura del ADN Contenido 1.2 ADN nuclear Contenido 1.3 ADN mitocondrial Contenido 1.3 ADN cloroplstico Contenido 1.1 Revisin soluciones molares, normales, Contenido 1.2 Regulacin de pH Contenido 1.3 Manejo de materiales y equipos de un laboratorio de molecular. Contenido 1.4 Como hacer un reporte de laboratorio y como colectar datos Contenido 3.1 Planteamiento de preguntas de investigacin. Contenido 3.2 Cules son las tcnicas que nos ayudarn a responder las interrogantes

Clase magistral Semana 1

ACTIVIDADES EXTRACLASE Nro. Fecha de de Actividad horas entrega Lectura previa del 3 tema Tarea complementaria: Investigar sobre las obras de Bryan Sykes Lectua previa del tema Tarea complementaria: busqueda bibliografica, bioseguridad en un laboratorio de molecular Lectua previa del tema Tarea complementaria: busqueda bibliografica sobre nuevas tcnicas moleculares para identificacin de especies Lectua previa del tema

Discusin participativa

0.5

5- Abril2011

Clase magistral

1.5

CAPITULO 2 SOLUCIONES. REPORTES DE LABORATORIO

Semana 2 Laboratorio 1

5-abril2011

Clase magistral CAPITULO 3 Proyectos de investigacin que involucran tcnicas moleculares

Semana 3 Foro 1.5

2.5

18-abril2011

Clase magistral

3.5

CAPITULO 4 PROTEINAS

Contenido 4.1 SDS-PAGE principio, metodologa, utilizacin. Contenido 4.2 Isoenzimas Aloenzimas, principio, metodologa, utilizacin Contenido 4.3 Deteccin de enzimas en geles electroforticos.

Semana 4

Discucin participativa Exposicin: PROTEOMICA, bases, aplicacin, 1.5 metodologa (requerimientos mnimos en equipos)

Busqueda bibliogrfica

2.5

12-abril2011

Lectura previa del tema Semana 5 Laboratorio 2.5 Tarea complementaria: revisin de un artculo cientfico Lectura previa del

3 3

CAPITULO 5

Contenido 5.1 Mtodos de

Semana

Laboratorio

2.5

extraccin de ADN Contenido 5.2 Preparacion de geles Contenido 5.3 Electroforesis EXTRACCION DE y tincin ADN Contenido 5.4. Mtodos CONCENTRACION y para determinar la CUANTIFICACION DE concentracin de ADN ADN Contenido 5.5. Mtodos para cuantificar el ADN Contenido 5.6. Cuaderno de laboratorio Contenido 6.1. Una introduccin a la PCR Contenido 6.2. Principios bsicos, como trabaja la PCR. Contenido 6.3. Aplicaciones

tema 6 y Discusin participativa Semana 7 2.5 2.5 Tarea complementaria: Buscar un artculo sobre metodologas actuales para extraer ADN de plantas, bacterias y animales Revisin artculo Lectura previa del tema

3 26-bril2011

Clase magistral Semana 8

1.5

CAPITULO 6 PCR

Discusin participativa Exposicin: PCR1 Tiempo Real, bases teoricas, aplicaciones

Bsqueda bibliogrfica

2.5

3-mayo2011

Fechas importantes (actividades acadmicas): Los informes escritos de las exposiciones deben ser entregados el da mismo de la exposicin oral en formato de artculo cientfico. SEGUNDO BIMESTRE
ACTIVIDADES PRESENCIALES CAPTULO CONTENIDOS
SEMANA

(con profesor) Actividad


Nro. de horas

ACTIVIDADES EXTRACLASE Nro. Fecha de de Actividad horas entrega Lectura previa del tema Revisin de un artculo cientfico Tarea complementaria: Desarrollo de ejercicios Lectura previa del tema Tarea complementaria: Buscar artclo cientfico sobre genetica de poblaciones de 1 especie animal y 1 especie vegetal donde empleen microsatlites en sudamrica 4

CAPITULO 7 MARCADORES MOLECULARES DOMINANTES (ISSRAFLPS-RAPDS)

Contenido 7.1 ISSRs, principio, mtodologa, utilizacin. Contenido 7.2 AFLPs, principio, mtodologa, utilizacin. Contenido 7.3 RAPDs, principio, mtodologa, utilizacin.

Clase magistral Semana 1 Discusin participativa

1.5

3 25mayo2011

Laboratorio: Semana Amplificacin de 2 ADN, tincin, interpretacin Clase magistral

2.5

CAPITULO 8 MARCADORES CODOMINTANTES: PCR-RFLPS, Microsatlites

Contenido 8.1 PCRRFLPs, principio, mtodologa, utilizacin. Contenido 8.2. Microsatlites, principio, mtodologa, utilizacin.

Semana 3 Laboratorio: Revisin 0.5 de electroferogramas

2.5

31mayo2011

Clase magistral Contenido 9.1 Secuenciacin, principio, mtodologa, utilizacin. Contenido 9.2. Anlisis filogentico

Lectura previa del tema Tarea complementaria: Buscar un artculo sobre la evolucin de la especie humana (donde se haya usado la anlisis filogentico) Lectura previa del tema Tarea complementaria: revisin de las herramientas infomticas para anlisis de secuencias Lectura previa del tema Tarea complementaria: revisin de un artculo cientfico Bsqueda bibliogrfica Lectura previa del tema

CAPITULO 9 SECUENCIACION

Semana 4 Laboratorio: Revisin 1.5 de secuencias

2.5

7 junio2011

Clase magistral Contenido 10.1 DNA BArcoding principio, mtodologa, utilizacin. Contenido 10.2. Anlisis de secuencias

CAPITULO 10 DNA BARCODING

Discusin parcipativa Exposicin: Proyecto Semana DNABarcoding for 5 life: qu s? quines 1.5 participan?cul es el objetivo?que metodologas emplean? 2

2.5

21-junio2011

Contenido 11.1 Clase magistral Microarrays, principio, Semana mtodologa, utilizacin. CAPITULO 11 6 Contenido 11.2 . Western MICROARRAYS Discusin bottling, principio, WESTERN BLOTLINGparticipativa mtodologa, utilizacin. SNPS Contenido 11.3 . SNPS, Laboratorio: principio, mtodologa, Semana Polimorfismos en utilizacin. 7 poblaciones humanas (SNPs) Clase magistral Discucin Participativa Exposicin: Alimentos Semana transgnicos: 8 qu sn? cmo se crean?ventajasdesventajas? cules son las metodologas utilizadas para crearlos? Subtotal

0.5

2.5

CAPITULO 12 TRANSFORMACIN GENTICA Avances

Contenido 12.1 . Principio, mtodologa, utilizacin. Contenido 12.2 Prctica de laboratorio

1.5

Tarea complementaria:B squeda bibliogrfica sobre las investigaciones que se efectuen en Ecuador empleando herramientas moleculares

2.5

19-julio2011

40 hora s TOTAL 128 HORAS

88 horas

Fechas importantes (actividades acadmicas): Los informes escritos de las exposiciones deben ser entregados el da mismo de la exposicin oral en formato de artculo cientfico.

E.

EVALUACIN DE LA MATERIA

PRIMER BIMESTRE Y SEGUNDO BIMESTRE: ACTIVIDAD Prcticas de laboratorio CRITERIOS Asistencia al laboratorio Resultados obtenidos en el desarrollo de la prctica INSTRUMENTO Informe de laboratorio Peso 20% Puntos 4

Dominio de los conocimientos tericos de la materia y Ejercicios de la materia Evaluacin aplicacin en la resolucin de problemas Presentacin de la investigacin solicitada (artculos, informes impresos)

40%

Investigacin: Bsquedas bibliogrficas

20%

Realizacin trabajos

Exposicin En el trabajo se analizar: Presentacin del informe - Estructura escrito y exposicin oral - Bibliografa - Calidad de la documentacin -Ortografa y presentacin TOTAL 20% 4

100%

20 puntos

F.

RECUPERACIN Las actividades de recuperacin (antes supletorios) debern desarrollarse de acuerdo a las fechas establecidas en el calendario acadmico ACTIVIDAD A RECUPERAR Primer Bimestre Segundo Bimestre Ejercicios de la materia Ejercicios de la materia INSTRUMENTO Evaluacin Evaluacin Puntos 8 8

G.

RECURSOS A UTILIZAR PARA EL DESARROLLO DE LA MATERIA: Bibliografa Bsica Sambrook J., Russell D. 2001. Molecular Cloning A laboratory manual. Vol 1-3. Cold Spring Harbor Laboratory Press. Manchenko G. 2003. Handbook of detection of enzymes on electrophoresis gels. Second edition. CRC Press. Walker J. 2002. Protein Protocols Handbook. Second Edition. Humana Press. Westermeier R. 2001. Electrophoresis in Practice. Third Edition. Wiley-VCH. McPherson M., Moller S. 2000. PCR The Basics. BIOS Scientific Publisher. Ream W., Field K. 1999. Molecular biology Techniques. Academic Press.

Bibliografa Complementaria

Sitios web

Alberts Alberts B., Johnson A., Lewis J., Raff M., Roberts K., Walter P. 2004. th Molecular Biology of the Cell Garland Pub; ISBN 0815332181; 4 edition Cooper G. 2000. Coopers La clula. Marban ediciones. Segunda edicin. Lewin Benjamin. 2001. Genes VII. ISBN: 84-7101-341-X. Primera Edicin. Marban Ediciones Nelson D, Cox M (2000) Lenhinger principles of biochemistry. Tercera edicin. Worth Publishers.

http://www.cellbio.com/protocols.html Buscadores para artculos cientficos: www.journals.uchicago.edu www.blackwell-synergy.com www.utpl.edu.ec/biblioteca www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/ www.scirus.com Conceptos y actividades relacionadas: www.whfreeman.com/lodish4e www.wikipedia.org http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?call=bv.View..ShowTOC&rid=mboc4.TOC&depth=10 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=cooper.TOC&depth=2 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=mcb.TOC Libros online: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=books

Firma: Blga. Lorena Riofro

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