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XXI Semana de Biologa Experimental

La biofisicoqumica
o cmo es que la fsica, la qumica y la biologa se comunican para enriquecer el conocimiento cientfico

Dr Ral Alva Garca Biofisicoqumico


alva@xanum.uam.mx http://investigacion.izt.uam.mx/alva/ Universidad Autnoma Metropolitana Unidad Iztapalapa 13 de octubre de 2011

Parteaguas de la Biologa

Charles Darwin Gregor Mendel

Imposible sintetizar
Friedrich Whler virti cianato de plata en cloruro de amonio; filtr el cloruro de plata y evapor el cianato de amonio; esperaba cristales de sal pero hall otros con la misma composicin de la urea Dedic el resto de su vida a la qumica inorgnica

Qu es la vida?

Ubicacin: c1992. / QH331 S3.7

Energa
E = 1/2 mv
2

E=h

E = m c2

Transformacin de energa biolgica

puede ser explicada por medio de las leyes de la qumica, ya que son evidentes las transformaciones qumicas de la materia biolgica

Glucolisis

C6H12O6 + ADP -> CH3COCO2 + H+ + ATP

The Mechanism of Oxidative Phosphorylation


Despite intensive investigations in many laboratories over the past quarter century we still lack a detailed molecular picture of the mechanism by which the oxidoreduction energy of electron transport is converted into the phosphatebond energy of ATP. Three hypotheses have gained wide attention*
*Lehninger, AL. 1975. Biochemistry. 2nd ed. Worth Publ. Inc., NY. p 524.

Hiptesis Quimiosmtica 1961

"In the exact sciences, cause and effect are no more than events linked in sequence. . . if the processes that we call metabolism and transport represent events in a sequence, not only can metabolism be the cause of transport, but also transport can be the cause of metabolism" Peter Mitchell, Nature, 1961

Confirmada por ionforos


Berton Pressman y Sergio Estrada descubrieron los ionforos peptdicos y carboxlicos que demostraron que la translocacin inica en organelos energticos es electrofortica y define la anisotropa de las membranas biolgicas. Los estudios en mitocondrias, cloroplastos, bacterias quimitrofas y fottrofas, demostraron que el potencial de membrana es la fuerza motriz que impulsa a la sntesis biolgica de ATP y que realiza la translocacin de iones necesaria para el metabolismo

Con la Teora Quimiosmtica...


... el problema central de la fosforilacin acoplada a la oxidacin y el transporte de iones [...] haba sido, al fin, resuelto Efraim Racker

The Nobel Prize in Chemistry 1978 Peter Mitchell "for his contribution to the understanding of biological energy transfer through the formulation of the chemiosmotic theory"

Estructura de protenas

Estructura del ADN


La biofisicoqumica emplea tcnicas usadas en fsica y qumica para estudiar la estructura de sistemas biolgicos. Se incluyen mtodos espectroscpicos como rayos X y NMR

Supraestructuras biolgicas
Por ejemplo, el Premio Nobel de 2009 se entreg a tres

qumicos por el estudio de la superestructura de los ribosomas por difraccin de rayos x

Instituto Max Planck de Biofisicoqumica


El ms antiguo instituto de biofisicoqumica es el Max Planck Institute para Biofisicoqumica en Gttingen creado en 1971 con la fusin del Institute for Physical Chemistry, fundado en 1949, y el Institute for Spectroscopy; fue de los primeros en aplicar mtodos fisicoqumicos en estudios biolgicos y en diferentes campos de las ciencias naturales, como cintica rpida de reaccin, aplicacin de tcnicas de registro canales inicos, etc

Biofisicoqumica: publicaciones

Yale Biophysical Chemists

Flexibilidad inica-estructural

La llave ya no abre

La funcin de las osmoenzimas depende de su flexibilidad estructural y su variable afinidad inica regulada por factores fisicoqumicos intrnsecos y ambientales, as como una manopla de baseball puede tomar pelotas de distinto tamao...

La fisicoqumica de las osmoenzimas


Ji = f(pHamb, pKa, ai, aei, Ei, ri, qi, [A]m, FA, A, Ks, CpL, DL, m, Kd)

regula la translocacin inica catalizada

Antiporters Na /H
+

Cmo funcionan los antiporters?

Alineado de secuencias de NHE...

muestra divergencia evolutiva


El enfoque puede partir desde la fsica, la qumica o la biologa En este caso parte de los mecanismos de evolucin biolgica

sta y la convergencia evolutiva...

...dependen de la estructura-funcin

En toda la escala filogentica

es la revisin del mayor nmero de antiporters NHE proteicos existentes en la literatura (http://www.nih.nlm.ncbi.gov); alineamiento y bsqueda de homologas qumicas y analogas fisicoqumicas de residuos, lo que sugerir vas evolutivas divergentes o convergentes que cumplan la relacin estructura-actividad. El criterio que orienta esta hiptesis es el principio de Occam.

Biofisicoqumica

en la UAM

La flexibilidad inica-estructural de los politeres corona son fundamento para la nanociencia y la nanotecnologa

Macroestructuras biomimticas

Microestructuras biomimticas

Biomimetic Microstructure Formation of High Performance Silk Films and Fibers


Award Amount: $99,981.00 (FY 2001)
The complex biological processing and spinning operations used by the silkworm and spider to create silk fibers lead to a morphology that yields exceptionally high combinations of strength, stiffness, and extensibility The material is likely well suited for highly optimized large space structures such as solar sails or space telescopes. Foster-Miller is currently working on large deployable structures for the Air Force and NASA

Nanoestructuras biomimticas

De la fisiologa vegetal al origen de la vida

By the year 2000, I started to pay more attention to fundamental questions related to the origin of life... However, in at least one way, the study of membranes composed of prebiotic building blocks such as fatty acids was perfect for me, since this field was filled with important yet technically addressable questions Jack W. Szostak

A la bsqueda de vida extraterrestre

Multidisciplina

Interdisciplina

Transdisciplina

Responsabilidad ante la sociedad

http://investigacion.izt.uam.mx/alva/

Dr Ral Alva Garca Biofisicoqumico

Depto Ciencias de la Salud Universidad Autnoma Metropolitana Unidad Iztapalapa