Bases qumicas de la vida

MSc. Csar Alberto Guzmn Vigo

PRINCIPIO UNIFICADOR DE LA NATURALEZA

Establece que propiedades de toda la materia viviente y no viviente, estn regidas por las mismas leyes bsicas de la fsica y de la qumica Ello implica que las caractersticas y el comportamiento de todos los organismos puedan explicarse por sus propiedades fsicas y qumicas Es imposible comenzar a comprender la fisiologa celular sin un conocimiento razonable de la estructura y propiedades de los tipos principales de molculas biolgicas

CONSTITUCION CELULAR

En materia viviente: Macromolculas: Polmeros, constitudos por Monmeros (semejantes: homopolmeros: glucogeno glucosa; diferentes: heteropolmeros: cidos nucleicos) Macromolculas, diversas, difieren en tamao y en relacin a variedad de monmeros Biopolmeros: Protenas (aminocidos), Polisacridos (polmeros de monosacridos), cidos nucleicos (ADN y ARN) Molculas menores: lpidos, agua, sales minerales, vitaminas Macromolculas, asociadas: lipoprotenas, glicoprotenas, proteoglicanos, nucleoprotenas)

AGUA: Propiedades

El agua e iones influyen en la configuracin y propiedades biolgicas de las macromolculas Solvente, papel estructural y de interacciones Naturaleza dipolar (cargas: O, centro y H extremos de tetraedro) Propiedades: 1. molcula asimtrica 2. Cada uno de los enlaces covalentes de la molcula est altamente polarizado 3. los 3 tomos de la molcula pueden formar enlaces de hidrgeno

Formacin de red interconectada

Formacin de puentes de hidrgeno entre molculas de agua contguas

AGUA: Molcula asimtrica

+

Enlaces de H y O polarizados

Dipolo del agua

Las molculas polares de importancia biolgica contienen uno o ms tomos electronegativos, casi siempre O, N,S o stos y P Disolucin de un cristal de sal

NATURALEZA DE LAS MOLCULAS BIOLGICAS

Carbohidratos

Son compuestos orgnicos: C, O, Hay muchos en relacin a (CH2O)n.

Qumicamente se definen como aldehdos o cetonas, dentro de ellos se clasifican los azcares simples o monosacridos en donde n es un nmero entero de 3 (Triosas) a 7. Si se unen dos monosacridos forman un disacrido; si se unen de 3-20 monosacridos resulta un oligosacrido y cuando se unen numerosas unidades de monosacridos, constituyen un polisacrido como por ejemplo los almidones, celulosas, pectinas, quitinas, etc. Azcares y los almidones generalmente se utilizan por los organismos como fuentes de energa; la celulosa, pectina y quitina tienen funcin estructural en clulas individuales y an en organismos completos como hongos, plantas, bacterias artrpodos, etc. Adems, algunos polisacridos y polmeros ms cortos de azucares actan como marcadores para una variedad de procesos de reconocimiento en las clulas, incluyendo la adhesin de ellas con sus vecinas y el transporte de protenas a los destinos intracelulares apropiados y otros hacen parte de sustancias celulares importantes como son los cidos nucleicos y como cofactores que contienen vitaminas. Los carbohidratos de peso molecular bajo son solubles en agua y tienen poder edulcorante (endulzante) alto, caractersticas que son opuestas en los carbohidratos de peso molecular alto en los cuales la solubilidad se reduce notablemente.

MONOSACRIDOS

Son los azcares ms simples, en su nombre incluyen la terminacin osa. Si en su molcula contienen la funcin carbonilo ( - C=O ) en un carbn primario se denominan aldosas y si esa funcin est en un carbono secundario, se denominan cetosas. Otro aspecto que se debe tener en cuenta para la clasificacin y estructura de los monosacridos es el nmero de carbonos que presenta la molcula tal como se resume en el siguiente cuadro:

No. 3 4 5 6 CARBONOS CARBONOS CARBONOS CARBONOS CARBONOS FUNCIN ALDOSA CETOSA

Aldotriosa Cetotriosa Aldotetrosa Cetotetrosa Aldopentosa Cetopentosa Aldohexosa Cetohexosa

FORMACIN DE TRIOSAS

D-Glucosa

Gliceraldehdo

Monosacridos con tres tomos de carbono. Si la funcin carbonilo est en el carbono 1, es una Aldosa, si est en el carbono 2, es una Cetosa. Dentro de los monosacridos de cinco tomos de carbono o pentosas, se tienen como ejemplo importante en las clulas las aldopentosas ribosa y desoxirribosa que hacen parte de la molcula del ARN y ADN. En la fig. de la izq. se muestra la estructura lineal y en la fig. der. las dos formas alternativas en anillo (a y ) de estos dos azcares dependientes de la configuracin del carbono 1. La estructura cclica es caracterstica de los azcares que tienen cinco o ms carbonos, y es la forma predominantes de esas molculas en las clulas.

D-Glucosa

Formacin del anillo

Glucosa-Anillo

a D-Glucosa

b D-Glucosa

Formas alternativas del anillo: a y b

Las hexosas son los azcares de seis carbonos. El ejemplo ms comn en los organismos vivos es la Glucosa que es la subunidad de la cual estn hechos la mayora de los polisacridos, su molcula cclica es el resultado de la reaccin del grupo carbonilo (C=O) de la posicin C1 con el grupo hidroxilo (OH) de la posicin C5 para formar una estructura denominada anillo de piranosa o anillo piransico que presenta al igual que las pentosas dos formas isomricas a y .
Por convencionalismo, la molcula se denomina a (alfa) glucopiranosa o a-glucosa cuando el grupo OH del C1 se proyecta hacia abajo del plano y -piranosa o -glucosa cuando el grupo hidroxilo se proyecta hacia arriba. An cuando las molculas presentan caractersticas semejantes a las de los azcares simples, pueden formar polmeros con estructuras y funciones diferentes como se ver ms adelante. Muchos organismos tambin sintetizan otros monosacridos del tipo hexosa dentro de los que se incluyen a la fructosa (azcar de frutas) y la galactosa (azcar de la leche).

Fructosa (Azcar de las frutas). Izquierda: Estructura lineal Derecha: Estructura en anillo

DISACRIDOS Los monosacridos, en especial la glucosa y sus derivados, tienen un lapso de vida muy corto dentro de la clula ya que la mayora de ellos se degradan por hidrlisis para liberar su energa qumica utilizada en las diferentes reacciones celulares, o se unen mediante enlaces glucosdicos (C-O-C) por sntesis de deshidratacin para formar disacridos y polisacridos. El enlace glucosdico se forma entre el hidroxilo ( este aporta un -H ) del carbono 1 del primer monosacrido con el -OH del carbono 2, 3 o 4 del segundo monosacrido formando una molcula de agua; los enlaces resultantes sern alfa (a ) o beta ( ) segn la posicin del -OH en el primer azcar.

Esquema de los enlaces glicosdicos alfa.

Los disacridos a menudo se usan en las plantas para almacenar energa por corto tiempo, los ms comunes en la naturaleza son: la Sacarosa, la Maltosa y la Lactosa

SACAROSA

LACTOSA

MALTOSA

La sacarosa o azcar de mesa, es el resultado de la unin del carbono 1 de la a-glucosa y el carbono 2 de la -fructosa con un enlace glucosdico a(1-- 2); es un compuesto de gran valor energtico . La hidrlisis de la sacarosa por cidos o por enzimas como la invertasa o sacarasa, rompe el enlace glucosdico y se obtiene el azcar invertido que es una mezcla de glucosa y fructosa. La molcula de la lactosa o azcar de la leche ( entre 2-7% ), est constituda por -galactosa y a-glucosa, con el enlace glucosdico ( 1 --> 4 ) entre el carbono 1 de la -galactosa y el carbono 4 de la a-glucosa. Es un azcar reductor sintetizado por las clulas secretoras de las glndulas mamarias durante la lactancia, su hidrlisis se lleva a cabo por la accin de la enzima Lactasa.

La maltosa est formada por dos molculas de a-glucosa con el enlace glucosdico a(1-- 4) entre el carbono 1 de la primera molcula y el carbono 4 de la segunda. Este compuesto se obtiene despus de la digestin del almidn, es un azcar reductor debido a que reduce el in cprico a in cuproso cuando se emplea el reactivo de Felhing. Otros disacridos tienen funcin estructural como la celobiosa, constituida por dos molculas de -glucosa entre las cuales existe un enlace glucosdico ( 1 --> 4 ), se obtiene durante la degradacin o sntesis del polisacrido celulosa.

POLISACRIDOS Son los carbohidratos ms abundantes, son el resultado de la unin de ms de 10 unidades de azcares sencillos (generalmente la glucosa) mediante enlaces glucosdicos. entre otros se pueden citar el almidn y la celulosa (en plantas) y el glucgeno (en animales).

Polisacrido Constituyente del Almidn y el Glucgeno. Conformado por unidades de glucosa en enlace alfa 1-4.

Polisacrido ramificado (Amilopectina) Constituyente del Almidn y el Glucgeno.

El almidn es un polisacrido de estructura helicoidal, su funcin es de reserva en las plantas. Consta de una mezcla de dos tipos diferentes de polmeros; la amilosa y la amilopectina. La primera es una molcula recta sin ramificaciones en la cual las molculas de glucosa se unen mediante enlaces glucosdicos a(1-- 4), la amilopectina es una molcula ramificada como el glucgeno o almidn animal, en donde las molculas de glucosa se unen con enlaces glucosdicos a (1-- 4) en su porcin recta y enlaces a (1-- 6) en sus ramificaciones que estn separadas por 24-30 unidades de glucosa.

Un extremo de la cadena de almidn lleva un grupo -OH que constituye el terminal reductor de la gran molcula.. La amilopectina difiere del glucgeno porque tiene menos ramificaciones y un peso molecular general ms bajo (aproximadamente 500 mil daltons ), sus terminales no son reductores ya que los carbonos que tendran el grupo -OH estn participando en los enlaces glucosdicos.

El glucgeno es un polisacrido helicoidal de reserva semejante a la amilopectina vegetal con enlaces glucosdicos a (1-- 4) y a (1-- 6) sin embargo, sus ramificaciones son cortas y se establecen cada 8-12 subunidades de glucosa razn por la cual se obtienen fcilmente cuando se necesita energa. Se almacena en los msculos y en el hgado en donde las enzimas all presentes hidrolizan con facilidad los enlaces glucosdicos del glucgeno. Dado que su molcula es semejante a la amilopectina, el glucgeno se puede degradar en los animales por la alfa amilasa del pncreas y de la saliva a nivel de los enlaces a (1-- 4) obtenindose como producto una mezcla de glucosa, maltosa y dextrina lmite. Esta ltima corresponde al glucgeno parcialmente hidrolizado con abundantes enlaces a (1-- 6) que la alfa amilasa no puede digerir, de manera que las amilo a (1-- 6) glucosidasas actan sobre esos enlaces y posteriormente la alfa amilasa puede continuar la degradacin sobre los enlaces a (1-- 4).

La celulosa se considera como el compuesto ms abundante del planeta, puesto que es el principal componente estructural de la pared celular los vegetales. Es un polmero de -glucosa no ramificado en donde las subunidades se unen mediante enlaces glucosdicos (1-- 4); debido a esto la molcula se presenta como una lmina extendida constituida por cables moleculares rgidos sobre los cuales no actan las enzimas digestivas de los animales que consumen vegetales. As, que esta funcin la realizan las bacterias y los protozoarios que se encuentran normalmente haciendo parte de la flora ruminal (en rumiantes) e intestinal (de otros animales) que producen celulasa y para las cuales la celulosa es alimento.

No todos los polisacridos que se encuentran en los organismos estn formados por unidades de glucosa. Algunos como la quitina, por ejemplo, es un polmero estructural no ramificado del aminoazcar N-acetil glucosamina, unido por enlaces glucosdicos (1--4) que hace parte del exoesqueleto de artrpodos y de las paredes celulares de muchos hongos.

N-acetil-D-Glucosamina

QUITINA

Polmero estructura del aminoazcar n-acetil-D-Glucosamina

MUCOPOLISACRIDOS O GLUCOSAMINOGLUCANOS

Son polmeros de monosacridos que poseen unidades de azcares modificados como aminoazcares, azcares sulfatados, azcares cidos y N- acetil derivados. Las cadenas de carbohidratos de los glucosaminoglucanos existen como repeticiones de disacridos en los cuales uno de los dos azcares es siempre la N-acetilglucosamina o Nacetilgalactosamina. Todos los glucosaminoglucanos con excepcin del cido hialurnico tienen azcares sulfatados, y la presencia de grandes cantidades de grupos carboxilo y sulfato hacen de estos polmeros molculas fuertemente cidas. La mayora de estos compuestos se encuentran combinados con protenas para formar proteoglucanos en la matriz extracelular, especialmente el heparan sulfato que est en estrecha asociacin con el lmite externo de la membrana plasmtica.

Los glucosaminoglucanos son de aspecto amorfo, tan viscosos como las secreciones mucosas, entre los ms comunes se pueden citar: el cido hialurnico, el condroitn sulfato A, la heparina, el keratosulfato y el dermatn sulfato.

El cido hialurnico est formado por la repeticin de un disacrido formado por el cido glucurnico y la N- acetil glucosamina, unidos entre s por enlaces glucosdicos (1-- 3) y los disacridos mediante enlaces (1-- 4). El cido hialurnico se encuentra como componente principal de la sustancia fundamental del tejido conectivo, constituyendo el humor acuoso del ojo, el lquido sinovial y la gelatina de Wharton del cordn umbilical. Se hidrata fcilmente y de l dependen los cambios en la viscosidad y la permeabilidad de la sustancia fundamental del tejido conectivo, y por ello tiene influencia importante en el intercambio de material entre las clulas de los tejidos y el plasma sanguneo. La enzima que hidroliza los enlaces del cido hialurnico es la hialuronidasa presente en los espermatozoides para facilitar la entrada al vulo y en los estafilococos para invadir el tejido conectivo. Ella reduce la viscosidad y con ello aumenta la permeabilidad del tejido.

Mucopolisacrido formado por el cido glucurnico y la N- acetil glucosamina

La heparina es un mucopolisacrido acdico sulfatado, resultado de la repeticin del disacrido formado por del cido glucurnico sulfatado (cido idurnico) unido a una glucosamida 6-sulfato mediante enlace glucosdico a(1-- 4). Los disacridos tambin se unen entre s por enlace glucosdico a(1-- 4).

Mucopolisacrido Heparina formado por el cido glucurnico sulfatado y la glucosamida 6-sulfato

El condroitn sulfato A, es la unidad disacrida repetitiva del cido glucurnico con la N-acetil galactosamina 4 sulfato mediante enlace a(1-- 3). Los disacridos se unen con enlace glucosdico a(1-- 4) y forman a su vez la condromucina componente de la sustancia fundamental del cartlago.

Mucopolisacrido formado por las unidades de cido glucurnico con la N-acetil galactosamina.

Estructura de los lpidos simples (molculas no polares, insolubles en agua)

GRASAS: El patrn ms comn de la estructura de las grasas es una molcula de glicerol unida a tres cidos grasos (Triacilglicerol) . Los cidos grasos son cadenas hidrocarbonadas apolares largas no ramificadas, con un solo grupo carboxilo ionizable en un extremo. El glicerol o glicerina es un polialcohol de tres tomos de carbono que puede unir sus tres OH (hidroxilos) mediante enlaces ster con los grupos carboxilo (COOH) de una, dos o tres molculas de cidos grasos para dar lugar a monoglicridos, diglicridos o triglicridos respectivamente. Las grasas lquidas a t ambiente se denominan aceites

GLICEROL: Polialcohol de tres tomos de carbono

a) Estructura bsica de un triacilglicerol o grasa neutra. El radical glicerol (en naranja), est unido por tres enlaces ster a los grupos carboxilo de tres cidos grasos. B) cido esterrico, cido saturado de 18 carbonos , comn en grasas animales.

Cadenas hidrocarbonadas. cido graso saturado y cido graso insaturado

Nmero par de tomos de carbono Longitud 14 - 24 carbonos Presentes o ausentes enlaces: carencia saturadas(triestearina), dobles enlaces: insaturadas (linoleico) Un aceite se puede convertir en grasa suturada, rompiendo enlaces entre carbonos, reemplazando simples y aadiendo hidrgenos (margarina) Grasa con ac. Grasos idnticos o mixtos

Ceras

Son similares a las grasas y a los aceites excepto en que los cidos grasos que las conforman se ligan a cadenas largas de alcoholes en lugar de unirse al glicerol. Son slidas e insolubles en agua. Las ceras forman una cubierta impermeable sobre las hojas, frutos y tallos de plantas terrestres para impedir la prdida de agua por excesiva evapotranspiracin. Algunas estructuras cobertoras de los animales como son las plumas, los pelos, la piel poseen ceras con funcin impermeabilizante y lubricantes ms no de importancia alimenticia. En casos excepcionales como en las abejas las utilizan para construir sus colmenas. Esta cera de abejas est constituida principalmente por steres de cido palmtico y alcoholes de 26-34 tomos de carbono.

Estructura de los lpidos complejos

FOSFOLPIDOS O FOSFOGLICRIDOS Son diglicridos semejantes a un aceite excepto en que uno de los cidos grasos se reemplaza por un residuo de cido fosfrico y a menudo este ltimo se une a una molcula polar pequea ionizable tal como la colina, serina, inositol, o etanolamina De esta manera el fosfolpido adquiere una caracterstica anfiptica, es decir su molcula presenta una "cabeza" (de glicerol y base orgnica) polar o cargada (hidrosoluble) unida a una "cola" no polar (hidrofbica) de cidos grasos, condicin que le facilita hacer parte estructural de las membranas celulares como bicapa lipdica y cumplir en ellas una funcin selectiva en el transporte puesto que al entrar en contacto con el agua adquieren cierta configuracin y los extremos hidrosolubles se orientan hacia fuera mientras los extremos hidrofbicos se orientan en sentido opuesto.

FOSFOLIPIDO

Lpido Complejo principal constituyente de las membranas celulares

ESFINGOLIPIDOS

Son los lpidos estructurales de membrana menos abundantes, derivados de la esfingosina, un amino alcohol de cadena larga hidrocarbonada el cual esterifica con diferentes grupos. Si el grupo amino de la esfingosina se une a un cido graso (R) y establece un enlace amida, esta molcula es una ceramida.

Esfingolpido que presenta un enlace tipo amino con un radical de tipo cido graso (R)

La funcin de las ceramidas consiste en reforzar la cohesin de las clulas de la capa crnea de la epidermis, limitando la prdida de pptidos hidrosolules y minimizan las alteraciones producidas por los rayos UV tanto en la piel como en el pelo.

Si la esfingosina esterifica el alcohol terminal con fosforilcolina, la molcula resultante es una esfingomielina, fosfolpido de esfingosina presente en las membranas celulares. Si el grupo esterificado es un carbohidrato la molcula es un glicolpido, que puede llamarse cerebrsido si el carbohidrato es un azcar simple y si es un oligosacrido se llama ganglisido. Puesto que los esfingolpidos tienen dos cadenas largas de hidrocarburos (hidrofbicas) en un extremo y una regin hidroflica en el otro son tambin molculas anfipticas y muy similares a los fosfoglicridos o fosfolpidos razn por la cual se ajustan de manera adecuada en la bicapa lipdica de las membranas.

Estructura molecular de un gangleosido tpico

Lpidos derivados: Incluye cualquier lpido que no se clasifique como simple o complejo como los esteroides, carotenoides, prostaglandinas y vitaminas liposolubles
ESTEROIDES

Vitamina A en la que se detalla las unidades de isopreno

Son lipoderivados que presentan semejanza estructural con los terpenos o isoprenos , su molcula presenta la estructura bsica del compuesto anillado ciclopentanoperhidrofenantreno que corresponde a un conjunto de cuatro anillos entrelazados; tres de los cuales contienen seis tomos de carbono y el cuarto slo tiene cinco. La longitud y estructura de las cadenas caracteriza a cada uno de los esteroides derivados. Los esteroides que tienen un grupo -OH se denominan esteroles, el ejemplo ms conocido es el colesterol el cual en ciertas clulas animales llega a constituir ms del 50% de los lpidos de membrana y es el ms pequeo y menos anfiptico de ellos. Debido a que la estructura cclica del colesterol carece de la flexibilidad de las cadenas alifticas, se cree que su funcin sea la de mantener la estabilidad de la membrana a pesar de leves aumentos de temperatura. Las membranas de las clulas vegetales contienen otros tipos de esteroles.

Conformacin de la estructura base de los lpidos derivados (CicloPentanoperhidrofenantreno)

Otros ejemplos de esteroides son las sales biliares, las hormonas sexuales masculinas y femeninas y las hormonas de la corteza suprarrenal. Esas hormonas en los animales como los crustceos, insectos y vertebrados estn implicadas en procesos de regulacin metablica. As, la hormona de la muda (ecdisona) de los insectos, la produce la glndula protorxiaca y estimula en conjunto con otras hormonas el cambio de la cubierta externa para regular el ritmo del crecimiento. Dentro de las hormonas de la corteza suprarrenal se consideran principalmente: glucocorticoides (cortisol) los cuales entre otras funciones median las respuestas del cuerpo al estrs favoreciendo el uso de cidos grasos y protenas para la obtencin de energa por parte de todas las clulas excepto las musculares y nerviosas que se beneficiarn de la energa obtenida directamente de las fuentes de glucosa (glucgeno), mineralocorticoides (aldosterona)

HORMONA DE MUDA EN ARTRPODOS

PROSTAGLANDINAS Son hormonas derivadas de cidos grasos poliinsarturados de 20 carbonos con un anillo de cinco tomos de carbono en su estructura , Su efecto de tipo hormonal radica en la regulacin de la actividad de otras hormonas mediante estmulo o inhibicin de la formacin de AMP cclico. Las prostaglandinas se sintetizan y liberan en diferentes tejidos del cuerpo como la vescula seminal, los pulmones, el hgado y el aparato digestivo. Algunas prostaglandinas dilatan las vas bronquiales, inhben la secrecin gstrica, incrementan la motilidad intestinal, estimulan la contraccin del tero, elevan o reducen la presin arterial, regulan el metabolismo y provocan inflamacin. Las sintetizadas en el centro termorregulador del hipotlamo provocan fiebre. Los premios Nobel suecos Sune Bergtrom y Bengt Samuelson en 1982 las denominaron prostaglandinas debido a que inicialmente se aislaron del semen humano, al considerar que provenan de la prstata.

PROTENAS
Son las molculas ms diversas, complejas y de mayor tamao presentes en la clula. Contienen carbono, hidrgeno, oxgeno, nitrgeno y usualmente azufre. En algunas protenas pueden encontrarse unidos diferentes tipos de sustancias qumicas llamadas grupos prostticos, estos incluyen carbohidratos, lpidos, grupos fosfato, el grupo hem que contiene hierro e iones metlicos tales como el cobre y el zinc. Las protenas tienen formas tridimensionales que son necesarias para su funcin especfica. Entre las funciones ms importantes de las protenas se consideran: Su papel como catalizadores orgnicos (enzimas) de casi todas las reacciones de los sistemas biolgicos. Como hormonas transmitiendo informacin entre clulas. Su participacin en el transporte y almacenamiento de otras molculas pequeas, por ejemplo el transporte de oxgeno por la hemoglobina. En el caso de los anticuerpos proporcionan defensa contra infecciones. Sirven como componentes estructurales en las clulas y tejidos. Ser la molcula bsica en los mecanismos de movimiento, como en el caso de las protenas contrctiles. Ser el ltimo recurso para la obtencin de energa cuando el organismo carece de otras reservas tales como lpidos y carbohidratos.

Las protenas son polmeros constituidos por monmeros denominados aminocidos proteicos o naturales, los cuales son 20. Cada uno de ellos posee un grupo amino -NH2 y un grupo carboxilo -COOH unidos al mismo tomo de carbono alfa , se diferencian entre s por el tamao de sus cadenas laterales. Los aminocidos se agrupan en cuatro categoras segn las propiedades de sus cadenas laterales

Estructura bsica de los aminocidos evidencindose los grupos funcionales (Grupo carboxilo y amino) y el grupo radical (R)

5 de los 20 aminocidos. Obsrvese la diferencia en composicin en el grupo radical.

FORMACIN DE PPTIDOS Los diferentes aminocidos se polimerizan en el interior de las clulas para constituir pptidos y protenas de acuerdo con la informacin gentica razn por la cual la polimerizacin se realiza con la participacin de enzimas especficas y requiere del concurso del ARN y de los ribosomas para llevarse a cabo. Este proceso de inicia con una reaccin de condensacin entre el grupo carboxilo del primer aminocido con el grupo amino del segundo para formar un enlace peptdico o amida con la eliminacin de una molcula de agua. El compuesto resultante es un dipptido, el cual puede formar un segundo enlace peptdico entre su grupo carboxilo terminal y el grupo amino de un tercer aminocido dando lugar de nuevo a una molcula de agua y originando un tripptido como se observa en la siguiente figura:

Conformacin de dipeptidos y tripeptidos con la eliminacin de una molcula de agua en cada paso

CLASIFICACIN DE LAS PROTENAS La clasificacin de las protenas se realiza desde varios puntos de vista, as: SEGN SU COMPOSICIN: Protenas simples u Holoprotenas: Las cuales estn formadas exclusivamente o predominantemente por aminocidos. Protenas conjugadas: Poseen un componente de proporcin significativa no aminoacdico que recibe el nombre de grupo prosttico. Segn la naturaleza de este grupo consideramos: Glicoprotenas: Se caracterizan por poseer en su estructura azcares. Se pueden citar como ejemplo: las inmunoglobulinas, algunas protenas de membrana, el colgeno y otras protenas de tejidos conectivos (glucosaminoglicanos). Lipoprotenas: Protenas conjugadas con lpidos que se encuentran en las membranas celulares. Nucleoprotenas: Se presentan unidas a un cido nucleico, como en los cromosomas, ribosomas y en los virus. Metaloprotenas: Contienen en su molcula uno o ms iones metlicos que no constituyen un grupo hem. Por ejemplo algunas enzimas. Hemoprotenas o Cromoprotenas: Protenas que tienen en su estructura un grupo hem . Ejemplo: Hemoglobina, Mioglobina y ciertas enzimas como los citocromos.

Estructura bsica de las hemoprotenas o cromoprotenas

DE ACUERDO CON SU MORFOLOGIA Y SOLUBILIDAD: Protenas fibrosas: Son insolubles en agua, presentan formas moleculares alargadas, con un nmero variado de cadenas polipeptdicas que constituyen fibras resistentes, con cierto grado de elasticidad, fragilidad o ductilidad. Funcionan como protenas estructurales o de soporte. Las ms comunes son: Elastina, Colgeno, Queratina, Fibrina, etc. Protenas Globulares: Tienden a ser ms solubles en agua, debido a que su superficie es polar. Sin embargo, pueden presentar mayor solubilidad en otros solventes como soluciones salinas, cidos o bases diluidas o alcohol. Su estructura es compacta con formas casi esfricas. La mayora de las protenas conocidas son globulares, dentro de las que se consideran todas las enzimas, las protenas del plasma y las presentes en las membranas celulares. A su vez las protenas globulares se pueden clasificar de acuerdo con su solubilidad: Albminas: Protenas fcilmente solubles en agua, que coagulan con el calor y precipitan con las soluciones salinas saturadas. Por ejemplo la Lactoalbmina, albmina del suero, la ovoalbmina (presente en la clara del huevo). Globulinas: Escasamente solubles en agua pura, pero solubles en soluciones salinas diluidas como cloruro de sodio, entre ellas se encuentran las seroglobulinas (sangre), ovoglobulina, inmunoglobulinas, etc. Glutelinas: Solubles en cidos y bases diluidos, insolubles en solventes neutros. Ejemplo: La Glutenina del trigo. Prolaminas: Solubles en alcohol del 70 al 80%, insolubles en agua, alcohol absoluto y otros solventes neutros, como la Zena del maz y la Gliadina del trigo.

DE ACUERDO CON SU FUNCIN BIOLGICA:

Protenas estructurales: Forman parte de clulas y tejidos a los que confieren apoyo estructural. Ejm. el colgeno y la elastina presentes en el tejido conectivo de los vertebrados. La queratinas de la piel, pelo y uas y la espectirna presente en la membrana de los eritrocitos. Protenas de transporte: Ejm. la hemoglobina y la mioglobina, cidos grasos en el caso de la albmina de la sangre, o las que realizan un transporte transmembrana en ambos sentidos. Protenas de defensa: Ejm. anticuerpos (inmunoglobulinas) de la fraccin gamma globulnica de la sangre, las protenas denominadas interferones cuya funcin es inhibir la proliferacin de virus en clulas infectadas e inducir resistencia a la infeccin viral en otras clulas, el fibringeno de la sangre importante en el proceso de coagulacin. Protenas hormonales: Se sintetizan en un tipo particular de clulas pero su accin la ejercen en otro tipo. Ejemplo, la insulina. Protenas como factores de crecimiento: Su funcin consiste en estimular la velocidad de crecimiento y la divisin celular. Como ejemplo se puede citar la hormona de crecimiento y el factor de crecimiento derivado de plaquetas. Protenas catalticas o enzimas: Ejm. lipasas, amilasas, fosfatasas, etc. Protenas contrctiles: Son protenas capaces de modificar su forma, dando la posibilidad a las clulas o tejidos que estn constituyendo (desplazamiento, contraccin, relajacin) razn por la cual se encuentran implicadas en los diferentes mecanismos de motilidad. Las protenas ms conocidas de este grupo son la actina y la miosina. Protenas receptoras: Protenas encargadas de captar las seales externas o simplemente de inspeccionar el medio. Si encuentran en las membranas de los organelos, permiten su interaccin. Sin embargo, no son protenas exclusivas de membrana ya que algunas se encuentran en el citoplasma. El ejemplo ms tpico de stas son los receptores de las hormonas esteroides. Casi todos los neurotransmisores, la mayora de las hormonas y muchos medicamentos funcionan gracias a la presencia de estas protenas. Protenas de transferencia de electrones: Son protenas integrales de membrana, comunes en las mitocondrias y cloroplastos cuya funcin se basa en el transporte de electrones desde un donador inicial hasta un aceptor final con liberacin y aprovechamiento de energa. Como ejemplo se citan a los Citocromos que hacen parte de la cadena respiratoria.

ARQUITECTURA DE LAS MOLCULAS DE PROTENA

En la estructura de las protenas se pueden considerar cuatro niveles de organizacin: primario, secundario, terciario y cuaternario. Cada uno de los cuales resalta un aspecto diferente y depende de distintos tipos de interacciones. Mientras la estructura primaria es simplemente la secuencia lineal de aminocidos de una cadena polipeptdica las dems establecen su organizacin tridimensional de pptidos o conjunto de ellos.

ESTRUCTURA PRIMARIA Se considera como estructura primaria a la secuencia lineal especfica (sin ramificaciones) de aminocidos de una cadena polipeptdica. La importancia desde el punto de vista qumico de la estructura primaria, radica en la secuencia de los grupos laterales de los aminocidos (cadenas laterales, R) dado que es el componente variable de la molcula que proporciona la identidad a la cadena. Por otra parte, el significado biolgico de esta secuencia se basa en el control que ella ejerce en la organizacin de los niveles de complejidad superiores de la estructura proteica ya que esta permitir en ltima estancia la determinacin de su actividad biolgica, es decir, la secuencia de aminocidos tiene la informacin necesaria para que la molcula adopte una conformacin tridimensional adecuada. Es tan importante esta secuencia que el cambio en solo un aminocido como resultado de una mutacin, puede ser trgico para la vida de un organismo. El grado de tolerancia a los cambios depende del grado de alteracin de la geometra que presente la estructura proteica, as como del comportamiento qumico que tiene la cadena lateral del aminocido sustituido (polar, no polar, bsico o cido). Cabe resaltar que todas las protenas sin importar su nivel de organizacin se originan de una estructura primaria que posteriormente adopta una conformacin tridimensional especfica. No obstante, una protena que permanece con su estructura primaria inmodificable pero funcional es la insulina, cuya secuencia de aminocidos se conoci por primera vez a principios de la dcada de 1950.

ESTRUCTURA SECUNDARIA Consiste en el enrollamiento de la cadena peptdica sobre su propio eje para formar una hlice o alguna otra estructura tridimensional especfica. La estructura secundaria ms comn es la a-hlice (alfa), la cual se caracteriza por formar una estructura geomtrica en espiral, muy uniforme, en la que cada vuelta est constituida por 3,6 aminocidos. La hlice se mantiene mediante puentes de hidrgeno entre el hidrgeno del grupo amino del enlace peptdico de un aminocido y el grupo carboxilo del enlace peptdico de otro. Dentro de este grupo se pueden mencionar protenas como el colgeno, la queratina, elastna .

Colgeno. orientacin alfa-hlice

Otro tipo comn de estructura secundaria es la hoja plegada, que se caracteriza por presentarse de forma aplanada y extendida, adems posee un mximo de enlaces de hidrgeno entre los enlaces peptdicos. Esta estructura consta de varias cadenas peptdicas que permanecen enfrentadas y se mantienen juntas con enlaces de hidrgeno en un arreglo a manera de zig-zag. La estructura laminar formada le confiere flexibilidad ms no elasticidad . Debido a que toda cadena polipeptdica tiene un extremo C-terminal en una direccin y un extremo N- terminal en la otra, dos cadenas enlazadas con hidrgeno y una al lado de la otra pueden correr en la misma direccin, paralelas, o en direccin opuesta, antiparalela. Un ejemplo de estas protenas es la fibrona de la seda.

Estructura secundaria en forma de hoja plegada

ESTRUCTURA TERCIARIA Es raro para una protena entera permanecer con la estructura de a-hlice u hoja plegada . La mayora de ellas adquieren formas tridimensionales complejas denominadas estructuras terciarias. La estructura terciaria describe la conformacin definitiva y especfica de la protena. Durante el enrollamiento de la cadena peptdica, para dar origen a la estructura terciaria, los puentes de hidrgeno y la interacciones inicas e hidrofbicas entre una parte de la cadena y otra son las fuerzas que mantienen los pliegues en posicin espacial correcta. Por otra parte, los puentes disulfuro (-S-S-) que se forman entre los aminocidos de cistena pueden acercar partes que se hayan distantes en una protena, de hecho algunos sitios activos de enzimas estn constituidos por ellos. Adems, en la protena tambin se forman algunos otros enlaces covalentes para mantener su estructura terciaria que por lo general es globular. Con respecto a la estructura terciaria de cadenas polipeptdicas largas, cabe destacar la presencia de regiones compactas semiindependientes denominadas dominios, que se caracterizan por poseer una geometra casi esfrica especfica con un interior hidrofbico y un exterior polar. El carcter independiente del dominio es evidente cuando al separarlo de la cadena, su estructura primaria es capaz de plegarse sobre s misma para adoptar la conformacin nativa. Una protena puede presentar ms de un dominio, a menudo interconectados por un segmento polipeptdico carente de estructura secundaria regular y alternativamente estar separados por una hendidura o una regin menos densa en la estructura terciaria de la protena. Los diferentes dominios de una protena pueden gozar de movimiento relativo que est asociado con una funcin. As por ejemplo, en la enzima hexoquinasa, el sitio activo de unin del sustrato glucosa est en una hendidura entre dos dominios, cuando la glucosa se une a la hendidura, los dominios colindantes se cierran sobre el sustrato, atrapndolo para la fosforilacin.

Secuencia de conformacin de la protena hemoglobina

ESTRUCTURA CUATERNARIA En la estructura cuaternaria se consideran molculas proteicas superiores a los 50 mil daltons en donde las subunidades constitutivas pueden ser idnticas o diferentes y se asocian para formar dmeros, trmeros y tetrmeros. En algunos casos las cadenas aisladas son inactivas, pero en otros pueden cumplir la misma funcin que el complejo, aunque con diferente cintica. El ejemplo ms conocido es la hemoglobina en donde las interacciones hidrofbicas, los enlaces de hidrgeno y los enlaces inicos ayudan a mantener las cuatro subunidades juntas para formar una molcula funcional, as cada subunidad de hemoglobina se pliega de manera similar a la estructura terciaria de mioglobina. Dado que la hemoglobina dentro de los glbulos rojos est constituida por dos cadenas alfa y dos cadenas beta que permiten tomar una molcula de oxgeno, para "atrapar" molculas adicionales de oxgeno, las cuatro subunidades cambian ligeramente su conformacin y los enlaces inicos se rompen para exponer las cadenas y facilitar esta funcin. Esto indica que las asociaciones estrechas de las cadenas de polipptidos dentro de la misma protena proporcionan un tipo de comunicacin entre las unidades y se puede entender que en las cadenas de aminocidos existen dos tipos de informacin: uno que genera la conformacin adecuada de las estructuras secundarias, terciarias y cuaternarias y otro que permite la reactividad correcta de las molculas.

Estructura Cuaternaria de la hemoglobina. Observe los grupos hem en cada dominio

FACTORES QUE AFECTAN LA ESTABILIDAD ESTRUCTURAL DE LAS PROTENAS Hasta el momento se cree que la estructura primaria de una protena induce a establecer las estructuras secundaria, terciaria y cuaternaria ya que el ADN no slo determinara la estructura primaria sino tambin los niveles superiores de estructura. Sin embargo, la actividad biolgica de la protena depende en gran medida de su estructura terciaria especfica mantenida por los enlaces mencionados anteriormente, de tal manera que cuando una protena se somete a: calor, determinadas sustancias qumicas, cambios bruscos de pH, etc. su estructura terciaria se desorganiza y las cadenas peptdicas adquieren una conformacin al azar que induce a la prdida de su actividad biolgica especialmente cuando acta como enzima.

Las temperaturas elevadas, rompen muy fcilmente los puentes dbiles de hidrgeno y las interacciones hidrofbicas a causa del aumento en la energa cintica de las molculas. La alteracin del pH puede cambiar el patrn de ionizacin de los grupos carboxilo y amino en las cadenas laterales de los aminocidos desorganizando el patrn de atracciones y repulsiones inicas que contribuyen a la estructura terciaria normal.
La prdida de la estructura terciaria se denomina desnaturalizacin, y siempre se acompaa de la alteracin de las funciones biolgicas normales de las protenas. La desnaturalizacin se puede originar por calor o concentraciones altas de sustancias polares y solventes no polares tales como la rea que rompen los puentes de hidrgeno que mantienen la estructura de la protena. Generalmente la desnaturalizacin es irreversible, particularmente si muchas protenas desnaturalizadas interactan en eventos no especficos al azar, como se presenta en los cuerpos de inclusin caractersticos de algunas enfermedades neurodegenerativas. Sin embargo, en algunos casos la desnaturalizacin es reversible, y una vez las condiciones del ambiente vuelvan a su estado normal, la protena puede adquirir su forma activa (ejemplo la lisosima). En este caso se habla de renaturalizacin.

CHAPERONAS: SU PAPEL EN EL ESTABLECIMIENTO DE LA FORMA DE LAS PROTENAS

El establecimiento de los pliegues de la molcula en una estructura terciaria es algo complicado que se ha estudiado por muchos aos. La protena no se forma toda de una vez, en algunas clulas puede tomar varios minutos desde el comienzo de la sntesis hasta que adquiere la conformacin definitiva.
Este proceso es de suma complejidad, sobretodo cuando la protena es de gran tamao; por lo cual la clula con el fin de asegurar la produccin de molculas de buena calidad utiliza un grupo especial de otras protenas, llamadas chaperonas, que ayudan en parte a prevenir el plegamiento inapropiado que conduce a desrdenes metablicos. Algunas chaperonas se unen a protenas en formacin y las protege de las interacciones con otras hasta que la nueva molcula adquiere su estructura correcta. Otras por su parte, participan en la conformacin de una molcula proteica especfica.

Otro aspecto importante de algunas chaperonas conocidas genricamente como protenas de "Choque Trmico" es la respuesta que desencadenan ante cambios bruscos de temperatura. Esta respuesta consiste principalmente en elevar su concentracin en la clula con el fin de permitir su interaccin con las dems protenas y evitar su desnaturalizacin. Algunas evidencias sugieren que las protenas se pliegan de manera anormal en ciertas enfermedades infecciosas como el mal de las "vacas locas" o la enfermedad de Creutzfeldt-Jakob o neurodegenerativas humanas como la enfermedad de Alzheimer .

PROTENAS COMO CATALIZADORES BIOLGICOS

Las protenas no solo hacen parte de la estructura de la clula, ellas tambin juegan un papel importante como catalizadores bilogicos en las clulas vivas ya que incrementan la velocidad de reaccin qumica, es decir la velocidad a la cual la reaccin se mueve hacia el equilibrio al reducir la energa de activacin y ejercer control sobre las actividades celulares. La energa de activacin es la cantidad de energa (en kJ) requerida para llevar mediante el rompimiento de enlaces de energa a las molculas de los reactivos hacia un estado de catlisis. El poder cataltico de las enzimas es impresionante, ya que el incremento de la velocidad de las reacciones qumicas est entre 108 y 1020 veces, comparado con la velocidad a la que se llevara a cabo la reaccin de manera espontnea.

Louis Pasteur demostr por primera vez la participacin de clulas vivas de levadura en los procesos de fermentacin. A finales del siglo XIX se concluy que las clulas intactas de levadura no eran necesarias para obtener el alcohol, sino que se podan preparar extractos por macerado de las levaduras para realizar la misma conversin enzimtica.

Acidos nucleicos

Los cidos nucleicos, ADN (cido desoxirribonucleico) y ARN (cido desoxirribonucleico) son polmeros especializados en almacenar, transmitir y expresar la informacin gentica en secuencias de aminocidos, las cuales luego de algunos procesos conforman las protenas de una clula.

COMPONENTES DE LOS ACIDOS NUCLEICOS

Representacin esquemtica de la cadena de la doble cadena de ADN.