Lecturas Guia03

Introduccin al Metabolismo
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INTRODUCCIN AL METABOLISMO
Silvia Mrquez Sergio D. Ifrn Nancy Fernndez Gladys Glvez Luis Fernndez
La clula viva se asemeja a una industria qumica donde miles de reacciones ocurren dentro de un espacio, en este caso, un espacio microscpico. Por ejemplo, los azcares son convertidos en aminocidos y viceversa. El glucgeno es ensamblado a partir de miles de molculas de glucosas; las protenas a partir de aminocidos. Por otro lado, estos polmeros sern hidrolizados cuando las necesidades de la clulas as lo requieran. El metabolismo (del griego metabole, cambio) es la totalidad de los procesos qumicos de un organismo. El metabolismo es el mapa de rutas de miles de reacciones qumicas que ocurren en la clula. Las enzimas dirigen dichas rutas metablicas, acelerando diferencialmente reacciones determinadas. Como un todo, el metabolismo maneja las fuentes de materia y energa de la clula. Algunas rutas metablicas liberan energa por ruptura de los enlaces qumicas de molculas complejas a compuestos ms simple. Estos procesos de degradacin constituyen el catabolismo celular o vas catablicas. Por otro lado, existen vas anablicas o reacciones qumicas del anabolismo, las que consumen energa para construir molculas de mayor tamao a partir de molculas ms simples. Las vas metablicos se interceptan de tal forma que la energa liberada de reacciones catablicas (reacciones exergnicas) puede utilizarse para llevar a cabo reacciones anablicas (reacciones endergnicas) As, la transferencia de energa del catabolismo al anabolismo se denomina acoplamiento energtico. LOS ORGANISMOS SON TRANSFORMADORES DE ENERGA La energa ha sido definida como la capacidad de realizar trabajo, de producir una modificacin en la materia. Puede adoptar la forma de calor, luz, electricidad, movimiento, etc. Se reconocen dos clases principales de energa:
Energa potencial Energa cintica

La energa potencial es la capacidad de realizar trabajo en virtud de la posicin o el estado de una partcula. Por ejemplo, una piedra en la cima de una montaa tiene energa potencial, a medida que rueda por su ladera, la energa potencial se transforma en cintica. La energa derivada en ltima instancia del sol, se almacena en las molculas de los alimentos como energa qumica. Esta ltima es un tipo de energa potencial. Luego dentro del organismo, se producen reacciones qumicas que transforman la energa potencial en calor, movimiento o alguna otra forma de energa cintica. Todas las formas de energa son, por lo menos en parte, interconvertibles. Los sistemas vivientes constantemente transforman energa potencial en cintica o viceversa. La energa qumica que los organismos utilizan en las reacciones metablicas, proviene de los enlaces qumicos de los glcidos, lpidos y protenas. Esta energa potencial que guardan los enlaces qumicos, puede ser
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aprovechada parcialmente por el organismo cuando se rompen esos enlaces qumicos. La energa que no puede ser atrapada por el organismo, se disipa como calor. En condiciones experimentales controladas, puede medirse y compararse la cantidad de energa que entra y sale de un sistema determinado. LA TERMODINMICA ES EL ESTUDIO DE LA ENERGA El anlisis de las transformaciones energticas que ocurren en la materia viva se llama termodinmica. Los investigadores llaman sistema para denotar una porcin de materia bajo estudio. El resto del universo (todo aquello fuera del sistema) es el entorno. Los organismos son sistemas termodinmicos obligatoriamente abiertos, es decir intercambian materia y energa con el entorno. La termodinmica tiene dos leyes fundamentales que gobiernan las transformaciones energticas de la materia y por lo tanto tambin rigen para los seres vivos. La Primera Ley de Termodinmica o de la Conservacin de la Energa establece que la energa puede convertirse de una forma en otra, pero no se la puede crear ni destruir. La energa total de un sistema y su ambiente, por lo tanto se mantiene constante a pesar de todos los cambios de forma. En todas las conversiones energticas, cierta energa til se convierte en calor y se disipa. De todos modos, en una reaccin qumica, la energa de los productos de la reaccin ms la energa liberada en la misma, es igual a la energa inicial de las sustancias que reaccionan.
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Fig. 3.1 - Flujo de energa y materia en un ecosistema. Las mitocondrias de los eucariotas (incluso plantas!) utiliza las molculas orgnicas producto de la fotosntesis como combustible para la respiracin celular, pero tambin consume el oxgeno liberado en la fotosntesis. La respiracin libera la energa almacenada en las molculas orgnicas y genera ATP, el cual se utiliza para el trabajo celular. Los productos de desecho de la respiracin, CO2 y H2O, son las molculas que los cloroplastos utilizan como sustrato de la fotosntesis. Por lo tanto, las molculas esenciales de la vida son recicladas, pero la energa no. La energa ingresa al ecosistema como energa lumnica y sale como energa calrica. La Segunda Ley de la Termodinmica establece que todos los intercambios y conversiones de energa, si no entra ni sale energa del sistema en estudio, la energa potencial del estado final siempre ser menor que la energa potencial del estado inicial. Por ejemplo las piedras ruedan siempre cuesta abajo, nunca lo hacen haca arriba. En termodinmica se designa como energa dependiente de un alto grado de ordenamiento a la energa potencial, mientras que a la energa cintica molecular se la considera como energa con un grado reducido de ordenamiento. A medida, entonces, que la energa potencial se transforma en cintica, el desorden aumenta y utilizamos la expresin ENTROPA, para caracterizar el grado de desorden de un sistema (las clulas NO estn desordenadas, as que tienen baja entropa). En la naturaleza, el desorden es un estado ms probable que el orden y la entropa, como medida del desorden, se convierte en una funcin que tiende a crecer constantemente. Sabemos que el contenido de energa potencial de los compuestos qumicos est representados por la fuerza que mantiene unidos a los tomos y molculas y cuando las sustancias qumicas reaccionan, parte de esta energa se libera como calor y otra parte puede ser convertida en trabajo. Esta fraccin de energa disponible para el trabajo se denomina ENERGA LIBRE O ENTALPA. En otras palabras es el monto mximo de trabajo que puede obtenerse de un sistema. La energa libre: un criterio para cambio espontaneo Los organismos solamente pueden vivir a expensas de la energa libre adquirida del entorno. La cantidad de energa libre de un sistema se simboliza con la letra G. Hay dos componentes para G: la energa total del sistema (H) y su entropa (S). La energa libre se relaciona con estos factores de la siguiente manera:
G = H - TS
con T (temperatura, en grados Kelvin) para temperaturas absolutas. Como se ve, la temperatura aumenta el trmino de la entropa en la ecuacin. Esto tiene sentido si se recuerda que la temperatura mide la intensidad del movimiento de las molculas al azar (calor), lo que provoca desorden. Entonces, esta ecuacin enuncia que no toda la energa almacenada en un sistema (H) est disponible para el trabajo. El desorden del sistema, el factor de entropa (S), se resta a la energa total para calcular la mxima capacidad del sistema para realizar trabajo til. Cmo el concepto de energa libre ayuda a determinar si un proceso determinado puede ocurrir espontneamente? En la ecuacin de ms arriba, la energa libre (G) es considerada como una medida de inestabilidad del sistema, o sea su tendencia a cambiar a un estado ms estable. Por lo tanto, aquellos sistemas que tienden a cambiar espontneamente a uno ms estable son los que tienen mayor energa, baja entropa o ambos. La ecuacin de G considera estos dos factores los cuales estn consolidados en el contenido de G del sistema en estudio. Ahora se puede establecer un criterio para cambio espontneo: en cualquier proceso espontneo la energa libre de un sistema decrece.
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Los cambios de energa libre cuando un sistema va desde un estado inicial a un estado final es representado por DG:
G=G
o, tambin:
estado final
-G
estado inicial
G=
H - T.
Finalmente, para que un proceso ocurra espontneamente, el sistema debe ceder energa (decrece H) o perder orden (se incrementa S), o ambos. Cuando los cambios en H o en S son grandes, DG tiene un valor negativo. LAS REACCIONES METABLICAS SON EXERGNICAS O ENDERGNICAS Las reacciones metablicas pueden ser clasificadas en exergnicas (aquellas que liberan energa) o endergnicas (aquellas que consumen energa) tomando en cuenta sus cambios de energa libre. En una reaccin exergnica hay una liberacin neta de energa libre. Puesto que los reactantes pierden energa libre (G), DG es negativa para una reaccin exergnica. En otras palabras, las reacciones exergnicas ocurren espontneamente. Las reacciones endergnicas toman G de su entorno. Esto se debe a que esta clase de reacciones almacenan ms energa libre (G) en las molculas, por lo tanto DG es positivo. Tales reacciones no son espontneas. De lo anterior, se concluye que si un proceso qumico es exergnico en una direccin, entonces el proceso inverso debe ser endergnico. Desequilibrio Metablico: Clave de la vida Las reacciones qumicas del metabolismo son reversibles y podran equilibrarse slo en un medio aislado como un tubo de ensayo. En los sistemas qumicos en equilibrio DG es cero y sin energa libre no hay trabajo, por lo tanto una clula que ha alcanzado su equilibrio est muerta. Este desequilibrio metablico es una de las caractersticas que define a la vida y esto se mantiene gracias a que en las vas metablicas los productos no se acumulan , siendo sutratos de otras reacciones y por lo tanto no alcanzndose nunca el equilibrio. Por ejemplo, durante la respiracin celular, la glucosa y otros combustibles energticos son degradados y el dioxido de carbono es eliminado al medio interno y luego expelido al exterior con lo cual la clula no alcanza nunca su equilibrio y continua trabajando. Este simple ejemplo nos sirve para comprender la importancia que reviste para los organismos vivos ser sistemas abiertos. LA MOLCULA DE ATP ES RESPONSABLE DE LA MAYORA DE LOS PROCESOS DE ACOPLAMIENTO ENERGTICO EN LAS CLULAS Como se recordar, una estrategia clave de la bioenergtica es el acoplamiento energtico, es decir el uso de un proceso exergnico para llevar a cabo uno endergnico. El adenosn trifosfato (ATP),la moneda de la clula, transfiere la energa liberada por la ruptura de las uniones qumicas en los procesos exergnicos hacia las reacciones endergnicas, es decir las reacciones que consumen energa. La clula puede realizar tres clases principales de trabajo donde se requiere energa:
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Trabajo Mecnico: como el batido de cilias y flagelos, la contraccin de las clulas musculares, el fluir del citoplasma dentro de la clula o el movimiento de los cromosomas durante la divisin celular. Trabajo de Transporte: el bombeo de sustancias e iones a travs de la membrana en contra de la direccin del movimiento espontneo. Trabajo Qumico: El impulso de reacciones endergnicos, que no ocurriran espontneamente, como la sntesis de los polmeros a partir de sus monmeros.
Fig. 3.2 - Tipos de trabajo celular que utilizan ATP En la mayora de los casos, la fuente inmediata de energa que potencia el trabajo celular es el ATP. Esta molcula es tambin conocida como un transportador o intermediario energtico.
Fig. 3.3 - Molcula de ATP. (a) Estructura del ATP. (b) Hidrlisis de la molcula de ATP El enlace entre el segundo y el tercer fosfato es un enlace rico en energa. Para establecerlo se necesit de un gran aporte energtico, esto es, de la energa libre obtenida del entorno por la clula.
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Por otro lado, su ruptura resulta en la liberacin de esta energa, la que puede ser empleada para los distintos tipos de trabajos celulares.
Fig. 3.4 - El ciclo del ATP. La energa liberada en las reacciones catablicas se usan para fosforilar ADP, generando ATP. La energa almacenada en el ATP se utiliza en la mayora de los trabajos celulares. Por lo tanto, el ATP acopla los procesos productores de energa de la clula a los consumidores de energa. Muchos de las reacciones del metabolismos son reacciones de oxido-reduccin Los electrones poseen distintas cantidades de energa potencial segn su distancia respecto del ncleo del tomo y la atraccin del ncleo por los electrones. Al aportar energa, el electrn pasa a un nivel energtico ms alto, pero sin la energa adicional, el electrn permanece en el nivel energtico ms bajo disponible para l. Las reacciones qumicas son transformaciones energticas en las cuales la energa almacenada en los enlaces qumicos se transfiere a otros enlaces qumicos recin formados. En estas transformaciones los electrones pasan de un nivel energtico a otro. En muchas reacciones los electrones se transfieren de un tomo o molcula a otro. Estas reacciones muy importantes en los sistemas vivientes, se conocen como reacciones de oxidacin-reduccin (REDOX). La prdida de un electrn se conoce como oxidacin y el tomo o molcula que pierde el electrn se ha oxidado. La perdida de electrones se llama oxidacin porque el oxgeno que atrae con fuerza a los electrones, es la mayora de las veces el receptor de los mismos. Reduccin, por el contrario, es la ganancia de electrones. La oxidacin y la reduccin siempre ocurren simultneamente, porque el electrn que pierde un tomo es aceptado por otro, que se ha reducido en el proceso. En los sistemas vivientes muchas veces los electrones son transferidos con un protn, es decir, es un tomo de hidrgeno. En tal caso la oxidacin implica una perdida de tomos de hidrgeno y la reduccin la ganancia de estos. LA ENERGA DE LAS MOLCULAS ES LIBERADA EN EL TRANSCURSO DE LAS REACCIONES DE OXIDACIN Durante el transcurso de sucesivas y graduales reacciones de oxidacin, la mayor parte de la energa qumica contenida en los alimentos es liberada de manera secuencial. De esta manera, se logra la eficaz captacin de la energa liberada en enlaces de alta energa como los del ATP. Como se ha dicho, toda oxidacin de un tomo o de una molcula est asociada a la reduccin de otro tomo u otra molcula. Durante las reacciones de oxidacin pueden perderse hidrgenos (H). Estos se pueden disociar en un protn (H+) y en un electrn (e-). En un sentido general, toda remocin de e- de cualquier tomo o molcula constituye una reaccin de oxidacin. Este e- pudo haber sido removido de un H. Luego el H+ puede permanecer en la molcula a la que conformaba o puede pasar al medio. Por otro lado, la reduccin de un tomo o molcula puede implicar la ganancia de hidrgeno o e-. Existen molculas intermediarias en las reacciones de oxido-reduccin: la nicotinamida adenina dinucletido
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(NAD+), la nicotinamida adenina dinucletido fosfato (NADP+) y la flavina adenina dinucletido (FAD). Las siglas de las coenzimas anteriormente expuestas representan las molculas oxidadas. Las formas reducidas se representan: NADH + H+ ; NADPH + H+ ; FADH2 , respectivamente. Por ejemplo, el compuesto XH2 es oxidado, NAD+ es reducido: XH2 + NAD+ +
X+ + NADH + H+
Fig. 3.5 - Oxido-reduccin de la coenzima NAD+ ENZIMAS INTRODUCCIN Todas las reacciones que se efectan en los seres vivos son catalizadas por enzimas. Estas hacen posible que las reacciones metablicas se desarrollen a un ritmo razonable, compatible con la vida. El trmino catalizador se emplea para referirse a cualquier sustancia que acelera el transcurso de una reaccin qumica, sin intervenir en ella ni como reactivo ni como producto. El catalizador no provoca la reaccin solo afecta la velocidad con que ocurre la misma. Esto es posible por que los catalizadores disminuyen la energa de activacin como lo indica el siguiente grfico.
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Fig. 3.6 - Perfil de energa de una reaccin exergnica. La curva punteada indica el curso de la reaccin sin enzima. La curva continua el curso de la reaccin en presencia de la enzima Segn su naturaleza los catalizadores pueden ser qumicos o biolgicos (Tabla 3.1) Tabla 3.1 - Diferencias entre catalizadores biolgicos y qumicos BIOLGICOS QUMICOS Son especficos para una determinada reaccin Aceleran cualquier reaccin inespecficamente. qumica o para un grupo de reacciones qumicas a para un sustrato o grupo de sustratos. Son protenas mayoritariamente ( hay ARN (Ribozimas) con funcin enzimtica). Son saturables Son altamente eficaces (son eficaces en bajas concentraciones). Puede ser regulada su actividad cataltica. Son sustancias simples finamente divididas. No son saturables. Son medianamente eficaces. No pueden ser regulados.
Son termolbiles y su actividad puede variar tambin No son termolbiles ni se alteran con cambios de pH. de acuerdo al pH del medio. Una enzima puede estar formada por una sola cadena de polipptido, consistir en subunidades mltiples o requerir de componentes no proteicos. En general las reacciones catalizadas por enzimas se llevan a cabo a presin, temperatura y pH moderado. CLASIFICACIN Desde el punto de vista estructural podemos clasificar a las enzimas en simples y conjugadas (de la misma forma que hemos clasificado a las protenas).
Cuadro 3.1 - Clasificacin de las enzimas segn su estructura Enzimas simples: son aquellas que constan solo de una estructura proteica. Pueden estar formadas por una o varias cadenas polipeptdicas. Enzimas conjugadas: tambin llamadas holoenzimas poseen en su estructura una parte no proteica denominada cofactor y una parte proteica que se denomina apoenzima. Para que estas enzimas acten como catalizadores es necesario que la apoenzima se una al cofactor. El trmino cofactor puede aplicarse tanto a un In como a una molcula orgnica de naturaleza variable (grupo prosttico y coenzimas). Las coenzimas funcionan como portadores de grupos qumicos pequeos como ser acetilo, metilo o bien protones y electrones. Las coenzimas se unen no covalentemente a la apoenzima permitiendo que la holoenzima as formada lleve a cabo reacciones que la apoenzima sola no puede efectuar. Por ejemplo, ninguna de las cadenas laterales de los aminocidos es capaz de transportar electrones pero cuando se agrega por ejemplo la coenzima FAD+, la protena adquiere esta funcin. Las molculas orgnicas que estn fuertemente unidas a
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la apoenzima se denominan grupos prostticos. Muchas coenzimas derivan de vitaminas solubles en agua como ser las del grupo B (Tabla 3.2). Tabla 3.2 - Vitaminas hidrosolubles , sus coenzimas derivadas y sus funciones Vitamina Tiamina (B1) Coenzima derivada Pirofosfato de tiamina Flavina mononucletido Riboflavina (B2) Flavina y adenina dinucletido Nicotinamida y adenina dinucletido Nicotinamida y adenina dinucletido fosfato Abreviatura TPP FMN FAD NAD+ NADP
+
Funcin Descarboxilacin y transferencia de grupos acilo. Portadores de hidrgeno y electrones en oxido-reducciones
cido Nicotnico
Portadores de hidrgeno y electrones en oxido-reducciones Transaminacin y decarboxilacin
Piridoxina, piridoxal y piridoxamina (B6) cido Pantotnico Biotina cido Flico Cobalamina (B12) Coenzima A Enlazada covalentemente a carboxilasas Tetrahidrofolato Coenzima de cobamida TH4 CoASH
Transferencia de acilos Carboxilacin Transferencia de un carbono Reordenamientos, transferencia de metilos
Otra forma de clasificarlas es de acuerdo con las reacciones que catalizan, como se indica en la Tabla 3.3, a continuacin. Tabla 3.3 - Clasificacin de las Enzimas (segn International Union of Biochemestry) CLASE TIPO DE REACCIN CATALIZADA Sntesis de componentes a trves de la ruptura oxidativa o reductora de un enlace de alta energa. 1 - Oxidorreductasas p. ej. alcohol deshidrogenasa alcohol + NAD+ colina + glutamato Transferencia de un grupo funcional de una molcula a otra. 2 - Transferasas p. ej. aspartato aminotransferasa L-aspartato + 2-oxoglutarato 2- oxalacetato + 1-L-glutamato Ruptura de enlaces por hidrlisis 3 - Hidrolasas p. ej. Acetilcolina + H2O 2 oxalacetato + L- glutamato Ruptura de enlaces por eliminacin 4 - Liasas p. ej. Piruvato descarboxilasa 2 oxocido aldehdo + CO2 Modificacin de la forma o del ordenamiento espacial de las molculas . 5 - Isomerasas p. ej. Fosfoglicerato mutasa
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2-fosfoglicerato 3- fosfoglicerato Unin de molculas usando la energa que se deriva de la hidrlisis de los enlaces de alta energa 6 - Ligasas p. ej. Acetil- CoA ligasa ATP + acetato+ CoA AMP + acetato + CoA + pirofosfato + acetil-CoA SITIO ACTIVO Es el sitio en el cual el o los sustratos se unen a la enzima. En general estos sitios se encuentran en el interior de la estructura proteica, formando hendiduras o bolsas, de manera que el sustrato pueda experimentar un mximo de interacciones con la enzima. De toda la estructura de la enzima, que en realidad son molculas enormes, solo una parte muy pequea interacta con el sustrato en general solo participar cinco o seis aminocidos. La especificidad de una enzima hacia su sustrato es una de las caractersticas ms notables, normalmente se propone el modelo de llave y cerradura para explicar la forma complementaria en que interactan la enzima y el sustrato, sin embargo esto nos hace pensar en una estructura rgida. Actualmente se sabe que las enzimas son molculas flexibles, por lo tanto el modelo ms correcto sera el llamado ajuste o encaje inducido, en donde el sitio activo se modifica para hacerse complementario al sustrato. Una manera de graficar este modelo sera la forma en que un guante se ajusta a la mano, es decir el guante tiene una forma particular, que al momento de interactuar con la mano se modifica, hacindose complementaria con la misma. MECANISMO DE ACCIN Como hemos visto las propiedades qumicas de una enzima dependen casi enteramente de las cadenas laterales. La actividad cataltica de una enzima resulta de la unin de la molcula de sustrato al sitio activo de la enzima por medio de interacciones generalmente dbiles. Al parecer, las ms significativas son las interacciones puente hidrgeno. Tambin debemos recordar que esta unin es sumamente especfica.
Fig. 3.7 - Ciclo cataltico de una enzima Una vez que la enzima reconoce al sustrato y se ajusta a l, se forma un complejo que recibe el nombre de complejo enzima-sustrato. La ruptura y la formacin de los enlaces se llevan a cabo por las interacciones
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entre las cadenas laterales de la enzima y los enlaces dentro del sustrato. Una vez que se han formado los productos obtenemos un complejo que recibe el nombre de complejo enzimaproducto, finalmente los productos se separarn de la enzima recuperndose esta para reaccionar con otra molcula de sustrato, es decir que en el transcurso de la reaccin la enzima no se modifica. FACTORES QUE MODIFICAN LA VELOCIDAD DE LAS REACCIONES QUMICAS Una determinada reaccin qumica ocurre solo en condiciones termodinmicas favorables, esto es cuando la energa de los reactivos o sustratos es mayor que la energa de los productos. La velocidad con que dicha reaccin ocurrir depende de distintos factores como ser la cantidad de reactivo o sustrato que interviene, la temperatura, el pH, etc. Como hemos mencionado, las enzimas aumentan la velocidad de las reacciones qumicas, sin embargo no las provocan, por lo tanto la concentracin de enzimas es otro de los factores que modifican la velocidad de la reaccin as como tambin aquellas sustancias que pueden inhibir la accin de la enzima (inhibidores). 1. Concentracin de sustrato En general a medida que aumenta la cantidad de reactivos o sustratos la velocidad tambin aumenta. En el caso de las reacciones qumicas conviene aclarar que la velocidad se mide como cantidad de producto formado por unidad de tiempo, las unidades sern: gr/seg, moles/seg, moles/min, etc. De este modo cuanto ms reactivo tenemos, ms producto se formar. En el caso de las reacciones catalizadas por enzimas, el efecto de la cantidad de sustrato es el siguiente: A medida que aumenta la cantidad de sustrato la velocidad aumenta en forma lineal (zona proporcional), luego si bien la velocidad contina aumentando ya no lo hace en forma lineal (zona mixta) hasta que finalmente la reaccin alcanza una velocidad mxima que es constante, se vuelve independiente de la cantidad de sustrato (zona de saturacin). Esto ocurre debido a que los sitios activos de las enzimas se encuentran todos interactuando con las molculas de sustrato, por lo tanto hasta que no finalice la reaccin la enzima no puede unirse a otro sustrato.
Fig. 3.8 - Efecto de la concentracin de sustrato sobre la cintica enzimtica 2. Concentracin de enzimas La concentracin de enzimas es otro de los factores que modifica la velocidad, cuanto mayor cantidad de enzima este presente, mayor ser la velocidad que se alcanzar, debido a que necesito ms cantidad de sustrato para alcanzar la saturacin.
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3. Temperatura En general las reacciones ocurren ms rpidamente cuando se le otorga calor, ya que el aumento de la temperatura hace que aumente la energa cintica de las molculas y de esta manera reaccionen con facilidad. Cuando las reacciones estn catalizadas por enzimas se produce primero un efecto complementario, es decir, la velocidad va aumentando conforme al aumento de temperatura, sin embargo la velocidad llega a un punto ptimo a partir del cual la velocidad comienza a decaer. No nos olvidemos que las enzimas son protenas, por lo tanto son susceptibles a la desnaturalizacin, es decir que la velocidad decae porque las enzimas pierden su actividad biolgica como consecuencia de la desnaturalizacin. Algunas enzimas son termoestables, es decir su actividad biolgica permanece aun a temperaturas mayores a 90 C. 4. pH El grfico de actividad en funcin del pH es similar al de la temperatura, es decir a pH extremos las protenas se desnaturalizan, por lo tanto la actividad biolgica decae. Algunas enzimas no varan su actividad con el pH sino que esta se mantiene constante en un amplio rango. Otra tendrn el pH ptimo cido o bsico teniendo en cuenta el medio en donde actan.
Fig. 3.9 - Efecto de la temperatura (a) y el pH (b) sobre la actividad enzimtica 5. Inhibidores Aunque hay muchos ejemplos de inhibidores, los mecanismos de inhibicin pueden ser de dos clases: reversibles e irreversibles, tambin hay mecanismos intermedios.
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Fig. 3.10 - Perfil de una reaccin en presencia de inhibidor COMPETITIVO y sin inhibidor 5.1. Inhibidores irreversibles: estos inhibidores se enlazan con fuerza a la enzima, generalmente se unen covalentemente a algn aminocido del sitio activo. Existen algunos inhibidores que se conocen como sustrato suicida, que se enlazan al centro activo y qumicamente se transforma en una especie reactiva que modifica en forma irreversible al aminocido del sitio activo. 5.2. Inhibidores reversibles: este tipo de inhibidores se disocian fcilmente de las enzimas, dentro de este grupo encontramos los inhibidores competitivos y los no competitivos. 5.2.a. Los inhibidores competitivos compiten con el sustrato por el sitio activo de la enzima, y si aumentamos la cantidad de sustrato, el efecto inhibidor se revierte alcanzndose la velocidad mxima.
Fig. 3.11 - Perfil de una reaccin en presencia de inhibidor NO COMPETITIVO y sin inhibidor 5.2.b. Los inhibidores no competitivos se enlazan a un sitio distinto del sitio activo, de manera que el inhibidor se puede unir a la enzima libre o bien al complejo enzima sustrato, pero en ninguno de los casos obtendremos productos. El efecto de estos inhibidores no se revierte por el agregado de mayor cantidad de sustrato, de manera que se llega a una velocidad mxima menor que si no tuviera el inhibidor. No es raro observar algunos inhibidores a los cuales no se les puede comprobar el mecanismo exacto de inhibicin, siendo en algunos casos un tipo de inhibicin mixta. REGULACIN DE LA ACTIVIDAD ENZIMTICA Dentro de las clulas se llevan a cabo infinidad de procesos metablicos, todos ellos relacionados entre s, de manera que deben estar controlados en forma precisa, para que a cada instante la clula disponga de los
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metabolitos necesarios para su funcionamiento. Para lograr esta coordinacin metablica es preciso disponer de mecanismos de control o regulacin adecuados. Existen distinto tipos de mecanismos regulatorios de la actividad enzimtica: 1. 2. 3. 4. Inhibicin por producto final Regulacin alostrica Regulacin por modificacin covalente Regulacin gentica
1. Inhibicin por producto final: Con frecuencia las enzimas son inhibidas en forma competitiva por los productos de las reacciones que catalizan. Esto es predecible, ya que la estructura del producto es muy similar a la del sustrato. Esta inhibicin ocurre en las ltimas etapas de la reaccin cuando hay una gran cantidad de producto y baja concentracin de reactivo o sustrato. En la mayora de los casos, las reacciones metablicas no ocurren en un solo paso, sino que son varias y encadenadas formando parte de una ruta metablica, en donde el producto de una reaccin es el sustrato de la siguiente. Generalmente en estos casos el producto final, es decir el producto de la ltima reaccin de esa va, acta inhibiendo a las enzimas que intervienen en los primeros pasos.
Fig. 3. 12 - Retroalimentacin negativa (feedback negativo) en una ruta metablica. Cuando el producto final Z se acumula, inhibe alguno de los primeros pasos de la ruta.
Fig. 3.13 - Regulacin alostrica. (a) La mayora de las enzimas alostricas se ensamblan a partir de 2 o ms subunidades. Cada una posee un sitio activo. La enzima oscila entre dos estados: activo e inactivo. Alejado del sitio activo esta el sitio alostrico, que acta como un receptor especfico regulando la actividad enzimatica. (b) Se observa el efecto opuesto de un activador y un inhibidor sobre las cuatro subunidades de la enzima. (c) Efecto de cooperacin: un sustrato unido a uno slo de los sitios activos (encaje inducido), puede activar toda la enzima.
2. Regulacin alostrica: Este tipo de regulacin ocurre solo en las enzimas alostricas, que son enzimas que por lo general tienen estructura cuaternaria y adems del sitio activo poseen otro capaz de reconocer efectores, que se denomina sitio alostrico. Los efectores son sustancias que pueden modular la actividad
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de las enzimas, algunos efectores aumentan la actividad enzimtica, de modo que se conocen como efectores positivos y otros tienen efecto inhibitorio que se denominan efectores negativos. Las enzimas alostricas presentan curvas de saturacin del sustrato distintas a lo que vimos anteriormente, dan una curva sigmoidea en lugar de una hiprbola (Fig. 3.14).
Fig. 3.14 - Curva de saturacin de una enzima alostrica. Como otro ejemplo de este tipo de regulacin, podemos mencionar la enzima fosfofructoquinasa que cataliza la siguiente reaccin:
FRUCTOSA 6 FOSFATO + ATP ADP + FRUCTOSA 1,6 DI-FOSFATO

El ATP es un modulador negativo, es decir que disminuye la actividad de la enzima , mientras que el AMP y el P son moduladores positivos 3. Regulacin por modificacin covalente: en este mecanismo algn aminocido de la enzima se une covalentemente a algn grupo qumico y de esta forma se activa o se inactiva la enzima. El grupo que ms frecuentemente interviene en este tipo de regulacin es el grupo fosfato (P) y los aminocidos que normalmente intervienen son la serina y la treonina. Algunas enzimas se activan al unirse al grupo fosfato y se inactivan si lo pierden
Enzima A (inactiva) + P
Enzima A + P (activa)
Otras se activan al perder el grupo P y se inactivan al ganarlo
Enzima B ~ P (inactiva)
Enzima B (activa) + P
El ejemplo ms caracterstico lo constituyen las enzimas que intervienen en la sntesis y degradacin de glucgeno.
Protena quinasa ~P (inactiva) Fosforilquinasa (inactiva)
Protena quinasa (activa) + P Fosforilasa quinasa ~P (activa) Fosforilasa ~ P (activa) Glucgeno Glucosa
Fosforilasa (inactiva)
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4. Regulacin gentica: Involucra el control a nivel del ADN. El ADN es la molcula que almacena la informacin para la sntesis de protenas de acuerdo al siguiente flujo de informacin:
Fig. 3.15 - Flujo de la informacin gentica De manera que si podemos impedir el pasaje de ADN a ARN (transcripcin) impedimos la sntesis de la enzima y por ende no se catalizar la reaccin en la que dicha enzima interviene. EL ARN COMO CATALIZADOR BIOLGICO Hasta hace poco tiempo se supona que los catalizadores biolgicos siempre eran protenas. Recientemente se demostr que el ARN puede actuar como catalizador en el corte y empalme de intrones (proceso que veremos en otro captulo). Adems se ha demostrado que la especie de ARN llamado ARN L19 posee todas las propiedades caractersticas de las enzimas, tales como la saturacin, inhibicin competitiva, especificidad de sustrato, etc., con la excepcin de que no es una protena. Estos ARN catalticos reciben el nombre de ribozimas. ACTIVIDADES DE AUTOEVALUACIN 1. 2. 3. 4. Qu es una enzima? Cul es su importancia biolgica? Qu tipos de catalizadores conoce? Qu es una ribozima? Mencione y explique brevemente los mecanismos de regulacin enzimtica.
PREGUNTAS DE OPCIN MLTIPLE 1. a. b. c. d. e. 2. a. b. c. d. La temperatura: aumenta el efecto cataltico de las enzimas siempre disminuye el efecto cataltico de las enzimas siempre aumenta el efecto hasta alcanzar un mximo a temperatura ambiente disminuye la accin cataltica a partir de los 80 C ninguna es correcta. Una enzima alostrica: se puede regular no se puede regular aumenta su efecto cataltico al unirse a un efector positivo a y c son correctas
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e. 3. a. b. c. d. e. 4. a. b. c. d. e. 5. a. b. c. d. e. 6. a. b. c. d.
b y c son correctas Un inhibidor competitivo: siempre se une al sitio alostrico se une al sitio activo es parecido al sustrato a y c son correctas b y c son correctas. Un cofactor es: una molcula orgnica que aumenta el efecto cataltico una molcula orgnica que disminuye el efecto cataltico una molcula inorgnica que se une covalentemente a la enzima una molcula necesaria para que la apoenzima acte ninguna es correcta Las enzimas son: especficas saturables termolbiles regulables todas son correctas Un grupo prosttico: es una secuencia de aminocidos que forman parte del sitio activo. forma parte de la estructura de ciertas enzimas, pudiendo disociarse de ellas fcilmente. es un grupo qumico no protico unido covalentemente a ciertas enzimas y protenas. es la parte protica de una holoenzima.
7. La formacin del complejo enzima-sustrato: a. b. implica necesariamente la unin covalente del sustrato al sitio activo de la enzima. se lleva a cabo mediante interacciones dbiles entre el sustrato y el sitio de unin de la enzima.
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c. d.
es un proceso irreversible, que conduce indefectiblemente a la formacin del producto. es bloqueada por los inhibidores competitivos, an frente a altas concentraciones del sustrato.
8. El FAD y el FMN son: a. b. c. d. grupos prostticos caractersticos de los citrocromos cofactores enzimticos metlicos coenzimas derivadas de la riboflavina holoenzimas
9. La hidrlisis del ATP para dar ADP + Pi es : a. b. c. d. una reaccin no espontnea una reaccin endergnica posible acoplarla a las reacciones exergnicas una reaccin exergnica
10. Cul de las siguientes afirmaciones no es cierta acerca de las conversiones energticas? a. b. c. d. Algo de energa til siempre se disipa hacia el entorno como calor. La energa total de un sistema y su entorno permanece constante. Las reacciones exergnicas se llevan a cabo espontneamente. El energa potencial de un sistema siempre permanece constante despus de una conversin energtica.
e. Las reacciones exergnicas usualmente resulta en un estado final que tiene menos energa potencial que el estado inicial. 11. Las reacciones que requieren consumo de energa se conocen como: a. b. c. d. e. endergnicas exergnicas exotrmicas reductiva oxidativas
12. Todas las reacciones que ocurren espontneamente se llaman: a. b. exergnicas oxidativa
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c. d. e.
exotrmica reductiva endergnica
13. La medida de azarocidad o desorden en un sistema se conoce como: a. b. c. d. e. calor. entropa el cambio en la energa libre. entalpa calor especfico
14. En cul situacin la entropa no se incrementara? a. b. c. d. e. Un cubito de hielo derritindose. Algunas plantas murindose debido a la falta de agua. Algo de sal disolvindose en agua. Agua hirviendo evaporndose. Un grupo de plantas producindo glucosa.
BIBLIOGRAFA Alberts, B et al. (1996) Biologa Molecular de la Clula. 3ra Edicin. Ediciones Omega S.A.Barcelona. Campbell, N. (1997) Biology. 4th Edition. the Benjamin Cummings Publishing Company. Inc. California. Curtis y Barnes (1992). Biologa. 5 Ed. Bs.As. Editorial Mdica Panamericana. Harper, (1995) Manual de Bioqumica. Ediciones El Manual Moderno. Mxico. Karp, G.. (1998) Biologa Celular y Molecular. Ed. Mc Graw Hill Interamericana. Mxico. Kuchel,p y Ralston, G. (1994) Bioqumica General. Serie Schaum. Ed. McGraw-Hill. Mxico. Smith and Wood. (1998) . Molculas Biolgicas. Ed.Addison-Wesley. Iberoamericana S.A. Solomon y col. (1998) . Biologa de Villee. 4. Ed.McGraw-Hill. Interamericana. Mxico. Stryer, L.. (1995) Bioqumica. Ed. Revert. Espaa.
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Introduccin al Metabolismo

Energa potencial Energa cintica

Funcin Descarboxilacin y transferencia de grupos acilo. Portadores de hidrgeno y electrones en oxido-reducciones

Portadores de hidrgeno y electrones en oxido-reducciones Transaminacin y decarboxilacin

Transferencia de acilos Carboxilacin Transferencia de un carbono Reordenamientos, transferencia de metilos

FRUCTOSA 6 FOSFATO + ATP ADP + FRUCTOSA 1,6 DI-FOSFATO

Otras se activan al perder el grupo P y se inactivan al ganarlo

Protena quinasa ~P (inactiva) Fosforilquinasa (inactiva)

exotrmica reductiva endergnica

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