Agrupamento de Escolas n1 de Reguengos de Monsaraz
Ano Letivo 2013/ 2014 Biologia Prof. Sandra Graa O processo da PCR (Polymerase Chain Reaction ou Polimerizao por reaes em Cadeia) foi primeiro descrito por cientistas da Cetus Corporation, em 1983. Kary Mullis (1) desenvolveu os primeiros estudos acerca deste processo, o que lhe valeu o Prmio Nobel da Qumica, tendo-lhe sido atribudo em 1994. Ainda em 1989, a Hoffman La Roche & Perkin-Elmer Corporation patenteou o processo, por se ter apercebido do potencial da tecnologia do mesmo. Atualmente, a Roche desenvolve esforos no sentido do aprefeioamento da tcnica.
1 Dr. Kary Mullis Biologia Patrimnio Gentico PCR 12B A PCR uma tcnica que permite a replicao in vitro de DNA de uma forma muito rpida. Esta tcnica permitiu avanos cientficos em todas as reas de investigao gentica, bem como em reas de diagnstico/ seguimento de doentes. A principal vantagem da PCR a amplificao exponencial de quantidades mnimas de material gentico em poucas horas atravs de processos simples. O prprio criador desta tcnica afirmou que seria apenas necessrio um tubo de ensaio, uns quantos reagentes simples e uma fonte de calor. A PCR baseia-se, ento, na capacidade da DNA polimerase (2) de sintetizar novas cadeias de DNA complementares s cadeias-padro, ou seja, na sua capacidade em replicar novas cadeias de DNA. 2 A ao da DNA polimerase Biologia Patrimnio Gentico PCR 12B Antes de se iniciar a reao de PCR propriamente dita, h que adicionar os reagentes simples a que Mullis se referia num tubo (3) prprio para a mesma: DNA extrado das clulas; Primer 1: liga-se a qualquer extremidade do segmento a copiar. So ferramentas poderosas no que toca cpia de sequncias de DNA especficas, pois a probabilidade de cometerem erros muito baixa; Primer 2: liga-se extremidade que ainda no possui o Primer 1, o que ocorre graas complementariedade de bases; Nucletidos: utilizados para criar milhes de cpias do DNA; DNA polimerase: enzima que l o DNA e acrescenta nucletidos correspondentes para criar as cpias, aguentando as temperaturas elevadas da reao de PCR; Soluo-tampo: contm ies Mg2+, essencial atividade da polimerase. Impede as variaes de pH. O tubo depois acondicionado num termociclador (4), um aparelho que aquece e arrefece o tubo a temperaturas especficas, no espao de uma hora. Estas mudanas de temperatura so essenciais ao bom funcionamento da reao. 3/ 4 tubos de reao PCR e termociclador Biologia Patrimnio Gentico PCR 12B Cada ciclo da reao de PCR constitudo por trs passos: 1. Desnaturao trmica a temperatura eleva-se a 95 C, separando a cadeia dupla de DNA, formando, a partir dela, duas cadeias simples, diferentes mas complementares entre si. 2. Hibridizao ou Annealing o termociclador desce temperatura de 55 C. Os primers ligam-se s sequncias-alvo, ou seja, o incio da sequncia de DNA alvo marcado pelos primers que se hibridizam com a sequncia complementar. 3. Extenso ou Polimerizao aps a hibridizao dos primers s sequncias de DNA, a temperatura eleva-se at 72 C e a enzima DNA polimerase replica a cadeia. O processo de replicao iniciado numa zona onde esto ligados os primers, incorporando assim os nucletidos complementares sequncia-alvo, formando uma nova cadeia em dupla hlice. Biologia Patrimnio Gentico PCR 12B Final do primeiro ciclo: Aps o primeiro ciclo encontramos duas novas cadeias idnticas original; A DNA polimerase no reconhece o final da sequncia, pois a extremidade 3 no est definida pelo primer, havendo fragmentos de diferentes tamanhos. As cadeias cujos limites esto definidos pelos primers denominam-se Amplicons. So estes Amplicons que interessam, ou seja, so eles que vo ser recolhidos para futuras aplicaes; Normalmente so realizados de 25 a 40 ciclos para cada reao, sendo a taxa de replicao igual a 2 ciclos . Biologia Patrimnio Gentico PCR 12B A sensibilidade extrema que caracteriza as reaes PCR torna possvel trabalhar com uma amostra de material gentico muito pequena, mesmo que contenha apenas restos de uma nica clula. Pode-se ainda obter uma impresso digital do DNA da pessoa da qual a amostra proveio. O DNA amplificado pelo PCR diferente na sequncia de um indivduo para outro, pois o genoma de cada ser humano diferente. A PCR encontra, ento, a sua principal aplicao em mtodos que necessitam de uma quantidade de DNA maior que a disponvel, como por exemplo: A investigao em biologia O diagnstico de doenas A medicina forense
Biologia Patrimnio Gentico PCR 12B Estudos paleontolgicos; Anlise de ligaes genticas; Amplificao de sequncias a partir de material no qual o DNA est gravemente degradado; Amplificao de sequncias de DNA que sofreram mutaes; Gnese de mutaes especficas ou recombinao de genes em estudo Estes genes mutantes ou recombinados so bastante utilizados no estudo funcional do genoma, da expresso gnica, da relao entre a estrutura-funo de protenas, das interaes proticas, da engenharia protica e da evoluo in vitro de enzimas.
Biologia Patrimnio Gentico PCR 12B Anlise gentica; Estudo da origem molecular de doenas; Prognstico de alteraes na sequncia de DNA: deteo de delees/ inseres determinadas pela gnese de produtos amplificados que apresentam alteraes no seu tamanho; Prognstico de mutaes pontuais (substituio de bases), sendo estas detetadas pela ao de enzimas de restrio ou atravs do sequenciamento; Diagnstico pr-natal ou pr-implantacional; Diagnstico e prognstico de doenas de ordem gentica, como o cancro, atravs do estudo de genes relacionados com as mesmas; Deteo de agentes patognicos infecciosos (vrus da hepatite B e C, herpes, vrus da rubola, HIV, clamdia, tuberculose, entre outros).
Biologia Patrimnio Gentico PCR 12B Pequenas amostras de material gentico retiradas da cena de um crime so amplificadas, atravs da PCR, para serem posteriormente analisadas pelo mtodo do DNA fingerprint. Com recurso a esta tcnica, at mesmo amostras antigas e j decompostas, restos mortais de vtimas de incndios ou acidentes e corpos em decomposio podem ser analisadas. As reaes PCR so tambm teis, seguindo o mesmo mtodo do que na medicina forense, na aplicao de testes de paternidade.
Biologia Patrimnio Gentico PCR 12B Preparao dos reagentes para PCR Termociclador Desnaturao trmica Annealing Polimerizao Cadeia amplificada Eletroforese Documentao Biologia Patrimnio Gentico PCR 12B Vantagens Limitaes Simplicidade Tcnica rpida, barata e segura Sensibilidade Rigor Possibilidade de anlise de amostras degradadas Especificidade no necessrio isolar o DNA que se quer amplificar, uma vez que a especificidade da PCR dada pelos primers necessrio conhecer a sequncia de DNA a amplificar para que se possam sintetizar os primers especficoss Pode ocorrer a incorporao errnea de bases durante a replicao, originando mutaes. Sensibilidade Limitada extenso da sequncia que possvel amplificar (difcil aplicar a PCR a sequncias superiores a 5 kb) Sensibilidade contaminao com DNA estranho, podendo ocorrer emparelhamento entre os primers e este DNA (amplificao de sequncias no pretendidas) Biologia Patrimnio Gentico PCR 12B Dias da Silva, A., Santos, M.E., Fernandes Mesquita, A., Baldaia, L., Flix, J.M. Terra Universo de Vida Biologia 12 ano (2013) 1 edio Porto: Porto Editora http://learn.genetics.utah.edu/content/labs/pcr/ (consultado em 27/3) http://www.roche.pt/portugal/index.cfm/produtos/equipamen tos-de-diagnostico/products/molecular-diag/intro- pcr/(consultado em 27/3) http://www.trabalhosfeitos.com/ensaios/Trabalho-De- Gen%C3%A9tica-Sobre-Pcr/684700.html(consultado em 27/3) http://www.trabalhosfeitos.com/ensaios/Rea%C3%A7%C3%A3o-De- Polimeriza%C3%A7%C3%A3o-Em-Cadeia- Pcr/470335.html(consultado em 27/3) http://www.trabalhosfeitos.com/ensaios/Rea%C3%A7%C3%A3o-De- Polimerase-Em-Cadeia/607942.html(consultado em 27/3) http://www2.iq.usp.br/docente/goldberg/veterinaria2006/Aula_P CRvet_2006.pdf(consultado em 27/3) http://pt.slideshare.net/AdrianaDantas2/recombinao-genetica (consultado em 28/3) http://www.biomedicinapadrao.com/2011/10/reacao-em-cadeia- da-polimerase-pcr.html (consultado em 28/3) http://www.ufpe.br/biolmol/Genetica- Medicina/ferramentas_gen_mol_hum.htm (consultado em 29/3) http://nar.oxfordjournals.org/content/18/7/1687 /consultado em 29/3)