ACIDOS NUCLECOS

MSc. MILVIO CASAVERDE RO

2012-I

*Durante incontables siglos, los seres humanos

han observado los patrones de herencia sin entender los mecanismo que transmiten los rasgo fsico y los proceso evolutivos de los padres ala progenia. Muchas culturas humanas han utilizado estas observaciones para mejorar sus condiciones econmicas, como la crianza de los animales domsticos o en los cultivos. Las investigaciones cientficas de la herencia, que actualmente se denomina gentica, no empez hasta el siglo XIX.

* Al comienzo del siglo xx los cientficos comenzaron

a admitir de forma generalizada que los rasgos fsicos se heredan en unidades discretas (que posteriormente se denominaron genes ) y que los cromosomas del interior del ncleo son los depositarios de la informacin gentica. Finalmente se elucido la composicin qumica de los cromosomas y se identifico el cido desoxirribonucleico como la informacin gentica en la actualidad, al conjunto completo de esta informacin de un organismo, codificado en la secuencia de nucletidos de su ADN, se denomina su Genoma.

*La biologa molecular es la ciencia que se

dedica a elucidar la. El estructura y funcin de los genomas descubrimiento de la estructura del ADN como un conjunto helicoidal duplex de polmeros de nucletidos por James Watson y Francis Crick en 1953 a permitido a los cientficos reexaminar la mayora de los fenmenos biolgicos utilizando las herramientas investigadoras descubiertas por los bilogos moleculares y los bioqumicas.

*En las 5 ultimas dcadas en una de

las investigaciones mas fascinantes y complejas del siglo XX , los bilogos han formulado una visin molecular de la herencia biolgica y de la transferencia de la informacin.

*Debido a la naturaleza informativa de los procesos

genticos , se han copiado algunos trminos descriptivos de otras ciencias de la informacin. Por ejemplo, la sntesis de ADN se suele denominar replicacin del ADN ( copiar o duplicar).De forma semejante, el proceso en el que se utiliza el ADN para sintetizar ARN se denomina trascripcin . Cada molcula de ARN se denomina trascrito. Las sntesis de protenas se denomina traduccin.

Se han ido introduciendo trminos nuevos al ir utilizando los cientficos tcnicas analtica cada vez mas potentes y sensibles en sus investigaciones de los genes y de la expresin gentica.

DEFINICION DE CIDOS NUCLEICOS Y GENERALIDADES

* El ADN constituye el deposito fundamental de

informacin gentica. Esta informacin es copiada en las molculas de ARN, cuyas secuencias de nucletidos contienen el cdigopara las secuencia especificas de los aminocidos. Posteriormente se produce la sntesis de las protenas, en un proceso en el que interviene en la taduccin el ARN.

*Los cidos nucleicos se encuentran en

todas la clulas vivas y estn combinados en casi todos los casos con ciertas protenas. Qumicamente, los cidos nucleicos (as llamados porque dan una reaccin cida al suspenderse en agua), son enormes compuestos en forma de cintas de gran longitud, con peso molecular de millones; en estas cintas se repite (a intervalos regulares) la misma estructura aunque no idntica, representando los enlaces o unidades de la cadena.

*Cada uno de los cientos de cientos de

unidades que componen un cido nucleico se llama nucletido y esta constituido de un grupo fosfato y una pentosa (azcar simple con 5 carbonos) a la cual se fija una estructura orgnica cclica llamada base, perteneciente a los compuestos conocidos como purina y pirimidinas ( bases pricas y pirimdicas).

En el caso del ADN las bases son dos purinas y dos pirimidinas. Las purinas son A (Adenina) y G (Guanina). (Timina) y C (Citosina) . En el caso del ARN tambin son cuatro bases, dos purinas y dos pirimidinas. Las purinas son A y G y las pirimidinas son C y U (Uracilo).
BASES PIRIMDICAS

BASES PRICAS

Las bases se unen al carbono 1' del azcar y el fosfato en el carbn 5' para formar el nucletido Los nucletidos se unen para formar el polinucletido por uniones fosfodiester entre el carbono 5' de un nucletido y el carbono 3' del siguiente.

*Ribosa y desoxirribosa.

*Los nucletidos ARN B D ribosa, y el ADN B D 2

desoxirribosa. Los dos son pentosas ( 5 carbonos). Solo se diferencian en el nivel estructural, en el carbono 2. Ya que el ARN tiene OH como radical y el DNA radical H. Entonces la ribosa es la forma reducida de la desoxirribosa.

*Purinas y Pirimidinas.
Las bases observadas comnmente son las purinas : adenina y guanina y las pirimidinas : citosina, timina y uracilo. Su presencia es: DNA: A, G, C, T RNA: A, G, C, U

*Las bases de cidos nucleicos se llaman as por dar reaccin

alcalina en solucin acuosa; son molculas orgnicas cclicas de complejidad diversa, las cuales tienen tomos de nitrgeno formando parte de su estructura anular. Dos clases particulares de estos compuestos, conocidos como pirimidinas y purinas, son componentes esenciales de los cidos nucleicos. Varios de estos mismos compuestos forman parte de un nmero de coenzimas.

*Las purinas y pirimidinas se presentan en la naturaleza en

diferentes formas qumicas. Las principales estructuras pirimidnicas en los sistemas biolgicos son citosina, uracilo y timina.

*Un

cido nucleico simple puede llevar varios o muchos nucletidos y entonces recibe el nombre de polinucletidos. Esto podra compararse a las unidades de aminocidos que constituyen al cadena pptida de una protena.

ENLACE FOSFODIESTER :

Los enlaces se unen entre s a travs del radical fosfato situado en el C5' del nucletido y del radical OH del C3' de otro nucletido, la unin se realiza mediante un enlace fosfodiester, se trata de una condensacin en la que se obtiene un compuesto denominado dinucleotido y se libera una molcula de H2O, dado que existen grupos OH libres el dinucleotido se puede unir a mas nucletidos y formar trinucleotidos, tetranucleotidos.

*En los poli nucletidos podemos

encontrar enlaces ster, en el cual se unen el fosfato y el azcar , y a estos a lo largo del esqueleto se les denomina enlaces fosfodister. La secuencia de estas bases nitrogenadas azcar fosfato a lo largo del esqueleto es el que determina la estructura nica de ADN y ARN.

Proporciona la especificidad a una cadena polinucleotida determinada, en todos los polinucleotidos existe un extremo denominado 3', con una pentosa, con el grupo OH del C 3' libre y otro extremo llamado extremo 5', donde se localiza un grupo fosfato libre unido al C 5' de otra pentosa.

la unin de cientos o miles de nucletidos constituyen cadenas de cidos nucleicos o polinucleotidos, como la unin entre los nucletidos se produce entre pentosas y fosfato, las bases nitrogenadas no participan en los enlaces, se establecen por tanto, largas cadenas sin ramificar formadas por la secuencia pentosa-fosfato en las que las bases nitrogenadas quedan colgando lateralmente de las pentosas, la secuencia de estas bases nitrogenadas es la que

Un dinucletido en el que se unieron un nucletido con la base A con un nucletido con la base T en el ADN y el enlace fosfodiester se form entre el carbono 3'del nucletido con base A y el 5'del nucletido con base T, se representa simplemente como AT. Si a este dinucletido se le agrega otro nucletido en el carbono 3' y este nucletido tiene una base T, la otra base seria A. sta es la forma simplificada en que se acostumbra representar los polinucletidos.

*Componentes monomricos (nucletidos) : *El ARN y ADN son polmeros integrados por
unidades estructurales monomricas llamadas nucletidos. De ah su nombre de poli nucletidos. Cada nucletido tiene fosfato, azcar, y una purina o pirimidina, a las cuales se les conoce como bases nitrogenadas. En los nucletidos las tres partes estn unidas en el orden, P S B.

CLASIFICACION DEL ACIDOS NUCLEICOS : EL RNA

EL ARN:

ARN corresponde a las siglas de cido ribonucleico. La nomenclatura es en ingls RNA. Toma su nombre del grupo de los azcares en la columna vertebral de la molcula ribosa. (ribonucleic acid, RNA) Uno de los dos tipos fundamentales de cidos nucleicos que se encuentran en los organismos vivos. La pentosa en los residuos de nucletidos que lo forman es la ribosa, a la cual se unen indistintamente las bases nitrogenadas adenina (A), guanina (G), citosina (C) y uracilo (U). Las diferentes formas del ARN participan en diversos procesos celulares y son claves en el proceso de biosntesis de protenas. v. ARN mensajero, ARN de transferencia y ARN ribosomal.

Hay varios tipos de ARN:

1 El ARN ribosmico (ARNr) que es el ms abundante de las tres clases correspondiendo al 50% del total de ARN, se encuentra en los ribosomas celulares. 2 El ARN de transferencia (ARNt) posee entre 73 y 90 nucletidos,representa el 45% del total de ARN, su funcin es llevar aminocidos a los ribosomas para incorporarlos a las protenas. 3 El ARN mensajero (ARNm) ,que posee en promedio 1000 o 1500 nucletidos,corresponde aproximadamente al 5% del total de ARN, lleva una copia del cdigo gentico obtenida a partir de la secuencia de bases del ADN celular. Esta copia especifica la secuencia de aminocidos de las protenas.

4 El ARN-viral

Existen varios tipos de ARN cada uno con funcin distinta. Los que forman parte de las subunidades de los ribosomas se les denomina ARN ribosomal (ARNr), los ARN que tienen la funcin de transportar los aminocidos activados, desde el citosol hasta el lugar de sntesis de protenas en los ribosomas; se les conoce por ARN de transferencia (ARNt) y los ARN que son portadores de la informacin gentica y la transportan del genoma (molcula de ADN en el cromosoma) a los ribosomas son llamados ARN mensajero (ARNm). El tamao de las molculas de ARN es mucho menor que las del ADN. En el caso de E. coli va de menos de 100 nucletidos en los ARNt hasta casi 4000 (4kb).

El ARN es un filamento de una sola cadena, no forma doble hlice. La presencia de un oxgeno en la posicin 2' de la ribosa impide que se forme la doble cadena de la manera en que se forma en el ADN. El filamento de ARN se puede enrollar sobre s mismo mediante la formacin de pares de bases en algunas secciones de la molcula.

CLASIFICACION DE LOS CIDOS NUCLEICOS DNA (cido desoxirribonucleico):

El

cido desoxirribonucleico(polmero de unidades menores denominados nucletidos) junto con el cido ribonucleico, constituye la porcin prosttica de los nucleoprotenas, cuyo nombre tiene un contexto histrico, ya que se descubrieron en el ncleo de la clula.

 Se

trata de una molcula de gran peso molecular (macromolcula) que est constituida por tres sustancias distintas: cido fosfrico, un monosacrido aldehdico del tipo pentosa (la desoxirribosa), y una base nitrogenada cclica .

 La

base nitrogenada cclica puede ser prica (adenina o guanina) derivada de la purina de dos anillos heterocclicos o pirimidnica (timina o citocina) derivadas de la pirimidina de un solo anillo.

La unin de la base nitrogenada (citosina, adenina, guanina o timina) con la pentosa (desoxirribosa) forma un nuclesido; ste, unindose al cido fosfrico, nos da un nucletido; la unin de los nucletidos entre s en enlace diester nos da el polinucletido, en este caso el cido desoxirribonucleico, formando dos cadenas.

 La

unin de la base nitrogenada (citosina, adenina, guanina o timina) con la pentosa (desoxirribosa) forma un nuclesido; ste, unindose al cido fosfrico, nos da un nucletido; la unin de los nucletidos entre s en enlace diester nos da el polinucletido, en este caso el cido desoxirribonucleico.

 Las

bases nitrogenadas se hallan en relacin molecular 1:1, la relacin adenina + timina / guanina + citosina es de valor constante para cada especie animal segn Erwin Chargaff (1905-2002) ,es decir la cantidad de purinas y primidinicas son siempre iguales : A + G= C+T

Las dos cadenas se encuentran arregladas en una estructura helicoidal alrededor de un eje comn por lo que recibe el nombre de doble hlice. Las bases se encuentran acomodadas hacia el eje de la doble hlice, mientras que el azcar y los fosfatos se encuentran orientados hacia el exterior de la molcula.

Estructuralmente

la molcula de ADN se presenta en forma de dos cadenas helicoidales arrolladas alrededor de un mismo eje (imaginario).

 Las

cadenas estn unidas entre s por las bases que la hacen en pares. Los apareamientos son siempre adenina-timina mediante dos puentes de hidrogeno y citosina-guanina mediante tres puentes de hidrogeno. El ADN es la base de la herencia.

Ambas cadenas siguen una hlice dextrgira, pero debido a las dadas las secuencias de tomos en las dos cadenas corren en direcciones opuestas. Cada una de las cadenas, por separado se parece al modelo N 1 de Furberg (2); esto es, las bases estn sobre la parte interna de la espira y los fosfatos en la externa.

La configuracin del azcar y los tomos cercanos se aproxima a la "configuracin estndar" de Furberg, el azcar se dispone perfectamente perpendicular a la base adjunta. Hay un residuo sobre cada cadena cada 3,4 en la direccin-z. Hemos asumido un ngulo de 36 grados entre residuos adyacentes en la misma cadena, para que la estructura se repita despus de 10 residuos sobre cada cadena, esto es, despus de 34.

La distancia de un tomo de fsforo desde el eje de la fibra es 10 . Como los fosfatos estn sobre la parte externa, los cationes tienen fcil acceso a ellos. La estructura es abierta, y su contenido de agua es ms bien alto. Para nosotros, a contenidos bajos las bases se acercaran y la estructura sera ms compacta.

Clases de ADN
El ADN

es por lo comn el constituyente bsico de la cromatina (cromosoma) nuclear en las clulas eucariticas, pero tambin existe en pequea cantidad en las mitocondrias y cloroplastos. En los procariontes forma el nucloide (que a diferencia de los eucariontes no va asociado a protenas, es desnudo) y en los virus (DNA virus)que lo poseen constituyen el virin o elemento infestante.

Por lo comn su estructura tridimensional posee giro hacia la derecha ( - ADN, dextrogiro) que es la forma ms estable y ocasionalmente posee giro hacia la izquierda (z-ADN,levgiro) Acorde a las evidencias, slo una pequea parte del ADN constituye genes (menos del 10 %). Existen diferentes tipos que los podemos dividir en: ADN de copia nica(el 57 % del total) formados por segmentos de aproximadamente 1000 pares de nucletidos del longitud, una pequea parte de este ADN contiene los genes.

Por lo comn su estructura tridimensional posee giro hacia la derecha ( - ADN, dextrogiro) que es la forma ms estable y ocasionalmente posee giro hacia la izquierda (z-ADN,levgiro) Acorde a las evidencias, slo una pequea parte del ADN constituye genes (menos del 10 %). Existen diferentes tipos que los podemos dividir en: ADN de copia nica(el 57 % del total) formados por segmentos de aproximadamente 1000 pares de nucletidos del longitud, una pequea parte de este ADN contiene los genes.

-ADN repetitivo(20 %)son unidades de aproximadamente 300 pares de nucletidos* que se repiten en el genoma unas 105 veces(unidades de repeticin). Se intercalan con el ADN de copia nica. -ADN satlite(altamente repetitivo: 28 %)son unidades cortas de pares de nucletidos que se repiten en el genomio. Son caractersticos en cada especie y pueden ser separados por centrifugacin. Constituyen la heterocromatina y no se le conoce funcin.

 Los

porcentajes indicados son del hombre y el ratn, y las proporciones seran las mismas en otras especies. Nucletido*: Es una molcula compleja formado por una base nitrogenada, un hidrato de carbono y un grupo fosfato (cido fosfrico inorgnico), unidos entre s por enlaces covalentes. Las bases nitrogenadas son anillos heterocclicos compuesto adems del carbono e hidrgeno por nitrgeno.

*Funcin biolgica de los cidos nucleicos : *La funcin biolgica de los cidos
nucleicos, especficamente el DNA es la de contener la informacin hereditaria. En 1953 Watson y Crick resolvieron su estructura molecular, dando comienzo a una nueva era en la bioqumica y la biologa.

*Existen dos clases de cidos nucleicos en todo

organismo viviente: cido ribonucleico o RNA cido desoxirribonucleico o DNA Por otra parte los virus contienen uno solo ya sea RNA o DNA.

*Otras de las funciones biolgicas de los cidos

nucleicos son las de almacenamiento, replicacin, recombinacin, y transmisin de la informacin gentica ( son las molculas que determinan lo que es y hace cada una de las clulas viva.

*La hidrlisis de cidos nucleicos por cidos o

por cierta enzima origina una mezcla de varios nucletidos; tal como la hidrlisis de las protenas produce una mezcla de aminocidos. El azcar y grupo fosfato pueden considerarse como la columna vertebral de los cidos nucleicos; mientras las bases pueden ser importantes ramificaciones laterales.

Importancia biolgicade los nucleotidos : Los nucletidos son molculas que poseen un gran inters biolgico ya que adems de constituir los cidos nucleicos llevan a cabo algunas funciones bsicas para los seres vivos: Son molculas acumuladoras y donantes de energa, como:

Ciertas reacciones qumicas propias de los seres vivos tienen como finalidad la produccin de energa, si esta energa se desprendiera libremente a penas seria til para el organismo, resulta mas eficaz disponer de un sistema capaz de acumular la energa liberada, de manera que pueda ser utilizada con posterioridad en la cantidad y en el momento preciso, algunos nucletidos, fundamentalmente de adenosina con mas de un grupo fosfato desempean esta funcin, cuando existe energa disponible una molcula de adenosin 5' monofosfato (AMP) la emplean en unir un segundo grupo fosfato al otro para obtener adenosin 5' difosfato (ADP), y el :

ADP la emplea en unir un tercer grupo fosfato a los otros dos para obtener adenosin 5' trifosfato (ATP). Los enlaces as constituidos son altamente energticos lo que quiere decir que para su formacin se requiere una cantidad considerable de energa, el sistema ADP/ATP, constituyen una forma eficaz de guardad la energa liberada en reacciones exotrmicas, si existe energa disponible en abundancia se formaran muchas molculas de ATP a partir de ADP, por el contrario el consumo de energa en gran cantidad por parte de la clula disminuir los niveles de ATP y aumentar los de ADP.

OTROS NUCLETIDOS ENERGTICOS:

Que intervienen en la sntesis o metabolismo de muchos compuestos, que intervienen en dar respuesta a su entorno y es la base fundamental de la relacin del organismo vivo y su ambiente y estos son : UMP, UDP, UTP. TMP, TDP, TTP. CMP, CDP, CTP GMP, GDP, GTP.

 Ciertos

dinucleotidos intervienen como coenzimas en algunas reacciones enzimticas importantes, este es el caso del NAD, NADP, FAD. Dos nucletidos unidos entre s para realizar funcin enzimtica (dinucletidos).

Proporciona la especificidad a una cadena polinucleotida determinada, en todos los polinucleotidos existe un extremo denominado 3', con una pentosa, con el grupo OH del C 3' libre y otro extremo llamado extremo 5', donde se localiza un grupo fosfato libre unido al C 5' de otra pentosa.

Estructura en donde se encuentra la informacin gentica, y cuya funcin es almacenar las instrucciones para la sntesis de molculas de RNA de secuencias especficas de nucletidos. Se le puede encontrar en cloroplastos, mitocondrias, cromosomas y como plsmidos. Est formado por una cadena doble de nucletidos, cada uno de los cuales contiene: azcar desoxirribosa, bases nitrogenadas ( adenina, citosina, guanina, timina ), radical fosfato Los nucletidos se unen formando largas cadenas, en un orden y proporcin determinados.

Casi todo el ADN de las clulas se localiza en el interior del ncleo. Las molculas de ADN componen los genes, que contienen las instrucciones codificadas qumicamente para la produccin de casi todas las protenas que necesitatan las clulas. El ncleo regula la sntesis de protenas al enviar molculas de RNA mensajero, que son copias de partes de los genes que codifican protenas a travz de la mebrana nuclear en direccin al citoplasma. El ADN se asocia con las protenas y forma un complejo denominado cromatina. Las molculas de ADN son largas y delgadas de modo que deben estar empaquetadas en el ncleo con suma regularidad. Deseamos sugerir una estructura para la sal del cido Desoxirribonucleico (A.D.N.). Esta estructura tiene aspectos novedosos que son de un inters biolgico considerable.

Una estructura para el cido nucleico ya ha sido propuesta por Pauling y Corey(1). Amablemente han puesto el manuscrito a nuestra disposicin antes de su publicacin. Su modelo consiste en tres cadenas entrelazadas, con los fosfatos cerca del eje de la fibra, y las bases hacia fuera. En nuestra opinin, esta estructura es poco satisfactoria por dos razones: 1. creemos que el material del que se obtienen los diagramas de rayos-X es la sal, no el cido libre. Sin los tomos de hidrgeno del cido no est claro qu las fuerzas puedan mantener la estructura unida, especialmente porque los fosfatos cargados negativamente cerca del eje se repeleran el uno al otro. 2. Algunas de las distancias de van der Waals parecen ser demasiado pequeas.

Otra estructura en cadena triple ha sido sugerida por Fraser (en prensa). En su modelo los fosfatos, estn hacia fuera y las bases hacia dentro, mantenindose unidas por enlaces de hidrgeno. Esta estructura as descrita est ms bien mal definida por lo que no la comentamos. Deseamos ofrecer aqu una estructura radicalmente distinta para la sal del cido desoxirribonucleico. Esta estructura tiene dos cadenas helicoidales cada vuelta en torno al mismo eje (ver diagrama). Hemos hecho las suposiciones qumicas usuales, ms especficamente, que cada cadena consiste en grupos fosfato-dister uniendo residuos de -Ddesoxirribofuranosa con enlaces 3',5'. Las dos cadenas (pero no sus bases) se relacionan por una dada perpendicular al eje de la fibra.

El ADN EN LOS NUCLEOSOMAS

*Son unidades repetitivas formadas por

un octmero de histonas (H2A, H2B, H3 y H4, dos de cada una), a manera de esferas aplanadas de 10 nm, alrededor del cual se arrolla una porcin de ADN de 140 pares de bases en dos vueltas y sellados por fuera con la H1 en correspondencia con 60 pares de bases ms, que actan como un puente a otros ncleosomas.

El ADN, en el de una clula humana totalmente desenrollado es de 2 mts aproximadamente de longitud, sufre con esta estructura un empaquetamiento de 5 a 7 veces de su longitud.

 En

consecuencia el ADN es una molcula muy importante puesto que lleva la carga gentica de todo ser vivo y una variacin en ella pondra en peligro su supervivencia.

Mecanismo de replicacin, transcripcin y traduccin

EL MATERIAL GENETICO Y LA INGENIERIA GENTICA