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Nucleótidos.
Funciones:
1. Constituyentes de ácidos nucleicos (ADN / ARN)
2. Moneda de transacción energética ATP
3. Cofactores enzimáticos (coenzima A)
4. Mensajeros secundarios: AMPc GMPc
5. Intermediarios metabólicos (NADH, FADH2)
Estructura de un nucleótido
Todos los nucleótidos van a estar constituidos por:
-Una base nitrogenada
-Un Azúcar tipo pentosa
-Un grupo fosfato
Cuando se numeran los carbonos en el azúcar se lee con números X’ (prima) para
diferenciar la nomenclatura dentro de la base nitrogenada.
La base nitrogenada Timina (T) contenida en la molécula del ADN, mientras que se
sustituye por Uracilo en el ARN.
Conceptos:
-Nucleósido: Es una azúcar + base nitrogenada, unidos por enlace β N-glicosídico. No tiene
el grupo fosfato.
-Desoxirribonucleótidos y ribonucleótidos, son los nucleótidos que tienen
respectivamente desoxirribosa o ribosa.
-Formas metiladas de bases nitrogenadas: Contienen grupo metilo extra
unido. No son los más comunes. Tienen Funciones como “etiquetas”
reguladoras. Se encuentran principalmente en las bacterias y plantas. En
humanos no son tan comunes.
ADN es más estable, lo que lo hace más seguro. Guarda información genética.
Propiedades Físicas:
ARN y ADN
-Son muy solubles en agua debido a: AZÚCAR y el grupo FOSFATO. O sea, son polares.
-Tienen carga negativa, debido a: Grupos FOSFATO. Siempre que
esté a pH neutro los oxígenos del g fosfato estarán cargados
negativamente. En la mayoría de nuestro cuerpo es así. ¿En zonas
como el estómago donde existe un pH negativo? No interfiere,
pues estos ácidos nucleicos están en el núcleo donde el pH es
neutro. El pH negativo se encuentra en el lumen estomacal, o
guardado dentro de zonas especiales como vacuolas.
-Absorben luz ultravioleta, debido a las BASES NITROGENADAS. Estas absorben a 260 nm
Según Gabriela: Las proteínas absorben a 280 nm. Esto sirve para comprobar si en una
extracción de ADN existen contaminantes proteicos. Ya que si tiene gran absorbancia a 280
significa que están presentes gran cantidad de proteínas en dicha extracción. Según Alape el
enlace peptídico absorbe a 214 nm. (mejor hay que preguntar) (el enlace peptídico absorbe a
214nm y los aminoácidos aromáticos como Phe, Trp, Tyr absorben a 280nm, entonces
cualquiera de las 2 longitudes de onda sirven para detectar proteínas. En biología molecular
se usa 280nm porque queda muy cerca de 260nm, entonces se puede hacer ambas lecturas
con el mismo filtro del espectrofotómetro. Para otras aplicaciones donde no interesa la
cantidad de Ácidos nucleicos, lo ideal seria hacer la lectura a 214nm porque así no depende
de la composición de la proteína)
Estructura Antiparalela.
ADN tipo B:
-Es muy común en la naturaleza. El descrito inicialmente por Watson y Crick
-Encontrada en las células.
-Gira hacia la derecha.
-La unión entre las bases nitrogenadas describe un ángulo de 6º.
-Más estable en condiciones fisiológicas
ADN Z:
-Es muy extraño. Se ha observado en regiones pequeñas del ADN de células.
-Se cree que tiene funciones como marcadores o etiqueta de regulación y durante la
recombinación en la meiosis.
-Gira hacia la izquierda
ADN A:
-Gira hacia la derecha pero está más compactada.
-Las uniones de bases nitrogenadas tienen un ángulo de 20º lo que
hace que se compacten por su inclinación
-No encontrado en células, solo en laboratorios, se baja mucho el
pH para obtenerla.
-Hélice más corta y más ancha.
Las Histonas tienen una gran importancia en el empaquetamiento del ADN. Éstas tienen una
carga positiva (por eso interactúan con el ADN con carga negativa). Características:
-Muy conservadas: Casi no varían de una especie a otra.
-Poco reactivas
-Muy estables químicamente.
-A la hora de empaquetar se unen en grupos de 8 histonas.
-Tienen proyecciones que regulan su actividad (“soltar”/ “agarrar (unirse)” ADN)
Conceptos:
- Nucleosoma: Consiste en un grupo de 8 histonas en donde el ADN da dos vueltas
alrededor del grupo de histonas.
-Polinucleosoma: Grupo de
varios nucleosomas.
-Luego de estas siguen otras
estructuras de empaquetamiento
hasta llegar al cromosoma.
Secuencias Palindrómicas
Son secuencias que se leen igual de un lado que al revés.
-Pueden tener funciones de regulación para crear señales.
-Existen de diferentes formas. Una de ellas es la cruciforme.
Ej. En espejo: TTAGCCGATT
Nota:
Se han encontrado ADN triples. Sucede que 3 bases
nitrogenadas pueden unirse. Generalmente encontradas cuando
hay timinas y citosinas. Son etiquetas de reconocimiento para
algunas proteínas.
ARN
Conceptos importantes:
1. Genoma: Es toda la secuencia de ADN de un organismo. Igual en todos los tejidos.
2. Transcriptomas: Son los ARN que se expresan. Son particulares para cada tejido.
3. Proteoma: Se utiliza para conocer todas las proteínas del tejido. Ej. Para analizar un
cáncer ya detectado.
4. Metaboloma: Proteoma específico: Importancia en proteínas de metabolismo.
Cuando un ADN sintetiza un ARN normalmente lo hace lineal, sin embargo a veces se
pliega. Entonces tiene estructuras secundarias. De manera que existe una clasificación de
ARN.
Tipos de ARN
1. ARNm (mensajero)
-Es la que tienen la secuencia para la creación de una proteína.
-Su tamaña depende del tamaño de la proteína a sintetizar. Puede
ser grande o pequeño.
-Suman el 5% de ARN
-Tienen una secuencia que se lee de 3 en 3 llamados codones.
-No se pliega generalmente, pero su única hebra tiende a hacer una hélice
(dextrógira) por estabilidad.
.
Monosistrónicos:
Encontrados en eucariotas. Un ARNm que solo codifica para una proteína. Se da por la
dispersidad de genes. Dentro de los monosistrónicos tenemos intrones y exones. Los
primeros son secciones de ADN que transcriben pero no se traducen. Mientras que los
exones, son secuencias que se traducen y codifican por proteínas.
2. ARNt (trasferencia)
-Constituyen el 15% de ARN totales
-Tamaños estables entre 70 y 90 nucleótidos
-Adaptan los aminoácidos para tener la síntesis de
Proteínas.
-Interactúan con el ARNm, se acopla a la tripleta de este
(codon) solamente si son complementario.
-Se diferencia del ARNm porq este era lineal, mientras que
el ARNt tiene un plegamiento muy característico de 3
lazos. Este plegamiento tiene 2 partes importantes:
a. El anticodón: Determina el aminoácido que se une al
extremo 3’
b. El extremo 3’: Une el aminoácido (correspondiente a) la secuencia de nucleótidos del
anticodón.
3. ARNr (ribosomal)
-Son la gran mayoría.
-Estructuras de plegamiento muy complejas.
-80% del ARN total.
-Van desde 100 a 2000 nucleótidos.
-ARNr se unen a proteínas que conforman el ribosoma
- A esos ARNr se les llama ribozimas: ácidos nucleicos que actúan como enzimas, o sea
catalizan.
-Existen como 200 genes que codifican para ARN ribosomales. O sea son importantes!!
Además (---) las copias se encuentran en
diferentes cromosomas.
-Los ARNr tienen varios nombres porque no son
iguales todos.
-Son la única excepción en eucariotas, ya que son
la única secuencia que “se van a partir”. Por
ejemplo Un pedazo será ARNr 28S, otro ARNr
18S etc. Es semejante al comportamiento de un
polisistrónico (Ojo: en polisistrónicos codifican
por proteínas, no tiene nada q ver, pero su
comportamiento es semejante). (no tienen que saberse los nombres de cada tipo de ARNr)
Propiedades Químicas
1. Desnaturalización
Se puede desnaturalizar. Se puede separar en las dos hebras. (rompen puentes de hidrógeno)
Ocurre normalmente en trascripción, reparación y recombinación
La desnaturalización puede ser causada por (in vitro):
1. Temperatura muy altas. 70-80º inicia la desnaturalización. Temperaturas bajas no la
desnaturalizan.
2. pH extremos
3. Compuestos desnaturalizantes como la urea. Es tóxica.
(in vivo) Para que el ADN en células se desnaturalice tiene que tener enzimas como
requisito, sino no se desnaturalizan.
2. Renaturalización:
Formación de nuevo de la doble hélice a partir de las hebras separadas pero
complementarias. La velocidad de la renaturalización depende de:
-Separación de las hebras. Pueden ir probando y probando hasta lograr unirse bien.
-La concentración
-La complementariedad
3. Hibridación:
- Puede ser entre ADN-ADN o ADN-ARN o ARN-ARN
-Quiere decir unir dos moléculas de polinucleótido que son de diferente origen y/o longitud.
Puede ser por ejemplo una banda simple de ADN de hombre y otra de chimpancé.
-Primero debe haber una desnaturalización en caso de ser ADN.
b. Cambios debido a la luz ultravioleta cuando hay presencia de 2 timinas, estas se enlazan
entre ellas y no con la del frente (con su base complementaria).
En las células existen porque son necesarias en el recambio, sin embargo están muy
reguladas. En el núcleo no hay muchas. En el citosol son mas abundantes principalmente
cuando queremos degradar ARNm y asi lograr que no se exprese más una proteína.
Los nucleótidos que funcionan como almacenamiento generalmente tienen como azúcar la
ribosa. El más común es el conocido ATP. El término dATP se refiere a que tiene como
azúcar una desoxirribosa.
OJO pueden ser cualquier base nitrogenada pero los anteriores son los mas comunes. Lo que
importa son los enlaces de grupos fosfato.
--FIN--