ANÁLISE DA TAXA DE PRODUÇÃO DE ENTROPIA GERADA PELA
REGULAÇÃO DA EXPRESSÃO GÊNICA
Cauê Augusto Boneto Gonçalves¹; Alexandre Ferreira Ramos¹ ¹Escola de Artes, Ciências e Humanidades, Universidade de São Paulo, Av. Arlindo Béttio, 1000, São Paulo CEP 03828-000, SP, Brazil
Resumo
Os fenótipos celulares podem ser determinados por meio das quantidades de
produtos gênicos, portanto, pode-se estimar seus custos energéticos e se estes encontram-se em equilíbrio, esta ideia pode ser útil na análise de patologias como no câncer. Devido a isso, a partir do solução exata para o modelo da regulação da expressão gênica, podemos calcular a taxa de produção de entropia para este processo de modo a facilitar o entendimento da viabilidade energética de células cancerígenas. O modelo mais simples do funcionamento de um gene, considera ele em apenas dois estados, denominados ON e OFF. Dentro deste modelo há os genes que são regulados por um regulador externo e genes que são regulados pelos próprios produtos gênicos, neste trabalho, focaremos apenas no que possuem um regulador externo. Desse modo, neste trabalho foi realizado o cálculo da taxa de produção de entropia tanto no regime estacionário, quanto no regime dependente do tempo entendendo melhor o consumo energético ligado a este processo dado uma certa situação. Foram analisados diversos casos, que podem ser resumidos em dois principais, modelo constitutivo do gene e modelo de “burst” do gene, a maior diferença entre este modelos é que o constitutivo cada trinca é transcrita de forma individual em um período de tempo, já o “burst” ocorre a transcrição de diversas trincas em um tempo muito curto. Ao final da análise nota-se que a taxa de produção de entropia do modelo “burst” é bem menor ao modelo constitutivo, mostrando um gasto de energia, consequentemente, menor. Então pode-se concluir que o gasto de energia está diretamente ligado a quantidade de vezes que há alteração de estado do gene. Estas conclusões sugerem fortemente que o câncer trabalha no estado “burst” explicando possivelmente sua viabilidade que mesmo com uma produção baixa de energia, consegue manter seu alto custo energético.
Palavras-chave: Taxa de produção de entropia, Regulação de gene binário,
modelagem estocástica, expressão gênica constitutiva, expressão gênica em burst