Herencia cuantitativa

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 16: Gentica cuantitativa

Tema 16: Herencia cuantitativa

Puntos principales a tratar:
Qu es la variacin fenotpica cuantitativa? Naturaleza de la variacin continua Poligenes y loci de caracteres cuantitativos Mtodos estadsticos para la descripcin de la variacin continua Heredabilidad y familiaridad Componentes gentico y ambiental de la varianza fenotpica de una carcter cuantitativo Heredabilidad en sentido amplio y restringido Mtodos para el recuento y cartografa de loci que actan sobre caracteres cuantitativos Herencia cuantitativa en el hombre: la frontera de la gentica en el siglo XXI
2
Tema 16: Gentica cuantitativa 2

Dr. Antonio Barbadilla

Variacin fenotpica cuantitativa

Dr. Antonio Barbadilla

Tema 16: Gentica cuantitativa

Qu es la variacin fenotpica cuantitativa?

Cualquier carcter fenotpico (morfolgico, fisiolgico, conductual) que toma distintos valores cuantificables en diferentes individuos y no sigue una patrn de herencia mendeliana simple es un carcter cuantitativo variacin continua (altura, peso, temperamento, C.I., tasa metablica, produccin lechera,...) variacin discreta (nmero de quetas o facetas en Drosophila, vrtebras en serpientes, bandas en caracoles, plumas en aves, escamas en peces...) Para describir su variacin se utilizan mtodos estadsticos tales com la media y la varianza Son caracteres de gran importancia Agrcola y ganadera Mdica y social El estudio de la herencia de estos caracteres son el objeto de la Gentica Cuantitativa Tema 16: Gentica cuantitativa 4
Dr. Antonio Barbadilla

Variacin cuantitativa vs mendeliana (o cualitativa)

Dr. Antonio Barbadilla

Distribucin de la altura de varones adultos de Boston

5

Caracteres cualitativos mendelianos

Tema 16: Gentica cuantitativa 5

Variacin cuantitativa: continua o discreta

Dr. Antonio Barbadilla

Carcter cuantitativo continuo

6

Caracteres cuantitativos discreto

Tema 16: Gentica cuantitativa 6

Variacin cuantitativa en el maz

(Emerson and East, 1913)

Dr. Antonio Barbadilla

Peter J. Russell, iGenetics: Copyright Pearson Education, Inc., publishing as Benjamin Cummings.

Tema 16: Gentica cuantitativa

Variacin mendeliana vs cuantitativa

Planta guisante
Enanas X altas

Frecuencia

Cortas X largas

Maz

Altura planta

Longitud de la mazorca F1 X F1

Frecuencia

F1

F1 X F1 = Altas X altas

Frecuencia

Altura planta Altas 3/4 Enanas 1/4

Longitud de la mazorca Gama completa

F2

Dr. Antonio Barbadilla

Altura planta

Tema 16: Gentica cuantitativa

Longitud de la mazorca8

Preguntas qu trata de responder la gentica cuantitativa

Qu parte de la variacin fenotpica de un carcter cuantitativo se debe a diferencias gentica entre los individuos y qu parte a diferencias en el ambiente? Qu parte de la variacin fenotpica puede ser seleccionada por un mejorador o por la seleccin natural? Cuntos genes o loci influyen sobre el carcter? Cmo se distribuyen los loci por el genoma? Qu efecto tienen los loci y como interactan entre s?
Dr. Antonio Barbadilla

Tema 16: Gentica cuantitativa

Variacin ambiental
aa Plantas enanas Sin variacin ambiental Frecuencia AA Plantas altas Mucha variacin ambiental

Alguna variacin ambiental

aa

AA

aa

AA

aa

AA

Altura planta

Altura planta

Altura planta

Dr. Antonio Barbadilla

10

Tema 16: Gentica cuantitativa

10

La disputa histrica entre Biomtricos vs mendelianos

Darwin (1859) y Mendel (1865 -> 1900)

Se crey por mucho tiempo que los caracteres cuantitativos y los mendelianos obedecen a leyes distintas. Naturaleza variacin importante para la evolucin: Biomtricos (caracteres cuantitativos) y mendelianos (caracteres cualitativos).

1918: Sir Ronald Fisher integra el mendelismo con la biometra. Demuestra que la variacin cuantitativa es una consecuencia natural de la herencia mendeliana. Tema 16: Gentica cuantitativa 11
Dr. Antonio Barbadilla

11

Experimento Nilsson-Ehle (1909) cruz dos variedades de trigo puras que diferan en el color de los granos de trigo, rojo y blanco. La F1 era intermedia en color y al cruzarla entre s obtuvo al menos 7 clases de color en la F2. Cmo explicarlo?
Supongamos control del carcter por un gen con dos alelos sin dominancia
Dr. Antonio Barbadilla

P F1 F2

Rojo AA

Blanco aa

Color intermedio Aa Rojo : Intermedio : Blanco AA Aa aa

1: 2: 1
Tema 16: Gentica cuantitativa 12

12

Supongamos control del carcter por dos genes idnticos con dos alelos cada uno, sin dominancia, y donde la intensidad del color rojo depende del nmero de alelos maysculas (que son los que producen el pigmento rojo)

Rojo X AABB

Blanco aabb

F1

Color intermedio (Rojo medio) AaBb AABB AaBB AABb AaBb AAbb aaBB Aabb aabb aaBb

F2 Rojo oscuro: Rojo medio oscuro : Rojo medio : Rojo claro : Blanco

Dr. Antonio Barbadilla

4 :

13

Tema 16: Gentica cuantitativa

13

Mismo supuesto anterior pero con tres genes P F1

Rojo X AABBCC AaBbCc Blanco aabbcc AaBbCc

Color intermedio X Color intermedio (autofecundacin)

F2
Fenotipo Rojo -------------> Blanco Nmero alelos que dan color 6 : 5 : 4 : 3 : 2 : 1 : 0 Proporcin 1 : 6 : 15 : 20 : 15 : 6 : 1
Supuestos: los genes segregan Dr. Antonio Barbadilla independientemente y sus efectos son aditivos 14

Tema 16: Gentica cuantitativa

14

Un par de genes (A1 A2 X A1 A2 ) Dos pares de genes (A1 A2 B1 B2 X A1 A2 B1 B2 )

Tres clases fenotpicas

Cinco clases fenotpicas

Tres pares de genes Cinco pares de genes Diez pares de genes Con variacin ambiental Dr. Antonio Barbadilla o caso lmite
15

Siete clases fenotpicas

Once clases fenotpicas

21 clases fenotpicas: desde el genotipo con ningn alelo + hasta el genotipo con los 20 alelos +

Rojo

Color

Blanco
Tema 16: Gentica cuantitativa 15

Ejemplos:

Modelo de poligenes o loci cuantitativos: el valor que toma un carcter cuantitativo en un genotipo depende del nmero de genes de efecto pequeo (poligenes) que aaden valores + al carcter. As, en un carcter determinado por 5 loci cuantitativos (poligenes) los genotipos irn de 10 alelos ms a 10 alelos 0 +++++ 00000 +++++ 00000 00000 +++++

Dos genes con dos alelos cada uno (A a y B b) y con accin aditiva de modo que A o B aade 2 unidades en promedio al valor del carcter. Hay cinco clases fenotpicas en proporciones 1:4:6:4:1 Si el genotipo aabb tiene una valor fenotpico de 10 unidades, entonces, el genotipo AaBb = 14 unidades fenotpicas y el genotipo Dr. Antonio Barbadilla AABB = 18.
16
Tema 16: Gentica cuantitativa 16

Generalizacin del modelo aditivo

1 locus
Gametos distintos producidos 2 por el multihbrido en la F1 (A,a)

2 loci

3 loci

n loci

Nmero de genotipos distintos en la F2 3 9 27 3n (AA,Aa,aa) (AABB, AABb, (AABBCC,... Aabb,AaBb,... ...,aabb) ...,aabbcc) Nmero de fenotipos distintos en la F2 3 5 7 2n+1
Proporcin de la F2 con un fenotipo extremo como el de una de 1/4 las lneas parentales Proporcin Dr. Antonio Barbadilla fenotpica de la F2
17

4 8 2n (AB, Ab, aB, ab) (ABC,Abc,... ...,abc)

(AA aa) (AABB aabb) (AABBCC aabbcc)

1/16

1/64

1/4n

1:2:1

1:4:6:4:1

1:6:15:20:15:6:1 (A+a)2n
17

Tema 16: Gentica cuantitativa

Demostracin Galtons apparatus (Galtons Quincunx) intuitiva del Teorema Central del Lmite
Cuando una bola topa con un palito tiene una probabilidad de ir hacia la derecha o hacia la izquierda (sera anlogo a la segregacin de uno u otro alelo en un gen heterocigoto. As cada palito que se encuentra la bola al caer es un gen cuantitativo que segrega con igual probabilidad hacia un Dr. Antonio Barbadilla alelo (+) (-)).
18
Tema 16: Gentica cuantitativa

Ver animacin aqu

18

La distribucin aproximadamente normal de muchos caracteres cuantitativos puede fundamentarse en el teorema central del lmite, que dice que la distribucin de la suma aleatoria de muchos pequeos efectos se aproxima asintticamente a una distribucin normal, a singularly beautiful law (F. Galton).

Dr. Antonio Barbadilla

19

Tema 16: Gentica cuantitativa

19

Slo existe la estadstica! El hombre racional es el hombre estadstico. Ser un nio guapo o feo? Sentir amor por la msica? Sobre todo esto decide un juego de dados. La estadstica est presente en el momento de nuestra concepcin, es ella quien sortea los conglomerados de genes que crean nuestros cuerpos, ella rifa nuestra muerte. De un encuentro con la mujer que amar, de mi longevidad, de todo decide la distribucin estadstica normal... La Historia, a su vez, es el cumplimiento de unos movimientos brownianos, una danza estadstica de fragmentos que no dejan de soar en un mundo temporal diferente. Stanislav Lem
Dr. Antonio Barbadilla

20

Tema 16: Gentica cuantitativa

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P F1 F2

AABBCC

aabbcc

AaBbCc

Frecuencia en %

20 15 15

6
1

6
1
Tema 16: Gentica cuantitativa 21

Dr. Antonio Barbadilla

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Dr. Antonio Barbadilla

Distribucin de la altura de varones adultos de Boston

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Tema 16: Gentica cuantitativa 22

Dos parmetros determinan la forma de la distribucin: la media,

La distribucin normal
1 x 2 ( ) 2

1 f ( x) e la desviacin tpica (raz cuadrada de 2

la varianza

2 = [(x-)2]/n)

Funcin de densidad

A y B difieren en sus medias (4 y 8) B y C difieren en sus desviaciones tpicas (1 y 0,5)

http://www.evotutor.or g/Statistics/St1A.html
Dr. Antonio Barbadilla

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Tema 16: Gentica cuantitativa

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Muestreo de una distribucin normal

Dr. Antonio Barbadilla

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Tema 16: Gentica cuantitativa

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Relacin entre dos variables cuantitativas: correlacin

Longitud de cola y el cuerpo de 18 individuos de la serpiente

Lampropeltis polyzona

Longitud del 1er y 2o molar inferior de un mamfero extinto

Nmero de escalas caudales y longitud de la cola en las mismas 18 serpientes de arriba

rx , y Correl ( x, y ) Cov( x, y ) var(x) var( y )

( x x )( y y ) n

Dr. Antonio Barbadilla

http://www.evot utor.org/Statisti cs/St2A.html

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Tema 16: Gentica cuantitativa

Relacin entre dos variables cuantitativas: regresin

y bx a

Regresin entre la longitud alar de individuos de Drosophila y la media de la misma longitud en sus padres. Los valores se han normalizado como desviaciones de los valores medios
Dr. Antonio Barbadilla

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Tema 16: Gentica cuantitativa

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Heredabilidad de un carcter
Distribucin fenotpica de la poblacin en su conjunto

aa Aa AA

Maa

MAa

MAA Valor fenotpico

Si distintos genotipos de una poblacin presentan distintas distribuciones para un carcter, decimos que el carcter es heredable
Dr. Antonio Barbadilla

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Tema 16: Gentica cuantitativa

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Experimentos de seleccin artificial para la determinacin de la heredabilidad de un carcter cuantitativo

Generacin parental Cruce entre individuos con valores fenotpicos extremos (mismo ambiente)
Media

Heredable

No heredable
Tema 16: Gentica cuantitativa 28

Dr. Antonio Barbadilla

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Componente gentico y ambiental de la heredabilidad de un carcter

El valor fenotpico de un carcter en un individuo de la poblacin depende de su genotipo y de su ambiente z: valor fenotpico de un indivudo g: efecto medio del genotipo e: efecto del ambiente z=g+e Varianza fenotpica en la poblacin: Var (z) = Var (g + e) = Var (g) + Var (e) + 2 Cov (g,e) Si 2 Cov (g,e) = 0, entonces Var (z) = Var (g) + Var (e)
Dr. Antonio Barbadilla

aa Aa AA

Maa MAA MAa

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2z = 2g + 2e

Tema 16: Gentica cuantitativa

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Definiciones de heredabilidad para un carcter cuantitativo

Heredabilidad en sentido amplio

H2 = Var (g) / Var (z) = 2g / 2z

0 H2 1
Heredabilidad en sentido restringido
x: efecto medio del genotipo a: efecto aditivo de los alelos que forman el genotipo d: efecto no aditivo (o dominante) de los alelos que forman el genotipo

g=a+d h2 = Var (a) / Var (z) = 2a / 2z

Dr. Antonio Barbadilla

0 h2 1 h 2 H2
30

30

Tema 16: Gentica cuantitativa

Mtodos de estimacin (medida) de la heredabilidad en poblaciones experimentales

Respuesta a la seleccin artifical

Experimento de seleccin para aumentar o disminuir la longitud del ala en diversas poblaciones de Drosophia subobscura. (Datos de Prevosti 1967)

Dr. Antonio Barbadilla

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Tema 16: Gentica cuantitativa

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Respuesta a la seleccin artifical

h2r = heredabilidad realizada y = Media fenotpica en la poblacin parental y0 = Media fenotpica en la descendencia yp = Media fenotpica de los individuos seleccionados

h2r =

Y0 - Y Yp - Y

Respuesta
Dr. Antonio Barbadilla

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Tema 16: Gentica cuantitativa

Diferencial de seleccin

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Mtodos de estimacin (medida) de la heredabilidad en poblaciones experimentales (2)

Eliminacin de uno de los dos componenentes de la varianza fenotpica Gentico: se usan genotipos idnticos Ejemplo longitud trax en Drosophila melanogaster (Datos de Robertson 1957). Poblacin Varianza Apareamiento al azar (F2) Genotipos uniformes (F1) Terica Var(z)=Var(g) + Var(e) Observada 0,366 Var(e) 0,186

Var(g) = Var(z) - Var(e) = 0,366 - 0,186 = 0,180 Ambiental: Crecimiento bajo las mismas condiciones ambientales Se obtiene Var(g) directamente
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Tema 16: Gentica cuantitativa 33

Dr. Antonio Barbadilla

Mtodos de estimacin (medida) de la heredabilidad en poblaciones experimentales (3)

Estima de componentes genticos por correlacin o regresin fenotpica entre parientes

Correlacin fenotpica observada

HN =

Correlacin gentica esperada

Ejemplo: Se estudia la correlacin de los valores que toma el carcter nmero de crestas de las huellas digitales en gemelos dicigticos. rfenotpica observada en gemelos dicigticos = 0,48 rgentica esperada en gemelos dicigticos = 0,50 HN = 0,48 / 0,50 = 0,96. La heredabilidad es muy alta, del 96%
Dr. Antonio Barbadilla

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Tema 16: Gentica cuantitativa

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Mtodos para el recuento y cartografa de loci cuantitativos (QTLs) Cruce de lneas seleccionadas
artificialmente Ejemplo: resistencia al DDT en Drosophila melanogaster. Se demuestra que hay genes que contribuyen a la resistencia en todos los cromosomas

Estudios de asociacin genotipofenotipo (nueva frontera gentica) Lneas divergentes para distintos marcadores moleculares. Si hay muchos marcadores polimrficos (como secuencias microsatlites o SNPs), se incrementa la probabilidad de detectar QTLs ligados. Estudios asociacin a lo largo del genoma (Genome Dr. Antonio Barbadilla Wide Association Studies)
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Tema 16: Gentica cuantitativa 35

Heredabilidad en humanos
Distribucin de la F2 de cruzamientos que se dan de forma natural Ejemplo, color de la piel

Estudio de gemelos Limitaciones: Muestras pequeas Aleatoriedad ambiente (ambiente intrauterino comn,...) Estudio de adopciones
Dr. Antonio Barbadilla

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Tema 16: Gentica cuantitativa

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Concordancia de caracteres en estudios de gemelos

Color del pelo Color de los ojos Presin sangunea Lateralidad (diestro o zurdo) Sarampin Pie zambo Tuberculosis Cncer de mama Esquizofrenia Sndrome de Down Espina bfida Psicosis maniacodepresiva
80

Gemelos idnticos (monocigticos) 89 99,6 63 79 95 23 53 6 80 89 72 80

Gemelos fraternos (dicigticos) 22 28 36 77 7 2 22 3 13 7 33 20

Dr. Antonio Barbadilla

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Tema 16: Gentica cuantitativa

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Estimas de heredabilidad (H2) en algunos caracteres y transtornos humanos

Carcter

Heredabilidad
0,85 0,35 0,70 0,80 0,76 0,35 0,37 0,45 1,00
Tema 16: Gentica cuantitativa

Esquizofrenia Diabetes mellitus Aparicin temprana Aparicin tarda Asma Labio leporino Cardiopata (congnita) lcera pptica Depresin
Dr. Antonio Barbadilla

Estatura

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Links de inters

Introduction to Quantitative Genetics Recursos de Gentica cuantitiva - Quantitative Genetics Resources EvoTutor: Learning through interactive simulation (on line y off line) Sitio excelente para aprender los procesos gentico poblacionales mediante simulacin Program in Statistical Genetics Quincunx (simulacin) El teorema central del lmite en accin Genome Wide Association (GWA) Studies

Dr. Antonio Barbadilla

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Tema 16: Gentica cuantitativa

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