INSTITUTO TECNOLGICO SUPERIOR DE LERDO

Formatos De Archivos De Secuencia

Alumna Ilse Elizabeth Mauricio Adame Grupo: Carrera: Materia: Titular de la materia: 10231386

4B Ingeniera en Informtica Administracin Y Organizacin De Datos Ricardo Bustamante Gonzlez

Cd. Lerdo, Durango. 10 de Febrero 2012

Los archivos se utilizan mucho, las personas para guardar informacin de cualquiera que esta sea. Y poderla ver cuando nosotros la deseemos.

Los archivos son en si un conjunto de bits, a estos archivos tambin se le conoce como ficheros, esto quiere decir que es el conjunto de datos, o informacin. Los ficheros se guardan en las unidades como el disco duro, diskette, memorias USB, entre otros. Una de las caractersticas de los archivos son es que no esta determinado el tamao del archivo a crear, no importa si es pequeo o no. Adems de que cada archivo se caracteriza por tener un identificador entonces para nosotros, el identificador es el nombre que nosotros deseemos, ponerle a este. Entonces los archivos secuenciales podramos decir que se utiliza para ordenar la informacin. Por eso son secuenciales, ya que la secuencia es un ordenamiento sin importar que sea descendente o ascendente. Pero a nosotros como usuarios para que nos pueden servir que el contenido de los archivos estn ordenados? Bueno a nosotros nos puede servir de que el ordenamiento nos sirva de ventaja, para cuando el usuario desee encontrar alguna informacin, entonces tenerla ordenada a esta nos va reducir tiempo, y esto a la larga pues es un buen beneficio. Todo esto que tiene que ver con los archivos secuenciales los podemos ver mas, en registros, como las bases de datos, un ejemplo de esto de office como el Access que sirve de registro, que sirve para base de datos, para mas u menos almacenaje de informacin. En este tipo cuando se esta creando una tabla existen muchos campos, numricos y de caracteres y otros mas, en los numricos podemos poner fechas, nmeros de telfono etc. Y en los de tipo de caracteres, pues se puede poner el nombre, direcciones, etc. Pero aqu se deja por default la primera columna, pero esta columna es la llave. Esto quiere decir que es la entrada que puede enlazar al archivo a otro. Y a los campos de las tablas de registro son donde se almacena la informacin y a estos espacios de campo se les conoce como atributos de la estructura de los archivos. Las operaciones que se pueden realizar en archivo secuencial son insertar, borrar y modificar un archivo esto es lo que solo se puede realizar. Adems de que se auxiliara de un archivo de transacciones. Despus de conocer algo de archivos ahora vamos a los formatos de archivos secuenciales.

Formato PHYLIP: Esta categora se utiliza mucho para el formato de entrada de varios programas o paquetes de anlisis. Tambin hay que saber que se debe de utilizar un identificador de caracteres que no supere los 10 caracteres, esto es para que todo se pueda identificar, y no batallar a la hora de buscar algo. GenBank: En este consiste principalmente, para proporcionar al usuario una informacin bastante completa sobre la secuencia que est utilizando. EMBL: En este los formatos son reportes que se generan por las bases de datos. Se dice que antes de su formato deben cambiarlo cuando se utilice el paquete. En el PIR: se utiliza el formato son los que se generan pueden venir de las bases de datos de tipo PIR. los archivos que

FASTA: Segn esto se dice que es el formato mas empleado es la actualidad. CLUSTAL: Este se utiliza para las secuencias alineadas, y se representan por el cdigo de una letra, como por ejemplo los gaps son indicados con un guin "" y al final de las secuencias alineadas, puede aparecer una especie de secuencia consenso con signo como: "*", ":" y ".". MSF: Este se va a utilizar solo para cuando se utiliza para cuando se va a utilizar ms de una secuencia alineada. El MSF del GCG: se utiliza para los archivos de introduccin, que corresponden a la secuencia. RSF: En este tipo de formato se utiliza por los programas GCG, que permite estar introduciendo secuencias para llevara a cabo algo.

Con esto concluimos todo lo relacionado con los formatos de archivo de secuencia, de que todos los formatos son importantes para cualquier para la creacin de cualquier archivo.