Universidad del Zulia

Facultad de Medicina
Escuela de Medicina - Ctedra de Bioqumica
Centro de Investigaciones Endocrino - Metablicas

ENZIMAS
BASES MOLECULARES DE SU
MECANISMO DE ACCIN

Dr. Valmore Bermdez Pirela, MD, MgSc, MPH, PhD

Algo de Historia sobre las Enzimas

Queso, Pan y Vino

Que tienen en comn?

lustracin sobre el queso

en el Tacuinum Sanitatis,
libro rabe del siglo XI que
describe los beneficios de
hierbas y alimentos

Escenas de elaboracin de
pan en la Tumba de
Ramss III. Valle de los
Reyes. Egipto.

Elaboracin del vino en el

Antiguo Egipto. Tumba de
Najt, en el Valle de los
nobles.

Pan, Queso y vino: Que tienen

en comn?
Pan y vino:
Fermentacin Alcohlica
Saccharomyces cerevisiae

Queso:
Fermentacin Lctica
Lactococcus, Lactobacillus o
Streptococcus. Propionibacter shermanii

Historia: Experimentos sobre la digestin

Estudios de Ren-Antoine Ferchault de Raumur sobre la actividad de
los jugos digestivos
El fsico francs Ren-Antoine Ferchault de Raumur tena curiosidad
por lo que ocurra con los alimentos cuando descendan por el tubo
digestivo. Para saberlo, aliment a un cuervo con trozos de comida en
una cpsula de metal pinchada y cerrada. Como el ave excret una
cpsula vaca, Raumur se dio cuenta que el alimento en el tubo
digestivo no se procesa mecnicamente, sino que es disuelto por una
determinada sustancia.

Lzzaro Spallanzani Investig el proceso de digestin mediante

experimentos realizados en su propio cuerpo que casi le cuestan la
vida.
Basndose en los resultados obtenidos con animales, del francs
Raumur, Spallanzani ingiri esponjas y pequeas bolsitas de tela
rellenas de pan o carne. Al cabo de una horas vomit y analiz el
contenido del estmago: los alimentos se haban disgregado a pesar
de no haber estado en contacto con las paredes del estmago. dedujo
que la sustancia digestiva en la digestin era el jugo gstrico.
Utilizando el recogido por las esponjas, demostr que el alimento se
desintegra de la misma manera fuera del cuerpo.

LOS FERMENTOS

Louis Pasteur

Justus von Liebig

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Qu es una enzima?

Las enzimas son compuestos qumicos orgnicos

de naturaleza proteica que aceleran la velocidad
de una reaccin qumica termodinmicamente
posible.

Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Qu significa este concepto?

Las enzimas aceleran la velocidad de una
reaccin qumica por que se comportan como
catalizadores orgnicos (biocatalizadores). La
catlisis es el proceso mediante el cual se acelera
la velocidad de una reaccin qumica.
Cuando se hace referencia a que la reaccin debe
ser termodinmicamente posible, se destaca el
hecho que en el sistema donde ocurre la reaccin
qumica existe suficiente energa til (energa de
activacin) para realizar el trabajo que implica
convertir el sustrato en producto.
Dr. Valmore Bermdez Pirela

El DOGMA CENTRAL DE LA ENZIMOLOGA

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Qu es la termodinmica?
La termodinmica es la rama de la fsica que
estudia los fenmenos energticos y los
intercambios de energa entre la materia.
La termodinmica naci como consecuencia del
estudio de las mquinas de vapor, pero durante el
siglo 20 se observ que poda aplicarse a los
sistemas orgnicos.

Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Qu significa energa til suficiente

dentro del sistema para realizar un
trabajo?
S

Estado inicial

Estado final

Si dejamos caer una bola,

evidentemente ir hacia abajo sin
ninguna ayuda. El trabajo en este
sistema, est representado por el
movimiento que hace la bola desde el
estado inicial (S) hasta el estado final
(P). Para realizar este trabajo, hace
falta cierta cantidad de energa til
dentro del sistema. Ntese que en ste
sistema hay suficiente energa til que
permite la caida de la bola.
La energa til en este sistema est
representada por la energa gravitatoria
que ejerce una atraccin de la bola
hacia abajo.

Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Qu pasara si saliramos al espacio,

fuera de la atraccin gravitatoria de la
tierra?
S
Estado inicial

P
Estado final

Evidentemente, la bola no caera.No existe suficiente energa til en

el sistema en forma de energa gravitatoria para realizar el trabajo, es
decir, que la bola caiga hacia la tierra (la bola esta fuera del campo
gravitarorio de la tierra).

Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Si hay suficiente
sistema.

Estado inicial

energa

en

el

Se dice que la reaccin acontecer de

forma espontnea.
Es decir, que S se convertir en P sin
ninguna otra ayuda que la energa til
del sistema.

Caida espontnea

Estado final

Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Consideremos ahora el caso inverso

Estado final

Estado inicial

Habr energa suficiente en el sistema

Para que se realice el trabajo que se
plantea en la grfica?
Es decir, que la bola suba
espontneamente hacia la mano?

Evidentemente, NO
No hay energa libre suficiente, en forma
de energa ANTI-gravitatoria para hacer
que la bola suba hasta la mano
espontneamente.
Esto quiere decir, que esta reaccin en
este sistema, es una reaccin irreversible.

Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

En conclusin:
Una reaccin es termodinmicamente posible cuando
hay suficiente energa libre ( til) para realizarla.
Cuando la reaccin es termodinmicamente posible, est
implcito el hecho que esta reaccin ser espontnea.

Si en el sistema no hay suficiente energa til despus de

la conversin del sustrato a producto, la reaccin ser
irreversible.

Si en el sistema hay suficiente energa til, la reaccin

puede ser reversible, es decir, que el producto puede
volverse a convertir en sustrato.

P
Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Volvamos a la termodinmica:
Las leyes.
Primera ley de la termodinmica o ley de la
conservacin de la energa:
La energa no se crea ni se destruye solo se transforma
(de una forma de energa a otra)

Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Primera ley de la termodinmica o ley de la

conservacin de la energa:
La energa no se crea ni se destruye solo se transforma
(de una forma de energa a otra)
Esta ley presenta de forma implcita dos ideas:
1. Si la energa nunca se cre y no puede ni destruirse ni acabarse, se deduce
que la cantidad de energa total del universo es constante. Esto quiere
decir, que el contenido energtico del universo no ha cambiado desde que
fue creado (desde el Big Bang) hasta nuestros das, esto es, desde hace
unos 15.000.000.000 de aos.
2. A pesar que el contenido energtico del universo es constante, entre un
momento y otro acontecen transformaciones de una forma de energa a
otra. Para mantener estable la energa total, se supone que durante las
transformaciones de una forma a otra de energa, algunas aumentarn, lo
que ser compensado con la disminucin de otras formas de energa.

Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

La energa no se crea ni se destruye(siempre ha sido y

ser la misma cantidad)
Esquemticamente este proceso puede representarse de la siguiente manera:
Obsrvese que la cantidad de energa total
en el universo antes y despus de mucho tiempo, es la misma

15.000.000.000 de aos

Contenido energtico
total del universo
en el momento de
su creacin

Contenido energtico
total del universo
en la actualidad
Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Solo se transforma.en otras formas energticas

manteniendo el contenido total inalterable..
Esquemticamente este proceso puede representarse de la siguiente manera:
Obsrvese que la cantidad de energa total
en el universo antes y despus de mucho tiempo, es la misma

25 %
potencial
50 %
lumnica

25 %
cintica

15.000.000.000 de aos
20 %
lumnica
50 %
calrica

20 %
otras
20 %
calrica

Durante los primeros instantes

del universo, todo era luz y calor..
en esencia, solo energa calrica y lumnica

En la actualidad la distribucin y tipos de

energa son diferentes ( y ms diversos) a
las observadas al inicio de la creacin del
universo
Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Segunda ley de la termodinmica.

La entropa de todos los procesos del universo (y del
universo mismo) tiende siempre a incrementarse hasta
alcanzar el equilibrio, el cual representa el estado de
mximo desorden.
Esto quiere decir que cualquier sistema dentro del universo, e incluso, todo el
universo tiende a desordenarse espontneamente, buscando as el equilibrio.
El desorden se va incrementando en la medida que la energa til (que se
encarga de mantener organizado un sistema) va disminuyendo.
La cada de la energa til, tal como lo expresa la primera ley de termodinmica
es seguida por el incremento de otras formas energticas que no son tiles
para realizar un trabajo determinado en el sistema.
Si consideramos que el sistema usa la energa til para mantenerse
organizado, la disminucin de sta ocasionar desorden..Cuando el
desorden sea mximo se habr establecido el equlibrio. Por lo tanto, los
sistemas orgnicos estn adaptados para mantener la energa til en niveles
ptimos para mantenerse ORGANIZADOS
Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Segunda ley de la termodinmica.

La lucha del orden contra el desorden(donde
inevitablemente siempre gana el desorden)
El orden, implica alto grado de energa tilpero esta energa se utiliza para
mantenernos organizados. De esta forma, como la energa til tiende a
disminuir cuando se realiza el trabajo llamado organizarnos debemos
producir todos los das ms energa til para reponer la invertida.
Y as, la vida de cualquier ser vivo transcurre en una lucha contra la segunda
ley de termodinmica..Nos alimentamos para extraer de los alimentos la
energa potencial presente en los enlaces qumicos y guiarla hacia los enlaces
de alta energa del ATP.
Luego, al hidrolizar los enlaces de alta energa del ATP se liberan cantidades
inmensas de energa libre que pueden utilizarse para realizar un trabajo,
representado por las innumerables reacciones qumicas que requieren esa
energa para poder llevarse a cabo.

Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Segunda ley de la termodinmica.

La lucha del orden contra el desorden(donde
inevitablemente siempre gana el desorden, que en
nosotros recibe el nombre de muerte)
Lamentablemente, despus de algn tiempo de luchar contra la segunda ley,
todos los seres vivos experimentan la llamada muerte.
Todas las clulas se desorganizan: las membranas se rompen, las
mitocondrias y otros organelos se disgregan y todo el contenido celular se
combina con el entornoLos lpidos se peroxidan, las protenas se
hidrolizan a sus aminocidos y los carbohidratos se oxidan.se establece un
equlibrio entre el interior de la clula y su exterior. Este hecho es
extremadamente anmalo, pues lo que abunda dentro de la clula usualmente
es escaso en el medio ambiente.
La salud implica alto grado de orden y un gran desequilibrio con el medio
externo.
La muerte implica un alto grado de desorden y un equilibrio perfecto con el
medio. Ya no existe suficiente energa libre para mantener un alto grado de
organizacin.
Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

La vida y la muerte..Segn la termodinmica

Este proceso puede representarse esquemticamente de la siguiente manera:
alto
grado
de
energa
no utilizable

Bajo
grado
de
energa
no utilizable
Niez

30 - 40
aos
60
aos

Alto
grado
de
energa
til

La vida, implica un alto grado de orden

que solo puede lograrse con altas dosis
de energa til. Esta energa til debe
mantenerse estable en el tiempo. De esta
forma estamos adaptados para tener un
Metabolismo que genere altas cantidades
de energa til en forma de ATP.

70 80
aos
Muerte

La muerte implica el desorden mximo. El

individuo no puede transformar de forma
eficiente la energa que le ofrece Su entorno,
as que progresivamente acumula menos
energa til hasta un punto en el que no
puede mantenerse ordenado.
Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Bases termodinmicas del mecanismo de accin

de las enzimas
Para que un sustrato A se transforme en el producto B debe existir cierta
cantidad de energa libre (til) en el sistema que se pueda realizar este trabajo
qumico:

A
Alta cantidad
de energa
libre

B
Baja cantidad
de energa
libre

y todos los procesos qumicos transcurren desde un punto de alta energa libre
hasta uno de baja energa libre. Obsrvese como la flecha, que indica el
sentido de la reaccin, tiene un solo sentidoEsto es, que la reaccin es
irreversible. El compuesto B no puede tranformarse en el compuesto A porque
hay muy poca energa libre para realizar este trabajo.
Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Bases termodinmicas del mecanismo de accin

de las enzimas
Ntese tambin que la conversin de A en B es un proceso espontneo,
debido a que la cantidad de energa libre es suficiente para realizar los
cambios qumicos que caracterizan la reaccin. Al final puede apreciarse una
cada en la energa libre. Como la energa libre no se pierde, es obvio que se
ha transformado en otras formas energticas, quiz potencial dentro de la
molcula B

100
Alta cantidad
de energa
libre

Baja cantidad
de energa
libre

0
No hace falta aadir calor al sistema, ni ninguna otra forma de energa
Pero el hecho de que ocurra la reaccin, no nos da informacin alguna de la
velocidad con la que sta acontece.
En los seres vivos es importante que muchas reacciones ocurran
adecuadamente..pero tambin es importante que ocurran rpidamente.
Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Cmo podemos aumentar la velocidad de una

reaccin qumica?
En lneas generales se puede aumentar la velocidad de la reaccin de dos
maneras:
1. Incrementando la cantidad de energa libre para realizar el trabajo, hecho
que incrementa la pendiente entre el estado inicial y el final. Esto puede
hacerse con calor.

A
500
Incremento en
la cantidad
de energa
libre

Mayor velocidad
por incremento de
la pendiente (vase la pendiente
en la diapositiva anterior)
Baja cantidad
de energa
libre
0
Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Cmo podemos aumentar la velocidad de una

reaccin qumica?
En lneas generales se puede aumentar la velocidad de la reaccin de dos
maneras:
2. Manteniendo la cantidad de energa til constante, la nica manera de
aumentar la velocidad de la reaccin es utilizando de forma ms eficiente la
energa til del sistema. Esto puede hacerse gracias al uso de una ENZIMA

A
100

ENZIMA
Alta cantidad
de energa
libre

Baja cantidad
de energa
libre
0

Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Cmo una enzima puede optimizar el uso de la energa

libre en el sistema para as aumentar la velocidad de una
reaccin?.... Considere estos dos sistemas
Cantidad de
Energa til: 100 Kcal

Cantidad de
Energa til: 100 Kcal

A
Sistema 1

Sistema 2

B
Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

En ambos sistemas, la cantidad de energa til para realizar el trabajo

es la misma. Sin embargo, es obvio que el individuo del sistema 1
emplear menos energa que el individuo del sistema 2 para realizar el
trabajo.
Cantidad de
Energa til: 100 Kcal
Energa utilizada para realizar
el trabajo: slo 10 Kcal.

Cantidad de
Energa til: 100 Kcal
Energa utilizada para realizar
el trabajo: 100

Kcal

A
Sistema 1

Sistema 2

B
Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

En ambos sistemas, la cantidad de energa til para realizar el trabajo

es la misma. Sin embargo, es obvio que el individuo del sistema 1
emplear menos energa que el individuo del sistema 2 para realizar el
trabajo.
Energa
til: 100 Kcal
Energa
utilizada: 100 Kcal
Total

100
100
0

Cantidad de
Energa til: 100 Kcal
Energa utilizada para realizar
el trabajo: 100

Kcal

Conclusin: solo se puede

Tirar una piedra con la
cantidad de energa
disponible

Sistema 2

B
Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

En ambos sistemas, la cantidad de energa til para realizar el trabajo es la

misma. Sin embargo, es obvio que el individuo del sistema 1 emplear menos
energa que el individuo del sistema 2 para realizar el trabajo.

Cantidad de
Energa til: 100 Kcal
Energa utilizada para realizar
el trabajo: 10

A
La palanca en este sistema
es equivalente a la enzima
en un sistema qumico. Un
elemento que permite el
ahorro energtico y el uso
del excedente para realizar
Ms trabajo

Sistema 1

Kcal

Energa
til: 100 Kcal
Energa
utilizada: 10 Kcal
Total

100
10
90

Conclusin: se pueden tirar nueve piedras

ms con la cantidad de energa sobrante

B B B B
B B B B B
Dr. Valmore Bermdez Pirela

Tres conceptos clave:

Energa libre o energa libre de
Gibbs:
Es la energa disponible en un
sistema para realizar un trabajo.
En el caso de las reacciones
qumicas es la energa
disponible para que un sustrato
se transforme en un producto.

Josiah Willard Gibbs

Dr. Valmore Bermdez Pirela

Tres conceptos clave:

Energa de activacin: es la
energa que necesita un sistema
antes de realizar un trabajo. Suele
utilizarse para denominar la
energa mnima necesaria para
que se produzca una reaccin
qumica dada.
En trminos qumicos es la
cantidad de energa necesaria
para llevar un mol de sustrato al
estado de transicin.
Svante August Arrhenius

Dr. Valmore Bermdez Pirela

Tres conceptos clave:

Estado de transicin: es el punto mximo de
contenido energtico til (energa libre) de una
reaccin qumica.
En este punto se asume que las especies reactantes
al colisionar conducirn siempre a la formacin de
productos.
Desde una ptica probabilstica es el momento donde
el sustrato tiene la mayor probabilidad de convertirse
en producto dada la alta cantidad de energa libre en
el sistema.

Dr. Valmore Bermdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIN Y MECANISMOS DE ACCIN

Las enzimas y la energa de activacin

Dr. Valmore Bermdez Pirela

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