Regulacin de la Expresin gentica

Curso: Biologa Celular y Molecular Oscar Nolasco Crdenas MSc.

oscarnol@hotmail.com
Noviembre - 2013

Una clula puede cambiar la expresin de sus genes en respuesta a un estimulo externo En un organismo multicelular, las clulas se diferencian por el tipo de protenas que sintetizan a pesar de contener el mismo DNA La expresin de los genes puede ser regulada en muchos pasos en la va : DNA a RNA a Protenas

Regulacin de la cantidad de protenas

Transcripcin del gen

Procesamiento del RNA

Recambio de RNA Traduccin de mRNA Procesamiento, emsamble y recambio de la protena

Regulacin de la actividad proteica

Alosterismo Modificacin covalente

El inicio de la transcripcin es el punto principal de regulacin que es modulado por: REPRESORES ACTIVADORES

El activador puede ejercer una activacin alosterica de la RNA polimerasa Protenas que curvan el DNA pueden facilitar la interaccin entre distantes protenas reguladoras que se unen al DNA

 Durante los pasos de regulacin de la transcripcin los patrones de enlaces de hidrogeno y grupos aceptores son las caractersticas mas importante en el reconocimiento de genes por las protenas regulatorias adems de la secuencia de nucletidos y la geometra de la doble hlice.

Las protenas regulatorias, contienen un motivo estructural que puede leer las secuencias de DNA: El motivo hlice torsin hlice es uno de los motivos mas comunes que se encuentran en protenas que se unen al DNA como son las protenas homeoticas de Drosophila, represor lambda, represor triptfano y CAP

El motivo Dedos

de Zinc es un motivo que utiliza una o mas molculas de Zinc El motivo Cierre de leucina Motivos de hoja B tambin pueden reconocer DNA

Regulacin de la expresin gentica: Transcripcin del gen

Regulacin negativa La unin de un represor inhibe la transcripcin Regulacin positiva La unin de un activador facilita la transcripcin

Regulacin de la expresin en procariotes: OPERONES

Un opern es un grupo (cluster) de genes funcionalmente relacionados que se encuentran coordinadamente regulados

Contiene: Genes Estructurales: codifican a enzimas Genes Regulatorios: codifican represores o activadores de la expresin Sitios de regulacin: Promotores, operadores

CONTROL NEGATIVO

OPERON lac de E. coli

 Un nivel de 10 tetrameros de represor por celula asegura el enlace operador represor en un 96%. La induccion reduce la afinidad del operador al represor. Solo el 3% de operadores se unen.

15

Control positivo: Protena activadora de catabolitos o protena receptora de cAMP

Glucosa es el principal suministro de carbono para E coli La glucosa causa represin de otros operones que catalizan el metabolismo para otras fuentes de carbono como operon lac

En la ausencia de glucosa, los operones necesarios para el metabolismo de otras fuentes de carbono es inducida.
Es mediada por cAMP y CAP En presencia de glucosa, [cAMP] es cerca de 10-7 M En ausencia de glucosa, [cAMP] se incrementa cerca de 10-4 M

Protena activador del catabolito CAP Es un dimero Se une a cAMP

cAMP-CAP se unen al DNA adyacente al promotor y estimulan la transcripcin

Regulacin del operon trp de E. coli

Organizacin del operon trp de E coli

El operon trp es regulado en parte por un apo-represor

El operon trp es tambin regulado por atenuacin

El operon trp es tambin regulado por atenuacin

Como funciona la atenuacin de la transcripcin La [trp] determina la [trp-trNA] La [trp] determina la traduccin ribosomal adicionando triptofano al peptido Leader o peptido seal Si el trp es adicionado : El ribosoma se desplaza hasta el codon stop

El atenuador es una estructura secundaria que causa la terminacin de la transcripcin (OFF)

Si el trp no es adicionado Se forma una diferente estructura en el RNA leader

Permitiendo la transcripcin de los genes estructurales

Requerimientos para la atenuacin del operon trp

Transcripcin y traduccin simultanea
Un segmento de RNA puede servir como un terminador debido a la estructura secundaria que forman sus bases apareadas

Una estructura secundaria alternativa en el RNA no permite la transcripcin

No se requiere de una protena adicional como por ejemplo un represor

Estructuras alternativas en el RNA lider

La actividad del ribosoma determina la estructura secundaria del RNA lider de trp
Alta concentracin triptfano, provoca terminacin de transcripcin de la la

Baja concentracin de triptfano, mantiene la transcripcin

Muchos operones de biosintesis son regulados por atenuacin

Operones de sintesis de aminoacidos: His, phe, leu, thr
En cada caso un corto RNA leader y un polipeptido preceden a los genes estructurales. El peptido leader es rico en el aminocido producto de la via de sintesis

Alternativos factores sigmas pueden dirigir la expresin de set de promotores

Estados de los genes de eucariotes

Inactivo: Cromatina inaccesible o condensada heterocromatina

Cromatina accesible, pero con presencia de protenas represoras o falta de activadores de la iniciacin
Cromatina accesible, la transcripcin se ha iniciado pero la polimerasa no puede elongar el transcripto Activo: Cromatina accesible eucromatina, transcripcin basal, requiere secuencia promotor TATA Cromatina accesible, transcripcin activada, requiere enhancer o activador hebra arriba (posicin anterior a la posicin de inicio de la transcripcin: upstream de transcripcin)

Regulacin en genes eucariotes

I. Nucleosomas y sus modificadores II. Mas reguladores y regiones reguladoras mas extensas: Exacerbadores (Enhancers) Elementos aislantes o limtantes (Insulator)

Enhancers
Causan el incremento de la expresin del gen Actuan independiente de la posicin y la orientacin con respecto al gen Pueden actuar: Incrementando el porcentaje de iniciacin en el promotor

Los enhancer se presentan en una variedad de posiciones respecto a los genes

 Los activadores son reclutados por los modificadores de nucleosomas que ayudan a la maquinaria transcripcional unirse al promotor o iniciar la transcripcin

 Los activadores reclutan la maquinaria transcripcional al gen Factores necesarios para la elongacion

 Represin transcripcional:
HDAC Silenciadores

 Seales de transduccion y el control de la regulacin transcripcional

Silenciadores
Secuencias que causan la disminucin de la expresin del gen Similar al enhancer pero con efecto opuesto sobre la expresin del gen Represin del gen estructura de cromatina inactiva (heterocromatina)

Mecanismo de silenciamiento

La heterocromatina es nucleada en una secuencia especifica y la estructura de inactivacin se propaga a lo largo de la fibra de DNA Los genes en esa regin son inactivados Algunos promotores activos pueden inhibir la expansin. Algunos aislantes (insulator) dominios independientes de transcripcin pueden proteger una regin de transcripcin activa La inactivacin de genes en esa vecindad causa el efecto de posicin abigarrado Position effect variegation PEV en el cual clulas genticas idnticas tienen diferente fenotipo. En Drosophila regiones del ojo carecen de color debido a que el gen white (requerido para el pigmneto rojo) fue inactivado por estar adyacente a la heterocromatina en algunas clulas, mientras en otras clulas permanece activo.

43

El efecto del silenciamiento telomerico en levaduras es anlogo, los genes translocados a una posicin telomerica muestras una variable perdida de su actividad . En este caso la unin de Rap 1 (represor activator protein1) inicia el evento de nucleacin que resulta en el reclutamiento de protenas de heterocromatina. Adicional a los telomeros , otros dos sitios son nucleados en levadura, HML y HMR son copias de MAT (locus de Yeast mating type) donde se observa una nucleacin de heterocromnatina va protenas.

 La metilacin en el DNA esta asociada al silenciamiento en genes de clulas animales fenmeno llamado imprinting

Un gen de eucariote
Sitio de inicio 5 UTR de transcripcin Regin no traducida Intrones

3 UTR Regin no traducida

5
Promotor/ Regin de Control

Exon 1 Int. 1

Exon 2 Int. 2 Exon 3

3
Secuencia Terminador

Exones
RNA Transcripto
Exon 1 Int. 1 Exon 2 Int. 2 Exon 3