Microorganismos y ambiente

Aplicaciones de los
microorganismos en biotecnologa
Dra. Paulina Aguayo
Facultad de Ciencias Ambientales
Generalidades
La Biotecnologa es la ciencia que tiene por objetivo
el estudio de organismos vivos o sus partes para
la obtencin de bienes y servicios.

De carcter multidisciplinario que involucra varias
disciplinas y ciencias como biologa, bioqumica,
gentica, virologa, agronoma, ingeniera, fsica,
qumica, medicina y veterinaria entre otras.
La biotecnologa tiene gran repercusin en la farmacia, la medicina,
la microbiologa, la ciencia de los alimentos, la minera y la agricultura
entre otros campos.

Segn el Convenio sobre Diversidad Biolgica de 1992, la biotecnologa
podra definirse como "toda aplicacin tecnolgica que utilice sistemas
biolgicos y organismos vivos o sus derivados para la creacin o
modificacin de productos o procesos para usos especficos".
Personajes influyentes en la
Biotecnologa
Gregor Mendel.- Describi las Leyes de Mendel que rigen
la herencia gentica, estableciendo las bases de la
gentica moderna.
Pasteur.- Describi cientficamente el proceso de
pasteurizacin y comprob la imposibilidad de la
generacin espontnea.
Watson y Crick.- Descubridores de la estructura del ADN.
Beadle y Tatum.- Propusieron un vnculo directo entre los
genes y las reacciones enzimticas conocida como la
hiptesis Un gen, una enzima.
Aplicaciones
BIOTECNOLOGA ROJA
Se aplica a la utilizacin de biotecnologa en procesos
mdicos:
Producin de antibiticos
Desarrollo de vacunas ms seguras y nuevos frmacos
Diagnsticos moleculares
Terapias regenerativas
Desarrollo de la ingeniera gentica para curar
enfermedades a travs de la manipulacin gnica.
BIOTECNOLOGA BLANCA
Tambin llamada biotecnologa industrial, es aquella aplicada
a procesos industriales:

Produccin de nuevos materiales, biodegradables o no.
Produccin de combustibles renovables utilizando tcnicas
biolgicas. Tal es el caso del bioetanol y el biodisel
Realizacin de transformaciones qumicas de una forma ms
eficiente y efectiva
Control y utilizacin de las molculas provenientes de los
seres vivos como base para producir nuevos productos y
servicios
Utilizacin de plantas y microorganismos para conseguir
descontaminar aguas, suelos y la atmsfera
Optimizacin de procesos industriales tradicionales, o el
desarrollo de nuevos

BIOTECNOLOGA VERDE
Es la biotecnologa aplicada a procesos agrcolas:
Cultivo in vitro de plantas
Produccin vegetal asistida por marcadores moleculares
Hibridacin
Produccin de biofertilizantes y biopesticidas
Transferencia selectiva de genes de un organismo a otro
dando lugar a nuevos cultivos vegetales
BIOTECNOLOGA AZUL
Llamada tambin biotecnologa marina, describe las
aplicaciones de la biotecnologa en ambientes marinos y
acuticos.


Nutricin en acuicultura
Sanidad de peces y otros animales marinos
Obtencin de nuevos productos a partir de la
biodiversidad marina
Biotecnologa ambiental
Biorremedacin: proceso por el cual son utilizados
microorganismos para limpiar un sitio contaminado. Los procesos
biolgicos desempean un papel importante en la eliminacin de
contaminantes y la biotecnologa aprovecha la versatilidad
catablica de los microorganismos para degradar y convertir
dichos compuestos.
Biodegradacin: proceso que se ocupa de la utilizacin de
sistemas biolgicos, tales como enzimas y bacterias, para
producir rupturas o cambios moleculares de txicos,
contaminantes y sustancias de importancia ambiental en suelos,
aguas y aire, generando compuestos de menor o ningn impacto
ambiental.
Biotecnologa
Uso de microorganismos vivos o de sus productos en
procesos industriales o ambientales a gran escala
Fases de la biotecnologa microbiana
Tecnologa microbiana
tradicional:
Fermentaciones
alcohlicas
Produccin de productos
farmacuticos , aditivos
alimentarios, enzimas y
sustancias qumicas
industriales
Biorremediacin
Tecnologa microbiana con
organismos alterados
mediante procesos de
ingeniera gentica:
Fabricacin de
hormonas
Moduladores del sistema
inmune
Vacunas
Microorganismos industriales
No todos los
microorganismos tienen un
uso industrial


Microorganismos industriales
producen uno o ms
productos especficos
El microorganismo
es modificado antes
de ingresar a la
industria: se altera
genticamente por
mutacin o por
recombinacin
Microorganismos
industriales son
especialistas
metablicos capaces
de producir
especficamente y con
un alto rendimiento,
metabolitos particulares
La fuente de todas
las cepas
industriales es el
ambiente natural

Las cepas
industriales se
depositan en
colecciones de
cultivos que sirven
como almacn
Requisitos de un microorganismo industrial:
Producir la sustancia de inters
Crecer rpidamente en un medio de cultivo barato
Fabricar el producto en un perodo corto
Desarrollarse en cultivo puro y en gran escala
Ser estable genticamente pero susceptible de
manipulacin gentica
Cultivos que se mantengan durante perodos
largos en laboratorio y en planta industrial
Facilidad para inocular en grandes fermentadores
No debe ser peligroso para el hombre o las
plantas y animales de inters econmico
Posibilidad de retirar fcilmente las clulas del
cultivo
Clases de productos industriales
Metabolitos
microbianos
Alcohol
cido actico
cido lctico
Aminocidos
Vitaminas
Antibiticos
Esteroides
Alcaloides
Clulas microbianas
Protena unicelular:
levaduras, algas,
bacterias y hongos
Clulas para la
inoculacin:bacteri
as fijadoras de
nitrgeno,
micorrizas,
inculos para la
fermentacin de
lcteos yembutidos
Enzimas
Digestin de
almidones,
lpidos y
protenas
Sntesis de
antibiticos
semisintticos
Clasificacin de los productos
industriales segn su uso:
Productos farmacuticos de
origen microbiano
Biotecnologa microbiana en
agricultura
Sustancias qumicas y
aditivos alimentarios
Productos qumicos
comerciales y produccin de
energa
Biorremediacin
Productos farmacuticos de origen
microbiano
Antibiticos
Hormonas esteroides
Insulina
Hormona del crecimiento
Linfocinas
Pptidos neuroactivos
Factores de coagulacin sangunea
Activador del plasmingeno tisular
Vacunas
Anticuerpos monoclonales para diagnstico y
terapia
Biotecnologa microbiana en agricultura
Productos farmacuticos
veterinarios de origen
microbiano
Inculos radiculares
Ingeniera gentica de
plantas mediada por
microorganismos como
portadores genticos
Sustancias qumicas y aditivos alimentarios
Sustancias especiales y aditivos alimentarios:
Aminocidos:
Glutamato: potenciar el sabor
Aspartato+alanina: modular el sabor de jugos de
frutas
glicina: mejorar el sabor de alimentos dulces
Aspartame: endulzar
Lisina y metionina: aditivos nutrivos
Cistena antioxidante de jugos de frurtas
Triptofano + histidina: evita la rancidez de los
alimentos
Vitaminas: rivoflavina, vitamina B
12
, vitamina C
Productos qumicos comerciales y
produccin de energa
Productos qumicos
comerciales de
estructura sencilla y
bajo valor monetarios

Etanol (combustible
para motores)
cido actico
cido lctico
Glicerol
Fermentaciones
Para procesos
industriales, se usan
fermentadores de
hasta de 400.000 litros
de capacidad
Los fermentadores son
construidos de acero
inoxidable y tienen una
camisa externa la cual
puede ser esterilizada
inicialmente y
enfriadada durante la
fermentacin.



TCNICAS UTILIZADAS EN
INGENIERA GENTICA

TCNICAS BSICAS EN BIOLOGA MOLECULAR

ENZIMAS DE RESTRICCIN
CLONAMIENTO DE GENES
SECUENCIACIN
ELECTROFORESIS DE PROTENAS, RNA Y DNA
REACCIN DE LA POLIMERASA EN CADENA (PCR)


Enzimas de Restriccin
Ingeniera del DNA
Clonamiento en plsmidos (vectores)
Secuenciacin de DNA
Electroforesis (Protenas, DNA)
Gel de Agarosa para electroforesis de DNA
St 1 2 3 4 5 6 C- St
Amplificacin de DNA
Reaccin de la polimerasa en cadena (PCR)
Produccin de productos
de mamferos por microorganismos
modificados por ingeniera gentica
Desarrollo de un proceso biotecnolgico:
Si el gen o los genes que codifican para la
produccin de una protena de mamfero
se pueden clonar dentro de un
microorganismo
Si se obtiene una buena expresin de este
gen
Productos biotecnolgicos fabricados
por DNA recombinante
Protenas de sangre para:
Disolver cogulos
Promover la coagulacin sangunea
Desarrollar glbulos rojos

Hormonas para:
Tratamiento de diabetes
Regulacin del calcio
Alivio del dolor
Osteoporosis
Diurticos y antihipertensivos
Moduladores inmunes:
Estimulantes de las clulas T
Activador de clulas B
Agentes antivirales, anticancergenos,
antitumorales, antiinflamatorios
Tratamiento de infecciones
Vacunas:
Prevencin de infeccin
Hepatitis B
Sarampin
Clera
Rabia
Sida (no en el mercado, slo en experimentacin)
Antcuerpos monoclonales:
Protenas especficas que
reconocen y se fijan a un solo
antgeno
Tratamiento de cncer, deshacerse
de sustancias qumicas txicas de
las clulas tumorales
Tratamiento de enfermedades
cardacas: destruir cogulos de
sangre catalizados por plaquetas
Diagnstico clnico: embarazo y
enfermedades humanas y animales
No todos los productos estn en el mercado
Los procesos microbianos sobre
superficies tambin ofrecen oportunidades
por sus efectos industriales y ambientales
positivos:
Bioremediacin en sitios con
residuos peligrosos
Biofiltracin industrial del agua
Biobarreras para proteger el suelo
y las aguas subterrneas de
contaminacin.
La ubicuidad y el
significado del
fenmeno biofilm es
confirmado por el
inters de industrias:
Petrleo
Especialidades
qumicas
Minas
Agua para bebida
Productos de limpieza
Empresas de servicios
pblicos
Biorremediacin:
Aplicacin industrial de la biotecnologa
ambiental:
Biodegradacin: Microorganismos para la
degradacin de sustancias qumicas de
desecho txicas o indeseables,
xenobiticas no recalcitrantes
Futuro: microorganismos modificados
genticamente para degradar
recalcitrantes
Mtodos de tratamiento de
aguas residuales antes de su
eliminacin o reutilizacin
Tratamientos
anaerobios
Se utilizan para:
Estabilizacin de lodos
Desperdicios slidos en
vertederos
Tratamiento de agua
industriales y domsticas con
alta DBO
Proceso:
Requiere de interacciones sinrgicas
entre cuatro grupos microbianos:
I. Bacterias hidrolticas
II. Bacterias fermentadoras
III. Bacterias acetognicas
IV. Bacterias metanognicas

Acetognesis:bacterias acetognicas
ACIDOS GRASOS DE CADENA LARGA
Propinico, butrico .(voltiles); alcoholes, compuestos aromticos (benzoato)
Metanognicas:
Bacterias
metanognicas
reductoras (auttrofos)
Hidlisis por exoenzimas de:
bacterias fermentativas, Protozoos,
levaduras y mohos
COMPUESTOS ORGNICOS SIMPLES
Azcares, aminocidos, pptidos
Acidognesis por exoenzimas de:
bacterias fermentativas
H
2,
CO
2
cido actico
(Acetato)
CO
2
CO
2

CH
4

Metanognicas:
Bacterias
metanognicas
acetognicas
COMPUESTOS ORGNICOS COMPLEJOS
Protenas, carbohidratos y lpidos
Digestores anaerobios
Lquido
Lquido
CH
4
, CO
2

Influente
Efluente
Filtro
Gas
Factores que controlan
digestin anaerobia
1. Temperatura
2. Tiempo de retencin hidroltica (TRH o HRT,
hydrolic retention time)
3. pH
4. Composicin del desperdicio
5. Competencia con bacterias productoras de
sulfuro (respiradoras de azufre).
6. Txicos (oxgeno, amonaco, solventes clorinados,
benceno, formaldehdo, cidos voltiles, etc.)
Ventajas:
1. No requiere oxgeno.
2. Menos energa invertida en el proceso.
3. Produce metano.
4. Produce de 3-20 veces menos lodos que
tratamiento aerobio (20-150 vs. 400-600 kg
biomasa/m
3
DQO).
5. Eficiente a elevadas cargas de DBO.
6. Preservacin de actividad aun cuando el
sistema no operare por largos perodos de
tiempo.
7. Remocin de hidrocarburos clorinados,
co-metabolismo, etc.
Desventajas:
1. Ms lento que tratamiento aerobio
(requiere > tiempos de contacto o sea >
tiempos de retencin hidrulica).
2. Ms sensitivo a choques txicos.
3. Requiere mayor tiempo de aclimatacin.
Tratamientos Biolgicos
Aerobios
Gran parte de la materia
orgnica disuelta se
mineraliza a CO2, H2O y
biomasa (slidos que
pueden ser removidos)
Tratamiento de aguas residuales:
Trata. 1rio + Trata. 2rio = Remocin 80-90% DBO
Posterior a un tratamiento de sedimentacin
primaria

los desperdicios que contienen materia orgnica
disuelta son transferidos a un tanque aireado
mecnicamente

Durante este proceso, las poblaciones
heterotrficas se desarrollan vigorosamente y
predominan en el tanque.
Tipos de tratamientos aerobios:
1. Crecimiento
suspendido
Lagunas de
oxidacin
(disperso)
Lodos activados
(agregados)
2. Biopelculas
Filtros de goteo (Zooglea
ramigera)
Biodiscos (Filtros RBC):
(Sphaerotilus, Beggiatoa,
Nocardia, Oscillatoria,
Desulfovibrio)
Filtros aerobios sumergidos
Reactores de lecho
fluidizado