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Historia:
CAPITULO 6
Biochemistry 6th Edition Campbell and Farrell
1700: estudios de la digestin de carnes mediante secreciones del estmago. 1800: convertir almidn en azcar mediante la saliva. 1810: comienzan estudios sobre fermentacin. 1850: Louis Pasteur concluy estudios sobre fermentacin de azcares en alcoholes por levadura y catalizado por fermentos.
INTRODUCCION
Clasificacin enzimtica
Historia:
1897: Buchner descubri que los extractos de levadura podan convertir el azcar en alcohol. Fermentacin se llevaba a cabo por la presencia de molculas. Khne llam las molculas enzimas. 1926: ureasa fue aislada y cristalizada. 1930: pepsina, tripsina, y otras enzimas digestivas fueron cristalizadas.
1. Oxidoreductasas: transferencia de electrones 2. Transferasas: transferencia de grupos 3. Hidrolasas: reacciones de hidrlisis 4. Liasas: adicin de grupos a dobles enlaces 5. Isomerasas: transferencia de grupos en la molcula 6. Ligasas: formacin de enlaces
Clasificacin enzimtica
AGENTES CATALITICOS
Primer #: tipo de reaccin catalizada. Segundo #: indica la subclase; dice el tipo de sustrato o el enlace que se rompe en forma mas precisa. Tercer #: indica la sub-subclase; nos dice el tipo de aceptador de electrones (oxidoreductasas) o el tipo de grupo que se remueve (liasas), etc. Cuarto #: indica el nmero de serie de la enzima en su sub-subclase.
Cambian la velocidad de una reaccin qumica. Aceleran la reaccin en ambas direcciones disminuyendo la energa de activacin. Funcionan en reacciones que pueden ocurrir sin su presencia (exergnica). Permanecen inalterados al final de la reaccin.
CATALISIS ENZIMATICA
Funcin ms importante de las protenas. Todas las enzimas son protenas globulares excepto las riboenzimas. Aumentan la velocidad de una reaccin hasta por un factor de 1020 . Son altamente especficas. La accin enzimtica es regulada.
G = H - TS
Energa de activacin: cantidad de energa necesaria para convertir todas las molculas de un mol de sustancia reaccionando de su estado raso a su estado de transicin.
Las enzimas aumentan la velocidad de la reaccin disminuyendo la energa de activacin, pero no afectan los aspectos termodinmicos de las reacciones.
Catlisis enzimtica
Figura 6.1
La velocidad de una reaccin depende de la energa de activacin. La diferencia en energa entre el estado inicial y el estado final es dada por: G = RT l n K
eq
La termodinmica se refiere a la espontaneidad de una reaccin. Mientras que la cintica nos dice cun rpido ocurre la reaccin. Una reaccin espontnea no es una reaccin instantnea.
H2 O2
H2 O +
O2
Efecto de la temperatura
La temperatura puede afectar la velocidad de una reaccin.
Orden de reaccin
La velocidad de una reaccin se mide por la velocidad de aparicin de los productos o por la velocidad de desaparicin de los reactivos.
A + B P
= [P] t
Describe la velocidad de la reaccin en trminos de la concentracin del reactivo o los reactivos. Se determina experimentalmente.
Primer orden
Velocidad = k [A] Depende de la concentracin de un solo reactivo. Velocidad = k [A][B] Depende de la concentracin de ambos reactivos. Velocidad = k La velocidad no depende de la concentracin.
Segundo orden
Cero orden
La especificidad enzimtica puede variar. Pasos que ocurren durante la accin enzimtica:
Sustrato se enlaza a la enzima. Ocurren alteraciones qumicas que incluyen rompimiento y formacin de enlaces. La enzima libera el producto de la reaccin.
S es el sustrato: reactivo Centro activo: donde se enlaza el sustrato por interacciones no covalentes.
Llave y cerradura: especfica; un sustrato y una enzima. Adaptacin inducida: menos especfica, el centro activo se ajusta al sustrato que interviene.
E + S
ES enzyme-substrate compl ex
6.6 Michaelis-Menten
Velocidad de formacin = Velocidad de desaparicin El modelo de Michaelis-Menten presenta la formacin del complejo enzima-sustrato. La concentracin del complejo es baja, pero permanece constante durante la reaccin. El sustrato se convierte en producto. E+S ES E + P
Ecuacin Michaelis-Menten
+ k 2[ES]
Steady state:
Sustituyendo la concentracin de enzima libre y todas las constantes de velocidad se obtiene el valor de Km (Constante de Michaelis).
([E]T - [ES]) [S] [ES] = k-1 + k2 k1 = KM
[E]T [S] - [ES][S] = KM [ES] [E]T [S] - [ES][S] = KM [ES] [E]T [S] = [ES](K M + [S])
Ecuacin Michaelis-Menten
Cuando [S] = Km
= Vmax [S] [S] + [S] = Vmax 2
Vinit =
Mi chaelis-Menten equati on
Ecuacion de Lineweaver-Burk
V= Vmax [S] KM + [S] (an equati on for a hyperbola)
Ecuacin Michaelis-Menten
KM es igual a la concentracin de sustrato cuando 50% de los centros activos de la enzima estn ocupados. Tambin representa cun fuerte la enzima se enlaza al sustrato. VMAX est relacionado con el turnover number Es muy difcil determinar Vmax experimentalmente.
1 V 1 V
KM Vmax [S]
1 Vmax
1 [S] x + + 1 Vmax b
KM Vmax m
Turnover number
Constante cataltica equivale al turnover number. Kcat = turnover number: numero de moles de sustrato que reaccionan para formar un producto por mole de enzima por unidad de tiempo. La razn de kcat/Km representa una medida de la eficiencia cataltica.
Inhibidores
Reversibles
Competitivo: Compite con el sustrato por el centro activo. Se parecen al sustrato. No competitivo: el inhibidor no compite con el sustrato. Inhibidor tiene un punto diferente de enlace. Puede enlazar la E o el complejo ES. E + I EI + S EIS o E + S ES + I EIS De incompetencia: el inhibidor se enlaza directamente al complejo enzima-sustrato y no a la enzima libre. E + S ES + I ---> EIS (no reaccin). Inhibicin mixta: similar al no competitivo. El enlace del inhibidor no afecta el enlace del sustrato.
Inhibidor competitivo
EI
E + S
ES
Inhibidor no-competitivo
+S -S +I EI +S -S -I +I
E -I
ES
E + P
ESI
Inhibidor de incompetencia
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Inhibidores mixtos
Presencia de inhibidores
Similares a inhibidores no competitivos pero enlazar el inhibidor afecta el enlace del S y vice-versa.
Inhibidores
Irreversibles: se combina con o destruye un grupo funcional necesario para la actividad enzimtica. Se forma un enlace covalente.
Ejemplo: Inhibidores de acetilcolinesterasa. Interfiere con la secuencia del impulso nervioso. Diisopropylphosphofluoridate, tabun y sarin (nerve gases) Parathion and malathion
Ejemplo:
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