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UNIVERSIDADE FEDERAL DA FRONTEIRA SUL CAMPUS DE ERECHIM CURSO DE AGRONOMIA BIOLOGIA E ECOLOGIA DO SOLO 2013/1 PROFESSORES: ALFREDO CASTAMANN

N , ILOIR GAIO, TARITA DEBONI E ULISSES PEREIRA DE MELO

Diversidade e Ecologia da Microbiota do Solo Prof. Iloir Gaio

- Definio: mikros + bios + logos

- Primeiros microrganismos
3,5 - 3,8 bilhes de anos

O que so microrganismos?
Organismos vivos ou agentes que na maioria dos casos

no so visualizados a olho nu.

Protozorios, Algas, Bactrias, Fungos e Vrus

Importncia dos microrganismos no processo evolutivo


Responsveis por alteraes nas condies atmosfricas na Terra e pelo surgimento de outras formas de vida mais complexas.
Principais marcos na histria da vida: 3,7 bilhes de anos: Origem da vida 3,5 bilhes de anos: Fssil do procarionte mais antigo 2,7 bilhes de anos: Acmulo de O2 produzido pelas cianobactrias

2,6 bilhes de anos: Primeiros organismos terrestres


1,5 bilhes de anos: Fssil eucarionte mais antigo

Estromatlitos do Lago Thetis, na Austrlia.

Importncia dos microrganismos

Responsveis pela manuteno da vida na Terra

Ciclagem dos elementos pela degradao da matria orgnica Benefcio/prejuzo a sade do homem, animais e outros seres vivos Participam das atividades produtivas da vida do homem

Importncia sob a perspectiva do homem


Microbiologia: 300 anos
1%

99%
B enfico s o u in cuo s P ato gnico s

Morfologia Bacteriana
Tamanho
A variao da maioria das bactrias de: 0,2 a 2,0 m de dimetro e 2 a 8 m de comprimento. Morfologia

Cocos

Bacilos

Espirilos

Morfologia Bacteriana
Classificadas de acordo com a morfologia Cocos normalmente podem ser: ovais, alongados ou achatados: Diplococos (unidos 2 a 2) Estreptococos ( ligados em forma de cadeia) Ttrades ( associados de 4 em 4 ) Sarcina (3 planos de diviso) . Estafilococos (cachos)

Morfologia Bacteriana

Bacilos a maioria dos bacilos se apresentam isolados e aos pares Diplobacilos Estreptobacilos

Morfologia Bacteriana

Vibrio Forma de virgula Espirilos - Apresentam uma ou mais curvaturas Espiroquetas - filamentos axiais, corpo flexvel.

Citologia bacteriana

Flagelos
So longos apndices filamentosos. Pode ser nico ou vrios. Funo - permitem a motilidade bacteriana. Partes do flagelo: Corpo basal Ala ou Gancho Filamento Protena flagelina Classificao: Monotrquios (A) Lofotrquios (B) Anfitrquios (C) Peritrquios (D)

Fmbrias e Pili
Fmbrias so pelos curtos e retos. Constitudo por protenas pilina. Tem a funo de fixao

Ex: Neisseria gonorrhoeae gonorra

Pili - geralmente so mais longos que as fmbrias. So os responsveis pela transferncia de DNA (Pili sexuais).

Parede Celular
uma estrutura complexa, semi-rgida, responsvel pela forma da clula. Constituio qumica: composta por macromolculas denominadas peptdeoglicana (N-acetilglicosamina e cido Nacetilmuramico unidos por polipeptdeos). Funes: Manuteno da forma bacteriana confere resistncia contra a presso osmtica

Parede Celular

Parede Celular das Bactrias Gram-Positivas


Parede celular - peptideoglicano c. teicico e lipoteicico

Membrana plasmtica Citosol

Parede Celular das Bactrias Gram-Positivas


cidos teicicos e cidos lipoteicicos
So polmeros de ribitol ou glicerol unidos por ligaes fosfodister. Propriedades: Regulam a entrada e a sada de ctions Regulam a atividade das autolisinas Atuam como receptores de fagos Atuam como fortes adesinas Atuam como antgenos de superfcie

Parede Celular das Bactrias Gram-Negativas


Lipopolissacardeo \ \ \ l o Membrana Externa

Peptideoglicano

Espao periplasmtico

Membrana plasmtica Citosol

Membrana externa

Membrana externa
Lipopolissacardeo (LPS) Frao lipdica: Onde lipdeo A (Endotoxina) Frao polissacardica: Antgeno O Funo Evaso da fagocitose e da ao do complemento Barreira antibiticos, enzimas digestivas e detergentes Lipoprotenas Funo: fixao da membrana externa ao peptideoglicano. Porinas So protenas trimricas que formam canais na ME

Funo: passagem passiva de solutos

Membrana Plasmtica
uma fina estrutura situada no interior da parede celular, revestindo o citosol celular. Composio: Fosfolipdeos e protenas Funes da membrana plasmtica: Permeabilidade seletiva Digesto de nutrientes (enzimas catalisadoras) Produo de ATP (cadeia de transporte de eltrons) Mesossomos: Septais (diviso celular) e Laterais (enzimas respiratrias e outros).

Membrana Plasmtica

Nucleide
a regio onde se concentra o cromossomo bacteriano, constitudo por uma molcula circular de DNA. No possui carioteca ou envoltrio nuclear. Alm do DNA presente no nucleide, a clula bacteriana pode ainda conter molculas adicionais de DNA, chamadas Plasmdios.

cromossomo

Plasmdios

Nutrio Bacteriana
Hetertrofas ou Heterotrficas Nutrem-se do alimento (compostos orgnicos) que obtm parasitando seres vivos. Auttrofas ou Autotrficas Algumas bactrias possuem uma protena, conhecida como bacterioclorofila, que capta a energia da luz para a sntese (fabricao) de glicose 6 CO2 + 12H2S + energia da luz C6H12O6 + 6 H2O + 12 S

Respirao Bacteriana
Respirao anaerbia ou fermentao Quando se cataboliza a glicose sem o auxlio do oxignio C6H12O6 2 C3H6O3 + energia

Respirao aerbia
Catabolismo da glicose feito com o auxlio de oxignio C6H12O6 + 6 O2 + 6 CO2 + 6H2O + energia Existem bactrias que so exclusivamente anaerbias ou aerbias e anaerbias facultativas.

Reproduo Bacteriana
Reproduo assexuada A forma de reproduo mais comum entre as bactrias a bipartio ou cissiparidade.

Reproduo Bacteriana
Reproduo sexuada Pode ocorrer com a transferncia ou a incorporao de material gentico, Trs tipos: Transformao Transduo Conjugao

Formao dos endosporos


Os esporos que se formam dentro da clula, chamados endosporos, so exclusivos de algumas bactrias.
Os esporos surgem quando a clula bacteriana no se encontra em um meio ideal para o seu desenvolvimento. Baixo contedo H2O, alto concentrao de Ca2+, presena de cido dipicolnico, vrias camadas de revestimento protico. Ex: Bacillus, Clostridium

Crescimento microbiano
Em microbiologia, o termo crescimento refere-se a um aumento do nmero de clulas e no ao aumento das dimenses celulares. A taxa de crescimento a variao no nmero de clula por unidade de tempo. O tempo de gerao o intervalo de tempo necessrio para que uma clula se duplique. N = No x 2n N= nmero final de clulas No= nmero inicial de clulas n= nmero de geraes.

G = T/n

G= Tempo de gerao T= Tempo de crescimento n= nmero de geraes.

Crescimento microbiano
Fase Inicial - Fase Lag Perodo de adaptao nutritiva ao meio H uma intensa atividade metablica No h diviso celular Perodo de Incubao - Doenas Infecciosas

Crescimento microbiano
Fase de Crescimento - Fase Log Taxa de crescimento populacional alta e constante Fase aguda das Infeces - Manifestao dos sintomas

Crescimento microbiano
Fase Estacionria N de clulas que morrem = N de clulas novas Carncia de fatores nutricionais Fase crnica de doenas infecciosas

Crescimento microbiano
Fase de Morte ou declnio Curva de morte populacional N de mortes maior que N de clulas novas Nutrientes tornam-se escassos - falta de O2 (hipxia, anxia) Acmulo de metablitos txicos - Radicais Livres

Fatores necessrios para o crescimento microbiano


O crescimento dos microrganismos depende de fatores fsicos e qumicos. Fsicos Temperatura Presso osmtica e concentrao de sal Qumicos Atividade de gua do meio Composio qumica Composio gasosa Fatores antimicrobianos Interao entre microrganismos

Introduo
Solo: maior reservatrio de microrganismos do planeta
direta ou indiretamente recebe todos os dejetos dos seres vivos

local de transformao da matria orgnica em substncias nutritivas

com grande abundncia e diversidade de microrganismos 1 hectare de solo pode conter at 4 tons de microrganismos

Szabolcs (1994)

Formao do Solo
- Solo = f (material de origem, clima, organismos, relevo e tempo)

CLIMA E ORGANISMOS

PROCESSOS

TEMPO (controlado pelo relevo)


Material de origem (rochas)

Definio: Em agricultura e geologia, solo a camada que recobre as rochas, sendo constitudo de propores e tipos variveis de minerais de hmus

Composio de um Solo Hipottico

25%
Poros

45% 25% 5%

Parte slida

Constituintes do Solo
Minerais:
Slica (SiO2), Fe, Al, Ca,Mg, K P, S, Mn, Na...

Matria orgnica: origem vegetal, animal e microbiana


insolvel (hmus): melhora a estrutura, libera nutrientes
efeito tampo, reteno de gua solvel: produtos da degradao de polmeros complexos:

Acares, fenis, aminocidos

Constituintes do Solo
gua
livre: poros do solo adsorvida: ligada aos colides (argilas)

Gases:
CO2, O2, N2 ... composio varivel em funo dos processos biolgicos

Constituintes do Solo
Sistemas biolgicos:
plantas animais Microrganismos: grande diversidade e abundncia

O Ambiente Solo

(Fonte: Microbiologia de Brock, Madigan et al.)

O Solo como Habitat

Moreira & Siqueira, 2006

MACROFAUNA

BACTRIAS

FUNGOS

NODULAO

MICORRIZAS

A BIOTA DO SOLO
PARTCULAS SOZINHAS NO FAZEM UM BOM SOLO... Em cada kg de solo frtil tem-se em torno de: 500 bilhes de bactrias 10 bilhes de actinobacterias 1 bilho de fungos 0,5 bilho de invertebrados microrcpicos 1000 km de hifas e vrios de razes Numerosos vertebrados macroscpicos No so estticos e sim muito dinmicos So bons aliados e uma grande riqueza natural So ignorados devido ao carter microscpico So mais conhecidos pelos efeitos deletrios

Os microrganismos garantem a qualidade do solo

Distribuio de microrganismos em vrios horizontes do perfil (Starc, 1942 apud Alexander, 1977)
Profundidade (cm) 3-8 20 - 25 35 - 45 65 - 75 135 - 145 Bactrias aerbicas 7800 1800 472 10 01 Organismos/g de solo x103 Bactrias Actinomicetos Fungos anaerbicas 1950 2080 119 379 245 50 98 49 14 01 05 06 0,4 03 Algas* 25 5 0,5 0,1 -

*Inclui cianobactrias

Classificao Ecolgica dos Microrganismos do Solo


- Autctones (indgenas) = populao de microrganismos pouco afetada pela adio de nutrientes ao solo, vivendo s custas dos resduos em estgios avanados de decomposio - Zimgenes (fermentativos) = populao de microrganismos estimulada pela adio de resduos ao solo, principalmente os resduos facilmente decomponveis

A microbiota do solo
Bactrias:
grupo mais numeroso e mais diversificado

3 x 106 a 5 x 108 por g de solo seco


limitaes impostas pelas discrepncias entre tcnicas heterotrficos so mais facilmente detectados

Gneros mais freqentes:


Bacillus, Clostridium, Arthrobacter, Pseudomonas, Nocardia, Streptomyces, Micromonospora, Rizbios Cianobactrias: pioneiras, fixao de N2

Streptomyces

Mais de 4 000 espcies bacterianas diferentes em 100 g

de solo
Torsvik et al. 1994 (Tcnicas de reassociao de DNA extrado do solo).

Menos de 1% das espcies microbianas conhecidas (no


cultivveis no crescem em meio de cultura, e.g. fungos micorrzicos arbusculares)

Solo
Heterogneo, dinmico e complexo - Grande parte dos recursos genticos desconhecida Funo destes microorganismos???

Presena de microrganismos nas vrias profundidades do solo


Profundidade (cm) Umidade (%) Mat. orgnica (%) Bactrias (x 106)/g aerbias 24 3,1 1,9 0,9 0,7 anaerbias 2,7 0,4 0,4 0,04 0,03 Fungos (m/g)

0-8 8- 20 20-40 40-60 60-80

18,2 10,0 11,5 13,5 7,9

4,4 1,5 0,5 0,6 0,4

280 43 0 0 0

80-100

5,3

0,4

0,15

0,01

Fonte: Lindegreen & Jensen, 1973

A microbiota do solo
Fungos:
5 x 103 - 9 x 105 por g de solo seco
limitados superfcie do solo favorecidos em solos cidos

ativos decompositores de tecidos vegetais


melhoram a estrutura fsica do solo Gneros mais freqentes:

Penicillium, Mucor, Rhizopus, Fusarium, Aspergillus, Trichoderma

A microbiota do solo
Algas
103 - 5 x 105 por g de solo seco
abundantes na superfcie acumulao de matria orgnica: solos nus, erodidos

Protozorios e vrus
- equilbrio das populaes - predadores de bactrias - parasitas de bactrias, fungos, plantas, ...

Processos Biolgicos do Solo: Suas Inter-relaes e Funes no Ecossistema

Siqueira & Trannin, 2003

-(Constanza

Funes dos Microrganismos


et al. Nature,1997:Valor dos servios

dos

ecossistemas terrestres e capital natural: U$34 trilhes, Ciclagem de nutrientes global anual U$17 trilhes - Decomposio da matria orgnica e produo de hmus - Controle biolgico de patgenos - Alterao agregao) - Produo de metablitos diversos: antibiticos, cidos orgnicos, hormnios, alelopticos - Decomposio de xenobiticos das caractersticas fsicas do solo (e.g.

- Nutrio vegetal. Fixao biolgica de N2

Soja no Brasil: Economia de US$ 3.0 bilhes anual

REDUNDNCIA FUNCIONAL:
Vrias espcies de microrganismos realizam o mesmo processo, i.e., tm a mesma funo. Garante RESILINCIA (recuperao) dos processos no solo- Cada espcie microbiana realiza vrias funes. E. g.

Azospirillum brasilense , Bradyrhizobium japonicum


fixadores de N2 e desnitrificadores. Outros fixadores de N2 participam dos Ciclos do C, P, S, etc.

Viso Esquemtica do Solo como uma Mquina Decompositora


Disponibilizao de Nutrientes
- Mineralizao

- Imobilizao
- Oxi-reduo S0 + H2O + 1,5O2 H2SO4 2H+ + SO42MnO2 + 4H+ Mn2+ + 2H2O - Solubilizao Ca5OH(PO4)3 + H+ 5Ca2+ + H2O + 3PO43-

AlPO4 + 2H+ Al3+ + H2PO4FePO4 + 2H+ Fe2+ + H2PO4- Fixao Biolgica de Nitrognio - Micorrizas

Contribuio dos Microrganismos para a Formao ou Estabilizao de Agregados do Solo

Modificado de Rillig & Mummey (2006) Miller & Jastrow (1992)

Microrganismos e Agregao do solo.


Fungos filamentosos

Polissacardeos e hifas de fungos como agentes agregantes de partculas do solo (Robert & Chenu, 1992)

Derxia gumosa isolada de razes de Oryza perenne em solo de

vrzea da regio Amaznica. 1- Clulas em microscpio com contraste de fase, notar goma em volta das clulas. 2 Aspecto da colnia em placas.
Cortesia F.M.S. Moreira

RIZOSFERA
Hiltner (1904) zona de influncia das razes- 0,01 a 3 mm da superfcie

Rizosfera: O Paraso dos Microrganismos do Solo (Antagonistas e Patgenos)

Rizosfera

A Grande Maioria Benfica


O Efeito Rizosfrico

Compostos Excretados pelas Plantas na Rizosfera (Rizodeposio)

Modificado de Alexander, 1977; Curl & Truelove, 1986

(R)

(S)

Actinobactrias

Actinobactrias

A Reduo da Diversidade Facilita o Desequilbrio Biolgico nos Agrossistemas


Efeito do tempo de monocultivo no favorecimento de fungos fitopatognicos para as culturas do trigo e ma
Fungos Patgenos
(% total)

Actinobacterias

Fungos Patgenos

Microrganismos Antagonistas

Fitopatgenos = Espcies fngicas dos gneros Penicillium, Aspergillus, Fusarium, Mucor, Rhizopus, Stachybotris, Alternaria, etc

(Vancura & Kunc, 1988, 1989)

Processos Biolgicos do Solo: Suas Inter-relaes e Funes no Ecossistema

Siqueira & Trannin, 2003