Escolar Documentos
Profissional Documentos
Cultura Documentos
activity relationship)
• DEFINIÇÃO
• QSAR
• Processo matemático que permite quantificar a relação
entre a estrutura de um composto (geometria e
propriedades químicas) e a sua actividade biológica
• Pergunta:
• Porque se usa QSAR?
• Resposta:
• Ex: Para determinar a actividade biológica de compostos
de benzeno substituidos em quatro locais por 10 grupos
diferentes necessita-se de 104 reagentes para os
sintetizar e verificar a actividade biológica de cada um
posteriormente à sua síntese. Sob o ponto de vista
financeiro correspondia ao gasto de mais de 10 milhões
de dólares/composto.
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• Como se soluciona tal problema?
• 1º Sintetiza-se um pequeno número de
compostos
• 2º A partir dos dados da sua constituição
atómica, propriedades físicas e químicas,
prediz-se a actividade biológica dos
compostos análogos não sintetizados.
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• HISTÓRIA
• A primeira relação actividade-lipofilidade foi publicada
por Charles Richet em 1893, resultante da avaliação da
toxicidade do etanol, éter, uretano, paraldeído, alcool
amílico, acetofenona e essência de absinto, em que se
afirma “quanto mais solúvel na água menor a
toxicidade”.
• Em 1894 Emil Fisher expôs a teoria do modelo chave-
fechadura nas interacções substracto-enzima como
resultado da estereoespecificidade da clivagem
enzimática dos glucosidos anoméricos.
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• Entre 1899 e 1901 Meyer e Overton
desenvolveram a sua teoria (teoria de
Meyer-Overton) onde a bioactividade
de anestésicos foi correlacionada com
os coeficientes de partilha
octanol/água.
• Em 1935 Meyer e Hemmi descobriram
de novo que a actividade biológica
estava relacionada com um qualquer
coeficiente de partilha. Um modo de
ilustrar a correlação estrutura-
actividade, é desenhar uma curva
actividade em função do logaritmo dos Relação actividade-estrutura
parâmetros físico-químicos. A curva
resultante mostra o máximo de
actividade no topo da curva.
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• Nas décadas seguintes o conceito de receptor
resultante das investigações de Paul Erlich
permitiu o desenvolvimento da química médica
produzindo cada vez melhores fármacos contra
muitas doenças.
• Apesar de se ter encontrado uma relação entre
propriedades biológicas não específicas e
lipofilidade, expressa na maioria das vezes pelo
coeficiente de partilha óleo/água, este
conhecimento não se desenvolveu durante mais
de 70 anos.
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• A disciplina de Relações Quantitativas entre
Estrutura e Actividade biológica (QSAR), como
hoje se define foi iniciada por Corwin Hansch no
estudo dos ácidos fenoxiacéticos. Entre 1962-
1964 ele estabeleceu as bases do QSAR por
meio de:
• 1-A combinação de vários parâmetros físico-
químicos numa única equação de regressão
• 2-A definição do conceito do parâmetro
lipofilidade π .
• 3-Formulação de um modelo parabólico para
relações não lineares de actividade-lipofilidade.
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• Em 1974 foi publicado o livro “Strategy of drug
design. A molecular guide to biological activity”
por William Purcell, a partir do qual Hugo
Kubinyi remodelou, e criou novos modelos
matemáticos. Conjuntamente com Hansch
aplicou o modelo bilinear ao QSAR de enzimas
inibidores tendo sido publicados os resultados
deste modelo em 1980.
• Actualmente o desenvolvimento de fármacos
envolve conhecimento de QSAR,
simultaneamente com cristalografia de
proteínas.
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• Para que um fármaco exiba um certo efeito
biológico, deve interagir com um certo
componente celular num local de acção.
• Contudo, os sistemas biológicos são compostos
por um número de fases heterogéneas, e o local
onde o fármaco é administrado está
normalmente afastado do local onde actua. O
fármaco deve ser transportado através de
ligações de fase, submetido a processos de
adsorção/desorção com proteínas e membranas
e partição entre fases líquidas até atingir o local
onde se liga.
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• A interacção fármaco-receptor não ocorre sem
que seja perturbada pelos componentes
heterogéneos ambientes, tais como água,
proteína do soro, partículas de lípidos e outras,
tornando-a assim muito mais complexa. Nestas
circunstâncias, raramente é possível elucidar o
mecanismo da acção de um fármaco se
considerarmos apenas as teorias deterministas
ou modelos microscópicos dos estádios
individuais do transporte e processos de
interacção.
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• A aplicação dos conceitos de Hansch de relação
actividade-estrutura permite assumir que os
factores físico-químicos que governam o
transporte e interacção fármaco-local de acção,
podem ser explicados por componentes
electrónicos, hidrofóbicos e estéreo.
• Em geral, se considerarmos que as variações
na actividade biológica resultam de
modificações estruturais em fármacos
semelhantes, então essas mudanças resultam
de modificações nos factores físico-químicos.
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• Esta questão está sumarizada na
equação 1, que contém os factores
termodinâmicos E, H e S.
∆ BA= f(∆ E, ∆ H, ∆ S) (1)
• BA-Actividade biológica
• E-Energia interna
• H-Conteúdo energético ou Entalpia
• S-Entropia
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• Numa série de compostos congéneros ou série,
ou homólogos, a actividade biológica para um
composto de referência é constante, dando-nos
a equação 2, a actividade biológica de cada um
dos membros da série.
∆ BA= f(∆ E, ∆ H, ∆ S) + Const. (2)
Normalmente o valor da actividade BA é é um
recíproco proporcional da concentração C da
droga, o que causa uma resposta biológica
como EC50, I50 referido à concentração molar.
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• De um modo mais prático usa-se 1/C para BA π ou log P para
∆ H, σ , σ *, σ ´ou ∆ log KA para ∆ E e Es ou Esc para ∆ S.
π é uma constante hidrofóbica substituinte, derivada do
coeficiente de partilha P, que é determinado pelo sistema
octanol/água.
σ é a constante de Hammett
σ ´ é um parâmetro electrónico envolvido em reacções por
radicais livres
σ * é a Constante Polar de Taft para sistemas alifáticos
Es é a constante estéreo para sistemas alifáticos
Esc é a constante estéreo corrigida de Hancock
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• A equação mais divulgada é a equação 3, para a(»0), b, ρ ,
δ , e c constantes. Estas constantes são determinadas por
análise de regressão usando o método dos mínimos
quadrados.
• Log 1/C= -a(logP)2 + blogP + ρ σ + δ Es + c (3)
• Deste modo é possível analisar como é que cada
propriedade físico-química da molécula está relacionada com
a sua actividade.
• Nas equações entre 4 e 11 as letras n, s e r dizem respeito a:
• n=número de pontos usados na regressão
• s=desvio padrão
• r=Coeficiente de correlação
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• Ex 1: Oxidação do NADH
O
• Inibição pelos barbituratos
• pI50 = 1,11 log P + 1,24 (5) N N
• para n=6, s=0,261 e r=0,921
• Ex 2: Quimiotripsina O O
R2 R1
• Inibição por uma mistura de
compostos neutros Barbitúricos
• pK1=1,00 log P -2,60 (6)
R1
• para n=8, s=0,139 e r=0,995
• Ex 3: Secreção salivar de gatos C(OH)COOCH2CH2N R2
• Log1/C=0,50(logP)2+2,45logP+1,92s+1,77
• (12)
• para n=8, s=0,290 e r=0,815 X
• Nas equações (10) e (11) os valores σ
correspondem aos isómeros orto
• Nos estudos clássicos de relação
estrutura-actividade, a maioria concentra-
se na relação das propriedades da
molécula com uma única actividade
• Ex: propriedades cancerígenas dos PAHs
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• Muitas vezes a actividade está correlacionada apenas
com um único parâmetro molecular. Na técnica usada
no QSAR estas situações são casos especiais onde
outras propriedades não têm um papel relevante na
actividade biológica da molécula e os seus coeficientes
são zero.
• A parametrização do carácter hidrofóbico de uma
molécula é um dos aspectos mais importantes nesta
técnica. O valor π de um certo substituinte ou parte de
uma molécula é aproximadamente constante, em
moléculas estruturalmente relacionadas e pode ser
somado a outros valores de π para calcular e predizer
os seus valores de log P desconhecidos.
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• Deste modo as análises podem muitas vezes ser
efectuadas por cálculo a partir de log P conhecidos.
• Ex: determinação do KOW do β -BHC (1e,2e,3e,4e,5e,62-
hexaclorociclohexano)
• O valor do log P=3,78 é dividido por 6 para determinar o
valor de π da unidade (>CH-Cl)=0,63.
• O valor de π calculado a partir do Σ de 0,41 (π do anel
aromático) + 0,39 (π do cloro alifático) -0,20 (π da
ramificação da estrutura)=0,60
• Como o valor de π é constitutivo, a natureza estereo-
específica da ligação hidrofóbica na interacção droga-
receptor, pode ser delineada, por análise de regressão
usando separadamente os valores de p dos substituintes,
para cada posição das substâncias congéneras.
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• Ex: O efeito dos substituintes foi analisado para a hidrólise
dos fenilglucosidos substituidos observando,
separadamente, as constantes cinéticas dos isómeros
meta e para. Os substituintes meta desempenham um
papel não hidrofóbico no complexo de formação enzima-
substracto.
• Um outro exemplo é a acção bacteriostática dos análogos
do ácido kójico, como se observa na equação (9). Nesta
equação
• Log 1/Cn=0,97∆ log KA+1,4π (X)+1,71
• O valor Cn é a concentração mínima de inibição para a
molécula neutra e π (X) é o parâmetro para os
substituintes na posição 7.
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• Nem o uso de π (X+Y) nem a adição de π (Y) aumentam
a correlação. Os substtuintes Y na posição 2, metidos
entre os grupos OH e oxigénio do éter devem-se rodear
de uma atmosfera de moléculas de água, de modo a
ficarem impossibilitados de se ligarem às superfícies
hidrofóbicas do receptor.
• O valor óptimo de log P, log P0 obtidos, considerando a
derivada δ log1/C/δ logP=0, é um parâmetro útil para
prever a estrutura da droga mais potente num conjunto de
congéneros, assim como, para ilustrar o carácter das
barreiras que as drogas têm de atravessar para poderem
actuar.
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• Considerando a equação (12).
• Log1/C=0,50(logP)2+2,45logP+1,92s+
1,77
• O valor de log P0 para o crescimento
dos segmentos coleoptilos do arroz sob
a acção dos ácidos cinâmicos é de
2,45. Este valor está muito próximo do
obtido na promoção do crescimento
dos segmentos coleoptilos da aveia
pelos ácidos fenoxiacéticos e
fenilacéticos entre 2 e 2,5. Isto significa
que as barreiras físico-químicas
necessárias para atingir o local de
acção das auxinas (cis-ácidos
cinâmicos) são semelhantes para
diferentes tipos de compostos.
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• Esta situação simples
pode perturbar alguns
biólogos mas de facto
a própria interacção
enzima-inibidor é uma
cadeia de processos
complexos, incluindo
desolvatações,
colisões com locais
não específicos da
enzima e
resolvatações, antes
de atingir o centro de
inibição específico.
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• As interacções enzima-inibidor podem ser
consideradas como um modelo em miniatura da
acção das drogas em sistemas biológicos.
Assim, qualquer que seja o nível do sistema
biológico, o mesmo procedimento pode ser
aplicado para a acção da droga.
• Uma questão que se põe é ser usado o mesmo
tipo de equação para explicar um conjunto muito
diverso de propriedades fisiológicas das drogas.
• Considerando qualquer efeito biológico em
termos aproximativos, este pode ser encarado
sob dois aspectos:
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• 1-Carácter fisiológico específico
• 2-Grandeza do efeito
• Aceita-se geralmente que uma droga inicia uma cadeia
de eventos que eventualmente produzem um dado
efeito biológico mas que não envolve o droga após o
início do mecanismo da interacção droga-receptor, como
por exemplo: a sucrose tem sabor doce mas não
participa na transmissão do fluxo nervoso desta
sensação.
• A grandeza da resposta biológica observável é um
reflexo directo da intensidade dos eventos fisiológicos,
que por seu turno, são determinados pela grandeza da
interacção droga-receptor.
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• O grau da interacção droga-receptor é
controlado pelas propriedades físico-químicas
dos participantes e a concentração da droga no
centro activo é governada pelos processos
físico-químicos do transporte.
• Isto quer dizer que, no que diz respeito a um
efeito biológico, é razoável considerar-se que a
grandeza da resposta é expressa por uma
função das propriedades físico-químicas da
molécula da droga. É a grandeza do efeito
biológico que é usada nas análises estrutura-
actividade.
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• Com o uso da análise de regressão, é
possível separar a significância relativa
dos factores físico-químicos, na acção
total da droga.
• A- Inibição pelos Fenildietilfosfatos
substituidos
• 1-Hidrólise alcalina “in vitro”
• log k (hidr.) = 1,35σ - - 5,09 n=7 s= 0,238
r= 0,955 (13)
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• 2-inibição da acetilcolinesterase de cabeça
de mosca
• pI50 =2,37 σ - + 4,38 n=6 s=0,297
r=0,985 (14)
S-CH2CH2Br S-CH2CH2OH
X X
S-CH2CH2Br S-CH2CH2R
X X
• 3-Acção de derivados da
pargilina sobre as MAO de
fígado de rato CH3
desprezáveis. R
• n= 7 s=0,490 r= 0,954
• BA é a actividade da acetilcolina
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• As equações (28), (29) e (30), com dois
parâmetros parecem ter uma correlação razoável.
Embora a equação (29) possa ser considerada
inaceitável, devido aos elevados coeficientes, é
estatisticamente equivalente. Nestes compostos
é impossível escolher qual dos parâmetros tem
influência porque existe uma mútua relação entre
eles.
• Para se obter correlações significativas, os
substituintes têm de ser seleccionados de modo
que os parâmetros dos substituintes, incluidos no
conjunto dos congéneros, sejam os mais
afastado possível.
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• No exemplo anterior não só o hidrogénio, metilo e
etilo, cujos parâmetros variam em paralelo, mas
grupos como o isopropilo
• (σ *=-0,19, π = 1,20, Esc = -0,47); tert-butilo (σ *=-0,30,
π = 1,60, Esc = -0,54); trifluoroetilo (σ *=-0,92, π = 1,48,
Esc = -0,79), podem ser usados como N substituintes.
• Muitas vezes, o uso de índices da química quântica,
ou de potenciais de oxidação-redução, em vez das
constantes de Hammett-Taft, o uso de parâmetros
hidrofóbicos obtidos por cromatografia (∆ Rm), em vez
de π ou log P, ou a adição de outras variáveis tais
como ligação hidrogénio, momentos dipolares,
ligações de polarização e parâmetros de posição na
equação do slide 14, podem ser usados para melhorar
a correlação.
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• Não devem ser usados demasiados
parâmetros na equação do slide 14.
• A não ser que o número de compostos
usados
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• Bibliografia
• Hugo Kubinyi-QSAR:Hansch analysis and related
approaches. VCH. ISBN 1-56081-768-2
• Biological correlations-The Hansch Approach, Robert F.
Gould, American Chemical Society, Series 114,
Washington, 1972
• http://images.google.pt/images?hl=pt-PT&q=coleoptile&gbv=2
coleoptile
• http://www.plant-hormones.info/cytokinins.htm
• http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?
artigo sobre inibição da acetilcolinesterase
QSAR (Quantitative structure-
activity relationship)
• http://images.google.pt/imgres?
imgurl=http://upload.wikimedia.org/wikipedia/en/3/39/Mustard-
dna.png&imgrefurl=http://en.wikipedia.org/wiki/Mustard_gas&h=101
&w=602&sz=3&hl=pt-PT&start=1&tbnid=-87GXeH-
Jtf7uM:&tbnh=23&tbnw=135&prev=/images%3Fq%3Dcyclic
%2Bsulfonium%2Bions%26gbv%3D2%26hl%3Dpt-PT iões
sulfonium cíclicos –SN2 interna
• http://en.wikipedia.org/wiki/Monoamine_oxidase_inhibitors MAO
anti-depressivos
• http://www.drashirleydecampos.com.br/noticias/12656
MAOs
• http://www.rsc.org/ejarchive/F1/1988/F19888402603
bending conformation
• http://www.youtube.com/watch?v=k3UXY9U0o
videos sobre a célula