PRCTICA I

AA, DNA y RNA.

Nicols Hoces Gutirrez 19/10/2011

PRCTICA I

PROTENAS, DNA Y RNA.

Objetivo: Identificacin de las partes ms significativas de sus estructuras, y comparacin entre ellas.

PROTENAS:

Foto de la estructura en forma alfa

y en forma beta:

Estructura alfa: Identificacin de las partes ms significativas de dicha biomolcula. a) b) c) d) e) Extremo Carboxilo Extremo Amina Carbonos alfa Enlaces peptdicos Radicales

a)Extremo Carboxilo:

b) Extremo Amina:

c) Carbonos alfa:

Se unen mediante enlaces peptdicos, proporcinonando la estructura principal a la protena.

d) Enlace peptdico:

Enlace peptdico: Se forma entre los amino cidos. Al formarse este entre el C de un AA y el N de otro, se produce una molcula de H2O.

e) Radicales

Son importantes, puesto que determinan la conformacin espacial de la molcula, y le otorgan una polaridad caracterstica. Las biomolculas tienen una forma y no otra, porque en esa forma us grupos R estn estables los unos con los otros.

En la estructura alfa, puede observarse cmo los propios componentes de la estructura de la biomolcula, forman enlaces entre ellos para mantener la estructura alfa. Los oxgenos libres forman puentes de hidrgeno entre s, reforzando as la estructura:

Estructura beta: Identificacin de las partes ms significativas de dicha biomolcula. a) Extremo Carboxilo b) Extremo Amina

c) d) e) a)

Carbonos alfa Enlaces peptdicos Radicales Extremo Carboxilo:

b) Extremo amina:

c) Carbono alfa:

d) Enlace peptdico:

e) Radicales:

Tras ver dichas partes, pasaramos a ver lo significativo que es el orden de los amino cidos para la conformacin de la protena. Para eso, cambiaremos solamente el orden de los AA en dicha biomolcula, y compararemos su polaridad, para ver que efectivamente se trata de una protena completamente diferente. El aminocido 1 y el 2 tienen los mismos AA, pero cambiados de orden:

AA 1:

AA 2:

Como se puede observar, la polaridad de la molcula es completamente diferente. Mientras en el 1 las cargas estn completamente polarizadas, desplazndose todas las cargas negativas hacia un

extremo y las positivas hacia el otro, en el 2, dichas cargas estn ms repartidas por la estructura.

De ah la importancia en el rden de la secuencia de AA.

DNA RNA:

En este apartado trataremos las significativas diferencias entre las biomolculas de DNA y RNA.

La estructura base de ambas, se basa en una pentosa unida a una base nitrogenada, y unidas varias pentosas entre s para formar la cadena de DNA o RNA.

La diferencia bsica est en que el DNA carece de un grupo OH en el carbono 5, mientras que el RNA tiene.

Otra diferencia est en las base nitrogenadas. Mientras que las del DNA estn formadas por T-A y G-C el RNA sustituye la timina por uracilo.

Dichas bases, en el DNA, se enfrentan con su conjugada, en una estructura de doble hlice. En cambio, el RNA no forma una doble hlice. En algunos puntos puede enroscarse y aparearse varias bases de la misma cadena, pero no formando una hlice propiamente dicha.

Visto esto, est claro que las estructuras sern completamente diferentes. Como se puede observar a continuacin:

DNA:

RNA:

Adicionalmente, la biomolcula de DNA, con su forma caracterstica de doble hlice, forma dos tipos de surcos en su estructura ms externa. Uno ms accesible para ser manipulado y otro surco ms profundo y estrecho.