Metabolismo

microbiano
Ingeniera Qumica
Microbiologa Industrial

Ral Domnguez
Lourdes Imas
Jessica Ortz
Santiago Peralta

01/09/2014

Introduccin
La vida se sostiene por el atrapamiento y uso de la energa, un
proceso que es posible gracias a la accin de las enzimas. Las
rutas metablicas pueden ser tratadas como una secuencia de
enzimas actuando como una unidad, en la que cada enzima
utiliza como sustrato un producto de la reaccin precedente.
Las clulas se desorganizan y mueren en ausencia de un control
adecuado del metabolismo, y la regulacin es tan importante
as como la obtencin y utilizacin eficiente de energa.
Gran parte de la energa obtenida por los microorganismos se
utiliza en biosntesis o anabolismo.
Una clula microbiana, debe fabricar diversos tipos de
molculas para satisfacer sus necesidades y con ello las
necesidades de organismos ms complejos dependientes de su
sistema.

Metabolismo

El metabolismo es el conjunto de reacciones

qumicas que tienen lugar en una clula, y puede
dividirse en catabolismo, reacciones de
degradacin de compuestos complejos, y
anabolismo, sntesis
de compuestos
complejos.

Metabolismo Microbiano
Conjunto de procesos por los cuales un
microorganismo obtiene la energa y los nutrientes
(carbono, por ejemplo) que necesita para vivir y
reproducirse
Los microorganismos utilizan numerosos tipos de
estrategias metablicas distintas y las especies
pueden a menudo distinguirse en base a estas
estrategias.
Las caractersticas metablicas especficas principal
criterio para determinar papel ecolgico y su
utilidad industrial.

Funciones del metabolismo Microbiano

1. Formar las subunidades que luego sern
utilizadas en la sntesis de macromolculas.
2. Proporcionar la energa necesaria para todos
aquellos procesos que la requieran como
transporte activo, movilidad, biosntesis, etc.
3. Propiciar
las
vas
reproductivas
del
microorganismo.
4. Continuar la cadena trfica fundamental de la
biologa posterior al metabolismo celular

Metabolismo Bacteriano
El metabolismo de las bacterias tiene muchos
procesos en comn con el metabolismo de las
clulas eucariotas, pero algunos procesos son
exclusivos del metabolismo bacteriano. Algunas
particularidades del metabolismo bacteriano
son:
1. El metabolismo de la bacteria est adaptado
para el crecimiento veloz y transcurre entre 10
y 100 veces ms rpido que en las clulas
humanas.

2. La bacteria tiene mayor versatilidad en cuanto al tipo

de nutrientes que puede utilizar para obtener energa.
3. No estn limitadas al slo uso del O2, pueden recurrir a
otros oxidantes.
4. Existe una gran diversidad de requerimientos
nutricionales entre bacterias debido a que ellas no
poseen todos los caminos biosintticos.
5. El cuerpo de los procariotas es muy sencillo, lo que le
permite sintetizar macromolculas por mecanismos
menos complicados que los que utilizan las clulas
eucariotas.
6. Algunos procesos biosintticos son nicos de las
bacterias, como los que conducen a la sntesis de
murena, cidos teicoicos y lipopolisacridos.

Energa y trabajo

Trabajo qumico de biosntesis.

Trabajo mecnico.
Trabajo de transporte.

Leyes de la termodinmica
La primera ley establece que la energa ni se crea
ni se destruye.
La segunda ley de la termodinmica establece
que los cambios tienen lugar de tal forma que la
aleatoriedad

Energa libre y reacciones

Cuando la variacin de la energa libre de un proceso se

determina en condiciones estndar meticulosamente
definidas de concentracin, presin, pH y temperatura,
recibe el nombre de variacin de la energa libre
estndar ()

Papel del ATP en el metabolismo

El ATP es una molcula de alta energa, se descompone
o hidroliza casi completamente en los productos ADP
(Adenosina Difosfato) y Pi (Fosfato inorgnico) con
una de -7,3 Kcal/mol.

Reacciones de oxidacin-reduccin y transportadores de electrones.

El de la reaccin est directamente relacionada

con la magnitud de la diferencia entre los
potenciales de reduccin de las dos parejas ().
Cuanto mayor sea esta diferencia mayor ser la
cantidad de energa libre generada.

Enzimas
Son protenas globulares catalticas, catalizan
reacciones especficas. Estn constituidas por un
componente proteico, la apoenzima, y un
cofactor no proteico

Mecanismo de las reacciones enzimticas

Las enzimas aceleran las reacciones al reducir la

energa de activacin, por la unin de los
sustratos (reactivos) a los centros activos
catalticos.
La enzima puede interactuar con un sustrato de
dos formas. Puede ser rgida o cambiar su forma
cuando interacta con el sustrato

Efecto del ambiente sobre la actividad enzimtica

Las enzimas tienen valores ptimos de pH y

temperatura. La desnaturalizacin, fenmeno por
el cual la estructura de la enzima se altera y sta
pierde su actividad, puede estar causado por
valores extremos del pH y la temperatura.

Inhibicin enzimtica
Puede reducirse por inhibidores competitivos y
no competitivos.

Naturaleza y significado de la
regulacin metablica
La localizacin de los metabolitos y las enzimas
en diferentes partes de la clula, proceso
denominado canalizacin metablica, influye en
la actividad de las rutas.

Control de la actividad enzimtica

Modificacin covalente de las enzimas

Cada ruta tiene al menos una enzima limitante
que cataliza la reaccin ms lenta, limitante de la
velocidad de la ruta.
El primer paso en una ruta suele ser una
reaccin limitante catalizada por una enzima
reguladora.

Liberacin y conservacin de energa

Cuando el aceptor de electrones es exgeno, el

proceso metablico se llama respiracin y puede
clasificarse en aerobia, cuando el aceptor final de
electrones es el oxgeno, y anaerobia, cuando el
aceptor final el nitrato, sulfato, dixido de
carbono, fumarato u otros. La respiracin
requiere la actividad de una cadena de
transporte de electrones.

Respiracin aerobia
Puede dividirse en 3 etapas:
Etapa 1: las molculas nutrientes de mayor tamao
(protenas,
polisacridos
y
lpidos)
son
hidrolizadas para dar lugar a sus constituyentes
Etapa 2: los productos de la primera etapa son
degradados a unas pocas molculas ms sencillas,
como piruvato y acetil-coenzima
Etapa 3: el carbono parcialmente oxidado entra en
el ciclo de los cidos tricarboxlicos para ser
oxidado completamente hasta CO2, con lo que se
produce ATP, NADH y FADH2.

Va glucoltica: Va de Embden
Meyerhof

Descarboxilacin oxidativa
En este proceso, el piruvato pierde un carbono
en forma de CO2 y los dos carbonos restantes se
unen a la coenzima A mediante un enlace tiol
(enlace de alta energa).

Ciclo de los cidos tricarboxlicos,

del cido ctrico o de Krebs.
Esta es la etapa final del catabolismo en la
mayora de las clulas aerobias. Se oxida acetilCoA para formar CO2 y se produce un GTP, tres
NADH y un FADH2 por cada acetil-CoA.

 La respiracin aerobia en eucariotas puede

producir un mximo de 38 ATP.

Respiracin anaerobia

La respiracin anaerobia es un proceso de

produccin de ATP mediante trasporte
electrnico en el que el aceptor terminal de
electrones es una molcula exgena diferente del
O2. Los aceptores ms comunes son nitrato.
Sulfato y CO2.

Fermentacin
Durante la fermentacin, se usa un aceptor de
electrones endgeno para reoxidar el NADH
generado por el catabolismo de glucosa a piruvato.
El resultado es lactato o un producto reducido.

La fermentacin puede ser:

Fermentacin alcohlica
El piruvato se descarboxila a acetaldehdo, el cual es
reducido a etanol por la enzima alcohol deshidrogenasa,
con NADH como donador de electrones.

Fermentacin acidolctica.
Se reduce el piruvato a lactato. Los microbios
fermentadores pueden clasificarse en: Homolcticos:
usan la va de Embden Meyerhof y reducen directamente
casi todo su piruvato a lactato con la enzima lactato
deshidrogenasa. Heterolcticos: forman cantidades
sustanciales de otros productos adems de lactato, como
etanol y CO2.

Catabolismo de carbohidratos
Los microorganismo catabolizan muchos
carbohidratos extracelulares. Los monosacridos
son introducidos en la clula y fosforilados; los
disacridos pueden ser fragmentados en
monosacridos mediante hidrlisis o fosforlisis.
Los polisacridos externos son degradados
mediante hidrlisis, y los productos son
absorbidos. El glucgeno y el almidn
intracelulares son convertidos en glucosa-1fosfato mediante fosforolisis.

Catabolismo de lpidos
Los microorganismos quimioorgantrofos usan
frecuentemente los lpidos como fuentes de
energa. Los triglicridos son unas fuentes
comunes de energa. Pueden ser hidrolizados a
glicerol y cidos grasos por lipasas. El glicerol es
fosforilado, oxidado a dihidroxiacetona-fosfato y
catabolizado en la va de Embden Meyerhof.

Catabolismo de protenas y aminocidos

Las protenas son hidrolizadas para dar
aminocidos, los cuales son desaminados; sus
esqueletos carbonados pueden ser convertidos
en piruvato, acetil-CoA o un intermediario del
ciclo de Krebs, donde finalmente es oxidado para
liberar energa.

Quimiolitotrofa
Los quimiolittrofos sintetizan ATP mediante la
oxidacin
de
compuestos
inorgnicos,
generalmente hidrgeno, compuestos reducidos
de nitrgeno o azufre o Fe3+, con una cadena de
transporte de electrones, y O2 como aceptor de
electrones.

Fototrofa
Los fottrofos sintetizan ATP a partir de la
energa de la luz que capturan
Generalmente los organismos fottrofos reducen
e incorporan CO2 La fotosntesis es uno de los
procesos metablicos ms importantes en la
Tierra
Proporciona a los organismos fotosintticos ATP
y poder reductor para sintetizar el material
orgnico necesario para el crecimiento.

Uso de la energa en la biosntesis

La mayora de las enzimas glucolticas participan
tanto en la sntesis como en el catabolismo de la
glucosa. Por el contrario, los cidos grasos se
sintetizan a partir de acetil-CoA y malonil-CoA
mediante una va bastante diferente a la de la poxidacin de los cidos grasos.
Las rutas catablicas
y anablicas
pueden
diferenciarse en las enzimas, la regulacin, la
localizacin intracelular y el uso de cofactores y
transportadores nuclesido
difosfato.
Aunque
muchas enzimas de las rutas anfiblicas participan
en el catabolismo y en el anabolismo, algunas
enzimas slo participan en uno de los dos procesos.

Principios que regulan la

biosntesis
El metabolismo biosinttico parace seguir ciertos
patrones o estar basado en unos pocos principios
generales
Una clula microbiana contiene grandes
cantidades de protenas, cidos nucleicos y
polisacridos, las cuales son macromolculas o
molculas de gran tamao, polmeros de
unidades ms pequeas unidas entre s.

 A menudo, la clula economiza materias y

energa adicionales mediante la utilizacin de
muchas de las mismas enzimas para el
catabolismo y el anabolismo.
Aunque muchas enzimas de las rutas antiblicas
participan en actividades catablicas y
anablicas, algunos pasos estn catalizados por
dos enzimas diferentes.
Para sintetizar molculas de forma eficaz, las
vas anablicas deben operar de forma
irreversible en la direccin de la biosntesis.

 En los organismos eucariticos, las rutas

biosintticas se localizan a menudo en
compartimientos celulares distintos de los
compartimientos de las rutas catablicas
correspondientes
Las rutas anablica y catablica a menudo
utilizan cofactores diferentes. Las oxidaciones
catablicas suelen producir NADH, un sustrato
del transporte de electrones. Por el contrario, si
durante la biosntesis se necesita un reductor, el
dador suele ser NADPH en lugar de NADH.

Fijacin fotosinttica del CO2

Casi
todos
los
autotrofos
microbianos
incorporan CO2 mediante una ruta metablica
especial que recibe diversos nombres: ciclo de
Calvin, ciclo de Calvin-Benson o ciclo reductor
de las pentosas fosfato.
El ciclo de Calvin tiene lugar en el estroma del
cloro-plasto
de
autotrofos
microbianos
eucariticos. Resulta ms fcil comprender el
ciclo si se divide en tres fases: carboxilacin,
reduccin y regeneracin.

Ciclo de Calvin

Sntesis de azcares y polisacridos

La sntesis de glucosa a partir de precursores
diferentes de los hidratos de carbono recibe el
nombre de gluconeognesis.
Tres pasos glucolticos son irreversibles en la
clula:
1) la conversin de fosfoenolpiruvato en piruvato,
2) la formacin de fructosa1,6-bisfosfato a partir
de fructosa 6-fosfato, y
3) la fosforilacin de la glucosa.

Asimilacin ele fsforo, azufre y nitrgeno inorgnicos

Adems
de
carbono
y
oxgeno,
los
microorganismos tambin necesitan grandes
cantidades de fsforo, azufre y nitrgeno para la
biosntesis. Estos elementos son asimilados, o
incorporados a molculas inorgnicas, por vas
diferentes

Asimilacin de fsforo
El fosfato inorgnico se incorpora mediante la
formacin de ATP por una de tres formas
posibles: 1) fotofosforilacin, 2) fosforilacin
oxidativa y 3) fosforilacin a nivel de sustrato. La
gluclisis constituye un ejemplo del ltimo
proceso. El fosfato se une a gliceraldehdo 3fosfato para formar 1,3-bisfosfoglicerato, el cual
se utiliza a continuacin en la sntesis de ATP

Asimilacin de azufre
Muchos microorganismos utilizan cistena y
metionina, que se obtienen de fuentes externas o
de reservas intracelulares de aminocidos. Este
proceso se conoce como reduccin asimilatoria
de sulfato para distinguirla de la reduccin
desasimilatoria de sulfato que se produce
cuando el sulfato acta como aceptor de
electrones durante la respiracin anaerobia.

La reduccin de sulfato consiste en la activacin de

sulfato mediante la formacin de fosfoadenosina 5'fosfosulfato, seguida de la reduccin del sulfato. El
sulfato se reduce a sulfito (SCV") y despus a H2S.

Asimilacin de nitrgeno
Dado que el nitrgeno es un componente
principal de las protenas, los cidos nucleicos,
las coenzimas y muchos otros componentes
celulares, la capacidad de la clula para asimilar
el nitrgeno inorgnico es extraordinariamente
importante.
Aunque el gas nitrgeno abunda en la atmsfera,
pocos microorganismos pueden reducir este gas
y utilizarlo como fuente de nitrgeno;

Incorporacin de amonio
Una vez sintetizada la alanina o el glutamato, el
grupo
a-amino
recin
formado
puede
transferirse a otros esqueletos carbonados
mediante reacciones de transaminacin.
La ruta principal para la incorporacin del
amonio es la formacin de glutamato a partir de
occetoglutarato

Ruta de asimilacin del amonio

Reduccin asimilatoria de nitrato

El primer paso en la asimilacin de nitrato es su
reduccin a nitrito por accin de la nitrato
reductasa, una enzima que contiene FAD y
molibdeno. La fuente de electrones
es el
NADPH.
el nitrito se reduce a amonio mediante una serie
de adiciones de dos electrones catalizada por la
nitrito reductasa y, posiblemente, por otras
enzimas. A continuacin, el amonio se incorpora
a aminocidos por las rutas anteriormente
descritas.

Fijacin de nitrgeno
La fijacin de nitrgeno se produce en:
1) bacterias de vida libre (p. ej., Azotobacter, Klebsiella,
Clostridium y Methanococcus),
2) bacterias que viven en asociacin simbitica con
plantas tales como las leguminosas {Rhizobium), y
3) cianobacterias {Nostoc y Anabaena).
Los electrones provienen de la ferredoxina, la cual
se ha reducido por diversos mecanismos: durante la
fotosntesis en las cianobacterias, por procesos
respiratorios en los fijadores de nitrgeno aerbicos,
o durante la fermentacin en las bacterias anaerobias.

Sntesis de aminocidos
Relacin entre las rutas biosintticas de los
aminocidos y las rutas anfiblicas.

Reacciones anapierticas
Las reacciones de fijacin de CO2 anaplerticas
simplemente reponen los productos intermedios
del ciclo de los ATC, manteniendo as el
equilibrio metablico
El ciclo del glioxilato es en realidad una
modificacin del ciclo de los ATC. Se evitan las
dos descarboxilaciones de la ltima va ),
permitiendo la conversin de acetil-CoA para
formar oxaloacetato sin prdida de carbono de la
acetil-CoA en forma de CO2.

Sntesis de purinas, pirimidinas y

nucletidos
La biosntesis de purinas y pirimidinas es
fundamental para todas las clulas, ya que estas
molculas se utilizan en la sntesis de ATP,
cofactores, cido ribonucleico (RNA), cido
desoxirribonucleico (DNA) y otros componentes
celulares importantes.
Una base prica o pirimidnica unida a un azcar
pentosa (ribosa o desoxirribosa) forma un
nuclesido.

Biosntesis de purinas
Debido a que la ruta comienza con la ribosa 5fosfato y a que el esqueleto purinico est
construido sobre este azcar, el primer
producto purinico de la ruta es el nucletido
cido inosnico, no una base purnica libre.
Una vez formado el cido inosnico, dos vas
relativamente cortas sintetizan adenosina
monofosfato y guanosina monofosfato y
producen nuclesidos difosfato y trifosfato por
transferencia de grupos fosfato desde el ATP.

Biosntesis de pirimidinas
Comienza con el cido asprtico y el carbamoil
fosfato, una molcula de alta energa que se
sintetiza a partir de CO2 y amonaco. Despus
de la sntesis del esqueleto pirimidnico, se
forma un nucletido.
En la segunda etapa de la sntesis, se elimina el
grupo p-ceto derivado de la reaccin de
condensacin inicial en un proceso de tres pasos
en el que se producen dos reducciones y una
deshidratacin

Sntesis del peptidoglicano

Es especialmente vulnerable a la alteracin por
agentes antimicrobianos. La inhibicin de
cualquier etapa del proceso debilita la pared
celular y puede causar lisis osmtica.

Patrones de formacin de la pared celular

Una clula bacteriana tiene que aadir ms
peptidoglicano a su pared celular de manera
precisa y regulada manteniendo al mismo
tiempo la forma y la integridad de la pared en
presencia de una presin osmtica alta.
La digestin limitada del peptidoglicano es
realizada por enzimas conocidas como
autolisinas.

(a) Estreptococos y algunos otros cocos Gram

positivos, (b) Sntesis en bacterias con forma de
bastn.