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Microbiologia do Solo

Introduo
Solo: maior reservatrio de microrganismos do planeta
direta ou indiretamente recebe todos os dejetos dos seres vivos local de transformao da matria orgnica em substncias nutritivas

com grande abundncia e diversidade de microrganismos


1 hectare de solo pode conter at 4 tons de microrganismos

Definio: Em agricultura e geologia, solo a camada que recobre as rochas, sendo constitudo de propores e tipos variveis de minerais de hmus

Solos minerais Solos orgnicos

Perfil do solo
Centenas de anos

O solo como hbitat microbiano

Principais fatores que afetam a atividade: - Umidade - Status nutricional

Rizosfera
Regio onde o solo e as razes das plantas entram em contato

O efeito rizosfrico

Constituintes do solo
Minerais:
slica (SiO2), Fe, Al, Ca,Mg, K P, S, Mn, Na, N ...

Matria orgnica: origem vegetal, animal e microbiana


insolvel (hmus): melhora a estrutura, libera nutrientes efeito tampo, reteno de gua

solvel: produtos da degradao de polmeros complexos:


Acares, fenis, aminocidos

Constituintes do solo
gua
livre: poros do solo adsorvida: ligada aos colides (argilas)

Gases:
CO2, O2, N2 ...
composio varivel em funo dos processos biolgicos

Constituintes do solo
Sistemas biolgicos:
plantas animais Microrganismos: grande diversidade e abundncia
Dependendo de: nutrientes umidade aerao temperatura pH interaes

Presena de microrganismos nas vrias profundidades do solo


Profundidade (cm) Umidade (%) Mat. orgnica (%) Bactrias (x 106)/g aerbias 24 anaerbias 2,7 Fungos (m/g)

0-8

18,2

4,4

280

8- 20
20-40 40-60

10,0
11,5 13,5

1,5
0,5 0,6

3,1
1,9 0,9

0,4
0,4 0,04

43
0 0

60-80
80-100

7,9
5,3

0,4
0,4

0,7
0,15

0,03
0,01

0
0

Fonte: Lindegreen & Jensen, 1973

A microbiota do solo
Bactrias:
grupo mais numeroso e mais diversificado

3 x 106 a 5 x 108 por g de solo seco


limitaes impostas pelas discrepncias entre tcnicas heterotrficos so mais facilmente detectados Gneros mais freqentes:
Bacillus, Clostridium, Arthrobacter, Pseudomonas, Nocardia, Streptomyces, Micromonospora, Rizbios Cianobactrias: pioneiras, fixao de N2

Streptomyces

A microbiota do solo
Fungos:
5 x 103 - 9 x 105 por g de solo seco limitados superfcie do solo favorecidos em solos cidos ativos decompositores de tecidos vegetais melhoram a estrutura fsica do solo

Gneros mais freqentes:


Penicillium, Mucor, Rhizopus, Fusarium, Aspergillus, Trichoderma

A microbiota do solo
Algas
103 - 5 x 105 por g de solo seco
abundantes na superfcie acumulao de matria orgnica: solos nus, erodidos

Protozorios e vrus
- equilbrio das populaes - predadores de bactrias - parasitas de bactrias, fungos, plantas, ...

Microrganismos e os ciclos da matria


Terra: quantidade praticamente constante de matria
Mudanas no estado qumico produzindo uma grande diversidade de compostos. Ciclo carbono Ciclo nitrognio Ciclo do enxofre Ciclo do ferro

O ciclo do carbono

Principais reservatrios de carbono na Terra Reservatrio Oceanos Rochas e sedimentos Biosfera terrestre Biosfera aqutica Combustveis fsseis Hidratos de metano Carbono (gigatons) 38 x 103 (>95% C inorgnico) 75 x 106 (>80% C inorgnico) 2 x 103 1-2 4,2 x 103 104 % total de carbono na Terra 0,05 > 99,5 0,003 0,000002 0,006 0,014

Transformaes bioqumicas do carbono


O mecanismo mais rpido de transferncia global do carbono ocorre pelo CO2

Fixao do CO2
CO2 + 4H

(CH2O) + H2O

Plantas bactrias verdes e prpuras fotossintetizantes algas cianobactrias bactrias quimiolitrficas algumas bactrias heterotrficas: CH3COCOOH + CO2 HOOCCH2COCOOH cido pirvico cido oxaloactico

Transformaes bioqumicas do carbono


Degradao de substncias orgnicas complexas
celulose (40-50% dos tecidos vegetais) hemiceluloses (10-30% dos tecidos vegetais) lignina (20-30%)

Celulose
celulases Celobiose -glicosidase

celobiose (n molculas)

2 glicose

Glicose + 6O2

6CO2 + 6H2O

Transformaes bioqumicas do nitrognio


O N encontrado em vrios estados de oxidao (-3 a +5) O nitrognio gasoso corresponde a forma mais estvel, assim a atmosfera o maior reservatrio (contrrio do carbono)

- A alta energia para quebra de N2 indica que o processo demanda energia. -Relativamente, um nmero pequeno de microrganismos capaz disso - Em diversos ambientes, a produtividade limitada pelo suprimento de N. - Importncia ecolgica e econmica envolvida na fixao

Transformaes bioqumicas do nitrognio


Fixao do nitrognio atmosfrico N2 NH3
aminocidos

Fixao simbitica: 60-600 Kg/ha.ano 90% pelas leguminosas Economia em fertilizantes nitrogenados Associaes simbiticas fixadoras: Anabaena - Azolla Frankia - Alnus Rizbios - Leguminosas

Transformaes bioqumicas do nitrognio


Rizbios - Leguminosas
etapas da formao de um ndulo: reconhecimento: lectinas (protenas de adeso de membrana celular da bactria e do vega disseminao: citocininas clulas tetraplides formao dos bacterides nas clulas Leghemoglobina (produo pra proteger a nitrogenase) maturidade: fixao do nitrognio senescncia do ndulo: deteriorao

Associao simbitica rizbios-leguminosas

Associao simbitica rizbios-leguminosas

Reduo de acetileno: medida da capacidade fixadora

Transformaes bioqumicas do nitrognio


Protelise:

Protenas Peptdeos Aminocidos

Amonificao (desaminao por desaminases)


desaminase

CH3-CHNH2-COOH + O2 CH3-CO-COOH + NH3 alanina c. pirvico amnia A amnia rapidamente reciclada, mas uma parte volatiliza

Transformaes bioqumicas do nitrognio


Nitrificao: - produo de nitrato
- Solos bem drenados e pH neutro (nitrificao gera cidos, se o solo est cido, ela fica dificultada)
Embora seja rapidamente utilizado pelas plantas, tambm pode ser lixiviado quando chove muito (muito solvel). Uso de inibidores da nitrificao na agricultura (aumenta o nitrognio amoniacal e diminui a lixiviao de nitrato para subsolo,aumentando N no solo) - Etapas: Nitritao: oxidao de amnia a nitrito 2NH3+ 3O2 2HNO2 + 2H2O
(Nitrosomonas, Nitrosovibrio, Nitrosococcus, Nitrosospira, Nitrosolobus)

Nitratao: oxidao de nitrito a nitrato NO2- + O2 NO3(Nitrobacter, Nitrospina, Nitrococcus, Nitrospira)

Transformaes bioqumicas do nitrognio Utilizao do nitrato:


Reduo assimilatria: plantas e microrganismos
NO3- + 8e- + 9H+ NH3 + 3H2O (nitrato redutases)

Desnitrificao: ocorre em condies de anaerobiose


como aceptor de eltrons. reduo de nitratos a N2 (nitrognio atmosfrico)
2NO3 2NO2 2NO N2O N2
(Agrobacterium, Alcaligenes, Thiobacillus, Bacillus etc.) - Como o N2 menos facilmente utilizado que o nitrato como fonte de N, esse processo prejudicial pois remove o N fixado no ambiente. - Por outro lado, importante no tratamento de efluentes

Transformaes bioqumicas do enxofre


As transformaes do enxofre so ainda mais complexas que do nitrognio: - Devido variedade de estados de oxidao (-2 a +6) (S-orgnico a sulfato) - Porm, apenas 3 estados de oxidao se encontram em quantidade significativas na natureza (-2, 0, +6) Alguns componentes do ciclo:

Oxidao do enxofre elementar:


2S + 2H2O + 3O2 2H2SO4 2H+
ex. Thiobacillus thioxidans

+ SO4=

O S0 tambm pode ser reduzido pela respirao anaerbia

Transformaes bioqumicas do enxofre


Degradao (oxid/red) de comp. orgnicos sulfurados:
cistena + H2O cido pirvico + NH3 + H2S

Utilizao dos sulfatos: plantas microrganismos


S incorporado a aminocidos:
cistina cistena metionina

Transformaes bioqumicas do enxofre


Reduo de sulfatos (por bactrias amplamente distribudas na natureza) anaerobiose CaSO4 + 8H H2S + Ca(OH)2 + 2H2O
Desulfovibrio
- Necessidade da presena de compostos orgnicos (doadores de e-)

Oxidao de sulfato bactrias fototrficas CO2 + 2H2S


enzimas/luz

(CH2O) + H2O + 2S

Transformaes bioqumicas do ferro


Um dos elementos mais abundantes Naturalmente encontrado em apenas dois estados de oxidao

O O2 o nico aceptor de eltrons que pode oxidar o ferro Fe2+, e em pH neutro. Em condies cidas ocorre o crescimento de acidfilos oxidantes do ferro.

Comum em solos alagados e pntanos

Precipitao de depsitos marrons de ferro

MS

MS

Nitrognio Carbono Fsforo Potssio Clcio Magnsio Ferro Enxofre Mangans Cobre outros

Mquina decompositora
MS MS

Resduos orgnicos

MS

Microrganismo operrio

MS

Hmus

Decomposio de restos vegetais no solo: mquina decompositora operada pelos microrganismos (Siqueira & Franco, 1988)