Projeto Genoma Humano

A possibilidade de sequenciar o genoma

Foi considerada pela 1 vez em meados de 1980. Robert Sinshimer, UCSC. Em 1985, Charles DeLisi props a realizao do projeto pelo Departamento de Energia dos Estados Unidos. James Watson, em 1986 exps a idia no laboratrio de Cold Sprig Harbor.

 Wally Gilbert fez a 1 estimativa de custos: 3 bilhes de dlares, 1 dlar por par de bases. O projeto implica modificar a estrutura da cincia de tal maneira que vincular todos ns, especialmente os jovens, a algo to gigantesco como o nibus espacial. David Botstein, Stanford.

 Em 1987, Wally Gilbert anuncia seu plano de fundar a Genome Corporation. Em outubro de 87 o colapso da bolsa ps fim ao plano de Gilbert. A Academia Nacional de Cincias concebeu um plano para o Projeto Genoma Humano. O seqenciamento seria protelado enquanto se aperfeioavam as tecnologias envolvidas. O seqenciamento de genomas mais simples seria efetuado para aprimorar os mtodos.

O Mapeamento
Mapeamento Gentico
Estrutura bsica do genoma

Mapeamento Fsico
Proporciona ncoras fixas de posicionamento no genoma Determinao de cada trecho distinto da seqncia a partir de referncia a estas ncoras

O Consrcio
Nos primrdios do Projeto instituiu-se um modelo de colaborao. Os Estados Unidos coordenariam o empreendimento e realizariam mais da metade do trabalho. O restante seria levado a cabo principalmente no Reino Unido, Frana, Japo e Alemanha.

Os centros de mapeamento - US
Universidade Washington St. Louis Universidade Washington Stanford Universidade da Califrnia San Francisco Universidade de Michigan Ann Arbor MIT Cambridge Faculdade de Medicina Baylor Houston Walnut Creek Califrnia (Dep. Energia)

O Sequenciamento
O mtodo de seqenciamento de DNA utilizado foi o de Fred Sanger, desenvolvido em meados dos anos 1970.

Utilizao de Bases didesoxi.

Lee Hood, no Caltech, desenvolveu a automao do seqenciamento.

O Mtodo Sanger

Automao do Mtodo

Sequenciar todo o Genoma?

Alguns cientistas defendiam a idia de seqenciar apenas os genes, e no todo o junk DNA (DNA lixo).

Em 1992 Craig Venter pedia a patente pela descoberta de mais de 2400 genes (NIH).
Empresas privadas comearam essa abordagem. TIGR e HGS

O Projeto Genoma Privado

Em 1998 Craig Venter abandonou o TIGR e fundou a Celera Genomics. O plano: seqenciar todo o genoma humano pela abordagem shotgun usando trezentas PRISM 3700 e a maior concentrao de potncia computacional do mundo fora do Pentgono. O projeto levaria 2 anos e custaria entre 200 e 500 milhes de dlares.

A sobreposio das seqencias

O projeto privado contava com Gene Meyers para coordenar as operaes computacionais de sobreposio das seqncias obtidas pelo mtodo shotgun.

Jim Kent, UCSC, tomou emprestado 100 computadores pessoais e em 4 semanas resolveu o desafio tcnico de sobrepor as sequncias do Projeto pblico.

2000, o resultado preliminar

Em 22 de junho de 2000 o rascunho do projeto pblico havia sido concludo. Em 25 de junho de 2000 o projeto privado tambm concluiu o rascunho. No dia de 26 de junho de 2000 o presidente Bill Clinton, na Casa Branca e Tony Blair, na Downing Street anunciaram simultaneamente a concluso da 1 verso do Projeto Genoma Humano.

Informaes Obtidas
Menos do que aproximadamente 2% do genoma humano codifica protenas, apesar de 25% do DNA ser transcrito em RNA. As seqncias repetitivas parecem no desempenhar nenhuma funo direta, mas elas podem ter papel na dinmica estrutural dos cromossomos. Essas seqncias possibilitam rearranjos no genoma, criando genes novos e modificando outros.
As regies onde se concentram os genes possuem blocos ricos nas bases C e G, enquanto as regies pobres em genes possuem blocos ricos nas bases A e T.

Funo de Alguns Genes Conhecidos

Perspectivas
O sequenciamento do genoma humano uma faanha tecnolgica extraordinria, porm as possibilidades de desenvolvimento de novas tecnologias a partir destas informaes que ditaro os novos rumos da cincia.

 ... O genoma, por mais assombroso que seja, muito mais do que um monumento nossa sagacidade tecnolgica... um avano sem precedentes do nosso entendimento do que nos distingue biologicamente de outras espcies daquilo que, em outras palavras, nos torna humanos. James Watson (adaptado de DNA: the secret of life)