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UNIVERSIDADE DE CAXIAS DO SUL – UCS

PRINCÍPIOS DE BIOLOGIA MOLECULAR


-
Profa. Raquel Balestrin

Exercícios: Código Genético e Síntese de Proteínas (Tradução)


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1. O que significam os termos abaixo apresentados ou qual a relevância dos mesmos na


definição da possível função de seqüências nucleotídicas:
a) orf – Open reading frame - Módulo de leitura – Alterará a proteína formada, se
houver erro na leitura do códons, alterando a fase de leitura.
Uma fita de DNA pode ser lida começando na primeira, segunda ou terceira base,
gerando fases de leitura com códons completamente diferentes. Se a leitura for feita
a partir da quarta base, teremos a mesma fase de leitura daquela feita a partir da
primeira base, com um códon a menos, e assim por diante.
b) códon AUG – códon de iniciação -
c) códon UAA, UAG ou UAC – códons de terminação -
d) poli(A) – Cauda de Poli A – extensão de 200 resíduos adenílicos – função não
reconhecida para a tradução.
2. Como é iniciada a tradução de um mRNA em células procarióticas?
Ligação entre o mRNA e o ribossomo (rRNA), nos procariotos o sítio de ligação é a sequencia
RBS (Shine-Dalgarno), contendo o códon AUG.
3. Como transcorre a tradução de um mRNA procariótico após o seu início e antes de seu
término?
O alongamento se dá por 3 etapas:
a. Uma molécula de aminoacil-tRNA se liga ao ribossomo a um sítio A desocupado (adjacente a
um sítio P ocupado), pareando com os 3 nt (códons) expostos no sítio A.
b. A terminação carboxílica do polipeptídeo nascente é liberada do tRNA do sítio P e liga-se
através de uma ligação peptídica ao aminoácido ligado ao tRNA que se encontra no síitio A.
Esta reação e catalizada por uma PEPTIDIL TRANSFERASE que corresponde ao 23S
rRNA ou 28S RRNA da subunidade maior.
c. Um novo peptidil-tRNA é transferido do sítio A para P pelo movimento do ribossomo
exatamente três nt para frente. Este evento requer energia e envolve mudanças
conformacionais no ribossomo.
4. Como é encerrada a tradução de um mRNA procariótico?
Quando é encontrado um códon de terminação (UAA, UAG, UGA), onde fatores de liberação
ligam-se diretamente a qualquer destes. A ligação altera a tividade da peptidil
transferase, fazendo com que ela catalise a adição de uma molécula de água, ao invés de
um aminoácido, ao peptidil-tRNA.
5. O que são e quais as funções dos fatores IF e eIF?
Fatores envolvidos no complexo de iniciação , se desligando posteriormente.
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IF – Fatores de Iniciação que proporcionam a ligação da subunidade 30S como mRNA e o
tRNA iniciador. eIF – fator de iniciação em eucariotos.

6. Os elementos fundamentais para se iniciar a tradução de um mRNA procariótico são:


a. tRNAi-Glyfor, rRNA, pequena e grande subunidades ribossômicas, IF1, IF2, IF3;
b. IF1, IF2, IF3, mRNA, tRNAi-Metfor, pequena e grande subunidades
ribossômicas;
c. Pequena e grande subunidades ribossômicas, eIF1, eIF2, eIF3, mRNA, ATP;
d. IF1, IF2, eIF3, mRNA, rRNA, tRNAi-Metfor;
e. Todas as opções acima;
f. Nenhuma das opções acima.

7. Considerando a tabela de código genético e a fita de mRNA abaixo onde o primeiro


nucleotídeo da cadeia está em fase de leitura, qual a seqüência de aminoácidos do
peptídeo codificado?
5’-AUG AAU CGG AAC GCU AGG CAC GGG GGC AAC AAA UGA AUU UCA UAA AUG-3’
Met Asn Arg Asn Ala Arg His Gly Gly Asn Lys STOP

8. .Baseando-se na lista de códons e amino ácidos abaixo, quais das seguintes afirmações
são corretas?
AGU = serina AGC = serina
AAU = asparagina AAC = asparagina
AUG = metionina AUA = isoleucina
a. o código genético é degenerado – (códons diferentes, mesmo aa)
b. a alteração de um único nucleotídeo no DNA que dirige a síntese destes códons poderia
levar à substituição de uma serina por uma asparagina no polipeptídeo.
c. a alteração de um único nucleotídeo no DNA que dirige a síntese destes códons
necessariamente levaria à substituição de um aminoácido no polipeptídeo codificado.
d. um tRNA com o anticódon ACU se ligaria a um ribossomo na presença de um destes
códons.
9.
Uma globina de 146 aminoácidos sofreu uma mutação no códon correspondente ao sexto
aminoácido da cadeia. A análise do DNA indicou uma mudança de (3')TTC(5') para
(3')TAC(5') na fita molde. Pergunta-se :
DNA – TTC códon mRNA – AAG anticódon tRNA – UUC - Lysina
DNA – TAC códon mRNA – AUG anticódon tRNA – UAC - Metionina
a. A mutação provocou a troca de um aminoácido por outro? Em caso afirmativo, qual é
este aminoácido? Sim, troca uma lysina, por uma metionina
b. Qual seria o resultado se a mesma troca (T POR A) ocorresse na 1ª base do DNA
DNA – ATC códon mRNA – UAG anticódon tRNA – AUC - STOP códon
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10. De acordo com o princípio de oscilação no pareamento de bases ("wobble"), qual o
número mínimo de tRNAs necessário para decodificar os seis códons de leucina - UUA,
UUG, CUU, CUC, CUA e CUG ? Explique.
3 tRNA, o pareamento com a 3ª base é menos rígido, devido a própria conformação da
molécula de tRNA, porém, o pareamento mantém a distância usual entre as riboses.

11. Em procariotos, a maioria da cadeias polipeptídicas são iniciadas com o aminoácido


_MET_____, cujo códon é _AUG_____.

12. O códon AUG funciona tanto para iniciar uma cadeia polipeptídica quanto para dirigir a
incorporação de uma metionina em posições internas de uma proteína. Quais os
mecanismos de seleção do códon AUG para a iniciação da tradução em procariotos ?
O códon AUG, que inicia a síntese de proteínas (tradução), é reconhecido pelo metionil-
tRNAMET, sendo o único a se ligar ao sítio P da subunidade ribossômica menor, e assim
iniciar a síntese. O outro metionil- tRNA pode se associar unicamente ao sítio A, e
portanto só participa da elongação.

PARA ENTREGAR
1. Como se chama a estrutura secundária do tRNA? Como se apresentam os
braços? (Desenhe).

2. Explique e esquematize a estrutura do ribossomo (subunidades, tipos de sítios,


funções).

3. Como ocorre o alongamento e translocação ribossomal na tradução (Desenhe)? O que é


uma ligação peptídica?

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