REA DE CIENCIAS DE LA SALUD. UDI BIOQUMICA METABOLISMO DE PROTENAS M. en C. Jaime Humberto Flores Torres. METABOLISMO DE LOS COMPUESTOS NITROGENADOS:
Aminocidos y sus derivados, los nucletidos y los polmeros de cidos nucleicos y protenas. La disponibilidad biolgica de nitrgeno es limitada, y la degradacin de los compuestos nitrogenados conduce a menudo a productos txicos.
Hay 20 aa diferentes en las protenas lo que implica la existencia de 20 rutas de biosntesis y de degradacin. Las numerosas funciones de los aa: forman parte de las protenas, precursores de hormonas, vitaminas, coenzimas, porfirinas, pigmentos y neurotransmisores. Para muchos organismos, el crecimiento y la reproduccin estn limitados por la disponibilidad del nitrgeno utilizable, que a su vez est limitada por la capacidad de los organismos para utilizar diferentes formas inorgnicas del nitrgeno. Todos los organismos pueden convertir el amonaco (NH 3 ) en compuestos de N orgnicos (enlaces C-N). Sin embargo, no todos los organismos pueden Sx amonaco a partir de formas ms abundantes de nitrgeno inorgnico, el gas dinitrgeno (N 2 ) y el ion nitrato (NO 3 - ), una sustancia del suelo esencial para el crecimiento de la mayora de las plantas. La reduccin del N 2 a NH 3 , denominada FIJACIN BIOLGICA del NITRGENO, la realizan tan slo determinados microorganismos, a veces en una relacin simbitica con las plantas. La reduccin de NO 3 - a NH 3 es, en cambio, un proceso muy difundido entre las plantas y los microorganismos. Las plantas, animales y las bacterias obtienen su nitrgeno de orgenes diferentes, prcticamente todos los organismos compartes unas mismas rutas comunes de utilizacin del nitrgeno inorgnico en forma de amonaco.
El [Amonaco] es muy txico, pero a [ ] ms bajas constituye un metabolito central, que acta como sustrato de 5 enzimas que lo combierten en diversos compuestos orgnicos nitrogenados. Los animales deben reponer continuamente su aporte de nitrgeno mediante el alimento, con objeto de reemplazar el nitrgeno perdido a travs del catabolismo.
Cuando las protenas del alimento son insuficientes, se degradan las protenas que se han elaborado con otros fines, principalmente las protenas musculares. Estas consecuencias se dan a pesar de que la dieta contenga una cantidad de caloras proteicas suficientes, si esas protenas no contienen los aminocidos necesarios (esenciales). En condiciones ptimas los animales mantienen un consumo y excrecin de nitrgeno equivalente. Un adulto bien nutrido se encuentra en equilibrio nitrogenado o balance nitrogenado normal cuando la ingestin diaria de nitrgeno en los alimentos es igual a la que se pierde por la excrecin y otros procesos.
Un balance nitrogenado positivo la ingesta de nitrgeno supera la perdida (embarazo, crecimiento, recuperacin y regeneracin). Balance nitrogenado negativo la prdida de nitrgeno supera la ingesta (vejez, inanicin, estados patolgicos). Los aa que han de proporcionarse en el alimento para satisfacer las necesidades metablicas se denominan aa ESENCIALES. Los aa que se pueden sintetizar son los no esenciales. Los esenciales son aquellos que tienen estructuras complejas, como anillos aromticos y cadenas laterales hidrocarbonadas. Los no esenciales se sintetizan con facilidad a partir de metabolitos abundantes, como los intermediarios de la gluclisis o del ciclo del cido ctrico. Recomiendan un consumo de protenas de 50 a 100 g/da, el ser humano puede mantenerse bien con una dieta que contenga tan slo 20 g/da, si esas protenas son de alta calidad nutricional (mamferos>pescado>aves>frutas>verduras). Las protenas de las plantas presentan a menudo un dficit de lisina, metionina o triptfano. Sin embargo una dieta vegetariana proporciona las protenas suficientes si contiene diversas fuentes proteicas (compensa una fuente con otra). Una persona de 70 Kg., consume 100 g de protenas por da. Estudios con marcaje isotpico indican que se Sx 400g de protena al da y que se degradan 400g. Aproximadamente partes de los aa liberados se reutilizan en la sntesis proteica y los dems se degradan y se excreta el nitrgeno. El conjunto total de aa es de 500g/da, 100g ingeridos y 400g liberados a travs de la degradacin proteica. De este conjunto 400g se utilizan en la sntesis proteica y 100g se catabolizan y excretan. Las protenas que se secretan a un medio EC, como las enzimas digestivas, las hormonas polipeptdicas y los Ac, tienen un recambio metablico rpido; mientras que las protenas estructurales son ms estables. Las enzimas que catalizan pasos limitantes de la velocidad de las rutas metablicas son tambin de corta duracin. Para muchas enzimas, la velocidad de degradacin constituye un factor de regulacin en el control de las [enzimticas] IC. En cambio las protenas que no constituyen puntos de control metablicos tienen un recambio relativamente lento. Las molculas de protenas que se han alterado qumicamente son las que se degradan de manera preferente. Un cierto cambio qumico puede marcar una molcula proteica, haciendo que pase a ser el objetivo de una enzima proteoltica que identifica el marcador y que se encargar de degradarla. PROTEASAS:
Las protenas se degradan en todos los compartimentos celulares. En las clulas eucariotas en el citosol: 2 proteasas activadas por calcio (calpanas) y otra proteasa dependiente de ATP denominada proteosoma.
En el lisosoma (catepsinas) degradan las protenas EC captadas por una clula y las protenas de celulares de larga duracin; y en otros compartimientos se recambio proteico selectivo (regulacin metablica). SEALES QUMICAS PARA RECAMBIO: Ubicuitinizacin: la ubicuitina es una protena pequea y termoestable se encuentra en todas las clulas eucariotas; experimenta una reaccin dependiente de ATP con las protenas, que condensa los residuos de glicina C-terminales de la ubicuitina con grupos amino de lisina de la protena objetivo. Estas protenas modificadas se degradan poco despus, mediante un complejo proteasa cuyo ensamblaje requiere ms ATP y que reconoce el marcador ubicuitina. Oxidacin de Residuos de Aminocidos: muchas protenas se oxidan, promovidas por condiciones que generan radicales de oxgeno. Estas modificaciones marcan a las protenas para su posterior degradacin por las proteasas citoslicas. La acumulacin de protenas con daos oxidativos ms all de la capacidad de la clula para degradarlas y sustituirlas contribuye de manera importante al envejecimiento celular.
Secuencia PEST: secuencia de aa de las protenas de vida corta, contienen 1 o ms regiones ricas en prolina, glutamato, serina y treonina (PEST), regiones entre 12 y 60 residuos de longitud. La regin PEST forma parte de un esquema de reconocimiento para los sistemas enzimticos que degradan las protenas de vida corta, que posiblemente incluya el sistema de la ubiquitina.
Residuo Aminocido N-terminal: un residuo N-terminal de Phe, Leu, Tyr, Trp, Lys o Arg est correlacionado con una vida metablica corta, mientras que las protenas con otros aa terminales tienen una vida ms prolongada En los animales cuyo consumo de protenas en la dieta supera las necesidades existentes para la Sx de protenas y otras biosntesis, el exceso de nitrgeno se degrada y los esqueletos carbonados se metabolizan en el ciclo de Krebs.
El primer paso de la degradacin de aa consiste en la eliminacin del grupo -amino para el correspondiente -cetocido.
Una vez eliminado el nitrgeno, el esqueleto carbonado puede procesarse hacia la oxidacin en el ciclo del cido ctrico o puede utilizarse para la Sx de CHO, dependiendo del estado fisiolgico del organismo. La UREA se sintetiza casi exclusivamente en hgado y se transporta luego a los riones para su excrecin. La ornitina acta como transportador sobre el cual se ensamblan los tomos de C y N que finalmente constituirn la urea. La urea se sintetiza mediante una ruta cclica que requiere energa y que se inicia y termina en la ornitina. La determinacin de la [urea] en sangre (20-40 mg/100 mL) proporciona un indicador clnico sensible de la funcin renal, ya que la filtracin y eliminacin de la urea se deterioran cuando la funcin renal es incorrecta. La determinacin de amonaco en sangre constituye una prueba sensible de funcin heptica. La hepatitis, cirrosis, reducen la actividad del ciclo de la urea. La acumulacin de amonaco es txica para el cerebro.