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Domnio Archaea

Grupo de microrganismos procariontes 4 filos: 844 espcies descritas

Conhecimento das Archaea


Em 1970 vrios organismos procariticos foram isolados a partir de uma srie de ambientes considerados inspitos, quase que incompatveis com a presena de seres vivos. Temperaturas elevadas (prximas a 100C) Extrema acidez ou alcalinidade (pH 2 e 10) Altas salinidades (at 32%, 5,5 M NaCl)

***

Salinidade mdia de oceanos cerca de 3,5%.

Muitas vezes, ausncia completa de oxignio

Organismos primitivos????

Carl Woese e colaboradores (1977) realizaram estudos comparativos de sequncias de DNAr 16S e 23S de diferentes organismos

FILOGENIA

CLASSIFICAO PRTICA

PRINCIPAIS CARACTERSTICAS DIFERENCIAIS DO GRUPO DAS ARQUEAS


Grupos Caractersticas

Metanognicas cocos, Gram -, vivem em lodo, aude, estaes de tratamento de esgoto. Ex. Methanosarcina,

Methanobacterium, Metanospirillum
Halofticas extremas Dependentes de enxofre Crescem em 17 a 23% de sal (gua do mar = 3% de NaCl), vivem em lagos salgados, tanques industriais, alimento salgado. Ex. Bacteriorrodospsina. Vivem em fonte de gua quente (50 87 e cida C) (pH menor que 5,5), aerbicas. Energia da oxidao do enxofre, ou de acares e a.cidos. Ex.

Thermoproteus
Termoplasmas Ausncia de parede celular, temperatura tima: 5590 pH timo = 2, as clulas desintegram-se a pH 7. C,

Filos/ Ordens CRENARCHAEOTA (*) Ordem Sulfolobales Ordem Thermoproteales Ordem Desulfurococcales Ordem Cenarchaeales Ordem Caldisphaerales EURYARCHAEOTA Ordem Archaeoglobales Ordem Methanobacteriales(**) Ordem Methanococcales(**) Ordem Methanomicrobiales(**) Ordem Methanosarcinales(**) Ordem Thermoplasmatales(*) Ordem Thermococcales(*) Ordem Halobacteriales(***) KORARCHAEOTA NANOARCHAEOTA

Gneros representativos

Sulfolobus e Acidianus Thermoproteus e Vulcanisaeta Desulfurococcus, Acidilobus e Pyrodictium Cenarchaeum Caldisphaera Archaeoglobus, Ferroglobus e Geoglobus Methanobacterium e Methanobrevibacter Methanococcus e Methanothermococcus Methanospirillum e Methanomicrobium Methanosarcina e Methanohalobium Thermoplasma e Ferroplasma Thermococcus e Pyrococcus
Halobacterium e Natronococcus Organismos no cultivveis

Nanoarchaeum

(*) Termoflicos, (**) Metanognicos, (***) Haloflicos Fontes: The Procaryotes on line e NCBI on line

ARCHAEA: Habitats
Ambientes aquticos frios (podem corresponder a 34% da biomassa procaritica das guas costeiras superficiais da Antrtida) Sistema digestrio do homem e outros animais Pntanos Aterros sanitrios Tecidos vegetais Metanognicas endossimbiontes em protozorios

OBS: Podem ser encontradas nos mais diversos ecossistemas.

Crenarchaeota:
- hipertermfilos, como Thermoproteus, Pyrolobus e Pyrodictium; - Maioria: quimioautotrficos; - Neste filo h tambm organismos isolados (mas ainda no cultivados em laboratrio) de ambientes frios, tais como guas ocenicas.

Yellowstone National Park courtesy of Dr. Ken Stedman

Lagoa quente, rica em enxofre, que convertido a cido sulfrico por espcies de archaea

Sulfolobus, exemplo de uma archaea do filo Crenarchaeota, habitante da lagoa ilustrada ao lado

(Adaptado de Madigan et al., 2003 - Brock Biology of Microorganisms)

Euryarchaeota
ANAERBIAS. Ex: Methanococcus, Methanobacterium e Methanosarcina 2) Haloflicas - AERBIAS. Ex: Halobacterium e Halococcus. Coramse como Gram negativas, no apresentam esporos e, em sua maioria, so imveis. Geralmente possuem grandes plasmdeos (25 a 30% do DNA da clula) 1) Metanognicas

Lago hipersalino no Egito, rico em carbonato de sdio. O pH destas guas encontra-se na faixa de 10, sendo habitado por archaea halfilas extremas, tais como

Thermoplasma, uma archaea desprovida de


parede celular

Halobacterium salinarum

Pilha de refugo da minerao de carvo, que muitas vezes sofre auto-combusto. Hbitat da archaea

Thermoplasma

Korarchaeota
- composto por isolados identificados a partir do sequenciamento de RNAr 16S - Considerado um grupo de hipertermfilos - Poucos espcimes de Korarchaeota foram cultivados em laboratrio

NANOARCHAEOTA txon especialmente criado para a espcie Nanoarchaeum equitans descoberta em 2002

Fonte: http://pt.wikipedia.org/wiki/Nanoarchaeota

C. Brochier, et al. (2005). "Nanoarchaea: representatives of a novel archaeal phylum or a fast-evolving euryarchaeal lineage related to Thermococcales?". ogy 6 (5): R42.

Micrografia de fluorescncia, empregando um corante especfico para DNA, revelando as clulas de Igniococcus (maiores) e de Nanoarchaeum equitans (menores). No quadro direita, micrografia eletrnica evidenciando a estreita associao das duas

archaea

Micrografia de fluorescncia empregando corantes especficos para os rRNAs de Igniococcus (verde) e Nanoarchaeum (vermelho)

Huber et al. (2002) Nature, 417:63-67.

Archaea: Estrutura celular


Formas: esfricas, bacilares, espiraladas, achatadas, quadradas, discides e muitas vezes pleomrficas Tamanho: 0,1 a 15 atingindo 200 m m, com alguns filamentosos

Caractersticas especiais, que permitem desenvolvimento em uma vasta gama de ambientes

seu

Parede celular
- composio e estrutura variveis - ausncia de peptideoglicano - lisozima e penicilina no atuam - Algumas espcies no apresentam - Maioria cora Gram -

Diferentes composies de parede celular presentes em archaea.

(Adaptado de Atlas, R.M. (1997) - Principles of microbiology)

Membrana Citoplasmtica
Membrana Contedo protico Bacteria alto Archaea alto sulfolipdeos, glicolipdeos, hidrocarbonetos ramificados, isoprenoides, fosfolipdeos cadeia ramificada ter (di e tetraeter) CH2-OR Eukarya baixo

Composio lipdica

fosfolipdeos

fosfolipdeos

Estrutura dos lipdeos Ligao dos lipdeos

cadeia linear ster CH2-OCOR

cadeia linear ster

Ligao ter Isoprenos ramificados Anis de ciclopentano

Aumenta estabilidade (resistncia hidrlise e elevadas temperaturas)

Enzimas termoflicas e termoestveis - Substituio de aa associados a conformao flexvel (glicina, serina e alanina) por aa associados com rigidez (treonina, valina e prolina) - Substituio de aa com grupamentos quimicamente ativos (cistena, metionina e asparagina) - Maior taxa de arginina:lisina, que promove interaes polares fortes - Imobilizao dentro de uma matriz insolvel

Cromossomo: nico e circular como no domnio Bacteria. Por outro lado, sua organizao semelhante aos eucariotos, uma vez que o DNA est associado histonas.

Presena

de

ntrons

em

genes

de

RNA

de

hipertermfilos e halfilos Hipertermfilas com contedo G + C mais elevado

Bacteria
Carioteca Nucleossomos/histonas Operons/RNAm policistrnicos Introns protena de ligao TATA box Organelas Cromossomos RNA polimerase Aminocido de iniciao protica Ribossomo Peptoglicano No No SIm No No No Um, circular Uma, simples N-formil metionina 70S Sim

Archaea
No SIm SIm sim SIm No Um, circular Mais que uma, complexas Metionina 70S No

Eukarya
Sim SIm No SIm SIm SIm Mais que um, linear Mais que uma, complexas Metionina 80S No

Sntese de protena

fatores de iniciao protenas ribossmicas fatores de alongamento Archaea mais semelhante Eukarya do que Bacteria

METABOLISMO
Quimioheterotrficas Quimioautotrficas Fermentao rara. Ex: Hyperthermus butylicus As arqueas metanognicas apresentam vias bioqumicas raras, que atravs de sistemas enzimticos nicos, produzem o gs metano (CH4)

Via glicoltica ausente nas arqueas A glicose catabolisada por uma via oxidativa simples O ciclo de Krebs reduzido

ARCHAEA E BIOTECNOLOGIA
Produo de energia (biogs e lcool) Produo de cidos orgnicos, antibiticos, aa Tratamento de efluentes PCR Enzimas extremfilas, biocatlise industrial Polmeros biodegradveis (PHB) Minerao (cobre, ouro, urnio) Plantas transgnicas (genes de halfilas) ...

Diferenas entre as membranas plasmticas das clulas de bactrias, arqueas e eucariontes


Membrana Contedo protico

Bacteria
alto

Archaea
alto

Eucarya
baixo

Composio lipdica

fosfolipdeos

Sulfolipdeos, glicolipdeos, hidrocarbonetos ramificados, isoprenoides, fosfolipdeos

Fosfolipdeos

Estrutura dos lipdeos Ligao dos lipdeos

cadeia linear ster

cadeia ramificada ter (di e tetraeter)

cadeia linear ster

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