MOLCULAS

Cuando dos o ms tomos se unen entre s se forman las molculas. La molcula es la parte ms pequea de un compuesto qumico que conserva sus propiedades. Las molculas que integran los seres vivos son las biomolculas. Se pueden distinguir dos tipos de biomolculas: Biomolculas inorgnicas: La biomolcula inorgnica fundamental es el agua, pero tambin son importantes ciertos gases (O2, N2, CO2), aniones (HCO3 , Cl , SO4=) y cationes (Na+, K+, NH4+) Biomolculas orgnicas: azcares (glucosa, almidn, celulosa), lpidos (triglicridos, esteroides), protenas (hemoglobina, insulina), cidos nucleicos (DNA, RNA) y metabolitos intermediarios (cido actico, urea, etanol)

FRMULAS
La representacin qumica de las molculas se realiza mediante las frmulas, que informan sobre el nmero y clase de tomos que las constituyen y si es preciso, la forma como estn unidos y su situacin real en el espacio. Segn el tipo de informacin que suministran, hay varios tipos de frmulas (Figura 1): Las frmulas empricas indican la clase de tomos que integran la molcula y su proporcin relativa. As, por ejemplo, la frmula emprica del perxido de hidrgeno ser HO, es decir, que la molcula est constituda por hidrgeno y oxgeno en proporcin 1:1. Anlogamente, la frmula emprica del butano es C2H5, o sea, que contiene C e H en proporcin 2:5. La frmula molecular aade a la emprica el nmero real de tomos de cada elemento que forman la molcula. As, las frmulas del perxido de hidrgeno y del butano son, respectivamente, H2O2 y C4H10. En algunos casos, la frmula molecular y la emprica coinciden, pero en muchos otros no. La frmula estructural (o desarrollada) informa sobre la naturaleza y el nmero de tomos que integran la molcula, e indica con todo detalle cmo estn unidos entre s. La frmula racional (o semidesarrollada) informa sobre la naturaleza y el nmero de tomos que integran la molcula, e indica de forma resumida cmo estn unidos entre s. Las frmulas electrnicas representan la distribucin de los e- de valencia de los tomos que componen la molcula. Cada trazo equivale a 2 e-. Si son

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compartidos, el trazo va de tomo a tomo y si los dos e- pertenecen a un solo tomo se dibuja junto a l. Tambin se llaman diagramas de Lewis. Las frmulas espaciales informan de la verdadera direccin de los enlaces interatmicos, consecuencia de la naturaleza y propiedades de los e- implicados en estos enlaces. As, la frmula espacial del metano (CH4) corresponde a un tetraedro. Anlogamente, los tomos del H2O2 ocuparan el lomo y las pginas de un libro abierto.

GEOMETRA DE LAS MOLCULAS

Tanto la estructura como las propiedades de las biomolculas dependen en gran medida de la situacin relativa de sus tomos en el espacio y de las distancias que los separan. Por este motivo, es muy importante conocer las distancias interatmicas y los ngulos que forman los enlaces entre s. DISTANCIAS INTERATMICAS E INTERMOLECULARES La distancia que separa los ncleos de dos tomos pertenecientes a una misma molcula y enlazados covalentemente se pueden obtener sumando sus radios covalentes respectivos. En qumica, se denomina radio covalente a la mitad de la distancia entre dos tomos iguales unidos por un enlace covalente (Figuras 2 y 3). A cada tomo se le asigna una longitud de radio covalente. Si se trata de un enlace doble o triple, las distancias interatmicas resultan menores (Figura 4). La aproximacin mxima entre dos tomos pertenecientes a diferentes molculas viene determinada por la distancia de Van der Waals. Esta distancia se obtiene sumando los radios de Van der Waals de los tomos que establecen contacto. El radio de van der Waals es el radio de una esfera slida imaginaria empleada para modelizar el tomo (Figuras 5 y 6). NGULOS DE ENLACE EN LAS BIOMOLCULAS La direccin de los enlaces en el espacio depende de los tipos de hibridacin de los tomos enlazantes. En las Figuras 7, 8a y 8b se indican los principales tipos de hibridacin y la forma geomtrica de algunas biomolculas representativas. Estas formas geomtricas son aproximadas, ya que las figuras geomtricas tipo se distorsionan cuando los tomos enlazados no son idnticos. As, el CH4 ser tetradrico, pero el cloroformo (CHCl3) estar ligeramente distorsionado.

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FUNCIONES ORGNICAS DE INTERS BIOLGICO

La gran variabilidad estructural de los compuestos orgnicos se debe a la situacin privilegiada del tomo de carbono en el Sistema Peridico, en el centro del segundo perodo. El carbono tiene cuatro electrones en el ltimo nivel, y debido a su electronegatividad intermedia, puede unirse a otros tomos de carbono mediante enlaces sencillos, dobles o triples y formar cadenas abiertas o cerradas, de longitud variable (Figuras 9 y 10). Se asigna a cada tomo de carbono el calificativo de primario, secundario, terciario o cuaternario segn se enlace con uno, dos, tres o cuatro tomos de carbono distintos. Esta denominacin es independiente del nmero de valencias que pueda utilizar en cada enlace (Figura 11). Adems, esa electronegatividad intermedia le permite unirse a otros muchos tomos, tanto electropositivos (H) como electronegativos (O, N, S). Se define el grado de oxidacin de un carbono como el nmero de valencias que utiliza el carbono para unirse con el oxgeno o con otros tomos electronegativos (N, S, halgenos). As, los hidrocarburos son funciones con grado de oxidacin cero, los alcoholes tienen grado de oxidacin uno, los aldehdos tienen grado de oxidacin dos, los cidos carboxlicos tienen grado de oxidacin tres, y la urea tiene grado de oxidacin cuatro. Las funciones orgnicas se clasifican segn el grado de oxidacin del carbono portador de la funcin. El grado de oxidacin tambin es quien define el orden de prioridad de los grupos funcionales (Figura 12). HIDROCARBUROS Y RADICALES Los hidrocarburos son compuestos binarios de carbono e hidrgeno. Son sustancias muy apolares, y por lo tanto no son miscibles con el agua y s con disolventes orgnicos (cloroformo, ter). Son especialmente interesantes porque todos los dems compuestos orgnicos se estructuran a partir de ellos. En funcin de su cadena carbonada, los hidrocarburos pueden ser abiertos, alicclicos o aromticos. Entre los abiertos, la cadena puede ser lineal o ramificada. El nombre sistemtico de los hidrocarburos de cadena lineal consta de tres partes. La primera alude al nmero de carbonos de la molcula. El nmero de carbonos viene indicado por distintos prefijos (los ms usuales aparecen en la Figura 13a). La segunda parte indica el tipo de enlaces presentes en la cadena carbonada. Si todos son sencillos se indica por -an-; un doble enlace se indica por -en- y un triple enlace se indica por -in-. Si hay ms de un doble o triple enlace, se colocan los prefijos di, tri, tetra, etc. La tercera parte del nombre hace referencia al carcter hidrocarburo del compuesto, y se indica por la terminacin -o (Figuras 13a y 13b). Al sustituir un hidrgeno de un hidrocarburo por una valencia libre se obtiene un radical. Los radicales se nombran como el hidrocarburo de origen, sustituyendo la terminacin -o por la terminacin -il o -ilo (Figura 14). Si el hidrocarburo es saturado se omite la partcula -an-.

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Los hidrocarburos alicclicos contienen una cadena carbonada cerrada. Los hidrocarburos alicclicos y sus radicales se nombran como los abiertos, anteponiendo el prefijo ciclo. Los hidrocarburos aromticos contienen al menos un anillo bencnico, con tres dobles enlaces conjugados estabilizados por resonancia. La mayor parte de los hidrocarburos aromticos y sus radicales tienen nombres consagrados por el uso (Figura 15). ALCOHOLES Y FUNCIONES RELACIONADAS Los alcoholes son compuestos ternarios de C, H y O. Pueden considerarse derivados de los hidrocarburos por sustitucin de un tomo de H por un grupo hidroxilo (-OH) (Figura 16). Al contener en su molcula un radical alquilo y un grupo hidroxilo tienen propiedades fsicas intermedias entre los hidrocarburos y el agua. Su carcter apolar aumenta con la longitud de la cadena carbonada, mientras que su carcter polar o hidroflico aumenta con el nmero de hidroxilos en la molcula. Se nombran como los hidrocarburos, cambiando el sufijo -o por -ol. Si hay ms de un grupo hidroxilo en la misma molcula, se antepone el prefijo di, tri, tetra..., y se indica mediante un nmero a qu carbono est unido cada grupo -OH (Figura 15). Los alcoholes pueden ser primarios, secundarios o terciarios segn la naturaleza del carbono que sustenta la funcin. Por condensacin de dos funciones alcohol con prdida de una molcula de agua se obtiene la funcin ter (Figuras 17 y 18). ALDEHDOS, CETONAS Y FUNCIONES RELACIONADAS Los aldehdos y las cetonas son funciones con grado de oxidacin 2. Se consideran derivados de un hidrocarburo por sustitucin de dos tomos de hidrgeno en un mismo carbono por uno de oxgeno, dando lugar a un grupo oxo (=O). Si la sustitucin tiene lugar en un carbono primario, el compuesto resultante es un aldehdo, y se nombra con la terminacin -al. Si la sustitucin tiene lugar en un carbono secundario, se trata de una cetona, y se nombra con el sufijo -ona (Figuras 19a, 19b y 19c). El grupo carbonilo (>C=O), comn a aldehdos y cetonas, confiere polaridad a la molculas, aunque en menor cuanta que el grupo hidroxilo. Los aldehdos y cetonas pueden, por captacin de un tomo de hidrgeno de un carbono contiguo, dar lugar a una reaccin intramolecular con formacin de un doble enlace y una funcin hidroxilo, es decir, un enol. Este proceso es fcilmente reversible y se conoce con el nombre de tautomera cetoenlica (Figura 20). Una de las reacciones qumicas ms importantes del grupo carbonilo es la adicin de una molcula de alcohol para dar hemiacetales (hemicetales si son cetonas). Los hemiacetales (Figura 21) pueden condensar con otra molcula de alcohol, con prdida de una molcula de agua, para dar acetales (cetales si son cetonas).

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CIDOS CARBOXLICOS Y FUNCIONES RELACIONADAS Los cidos carboxlicos son funciones con grado de oxidacin tres, es decir, en un mismo tomo de carbono se insertan un grupo oxo (=O) y un grupo hidroxilo (OH), formando un grupo carboxilo. Se nombran sistemticamente sustituyendo la terminacin -o del hidrocarburo de procedencia por el sufijo -oico, pero la mayora posee nombres vulgares consagrados por el uso (Figura 22). El grupo carboxilo es el responsable de la polaridad de la molcula y de la posibilidad de establecer enlaces de hidrgeno. El hidrgeno del hidroxilo puede disociarse y el compuesto se comporta como un cido (Figura 23). Esta disociacin se ve favorecida por la resonancia del in carboxilato, ya que el doble enlace se deslocaliza y la carga negativa se distribuye entre los dos tomos de oxgeno (Figura 23). En la misma molcula pueden existir varios grupos carboxlicos. El nmero de estos grupos se indica con los prefijos di, tri, tetra, etc. Los cidos monocarboxlicos de cadena larga se llaman tambin cidos grasos. Los cidos carboxlicos pueden reaccionar con lcalis para dar lugar a sales. En el caso de los cidos grasos, estas sales se denominan jabones. Cuando los cidos carboxlicos reaccionan con alcoholes dan lugar a steres (Figura 24). El enlace ster se puede producir dentro de una misma molcula, en cuyo caso se origina una funcin lactona (Figura 25). Dos grupos carboxilo o un grupo carboxilo y un cido inorgnico pueden condensar (con prdida de agua) para originar un anhdrido (Figura 26). FUNCIONES NITROGENADAS Se originan al sustituir uno o varios hidrgenos del amonaco (NH3) por diversos radicales orgnicos. Las aminas se originan cuando se sustituyen uno o ms hidrgenos del amonaco por radicales alquilo (Figuras 27a y 27b). Segn el nmero de hidrgenos sustitudos se distinguen aminas primarias, secundarias o terciarias. El grupo amino (NH2) confiere a la molcula un carcter polar algo ms atenuado que el grupo hidroxilo. El grupo amino de una molcula puede reaccionar con un cido carboxlico, con prdida de una molcula de agua, para formar una amida (Figura 28). Uno de los enlaces amida ms importantes en Biologa es el enlace peptdico que se forma entre el grupo carboxilo de un aminocido y el grupo amino de otro (Figura 29). Cuando la amida se forma dentro de una misma molcula se llama lactama (Figura 30). FUNCIONES AZUFRADAS Los tioles son semejantes a alcoholes, pero en lugar de oxgeno contienen azufre. Cuando el grupo -SH es la funcin principal, la molcula se nombra con la terminacin -tiol; cuando acta como sustituyente, se utiliza el prefijo mercapto-. Los tioles pueden reaccionar con los cidos carboxlicos para formar tiosteres (Figura 31).

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Dos cadenas hidrocarbonadas pueden estar unidas por un puente de azufre, formando una funcin tioter (Figura 31). A veces este puente puede estar formado por dos azufres (RS-S-R'), formando lo que se llama un puente disulfuro (Figura 31). HETEROCICLOS Los heterociclos son estructuras cclicas que contienen tomos distintos del carbono (O, S, N), que se denominan heterotomos. En su nomenclatura predominan los nombres vulgares. Los heterociclos pueden ser alicclicos o aromticos, y sus propiedades son similares a las de los hidrocarburos de estructura semejante. En la Figura 32 se muestran algunos de los ms importantes en Biologa.

ISOMERA
Dos compuestos son ismeros cuando sus molculas estn formadas por el mismo nmero y clase de tomos, pero agrupados de distinta forma. Tendrn la misma frmula molecular, pero distinta frmula espacial, de manera que sus propiedades qumicas sern distintas. Son ismeros el gliceraldehdo, la dihidroxiacetona y el cido lctico porque son tres compuestos qumicos distintos que tienen la misma frmula molecular C3H6O3 (Figura 33). La frmula emprica no est relacionada con la isomera. La frmula CH2O pertenece a compuestos tan dispares como el metanal (CH2O), el cido actico (CH2O)2, el gliceraldehdo (CH2O)3 o la glucosa (CH2O)6, que no son ismeros entre s, ya que sus molculas tienen distinto nmero de tomos. Segn cmo estn conectados los tomos dentro de la misma molcula, se distinguen dos tipos de isomera (Figura 34): Isomera estructural o constitucional: Dentro de la molcula, los tomos se unen entre s de distinta forma o, en otras palabras, tienen distinta conectividad. Se distingue la isomera de cadena, de posicin y de funcin. Isomera espacial o estereoisomera: Dentro de la molcula, los tomos presentan la misma conectividad, pero se orientan de distinta forma en el espacio. Hay dos tipos de isomera espacial: Isomera conformacional: Es la que tiene lugar cuando un ismero se puede convertir en otro mediante una sencilla rotacin en torno a un enlace sencillo. En este caso se suele hablar de confrmeros en lugar de ismeros. A temperatura ambiente se produce la interconversin de unos confrmeros en otros y, por tanto, hay quien no considera a estas especies como verdaderos ismeros. Pgina 6 de 15

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Isomera configuracional: Es la que tiene lugar cuando un ismero no se puede convertir en otro mediante una sencilla rotacin en torno a un enlace sencillo. Se distinguen dos tipos: Isomera ptica: Es la que tiene lugar cuando la molcula carece de plano de simetra y los ismeros se diferencian nicamente por su capacidad de desviar la luz polarizada. Isomera geomtrica: Es la que tiene lugar cuando la molcula es rgida (su capacidad de rotacin est restringida por la presencia de dobles enlaces o de anillos).

ISOMERA DE CADENA, DE POSICIN Y DE FUNCIN Estos tres tipos de ismeros difieren en la frmula desarrollada y en el nombre qumico. En la isomera de cadena los ismeros tienen distinta cadena carbonada (Figura 35). En la isomera de posicin, el mismo grupo funcional est situado en distintos lugares de la misma cadena (Figura 36). En la isomera de funcin, distintas funciones qumicas pueden ofrecer la misma frmula molecular (Figura 37).

ISOMERA GEOMTRICA (CIS-TRANS) Los ismeros cis-trans tienen la misma cadena con las mismas funciones en las mismas posiciones, pero debido a que la molcula es rgida, cabe la posibilidad de que dos grupos funcionales estn ms prximos en el espacio (cis) o ms alejados (trans). La rigidez de la molcula se debe normalmente a la presencia de un doble enlace o de un anillo. En estos casos, determinados sustituyentes pueden quedar prximos en el espacio (ismero cis) o alejados (ismero trans). As ocurre con el 1,2-diiodociclopentano (Figura 38a) y el cido 2-butenodioico (Figura 38b). Si los carbonos que forman el doble enlace presentan varios sustituyentes distintos, la nomenclatura puede resultar ambigua. Por ejemplo, el 1-bromo-1-cloroprop-1-eno (Figura 39). En estos casos se adopta la nomenclatura E-Z. Esta nomenclatura se basa en las palabras alemanas E = entgegen (separados) y Z = zusammen (juntos). Para designar el ismero como E o como Z se siguen reglas muy precisas. Nos fijamos en los carbonos que forman el doble enlace, y vemos que cada uno tiene dos sustituyentes. Al sustituyente de mayor nmero atmico se le asigna el nmero 1 y al otro el 2. En caso de empate, se considera con el mismo criterio a los tomos unidos a ellos, hasta desempatar. En consecuencia, el ismero que segn estos criterios tenga los dos sustituyentes de mayor jerarqua (a los que se ha asignado el nmero 1) ms prximos en el espacio ser Z (zusammen) y el que los tenga ms separados ser E (entgegen). As, en el caso del 1bromo-1-cloroprop-1-eno se distinguen fcilmente los dos ismeros (Figura 39).

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ESTEREOISOMERA O ISOMERA PTICA Existen ismeros que coinciden en todas sus propiedades excepto en su capacidad de desviar el plano de luz polarizada. Son los llamados ismeros pticos. Uno de ellos desva la luz polarizada hacia la derecha, y se designa como ismero (+), o dextrgiro, mientas que el otro desva la luz polarizada en igual magnitud pero hacia la izquierda, y se designa como ismero (-) o levgiro (Figura 40). Su comportamiento frente a la luz polarizada se debe a que la molcula carece de plano de simetra. Los ismeros pticos tambin se llaman enantimeros, enantiomorfos o ismeros quirales porque cada ismero es la imagen especular del otro, del mismo modo que la mano derecha lo es de la izquierda. Ambas manos no son iguales (el guante de una mano no encaja en la otra) pero son simtricas: la imagen especular de la mano derecha es la mano izquierda (Figura 41). El caso ms frecuente de ausencia de plano de simetra se debe a la presencia de un carbono asimtrico. Se denomina carbono asimtrico a aquel tomo de carbono tetradrico que est unido a cuatro radicales distintos (Figura 42a). Para representar en un plano los carbonos asimtricos se han ideado varias representaciones convencionales en proyeccin. La ms utilizada es la de Fischer. Segn esta convencin, se proyecta la molcula sobre el plano del papel con las siguientes condiciones (Figura 42a): 1.- La cadena carbonada se sita en vertical, con las valencias que la integran en direccin a la parte posterior del plano. 2.- La cadena se orienta con la parte ms oxidada hacia arriba y la ms reducida hacia abajo. 3.- Las valencias que no integran la cadena carbonada resultan horizontales y dirigidas hacia la parte anterior del plano. Cuando se aplica esta convencin, se denomina ismero D al que presenta el grupo funcional a la derecha del espectador e ismero L al que lo tiene hacia la izquierda. Los ismeros D y L son imgenes especulares entre s y se denominan enantimeros, enantiomorfos o ismeros quirales. Casi todos los azcares y aminocidos presentan algn carbono asimtrico y presentan, por tanto, isomera ptica. Para decidir si son el ismero D o L se considera en los azcares el grupo OH del penltimo carbono, y en los aminocidos el grupo amino del segundo carbono (tambin denominado carbono ) (Figura 42b). Cuando hay un slo carbono asimtrico los dos ismeros pticos (el D y el L) son imgenes especulares entre s y se llaman enantimeros, pero cuando hay ms de un carbono asimtrico (como en la mayora de los azcares) el nmero de ismeros pticos posibles viene dado por la expresin 2n, donde n es el nmero de carbonos asimtricos que tiene la molcula. Entonces, puede darse el caso de que dos ismeros pticos no sean imgenes especulares entre s. Son los llamados diastereoismeros. Tambin es posible que una molcula con varios carbonos asimtricos presente un plano de simetra. En este

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caso no habr ismeros pticos. Se trata de una forma meso. Tomando la D-eritrosa como ejemplo de molcula con dos carbonos asimtricos (Figura 43), la L-eritrosa sera su enantimero, la D-treosa sera un diastereoismero y el eritritol (su derivado por reduccin) sera un ejemplo de forma meso, que al tener un plano de simetra carece de actividad ptica. La nomenclatura D-L es inequvoca para designar la configuracin de ismeros con un solo carbono asimtrico. Sin embargo, cuando en una molcula hay varios centros de asimetra es ms conveniente utilizar el sistema propuesto por Cahn, Ingold y Prelog (Figura 44) que permite establecer la configuracin absoluta de cada tomo. Con esta nomenclatura (o sistema CIP) se puede asignar un nombre sistemtico y discriminativo a molculas isomricas complejas. As, se podrn distinguir y nombrar diferentes ismeros con varios carbonos asimtricos como, por ejemplo, la galactosa y la manosa. Segn esta convencin, las dos configuraciones posibles de cada carbono asimtrico se designaran con las letras R y S (nomenclatura R-S). En algunos casos, R coincidir con D, pero en otros no. Para determinar la configuracin absoluta de un tomo de carbono asimtrico hay que seguir tres pasos (Figura 45). En primer lugar, se jerarquizan los cuatro sustituyentes del carbono asimtrico usando el mismo criterio (se da prioridad al sustituyente con mayor nmero atmico): 1.- Se numeran los cuatro grupos sustituyentes del carbono asimtrico: se otorga el nmero 1 al que tenga el tomo de mayor nmero atmico enlazado directamente con dicho carbono. El siguiente tomo (por orden de nmero atmico) recibir el nmero 2 y as sucesivamente. 2.- Si dos o ms de estos tomos son iguales se recurre a considerar los tomos unidos a ellos, con el mismo criterio de preferencia. 3.- Si la ambigedad persiste, se atiende al tipo de enlace que une los tomos en cuestin y se da preferencia al enlace triple sobre el doble y al doble sobre el sencillo. En segundo lugar, hay que orientar la molcula en el espacio. El tetraedro correspondiente al carbono asimtrico se orienta de modo que el sustituyente de menor categora (el nmero cuatro) ocupe el vrtice ms alejado del observador. De esta forma, los otros tres formarn una cara triangular frente al espectador. En tercer lugar, se traza una circunferencia imaginaria que conecta los tres sustituyentes siguiendo la secuencia 1 2 3. Al hacerlo, el recorrido podr ser hacia la derecha (en sentido horario) o hacia la izquierda (sentido antihorario). En el primer caso se tratar de un carbono asimtrico con la configuracin absoluta R (rectum = derecha) y en el segundo caso se tratar de un carbono asimtrico con la configuracin absoluta S (sinister = izquierda) (Figuras 45 y 46).

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Aplicando este criterio a cada carbono asimtrico se puede asignar un nombre sistemtico a cada uno de los posibles ismeros pticos de una molcula. As, el nombre sistemtico de la D-glucosa sera (2R, 3S, 4R, 5R)-pentahidroxihexanal (Figura 47). Hay que tener en cuenta, sin embargo, que hay molculas sin carbonos asimtricos que tambin presentan isomera ptica porque carecen de plano de simetra. Este es el caso de molculas como el dicetoespirononano (Figura 48).

CONFORMACIONES ESPACIALES
Incluso tras establecer la configuracin de cada uno de los carbonos, la disposicin de la molcula en el espacio no queda completamente especificada. En efecto, las molculas cuyos tomos estn unidos por enlaces sencillos son susceptibles de adoptar varias posiciones espaciales interconvertibles por rotacin en torno a un enlace sencillo. Estas disposiciones se conocen como conformaciones espaciales o ismeros conformacionales. Con un pequeo aporte de energa, la rotacin en torno a enlaces sencillos puede convertir fcilmente una conformacin en otra y, por este motivo, hay quien no los considera como verdaderos ismeros. La interconversin es un fenmeno espontneo y rapidsimo, si bien algunas disposiciones espaciales estn favorecidas por su mayor estabilidad (corresponden a mnimos de energa libre). As, en la rotacin de los dos grupos metilo que constituyen el etano (CH3-CH3) se pueden distinguir dos conformaciones extremas, que se llaman eclipsada y alternada, segn la posicin relativa de los hidrgenos. Para distinguir ambas conformaciones es til recurrir a la llamada proyeccin de Newman que intercala un disco imaginario entre los dos carbonos, de manera que las valencias prximas al espectador se ven enteras, mientras que las ms alejadas slo se ven en la parte que sobresale del disco (Figura 49). Con frecuencia, los sustituyentes de cada carbono son distintos, las posibilidades de presentar conformaciones distintas se multiplican, como en el caso del butano (Figura 50). Para distinguir unas de otras, la nomenclatura sistemtica utiliza la siguiente convencin: El prefijo "anti" se emplea cuando los enlaces de los grupos ms voluminosos (en este caso los dos grupos metilo) forman ngulos superiores a 90 El prefijo "sin" se emplea cuando los enlaces de los grupos ms voluminosos (en este caso los dos grupos metilo) forman ngulos inferiores a 90 La terminacin "periplanar" se aplica cuando los dos grupos ms voluminosos estn en un mismo plano La terminacin "clinal" se aplica cuando los dos grupos voluminosos estn en distintos planos

Las formas ms estables son, por lo general, las que tienen los sustituyentes ms voluminosos en posiciones alternadas anti. As, las cadenas hidrocarbonadas de los

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cidos grasos saturados adoptan la conformacin todo-anti, que es la ms estable (Figura 51). Cuando los grupos ms voluminosos estn en disposicin alternada formando entre s un ngulo de 60 o de 300 se dice que estn en conformacin gauche. La posibilidad de libre rotacin del enlace sencillo est impedida en los hidrocarburos cclicos. Este impedimento es prcticamente absoluto en los ciclos pequeos, de 3 o 4 tomos de carbono. En los anillos aromticos, estabilizados por resonancia, tampoco hay posibilidad de rotacin. Sin embargo, en los anillos de 5 o ms tomos de carbono, esta posibilidad de rotacin no est totalmente impedida. Cada una de las conformaciones representa estados de mnima energa para la molcula, que en realidad est transformndose continuamente de una en otra. As, en el caso del ciclohexano, la posibilidad de rotacin permite a la molcula adoptar conformaciones distintas de la plana. En cada una de estas conformaciones, la tensin del anillo es nula porque los ngulos entre los enlaces carbono-carbono son iguales a los de las valencias del carbono tetradrico y porque todos los carbonos, considerados dos a dos, adoptan preferentemente conformacin alternada. En el ciclohexano se distinguen tres conformaciones (Figura 52): dos en forma de silla y una en forma de bote. En la conformacin bote, las parejas de carbonos 2-3 y 5-6 son eclipsadas y las restantes son alternadas sin. En la conformacin silla todas las parejas posibles son alternadas sin, y por tanto es ms estable (Figura 53). En estas conformaciones, las valencias perpendiculares al plano ecuatorial se llaman axiales, y las prximas a l ecuatoriales. Al pasar de una forma de silla a la otra, los enlaces ecuatoriales en la primera son axiales en la segunda, y viceversa (Figura 54).

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FUERZAS INTERMOLECULARES
Dentro de una molcula, los tomos estn unidos mediante fuerzas intramoleculares (enlaces inicos, metlicos o covalentes, principalmente). Estas son las fuerzas que se deben vencer para que se produzca un cambio qumico. Son estas fuerzas, por tanto, las que determinan las propiedades qumicas de las sustancias. Sin embargo existen otras fuerzas intermoleculares que actan sobre distintas molculas o iones y que hacen que stos se atraigan o se repelan. Estas fuerzas son las que determinan las propiedades fsicas de las sustancias como, por ejemplo, el estado de agregacin, el punto de fusin y de ebullicin, la solubilidad, la tensin superficial, la densidad, etc. Por lo general son fuerzas dbiles (Figura 55) pero, al ser muy numerosas, su contribucin es importante. Los medios biolgicos son disoluciones acuosas muy complejas: sales, azcares, aminocidos, protenas, cidos nucleicos etc. Obviamente, las interacciones que se establecen entre las diferentes biomolculas en disolucin revisten especial importancia porque condicionan y definen la dinmica de los procesos bioqumicos. Las fuerzas intermoleculares pueden ser de varios tipos: Fuerzas electrostticas (in-in) Fuerzas in-dipolo Fuerzas in-dipolo inducido Fuerzas de van der Waals Fuerzas hidrofbicas

INTERACCIONES ELECTROSTTICAS (FUERZAS IN - IN) Son las que se establecen entre iones de igual o distinta carga. Los iones de signo opuesto se atraen y los del mismo signo se repelen. La magnitud de la fuerza electrosttica viene definida por la ley de Coulomb y es directamente proporcional a la magnitud de las cargas e inversamente proporcional al cuadrado de la distancia que las separa (Figura 56). Con frecuencia, este tipo de interaccin recibe el nombre de puente salino. Son frecuentes entre una enzima y su sustrato, entre los aminocidos de una protena o entre los cidos nucleicos y las protenas (Figuras 57a y 57b). FUERZAS IN-DIPOLO Son las que se establecen entre un in y una molcula polar. Por ejemplo, el NaCl se disuelve en agua por la atraccin que existe entre los iones Na+ y Cl- y los correspondientes polos con carga opuesta de la molcula de agua. Esta solvatacin de los iones es capaz de vencer las fuerzas que los mantienen juntos en el estado slido (Figura 58a). La capa de agua de hidratacin que se forma en torno a ciertas protenas, tambin se forma gracias a estas interacciones (Figura 58b).

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FUERZAS IN - DIPOLO INDUCIDO Tienen lugar entre un in y una molcula apolar. La proximidad del in provoca una distorsin en la nube electrnica de la molcula apolar que convierte (de modo transitorio) en una molcula polarizada. En este momento se produce una atraccin entre el in y la molcula polarizada. Un ejemplo de esta interaccin es la interaccin entre el in Fe++ de la hemoglobina y la molcula de O2, que es apolar (Figura 59).

FUERZAS DE VAN DER WAALS

Cuando se encuentran a una distancia moderada, las molculas se atraen entre s pero, cuando sus nubes electrnicas empiezan a solaparse, las molculas se repelen con fuerza. El trmino "fuerzas de van der Waals" engloba colectivamente a las fuerzas de atraccin entre las molculas. Son fuerzas de atraccin dbiles que se establecen entre molculas elctricamente neutras (tanto polares como no polares), pero son muy numerosas y desempean un papel fundamental en multitud de procesos biolgicos. Las fuerzas de van der Waals incluyen: 1. Fuerzas dipolo-dipolo (tambin llamadas fuerzas de Keesom), entre las que se incluyen los puentes de hidrgeno 2. Fuerzas dipolo-dipolo inducido (tambin llamadas fuerzas de Debye) 3. Fuerzas dipolo instantneo-dipolo inducido (tambin llamadas fuerzas de dispersin o fuerzas de London) 1.- FUERZAS DE POLARIDAD (FUERZAS DIPOLO - DIPOLO) Una molcula es un dipolo cuando existe una distribucin asimtrica de los electrones debido a que la molcula est formada por tomos de distinta electronegatividad. Como consecuencia de ello, los electrones se encuentran preferentemente en las proximidades del tomo ms electronegativo (Figura 60). Se crean as dos regiones (o polos) en la molcula, una con carga parcial negativa y otra con carga parcial positiva. Cuando dos molculas polares (dipolos) se aproximan, se produce una atraccin entre el polo positivo de una de ellas y el negativo de la otra. Esta fuerza de atraccin entre dos dipolos es tanto ms intensa cuanto mayor es la polarizacin de dichas molculas polares o, dicho de otra forma, cuanto mayor sea la diferencia de electronegatividad entre los tomos enlazados. En el cloruro de hidrgeno, por ejemplo, el Cl es ms electronegativo que el H porque su ncleo, con 17 cargas positivas, atrae a los e- compartidos con el H con ms fuerza que el ncleo del H, con una sla carga positiva. Por lo tanto, los e- compartidos estarn ms prximos al Cl que al H. Esta distribucin asimtrica de los e- es la responsable de la formacin de un dipolo con exceso de carga negativa del lado del Cl, y exceso de carga positiva del lado del H. (Figura 60).

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El momento dipolar () es un vector (orientado hacia la carga negativa y cuya magnitud depende de la intensidad de la carga y de la distancia entre los tomos) que permite cuantificar la asimetra de cargas en la molcula (Figura 61). En el estado lquido, las molculas polares se atraen entre s con ms fuerza que las molculas no polares, lo que explica que tengan unos puntos de fusin y de ebullicin ms elevados (Figura 62). Las sustancias polares se disuelven fcilmente en disolventes polares tales como el agua y por eso tambin se denominan sustancias hidroflicas. LOS PUENTES DE HIDRGENO Los puentes de hidrgeno constituyen un caso especial de interaccin dipolo-dipolo. Se producen cuando un tomo de hidrgeno est unido covalentemente a un elemento que sea: muy electronegativo y con dobletes electrnicos sin compartir de muy pequeo tamao y capaz, por tanto, de aproximarse al ncleo del hidrgeno

Este es el caso de los tomos de F, O y N. El enlace que forman con el hidrgeno es muy polar y el tomo de hidrgeno es un centro de cargas positivas que ser atrado hacia los pares de electrones sin compartir de los tomos electronegativos de otras molculas (Figura 63). La distancia entre los tomos negativos unidos por el puente de hidrgeno suele ser de unos 3 : el hidrgeno se sita a 1 del tomo al que est covalentemente unido y a 2 del que cede sus e- no apareados (Figura 64). La fuerza de este enlace oscila entre 2 y 10 Kcal/mol (menor que la de un enlace covalente o un enlace inico), pero su importancia en bioqumica es enorme. Muchas de las propiedades fsicas y qumicas del agua se deben a los puentes de hidrgeno, como veremos en el siguiente captulo. Adems, este enlace condiciona en gran medida la estructura tridimensional de las protenas y de los cidos nucleicos (Figura 65). 2.- FUERZAS DIPOLO - DIPOLO INDUCIDO Tienen lugar entre una molcula polar y una molcula apolar. En este caso, la carga de una molcula polar provoca una distorsin en la nube electrnica de la molcula apolar y la convierte, de modo transitorio, en un dipolo. En este momento se establece una fuerza de atraccin entre las molculas. Gracias a esta interaccin, gases apolares como el O2, el N2 o el CO2 se pueden disolver en agua. 3.- FUERZAS DE DISPERSIN (DIPOLO INSTANTNEO - DIPOLO INDUCIDO) Tambin se llaman fuerzas de London. En muchos textos, se identifican con las fuerzas de van der Waals, lo que puede generar cierta confusin. Las fuerzas de dispersin son

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fuerzas atractivas dbiles que se establecen fundamentalmente entre sustancias no polares, aunque tambin estn presentes en las sustancias polares. Se deben a las irregularidades que se producen en la nube electrnica de los tomos de las molculas por efecto de la proximidad mutua. La formacin de un dipolo espontneo en una molcula origina la formacin de un dipolo inducido en una molcula vecina de manera que se origina una dbil fuerza de atraccin entre las dos (Figura 66). Estas fuerzas son mayores al aumentar el tamao y la asimetra de las molculas. Son mnimas en los gases nobles (He, Ne), algo mayores en los gases diatmicos (H2, N2, O2) y mayores an en los gases poliatmicos (O3, CO2).

INTERACCIONES HIDROFBICAS
En un medio acuoso, las molculas hidrofbicas tienden a asociarse por el simple hecho de que evitan interaccionar con el agua. Este fenmeno se denomina efecto hidrofbico (Figura 67). El efecto hidrofbico es el responsable de que determinados lpidos formen agregados supramoleculares. Son ejemplos de fuerzas hidrofbicas (Figura 68): las que se establecen entre los fosfolpidos que forman las membranas celulares (forman bicapas) las que se establecen en el interior de una micela durante la digestin de los lpidos las que hacen que los aminocidos hidrofbicos se apien en el interior de las protenas globulares, evitando el contacto con el agua

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