Habitat terrestre: rocas y suelo- y los sedimentos

Litosfera
Rocas
Rocas igneas: por solidificacin del magma
Rocas sedimentarias por deposicin y consolidacin de los materiales
desgastados de otras rocas
Rocas metamrficas por metamorfosis de otras rocas
Las superficies rocosas pueden ser un habitat adecuado para ciertos
microorganismos.
La actividad de bacterias y hongos pueden solubilizar silicatos y otros
minerales por la produccin de cidos orgnicos y agentes quelantes.
El suelo es el material suelto no consolidado que resulta
inicialmente de la alteracin meteorolgica o de la disgregacin
fsica de las rocas y que, bajo la influencia de los seres vivos
evoluciona hasta formar un sistema complejo de estructura
estratificada y composicin especfica.

En agronoma: mezcla compleja de minerales, gases, lquidos,
materia orgnica y organismos vivos que sustentan el crecimiento
vegetal.
QU ES EL SUELO?
Material original
Clima
Topografia
Actividad biolgica
Tiempo
Como se forma el suelo?
A partir de las rocas
y a travs de
complejos procesos
fsicos, qumicos y
biolgicos.
Reduccin de la roca a
regolito (fragmentos de roca)
Algas, lquenes fottrofos productores de
materia orgnica soportan el crecimiento de
bacterias y hongos quimiohetertrofos.

Quimioheterotrofos excretan cidos orgnicos
que contribuyen a la disolucin de los minerales.

Desarrollo de pequeas plantas
Comunidad microbiana muy diversa
+
Desarrollo de plantas
Nmero y tipo de
microorganismos
Fertilidad
Solubilizacin de los minerales que
lixivian con el agua hacia la profundidad

Desarrollo de plantas superiores y
establecimiento de animales
Profundizacin de las
capas superiores,
mezclado, aireacin.
Horizonte O: capa de materia organica de restos veg y animales muertos.
Humus.
Horizonte A: eluvial, capa mineral cerca de la superficie. De alta lixiviacion de
arcillas de silicato oxidos de Fe y de Al.
Horizonte B: Iluvial, ocurre la deposicion y la maxima acumulacion de
materiales que lixivian del A.
Horizonte C: escasa actividad biolgica, acumulacion de calcio y de carbonato
calcico.Por debajo se encuentra el regolito y el lecho de rocas.
Edafognesis
Composicin volumtrica
Slidos Inorgnicos
Slidos Orgnicos
Agua
Gas
Microorganismos

Fraccin slida

38-45%
5-15%
15-35%
15-35%
0,05%

Arena, Limo, Arcilla,
Humus
Describe la superficie disponible como habitat para el desarrollo
microbiano.
Componente Dimetro
(mm)
Nro de
partcula / g
rea (cm2/ g)
Arena 2,00 0,05 90 11
Limo 0,05 - 0,002 5,78x10
6
454
Arcilla 0,002 9,03x10
10
8.000.000
Los suelos contienen variadas
proporciones de partculas de
arcilla, silicatos y arena.
Textura del
suelo
Clases
Texturales
Descripcin

Arenosos

Son los materiales que contienen 85 % o ms de arena; el
porcentaje de limo, ms 1 veces el porcentaje de arcilla, no
deber exceder de 15.

Areno-
francos

Son los materiales que contienen en su lmite superior de 85 a 90
% de arena, y el porcentaje de limo ms 1 veces el porcentaje
de arcilla, no ser menor de 15; en su lmite inferior contienen no
menos de 70 a 85 % de arena y el porcentaje de limo ms dos
veces el porcentaje de arcilla, no exceder de 30.

Franco-
arenosos

Son los materiales que contienen ya sea: 20 % o menos de
arcilla, y cuyo porcentaje del limo ms dos veces el porcentaje de
arcilla, excede de 30, y 52 % o ms de arena; o bien, menos del
7 % de arcilla, menos del 50 % de limo, y entre 43 y 52 % de
arena.

Francos

Son los materiales que contienen del 7 al 27 % de arcilla, del 28
al 50 % de limo, y menos del 52 %de arenas.

Franco-
limosos

Son los materiales que contienen 50 % o ms de limo y del 12 al
27 % de arcilla, o del 50 % al 80 % de limo y menos del 12 % de
arcilla.

Limosos

Son los materiales que contienen 80 % o ms de limo y menos
del 12 % de arcilla.

Franco-
arcillo-
arenosos

Son los materiales que contienen del 20 al 35 % de arcilla, menos
del 28 % de limo y 45 % o ms de arenas.

Franco-
arcillosos

Son los materiales que contienen del 27 al 40 % de arcilla y del
20 al 45 % de arenas.

Franco-
arcillo-
limosos

Son los materiales que contienen del 27 al 40 % de arcilla y
menos del 20 % de arenas.

Arcillo-
arenosos

Son los materiales que contienen 35 % o ms de arcilla y 45 % o
ms de arenas.

Arcillo-
limosos

Son los materiales que contienen 40 % o ms de arcilla y 40 % o
ms de limo.

Arcillosos

Son los materiales que contienen 40 % o ms de arcilla, menos
del 45 % de arenas, y menos del 40 % de limo.

Tringulo de textura
Interfaces slido-lquido, slido- gas
MICROAMBIENTES
Agregado de suelo: unidad estructural del suelo

2) las sustancias hmicas
propiamente dichas.

Porcin de materia orgnica del
suelo que ha estado sometida a
una intensa transformacin

Constituye la porcin principal de
la parte orgnica del suelo, 85-95
% de la reserva es humus.


1) La materia orgnica de
naturaleza individual

Restos orgnicos de animales y
vegetales.
Productos de su descomposicin o
los productos de la actividad vital
de la poblacin viva (protenas y
aminocidos, hidratos de carbono
simples y compuestos, cidos
orgnicos de distinta naturaleza,
ceras, resinas, ligninas y otros).

Constituyen aproximadamente el
10-15% de la reserva total de
materia orgnica.
NATURALEZA DE LA MATERIA ORGNICA DEL SUELO
Cosntituyente de las paredes celulares de las plantas, junto
con la celulosa y hemicelulosa.

De difcil biodegradacin y reducida biodisponibilidad.

LIGNINA: Polmero complejo de unidades de fenil propano, con alto
grado de entrecruzamientos.
HUMUS
Polmero de composicin no especifica, estructura tridimensional
Absorbe agua, iones y molculas orgnicas de manera intercambiable
Une covalentemente otras sustancias a travs de sus grupos funcionales

Fase I: degradacin microbiana de los polmeros orgnicos dando fenoles, quinonas,
aminocidos, azcares.
Fase II: polimerizacin de los monmeros por reaccin qumica espontnea,
autooxidacin, oxidacin, catalizados por enzimas microbianas.

Equilibrio dinmico entre la sntesis y la mineralizacin gradual.
LA ATMSFERA DEL SUELO
Relativamente estable en su composicin, y depende del tipo de textura y
estructura.
0
0,5
1
1,5
2
2,5
3 6 9 12 15 18 21
% en la atmsfera del suelo
P
r
o
f
u
n
d
i
d
a
d

d
e
l

s
u
e
l
o
Variacin de la cantidad de Oxigeno
y CO
2
en la atmsfera del suelo
Oxigeno
CO
2
* La proporcin de CO
2
y

O
2
del suelo
varia tambin segn la poca del ao.
En las estaciones hmedas, el contenido
de O
2
desciende y el contenido de CO
2

aumenta ligeramente.
La densidad del suelo es una
medida del empaquetamiento de las
particulas del suelo. Indica el
espacio que puede estar ocupado
por aire.

Zonas xicas y zonas anxicas.

La concentracin de CO
2
en el
suelo puede ser 2x que en el aire.

La concentracin de CO
2
y el O
2

del suelo se ve afectada por la
difusion de los gases y respiracin
microbiana: Suelos deficientes en
O
2
pueden contener CH
4
, SH
2
.

Los microorganismos constituyen el 80% de la biomasa


En 1 g de tierra agrcola
10
9
bacterias cultivables
10
7
hongos
10
6
algas
10
5
protozoos


Las bacterias cultivables: 1-10% de las bacterias totales
Comunidades microbianas del suelo
El suelo constituye un habitat favorable para el desarrollo de los
microorganismos.
El nmero de microorganismos suele ser mayor que en en habitat
acuticos (dulce-salado) ... 10
6
10
9
bacterias/g de suelo.
Zimgenos:
oportunistas, no pueden asimilar los
compuestos hmicos.
Desarrollan gran actividad con rpido
crecimiento sobre sustratos fcilmente
asimilables: vegetal, restos de
animales muertos.
Activos por perodos en funcin de la
disponibilidad de
nutrientes:Pseudomonas, Bacillus,
Penicillum, Aspergillus.
Autctonos:
fraccin de la comunidad que
puede utilizar las sustancia
hmicas refractarias.
Lenta actividad (Gram
negativos y actinomycetos).
Sergei Winogradsky,
Los parmetros abiticos
pueden restringir la diversidad
de poblaciones:

pH extremadamente
alcalinos / cidos.
Suelos polares que
permanecen la mayor parte
del ao congelados,
Desiertos ridos y calurosos
...
Microorganismos
Extremfilos.
Es difcil generalizar las propiedades de los
microorganismos indgenas de la microbiota del suelo
debido a los diferentes habitats.
Los distintos habitats varan en
contenido de materia orgnica,
contenido de O2 ...

Y asi pueden favorecer el
desarrollo de diferenes
poblaciones indgenas.
Hiptesis de las islas de
recursos ...
Proporcin relativa de los gneros bacterianos aerbicos, facultativos
y anaerbicos comunmente encontrados en suelo
Gnero Abundancia (%)
Arthrobacter 5-60
Bacillus 7-67
Pseudomonas 3-15
Agrobacterium 1-20
Alcaligenes 1-20
Flavobacterium 1-20
Corynebacterium 2-12
Micrococcus 2-10
Staphylococcus < 5
Xanthomonas < 5
Mycobacterium < 5
Alexander 1977
Grupo Actinomycetes
10-30% de las bacterias del suelo
The morphological characteristics of actinomycete
colonies on Hickey-Tresner agar medium after
incubation at 30C for 4 weeks
Gneros Streptomyces y Nocardia son los mas abundantes
Nocardia
Streptomyces
Streptomyces griseus sp.
griseus.
Resistentes a la
desecacin
Desarrollan bien en
suelos alcalinos o
neutros.
Las especies fijadoras de N
2
son
factores limitantes en el suelo para la
actividad microbiana y el desarrollo de
las plantas superiores.

Grupo cianobacterias, fotoauttrofos.

Gnero Azotobacter,
quimiohetertrofo fijador libre de N
2

Gnero Clostridium, anaerbico,
algunas especies son fijadoras de N
2

Gnero Rhizobium y Bradyrhizobium
fijan N
2
dentro de los ndulos de la raiz
de ciertas plantas.
Gloeobacter sp. Autofluorescencia luego de
iluminar con luz verde
Microscopia de
contraste de fases
Formas
filamentosas que
forman
heterocistes
Cianobacterias
Patgenos de plantas, llegan con material vegetal infectado:
Agrobacterium, Corynebacterium, Erwinia,
Pseudomonas y Xanthomonas

Patgenos de animales, llegan con aguas servidas:
E. coli, Salmonella,

Los alctonos rpidamente se eliminan del suelo, algunos pueden
permanecer tiempos ms largos debido a la capacidad de
desarrollar formas de resistencia. Pueden sobrevivir por largos
perodos en un estado de dormancia.
Los Alctonos pueden llegar al suelo por diferentes vias:
Aire - Hidrosfera - Asociados a plantas o a animales
Pueden desarrollar en formas libres o en
mycorrizas.

Predominan en los primeros 10 cm del suelo y
abundan en suelos bien aireados y de pH
cido.

La mayora son oportunistas (zimgenos)
Permanecen en dormancia activndose en
presencia de condiciones favorables.

Degradadores de lignina

Los gneros mas frecuentemente aislados:
Aspergillus, Geotrichum, Penicillum.

Las formas alctonas pueden desarrollar a
expensas de los nutrientes del suelo.
Los hongos constituyen una alta proporcin de la biomasa
microbiana.
Gran diversidad de gneros
Gneros predominantes de levaduras
indgenas del suelo: Candida,
Rhodotorula Cryptococcus. Las formas
alctonas llegan con vegetales enfermos.
Interacciones entre bacterias y hongos
Fungistasis del suelo: efecto inhibitorio de
la germinacin de los hongos, ampliamente
distribuido en suelo.

Depende de las propiedades fsicas, qumicas
y de la actividad microbiana del suelo.


i) Hipotesis de la privacin de nutrientes
ii) Hipotesis de la produccin de antibiticos.


Mycofagia
Collimonas
fungivorans
Los hongos patgenos de plantas son
mas sensibles a la fungistasis.
Los protege de
germinar bajo
condiciones
desfavorables
Mecanismo de control
para hongos patgenos
de plantas
Varios gneros de algas viven en el
suelo.
Pueden desarrollar en la superficie y en
los primeros mm de la superficie del suelo,
10
6
/

g.
La mayoria son pequeas y unicelulares.
Constituyen la microflora fotosinttica
dominante del suelo. Algunas pueden
utillizar compuestos preformados C/E
Son importantes en la colonizacion inicial
de las rocas, formacion y conservacion del
suelo.
Pueden desplazarse hacia la
subsuperficie del suelo transformndose
en alctonas y pueden ser consumidos por
los indgenas.
Cyanophyceae,
Chlorophyceae
ALGAS
Protozoos de vida libre en suelo

son de pequeo tamao y baja diversidad
comparado con el ambiente acutico.

Predominan las formas flageladas, 10
4
10
5
/g

Predominan cerca de la superficie, 15 cm.

Requieren relativamente alta concentracion de O
2
,
son importantes predadores de bacterias y algas.

Importante lugar en la cadena trfica como
predadores de algas unicelulares, bacteria y
hongos.

Constituyen el alimento de los
microinvertebrados.

El rol ecolgico es la transferencia de la
produccin de algas y bacterias hacia los
sucesivos niveles trficos.
Mastigophora,
(flagellates),Ciliata.
Amoeba
PROTOZOOS