Principios de aditividad y

contribuciones de grupo
Elide Viviana Cotugno Herreo
Interacciones y transformaciones fsicas
Departamento de Qumica
Facultad de Ciencias
Universidad Nacional de Colombia

4
Conclusiones.

Clculo de las capacidades calorfcas parciales molares de protenas desplegadas

en soluciones acuosas
Modelo de aditividad basado en un grupo de pptidos.
Determinacin de la capacidad calorfca parcial molar.

Determinacin
del volumen molar parcial de solutos inicos y no inicos en agua:

El volumen de Van Der Waals de iones y molculas

La contribucin de grupo

Enfoque del volumen intrnseco.

1
Introduccin

Contenido

1. Introduccin
Esquemas de aditividad de grupo:
Evaluacin de las propiedades termodinmicas: estructura molecular.
Explica: diferencias experimentales, interacciones intramoleculares de grupos funcionales
en la molculas.[2]
El principio de aditividad de grupo: cada grupo constituyente de una molcula interacta con
el disolvente circundante independientemente de grupos adyacentes.
La contribucin a la propiedad termodinmica de los grupos constituyentes es obtenida usando
datos termodinmicos de pequeos solutos que son utilizados para modelar la molcula de
inters[1].
compuestos modelo: tamao, rea superfcial, carga y la hidrofobicidad muy cercanas a la de
las fracciones de la molcula objetivo.

[1] G.R. Hedwig, H.-J. Hinz, Group additivity schemes for the calculation of the partial molar heat capacities and volumes of unfolded proteins in aqueous solution, Biophysical
Chemistry (2003), 100, 239-260.
3
[2]Lepori, L. and Gianni, P.: Partial molar volumes of ionic and nonionic organic solutes in water: A simple additivity scheme based on the intrinsic volume approach, J. Solution
Chem., 29, 405-447, 2000.

2. DETERMINACIN
DEL VOLUMEN MOLAR
PARCIAL DE SOLUTOS
INICOS Y NO INICOS
EN AGUA: el volumen
de van der Waals de
iones y molculas

El volumen de Van Der Waals Vw es el volumen contenido

dentro de una superfcie impenetrable por el solvente.
(calculado por el mtodo de Bondi el cual utiliza el radio de
van der Waals

rw [3]).

Para iones orgnicos rw no se afecta por la carga.

No se toman en cuenta puentes de hidrgeno.
[3] A. Bondi, J. Phys. Chem. 68, 441 (1964). [4] A. Bondi, J. Phys. Chem. 68, 441 (1964).[5] R. A.
Pierotti, Chem. Rev. 76, 717 (1976).]

DETERMINACIN DEL
VOLUMEN MOLAR
PARCIAL DE SOLUTOS
INICOS Y NO
INICOS EN AGUA: la
contribucin de grupo

Nuevo set de Vw :con in crementos de porciones de

hidrocarburos como CH3 fueron obtenidos a partir de Vw para
hidrocarburos.
Vw reproducible en +/- 0,2.
[2]Lepori, L. and Gianni, P.: Partial molar volumes of ionic and nonionic organic solutes in water: A
simple additivity scheme based on the intrinsic volume approach, J. Solution Chem., 29, 405-447,

DETERMINACIN DEL
VOLUMEN MOLAR
PARCIAL DE SOLUTOS
INICOS Y NO
INICOS EN AGUA:
enfoque del volumen
intrnseco.

[2]Lepori, L. and Gianni, P.: Partial molar volumes of ionic and nonionic organic solutes in water: A
simple additivity scheme based on the intrinsic volume approach, J. Solution Chem., 29, 405-447,

[2]Lepori, L. and Gianni, P.: Partial molar volumes of ionic and nonionic organic solutes in water: A simple additivity scheme based on the intrinsic volume
approach, J. Solution Chem., 29, 405-447, 2000

Propiedades termodinmicas a partir de contribuciones de

grupo de varios residuos de aminoacidos

CLCULO DE LAS
CAPACIDADES
CALORFICAS
PARCIALES MOLARES
DE PROTENAS
DESPLEGADAS EN
SOLUCIONES
ACUOSAS

Limitaciones:

protenas con aminocidos neutros

Solo funciona a 25C

Eleccin de compuesto modelo: (Gly)-X-(Gly) donde X es

uno de los 20 aminocidos.

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[1] G.R. Hedwig, H.-J. Hinz, Group additivity schemes for the calculation of the partial molar heat
capacities and volumes of unfolded proteins in aqueous solution, Biophysical Chemistry (2003), 100, 239-

CLCULO DE LAS
CAPACIDADES
CALORFICAS
PARCIALES MOLARES
DE PROTENAS
DESPLEGADAS EN
SOLUCIONES
ACUOSAS: modelo de
aditividad basado en
un grupo de pptidos.

La capacidad calorifca molar parcial de cualquier

cadena lateral R de la proteina esta dada por :

Interacciones con NH3+ o COO-.

Las capacidades calorfcas usando los valores
Cp20 de de los tetra pptidos GlyPheGlyGly y
GlyGlyAlaGly y de los pentapptidos
GlyGlyLeuGlyGly y GlyGlySerGlyGly son
idnticas
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[1] G.R. Hedwig, H.-J. Hinz, Group additivity schemes for the calculation of the partial molar heat
capacities and volumes of unfolded proteins in aqueous solution, Biophysical Chemistry (2003), 100, 239-

CLCULO DE LAS
CAPACIDADES
CALORFICAS
PARCIALES MOLARES
DE PROTENAS
DESPLEGADAS EN
SOLUCIONES
ACUOSAS: modelo de
aditividad basado en
un grupo de pptidos.

La capacidad calorfca del pptido principal, CHCONH, esta

dada por :

La contribucin a la capacidad calorifca de un polipeptido

en la forma de grupos terminales inicos esta dada por:

Teniendo la contribucin a la capacidad

calorfca de la cadena principal,del pptido
principal y de los grupos terminales se
reemplaza en la ecuacin 1 para obtener la
capacidad calorfca molar parcial de una
protena desplegada de secuencia desconocida.
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[1] G.R. Hedwig, H.-J. Hinz, Group additivity schemes for the calculation of the partial molar heat
capacities and volumes of unfolded proteins in aqueous solution, Biophysical Chemistry (2003), 100, 239-

CLCULO DE LAS
CAPACIDADES
CALORFICAS
PARCIALES MOLARES
DE PROTENAS
DESPLEGADAS EN
SOLUCIONES
ACUOSAS:
DETERMINACIN de la
capacidad calorfca
parcial molar.

La capacidad calorfca molar

parcial la cadena con cada uno
de los 20 aminocidos se
calculo por la ecuacin 2.

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[1] G.R. Hedwig, H.-J. Hinz, Group additivity schemes for the calculation of the partial molar heat
capacities and volumes of unfolded proteins in aqueous solution, Biophysical Chemistry (2003), 100, 239-

[1] G.R. Hedwig, H.-J. Hinz, Group additivity schemes for the calculation of the partial molar heat capacities and volumes of unfolded proteins in aqueous solution,
Biophysical Chemistry (2003), 100, 239-260.

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[1] G.R. Hedwig, H.-J. Hinz, Group additivity schemes for the calculation of the partial molar heat capacities and volumes of unfolded proteins in aqueous solution,
Biophysical Chemistry (2003), 100, 239-260.

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 La comparacin de los valores de las propiedades termodinmicas calculadas

por aditividad de grupo con los datos experimentales permite el
establecimiento de fallos en las bases del mtodo e indica la falta de mayores
aproximaciones o nuevas apreciaciones

Comparaciones entre distintos conjuntos de compuestos modelos permiten

inferir acerca de las interacciones intramoleculares del objetivo.

Para garantizar el mejor xito cuantitativo de un rgimen de aditividad de

grupo, es preferible elegir un compuesto modelo que refeje el tamao, el rea
de la superfcie, la carga y la hidrofobicidad del objetivo para las cuales las
propiedades termodinmicas han de ser evaluados

Conclusiones