Microorganismos con utilidad

en la agricultura y medio
ambiente
MICROBIOLOGA AMBIENTAL
INGENIERA AMBIENTAL IV CICLO
UPT
Blga. Claudia Clavijo Koc

Agroecologa

La agroecologa son tcnicas agrcolas

que no utilizan insumos qumicos, las
prcticas agroecolgicas certifica
productos orgnicos los cuales son
vendidos a mayor precio y mercados
especficos (Europeos y
Norteamericanos)
Sin embargo los lmites permisibles de
pesticidas y la disminucin de la
produccin por el uso de agroqumicos
est incrementando el uso de estas
tcnicas en muchos agricultores.

Las principales tcnicas es utilizar

insumos orgnicos como el compost,
humus, extractos vegetales etc, aunque
el uso artesanal de estos insumos no
resulta rentable para el agricultor.
Por esta razn se est trabajando e
investigando en insectos y
microorganismos capaces de controlar
plagas e incrementar los nutrientes en el
suelo como el nitrgeno y el fsforo, as
como hormonas vegetales.

Bacterias Fijadoras de
Nitrgeno

El nitrgeno es el principal insumo qumico

utilizado por los agricultores, tenemos el
nitrato de amonio que lo utilizan para fertilizar
todo tipo de cultivos.
Un suelo rico en microorganismos ayuda a
que el nitrgeno se encuentre en estado de
nitrato o de amonio los cuales son asimilables
por las plantas.
As mismo hay bacterias especializadas en
romper la molcula de nitrgeno atmosfrico
(poseen el gen de la nitrogenasa), para
convertir en amonio y de esa manera ser
utilizada por las plantas.
N2 +8H+ +8e-

2NH3 + H2

Bacterias fijadoras de nitrgeno

simbiticas

RIZOBIOS: Son bacterias bacilar

gramnegativa no esporulada,
Los rizobios (del idioma griego riza = raz
y bios = vida, singular rhizobium,
plural rhizobia) son bacterias del perfil
de suelo que fijan
nitrgeno diazotrfico despus de haberse
establecido endosimbiticamente dentro
de ndulos radiculares de las leguminosas
(Fabaceae). Los rizobios no pueden
independientemente fijar nitrgeno
atmosfrico: requieren una planta hospedante
Hasta la fecha se han propuesto 6 gneros,
que
son: Allorhizobium, Azorhizobium, Bradyrhizo
bium, Mesorhizobium, Rhizobium y

Taxonoma de los Rhizobios

Beijerinck en1888 obtuvo

el primer cultivo bacteriano
puro de un ndulo de raiz
de leguminosa y lo
llam Bacillus radicicola.
Frank propuso el
nombre Rhizobium y en
1929 ya se haban
reconocido seis
especies: R.
leguminosarum, R.
trifolii, R. phaseoli, R.
meliloti, R. japonicum y R.
lupini.

TAXONOMA DE
RHIZOBIUM

En esta clasificacin, cada especie se

compona de cepas que compartan un
grupo de leguminosas husped.
En 1944 Wilson report un gran nmero de
nodulaciones que cruzaban las fronteras de
las diferentes especies.
En 1964 Graham y en 1968 Moffett y
Golwell sugirieron revisar la taxonoma
basndose en resultados de la taxonoma
numrica.

Taxonoma de los Rhizobios

En 1974, Jordan y Allen dividieron estas

especies en dos grupos de acuerdo con
sus tasas de crecimiento, flagelos y
reacciones cido/alcalinas en medio YMA.
Adems de estas seis especies, se incluy
un grupo miscelneo
designadoRhizobium spp.
La taxonoma actual de los rizobios se basa
en un enfoque polifsico que incluye
morfologa, bioqumica, fisiologa, gentica
y filogenia.

TAXONOMA DE
RHIZOBIUM

El anlisis de secuencias de los genes 16S rRNA

se ha convertido en las principales herramientas de
clasificacin.
Las relaciones filogenticas inferidas del parecido
de las secuencias de genes de 16S rRNA tambin
constituyen la base principal para la descripcin de
los diferentes gneros de rhizobios
El uso de tcnicas moleculares ha provisto de una
descripcin ms precisa para las especies.

Secuenciamiento del Gen 16S

RNA

rbol filogentico

El proceso de nodulacin

Reconocimiento de la combinacin
adecuada de organismos, tanto por
parte de la planta como de la
bacteria, y adherencia de la bacteria
a los pelos radicales.
2. Invasin del pelo radical y
formacin de un canal (o hilo) de
infeccin
3. Desplazamiento de las bacterias
hacia la raz principal a travs del
canal de infeccin.
4. Diferenciacin de las bacterias en
un nuevo tipo al que se le llama
bacteroides, dentro de las clulas de
la planta, y desarrollo del estado de
fijacin de nitrgeno.
5. Divisin de las clulas bacterianas
y vegetales y formacin del ndulo
radical maduro.

Cianobacterias

Bacterias que
realizan fotosntesis
y fijacin de
nitrgeno.
Azolla anabaena,
en simbiosis con
helechos,
proporciona hasta
50 kg de
nitrgeno/ha siendo
la utilizacin de este
sistema fijador
general en muchas
regiones del sudeste

Frankia

Es una bacteria filamentosa o actinomiceto,

fijadora de nitrgeno, que cuando vive en
asociacin con ciertas plantas, induce en sus
races la formacin de ndulos fijadores de
nitrgeno.
La simbiosis formada por la
bacteria Frankia y el ndulo radical de la
planta se conoce con el trmino de
actinorriza.
Las plantas actinorrzicas son arbustos o
rboles que habitan muy diversos
ecosistemas.
Se adaptan a condiciones ambientales
extremas como suelos salinos, terrenos
pantanosos y ambientes polares.
Estas plantas son de rpido crecimiento y
una gran capacidad de crecer en suelos de
baja fertilidad o despus de algn disturbio
(como erupciones volcnicas e incendios).
Son frecuentemente las pioneras en el
desarrollo de la sucesin de la comunidad
vegetal

Esquema de raz lateral de una planta actinorrzica con

races protoides o agrupadas, con muchos pelos, que les
permiten capturar nutrientes.

Microorganismos No simbiticos
fijadores de Nitrgeno
Son bacterias que viven en el entorno de las
races llamado rhizsfera.
Estos microorganismos tambin son
conocidos como diazotrficos de vida libre.
Anaerobios: Clostridium spp, bacterias
sulfato reductoras son importantes en los
sedimentos ocenicos, y algunos
metangenos, fijan el nitrgeno en los lodos
y los intestinos de animales.

Anaerobios facultativos: Enterobacterias, Bacillus

spp.
Aerobios: Azotobacter, Sphyngomonas,
Novosphingobium, Azospirillum, Beijerinkia.
Bacterias fotosintticas oxignica : Anabaena
cylindrica y Nostoc commune.
Bacterias fotosintticas anoxignicas :Rhodobacter
spp.

Azotobacter
Es una bacteria cocoide,
gramnegativa no esporulada,
con motilidad y con la
capacidad de formar quistes.
Pueden producir grandes
cantidades de baba capsular.
Tiene una tasa respiratoria
efectiva y rpida a nivel
superficial.
Se utilizan en la produccin
de alginatos .
Especies de Azotobacter: A.
vinelandi, A. crococoom,
A.nigricans, A. paspali, A.
beijerinckii, A. armeniacus, A.

Azospirillum
Son mas abundantes en las
regiones tropicales, tambin se les
encuentra en las regiones
templadas, fras y desrticas.
El pH neutro del suelo juega un
papel importante en la presencia de
las especies del
gnero Azospirillum.
Azospirillum tiene la capacidad de
producir auxinas, citocininas y
giberelinas, es utilizado como
bioestimulante del crecimiento de
las plantas.
Especies de Azospirillum:
Azospirillum amazonense,
Azospirillum
braziliensis, Azospirillum
halopraeferans, Azospirillum
irakense y Azospirillum lipoferum,
especie candidata Azospirillum
doebereinerae

MICROORGANISMOS
NITRIFICANTE
Son microorganismos que utilizan el
in amonio para convertirlo en nitrito y
posteriormente en nitrato.
La nitrificacin ayuda a reducir la
volatilizacin y la desnitrificacin.
Este tipo de microorganismos no son
simbiontes.

Microorganismo solubilizadores
de fsforo

Son microorganismos que tienen la capacidad de

solubilizar el fsforo en el suelo.
En el suelo existe gran cantidad de fsforo pero no
en estado soluble (este mineral se encuentra en
forma de fosfato tricalcico y diclcico).
El pH cido del suelo dificulta la solubilizacin de
este suelo.
Existen bacterias y hongos capaces de solubilizar el
fsforo.
Las principales bacterias son: Pseudomonas,
Rhizobium, Burkholderia,Achromobacter,
Agrobacterium, Aereobacter, Flavobacterium,
Yarowia, Streptosporangium, Bacillus y Erwinia.
Los hongos solubilizadoras de fsforo son las
Micorrizas ( ecto micorriza y endomicorrizas).

Micorrizas

Qu es una micorriza?
Son asociaciones entre
ciertos hongos beneficiosos
del suelo y la inmensa
mayora de las plantas. El
hongo entra dentro de las
races sin daarlas, y ayuda
a la planta a tomar
alimentos y agua, y a que
crezca ms sana. La planta
micorrizada es capaz de
resistir mejor condiciones
ambientales adversas
(sequa, salinidad, plagas)

Tipos de Micorrizas
Ectomicorrizas.
Endomicorrizas
VA.
Micorrizas
arbutoide.
Micorrizas
ericoides.
Micorrizas
orquideoides

Microorganismos controladores
de plagas y enfermedades
En la naturaleza existe un equilibrio entre
la fauna benfica y las plagas, entre ellos
muchos microorganismos estn
controlando las plagas y las
enfermedades en los cultivos.
El cambio climtico, el mono cultivo y el
uso de plaguicidas e insecticidas est
causando que las plagas y enfermedades
sean cada vez ms resistentes.
Existen sobre todo hongos y bacterias
capaces de controlar plagas y
enfermedades en las plantas.

Hongos Entomopatgenos y
nematicidas

Son hongos que atacan a

plagas de insectos y
nemtodes la accin se
realiza:
Adhesin de la espora a la
cutcula del artrpodo
Germinacin de la espora
Penetracin va tubo
germinativo de la espora
Desarrollo del hongo
dentro del cuerpo del
artrpodo

Los hongos ms conocidos

son Bauveria bassiana,
Paecilomyces lilacinus,
Verticillium lecanii y
Metarhizium anisopliae

Bacterias entomopatgenas

La bacteria ms conocida es Bacillus thuringensis, esta

bacteria al esporular forma un txina Cry que es txica para
la mayora de los insectos en estado de larvas.
Las clulas del Bacillus thuringiensis se adhieran a las
hojas de las plantas al alimentarse el gusano va a ingerir la
bacteria, una vez dentro se va a alojar en el intestino
produciendo una toxina que origina una parlisis intestinal,
esto hace que el gusano deje de alimentarse, quedando
debilitado; al final la bacteria invade el hemocele (donde se
almacenan las reservas alimenticias) desde el intestino
produciendo una septicemia letal. Al morir se vuelven de
colores oscuros, consistencia blanda y con los tejidos
internos transformados en una masa viscosa.
Esta bacteria es la ms comercializada como alternativa a los
plaguicidas qumicos.

Bacteria y Hongo
antagonistas

Los hongos antagonistas compiten

contra hongos patgenos que causan
enfermedades en las plantas,
especialmente en las races, el
antagonismo puede ser por la
produccin de sustancias txicas o por
competencia.
Algunas especies de hongos
antagonistas son Trichoderma
harzianum es eficaz contra
Rhizoctonia solani, Sclerotium rolfsii y
Sclerotium cepivorum
La bacteria Bacillus subtilis y
Pseudomona fluorescens contra
Fusarium oxysporium, f. s. lycopersici,
Pythium ultimun, R. solani, Phytophtora
nicotianae, Fusarium moniliforme ,
Fusariun solani, Alternaria porri

La Biorremediacin
Es el proceso utilizado por el hombre para
detoxificar variados contaminantes en los
diferentes ambientes mares, estuarios,
lagos, ros y suelos usando de forma
estratgica microorganismos, plantas o
enzimas de estos.
Esta tcnica es utilizada para disminuir la
contaminacin por los hidrocarburos de
petrleo y sus derivados, metales pesados e
insecticidas; adems se usa para el
tratamiento de aguas domsticas e
industriales, aguas procesadas y de
consumo humano, aire y gases de desecho.

MTODOS DE
BIORREMEDIACIN

BIOESTIMULACIN: como su nombre

lo indica, consiste en estimular los
microorganismos nativos del suelo
adicionando nutrientes como nitrgeno o
fsforo.
BIOAIREACIN: es una forma de
estimulacin realizada con gases,
como por ejemplo oxgeno y metano,
estos son adicionados de forma pasiva
en el suelo para estimular la actividad
microbiana.

MTODOS DE
BIORREMEDIACIN
BIOAUMENTACIN: es la inoculacin de una alta
concentracin de microorganismos en el suelo
contaminado para facilitar la biodegradacin. Como se
van a inocular, estos microorganismos deben ser
seleccionados del suelo que se desea tratar.
COMPOSTAJE: esta estrategia de biorremediacin
utiliza microorganismos aerbicos y termflos,
formando pilas de material que deben ser mezcladas y
humedecidas peridicamente para promover la
actividad microbiana.
FITORREMEDIACIN: es el uso de plantas para
remover, contener o transformar un contaminante.
Esta puede ser directa, donde las plantas actan sobre
el compuesto, o indirecta, donde estas se utilizan para
estimular microorganismos en la rizosfera.

Bacterias Biorremediadoras
Existen contaminantes qumicos de
agua y suelo, proveniente de fuentes
naturales y por accin de la industria.
Los contaminantes ms comunes son
metales pesados, insecticidas y
derrames de petrleo .

Biorremdiacin del Agua

contaminada con Arsnico

El arsnico es un metaloide que se encuentra contaminando

las aguas especialmente de la zona sur del Per, su origen
es volcnico, los niveles permisibles del As es de 0,1 ppm.
Existen microorganismos capaces de crecer a elevadas
concentraciones de As.
Existen estudios de bacterias que han cambiado el radical
fosfato por el arsenato en la molcula de DNA.
Existen diversas especies con la capacidad remediadora de
las bacterias, entre ellas encontramos a las cianobacterias y
otras cmo Pseudomonas spp.
Hay reportes de la conversin de As 3 a As 5, siendo este
ltimo menos txico.
De igual manera se ha disminuido la concentracin del
mineral en el agua y suelos.

Biorremocin del Cianuro

El cianuro es una molcula utilizada para

la extraccin del oro.
El cianuro contamina agua y suelos y es
altamente txico para animales plantas y
las personas.
El cianuro est compuesto por Carbono
y Nitrgeno.
Las bacterias capaces de degradar el
cianuro son del gnero Pseudomonas,
utilizando el carbono y el nitrgeno en
sus vas metablicas.
Existen casos exitosos del uso de estas
bacterias para descontaminar aguas con
cianuro, volvndolas aptas para la vida
animal y humana.

Biorremediacin de petrleo

Una de las
contaminaciones ms
peligrosas son los
derrames de petrleo, este
compuesto es el resultado
de la degradacin
anaerbica de materia
orgnica, durante largos
perodos de tiempo y bajo
condiciones de alta
temperatura y presin, que
la convierte en gas natural,
crudo y derivados del
petrleo.

Diversidad microbiana en suelos

contaminados

Los suelos contaminados contienen gran

cantidad de microorganismos que pueden
incluir un nmero de bacterias y hongos
capaces de utilizar hidrocarburos, que
representan un uno por ciento (1%) de la
poblacin total de aproximadamente 104 a
10 clulas por gramo de suelo.
Tambin, se han encontrado cianobacterias y
algas capaces de degradar hidrocarburos.
Los suelos contaminados con hidrocarburos
contienen ms microorganismos que los
suelos no contaminados, pero su diversidad
microbiana es ms reducida.

Biorremediacin de suelos
contaminados con plaguicidas
La mayora de suelos estn
contaminados con pesticidas
organoclorados y organofosforados,
muchos de ellos contienen en su
estructura el benzeno.
Existen microorganismos capaces de
degradar estos compuestos, una de
las especies son Sphingomonas
yanocuyae, Novosphingobium spp,
Sphingobium spp, entre otras
bacterias

MICROORGANISMOS
ASOCIADOS A LA
DEGRADACIN DE
PETRLEO

EFECTO DE MICROORGANISMOS EN
SUELOS CONTAMINADOS CON PETRLEO

Contaminacin con
hidrocarburos en mares costeros

Microorganismos
biorremediadores aislados del
mar
Se han aislado a partir del medio ambiente
marino distintos microorganismos capaces
de degradar hidrocarburos. Algunos de ellos
utilizan hidrocarburos en forma casi
exclusiva, por ejemplo los gneros
bacterianos Alcanivorax, Cycloclasticus,
Cobetia, Halomonas, Oleispira, Vibrio,
Pseudomonas putida, Cobetia sp, Citreicella,
Bacillus, Lutibacterium ceanisphaera,
Pseudomonas plecoglossicida,
Brachybacterium, Brevibacterium,
Marinobacter, Marinomonas,Salinibacterium,
Nocardioides, Sporosarcina,
Pseudoalteromonas, Psychrobacter,

Medidas de la efectividad de la
Biorremediacin.

Se deben considerar los siguientes aspectos:

1. Cambios cualitativos en la composicin de
los hidrocarburos que son indicativos de
procesos biolgicos. Se realiza la
cromatografa gaseosa, teniendo en cuenta
los procesos de los factores ambientales
(fotlisis, disolucin fsica, lavado qumico,
volatilidad, etc.) que pueden contribuir a la
desaparicin del petrleo.
2. Los grupos indicadores de la degradacin
son los hidrocarburos aromticos
seleccionados ya que s estos se degradan,

3. Disminucin del porcentaje de la masa de

petrleo que son tambin indicativos de
procesos biolgicos.
4. Reduccin del peso total del petrleo,
determinando la prdida de peso en las
distintas fracciones de hidrocarburos del
petrleo.
5. La medicin del nmero de microorganismos
degradadores de petrleo es un indicador
inicial de la factibilidad de la biorremediacin.
6. Estudio de la mineralizacin (mediciones de la
produccin de CO2 total).
7. Efecto de la accin del nitrgeno

Landfarming
La tcnica ms usada para la biorremediacin
de los lodos contaminados con hidrocarburos y
de otros desechos de la industria petrolera es
la denominada landfarming.
Se realiza trasladando los contaminantes a un
suelo no contaminado, el cual ha sido
preparado con anterioridad para evitar su
contaminacin y la de las aguas subterrneas
con sustancias que puedan producirse durante
el tratamiento.
Para ello se efecta el diseo del lugar donde
se depositan los contaminantes, aislando el
material de tratamiento del rea no
contaminada con una tela impermeable.

Para empezar el procedimiento, se

hace una bsqueda y seleccin de
bacterias nativas aisladas de las
muestras de suelos que se
encuentran contaminados, ya que
estas tienen la capacidad catablica
para crecer bajo las condiciones
fsico-qumicas y de estrs a las que
estn sometidas, y tendrn un mejor
desempeo a la hora de la
biorremediacin.

Estudio de microorganismos y
aislamiento de microorganismos
cultivables.

Produccin de biomasa de
microorganismos

Seleccionar a los microorganismos

que realicen el proceso mas
eficientemente.
Evaluar los parmetros para
producir biomasa bacteriana
Optimizar los parmetros.
Producir gran cantidad de
microorganismos en biorreactores a
gran escala.
Determinar los parmetros para
poder realizar los procesos de
biorremediacin u otro
procedimiento (biofertilizacin o
biolixiviacin).