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CAPITULO 3
PROTENAS
PPTIDOS
Dos aminocidos
Eliminacin de una
molcula de agua
Enlace peptidico
Extremocarboxilo
PEPTIDOS Y PROTEINAS
Pptido:hasta50aminocidos.
Oligopptido:pptidopequeo.
Polipptido:pptidogrande.
Oligmero:protenaformadaporsubunidades
idnticasllamadasprotmeros.
Protenassencillasyconjugadas (poseen
grupo prosttico).
PPTIDOS
Polmerosde
aminocidosdePM
menora6000daltons
(<50aa)
Dipptido:2aa
Tripptido:3aa
Tetrapptido:4aa
Pentapptido:5aa Extremo N-terminal:comienzodela
cadena
Extremo C-terminal:findelacadena
NOMENCLATURA
SenombrandesdeelextremoN-terminal
alC-terminal,usandolaterminacinil,
exceptoparaelltimoaa.
Ej:
ser-asp-tyr-lis-ala-cys
seril-aspartil-tirosil-lisil-alanil-cystena
PEPTIDOS: EJEMPLOS
OCITOCINA:hormonaqueestimulala
contraccindeltero.
GLUCAGN:hormonaquetieneacciones
contrariasalaInsulina.
ANTIBITICOS
GLUTATIN:glu-cys-gli,participaen
reaccionesRedoxdelaclula.
GLUTATIN
Glu-Cys-Gly (L-glutamil-L-cisteinil-glicina)
Principal pptido de las clulas.
Papelesbiolgicos:
-Defensacelularcontracompuestosoxidantes:
H2O2+2GSH
GSSG+2H2O.
-Mantenimientodelasprotenasenestadoreducido.
PROTEINAS
GRUPO PROSTTICO
Lpidos
Carbohidratos
EJEMPLO
B-Lipoprotena
Ig G
Fosfoprotenas
Fosfato
Casena leche
Hemoprotenas
Hemo
Hemoglobina
Flavoprotenas
Metaloprotenas
Nucletidos avina
Succinato DH
Hierro
Ferritina
Zinc
Alcohol DH
Calcio
Calmodulina
Molibdeno
Dinitrogenasa
COMPOSICINELEMENTAL
Carbono
Oxgeno
50%
23%
Nitrgeno
16 %
Hidrgeno
Azufre
7%
3%
(Vlidoparalasprotenassimples)
Ejemplos
PROTEINAS DE ESTRUCTURA
COLAGENO
(HUESOYPIEL)
KERATINA
(PELOYUNAS)
FIBRINA
(AYUDAALACOAGULACION)
ELASTINA
(LIGAMENTOS)
PROTEINAS DE FUNCION
HORMONAS
(CONTROLANFUNCIONESDELORGANISMO)
ANTICUERPOS
(LUCHANINFECCIONES)
ENZIMAS
(ACELERANREACCIONESENELORGANISMO)
HEMOGLOBINA
(LLEVANOXIGENO)
SIMPLES
Por su naturaleza
qumica
CONJUGADAS
FIBROSA
CLASIFICACIN DE LAS
PROTEINAS
GLOBULAR
ENZIMAS
PROTENAS
Por su Solubilidad:
EUGLOBULINAS:
insolubles en agua
PSEUDOGLOBULINA
S:
solubles en agua
Por su funcin
Biolgica
DE
TRANSPORTE
CONTRCTILES Y
MTILES
DE DEFENSA
REGULADORAS
NUTRIENTES
HORMONAS
Tipos
Enzimas
Reserva
Transportadoras
Ejemplos
cido-grasosintetosa
Ovoalbmina
Hemoglobina
Anticuerpos
Protectoras en la
sangre
Insulina
Hormonas
Estructurales
Contrctiles
Colgeno
Miosina
Localizacin o funcin
Cataliza la sntesis de cidos
grasos.
Clara de huevo.
Transporta el oxgeno en la
sangre.
Bloquean a sustancias
extraas.
Regula el metabolismo de la
glucosa.
Tendones, cartlagos,
pelos.
LA RESONANCIA
DE ELECTRONES
CONFIERE AL
ENLACE
PEPTDICO
CARCTER DE
DOBLE ENLACE
PARCIAL
Elenlacepeptdicotienecarcterdedobleenlacey
unarotacinrestringida
Elenlacepeptdicodefineaunpptido,ytienecarcter
parcialdedobleenlace.Porello,elenlacepeptdicoes
planoynopermitelalibrerotacindesussustituyentes.
LosngulosdetorsinentornoalCarbonoalfapermitenflexibilidad
conformacionalalacadenaprincipal(cadenapolipeptdica,sin
considerarlosgruposdecadenalateral,carctersticosdecada
aminocido.
Polipptidos
Pptidos.Menosde50AA
Ej.Glutatin.Esuntripptidoconstituidoportresaminocidos:
glicina, cistena y cido glutmico.
Esunantioxidanteintracelularparalocualusaelgrupotioldela
cistenacomoagentereductor.Actareduciendoespeciesreactivas
deloxgenocomoperxidodehidrgenograciasalaenzima
glutatinperoxidasalacualcatalizalasiguientereaccin:
H2O2+2GSH-------GSSG+2H2O.
Aminocidos
Estruct.
secundaria
Hlicealfa
Estruct.terciaria
Cadenapolipeptidica
Estruct.Cuaternaria
Subunidadesensambladas
concentracinsalina,temperaturayotros
factoresambientales.
Desnaturalizacineslaprdidadela
conformacindeunaprotena.
Unaprotenadesnaturalizadapierdesu
actividadbiolgica.
ESTRUCTURA PRIMARIA
Secuenciadeaminocidos,
Sirveparaentendersuspropiedadesfuncionales,identicarla
familiaalaqueperteneceydescribirlospolimorsmosy
lasprotenasmutantesquecausanenfermedades
moleculares.
Sedeterminaapartirdelasecuenciadelgeno
secuenciandolaprotena.
Cadaprotenatieneunnmeroderesiduosy
secuenciacarctersticos.
Lasprotenascontienenregionesesencialespara
sufuncin,cuyasecuenciaseencuentra
conservada.
Laestructuraprimariadeunaprotenapuedevariar
endiferentesespeciesydentrodelamisma
especieentreindividuos,tejidosdelmismo
individuoyfasedeldesarrollo
QU INFORMACIN PROPORCIONA LA
SECUENCIA DE AMINOCIDOS?
Prediccindesuestructura3D,sufuncin,
localizacincelularysuevolucin.
Clasicacindelasprotenasenfamilias
(25%deidentidadmnimaparapertenecera
lamismafamilia).
Deteccindemotivosrelacionadoscon
funcionesimportantes(localizacincelular,
modicacinqumicayvidamedia).
ESTRUCTURA SECUNDARIA
Patronesrepetitivosqueseformanal
plegarselospolipptidos.
Puedepredecirseconbastante
abilidadapartirdelasecuencia.
Tiposdeestructurasecundariams
frecuentes:
Hlicealfa,
lminaplegada.
ESTRUCTURAS SECUNDARIAS
LARESTRICCIONENLASROTACIONESDELENLACE
PEPTIDICOFAVORECEALGUNASCONFORMACIONES
DELACADENAPOLIPEPTIDICA
-hlice
lmina plegada
ESTRUCTURA SECUNDARIA
-hlice
HLICE ALFA:estructurargidaenformadevarillaqueseformacuando
unacadenapolipeptdicaseretuerceenunaconformacinhelicoidala
derechas
La -hlice se estabiliza a travs de puentes de hidrgeno que se
forman entre el grupo >C=O de un enlace peptdico y el grupo >NH de
otro
HLICE ALFA
UnpuentedeHentreelCO
deunaminocidoyelNHdel
cuartoaa.pordetrs.
3,6aacsporvueltadehlice.
5,4Amstrong(0,15nm)de
distanciaentrevueltayvuelta.
Dextrgira.
-hlice
lospuentesde
hidrgeno
sonparalelosaleje
central
delahlice
Losradicalesvan
dirigidos
haciaafuera
3,6aminocidos/vuelta
Lascadenaslaterales
sobresalendemanera
perpendicularalejede
lahlice.
Repulsinoatraccinelectrostticaentre
residuos.
Impedimentoestrico(entreresiduos
adyacentesyentreresiduosseparadospor3
4aminocidos).
LaprolinaylaglicinaTienenunefecto
desestabilizadordelaalfahlice.
COLAGENO
Triplehlice
Cadahlice
poseela
secuencia
prolina-glicina,
hidroxiprolina.
COLAGENO
triplehlice
cadahliceposeelasecuencia
(glicina-aminocidox-prolina/hidroxiprolina)n
3aa/vuelta
lashlicesNOson-hlices
Lascadenaspolipeptdicasenzig-zagse
disponendemaneraadyacenteformandouna
lminaestabilizadaporpuentesdeH.
Lminas beta paralelas (cadenas orientadas en
la misma direccin) y antiparalelas (orientadas
en direcciones opuestas).
vista
desde
arriba
vista
lateral
Losradicalesdelos
aminocidosvan
sobreybajoel
planomediodela
lmina,enforma
alternada.
Esmsestableen
aminocidos
conRpequeos.
B. paralela
vista
desde
arriba
vista
lateral
GIROS BETA
Son elementos de conexin entre hlices alfa y/o
lminas beta.
Determinanuncambiodedireccindelascadenas
polipeptidicas.
Seformaunpuentedehidrgenoentreunresiduo
(n)yelsituadotresaminocidosdespus(n+3).
Laprolinaylaglicinaabundanenlosgirosbeta.
GIROS BETA
Antiparalela
Paralela
Laestructura3Ddeunaprotenadependedelasecuencia
deaacs.
Lafuncindeunaprotenadependedesuestructura3D.
Dentrodelagranvariedaddelasprotenassereconocen
algunospatronesestructuralescomunes.
LA ESTRUCTURA TERCIARIA
Eslaformaquese
manifiestaenel
espaciouna
protena.
Puedeser
redondeaday
compacta,
adquiriendoun
aspectoglobular.
Tambinpuedeser
unaestructura
fibrosayalargada.
Laconformacin
espacialdela
protena
condicionasu
funcinbiolgica.
Mioglobina
ESTRUCTURA TERCIARIA
LaESTRUCTURATERCIARIA
correspondeaplegamientostridimensionales.
Laprotenasepliegasobresmismay
tiendeaunaformaglobular
Tambin puede ser una estructura fibrosa y
alargada.
Ensumantencinparticipanlosgrupos
radicales delosaminocidos.
Laestructuraterciaria
La conformacin espacial de la protena
condicionasufuncinbiolgica.
Estructura terciaria
PUENTEDEINTERACCIONENLACEIONICO
HIDROGENOHIDROFOBICA
PUENTEDISULFURO
INTERACCIONES Y ENLACES DE LA
ESTRUCTURA TERCIARIA
ESTRUCTURATERCIARIA
Mioglobina
Enlasprotenasenunmedioacuoso,losaminocidos
apolares(amarillos)selocalizanpreferentemente
haciaelinteriordelaprotena
mioglobina
seccintransversalde
lamioglobina
FORMACIONDEPUENTESDISULFURO
Puentesdisulfuro
Enlacesdehidrgeno:
Seproducenentretomosdelenlacepptidicoygrupospolares
colaterales,dondeuntomodehidrgenoescompartidopordos
tomoselectronegativos,ysonimportantesparalaformacindelos
buclesenlasestructurassecundariasyparaelplegamientodelas
estructurasterciarias.
Tienenunaenergadeenlacede20KJ/molyunalongitudde0,3nm.
Interaccioneshidrfobas:
Losresiduoshidrfobosproduceninteracciones,msque
verdaderosenlaces,alldondeformanagrupamientosmuy
compactos.Laenergadelenlacevienedeldesplazamientodelagua
Interaccionesinicas:
Sonelresultadodelasfuertesatraccionesentretomospositivosy
negativos.Estasunionesseobservanenlasestructurasterciariasy
tienenunaenergadeenlacede335KJ/molyunalongitudde
0,25nm
FuerzasdeVanderWaals:
(dipolos inducidos por dipolos) son fuerzas de atraccin dbiles
entredostomoscuandolosorbitalesdesuselectronesseacercan
unoalotro.Laenergadeenlaceesmuydbil,de0,8KJ/molyla
longitudde0,35nm.Colectivamente,estosenlacesseaadenala
importante energa contenida en la estructura terciaria de los
grandespolipptidos
Interaccionesdelascadenaslaterales:
Formanenlaces,siendolosmsimportanteslosproducidosentre
los grupos tiol de los residuos de cistena, que forman una unin
covalente de 210 KJ/mol llamada puente disulfuro. Los puentes
disulfuro son importantes en las estructuras terciarias y en la
estructuctura secundaria de la elastina, y se encuentran
habitualmenteenprotenasdiseadasparalaexportacin,porejm:
- Laenzimadigestivaribonucleasatienecuatropuentesdisulfuro.
- Laprotenaplasmticainsulinatienetrespuentesdisulfuro
ESTRUCTURA CUATERNARIA
Corresponde a la asociacin de cadenas polipeptdicas o
SUBUNIDADES,cadaunadeellaconsuestructuraterciaria.
Se mantiene por enlaces entre los radicales de cadenas
diferentes.
HEMOGLOBINA
HEMOGLOBINA
dmero
TBP
tetrmero
HEMOGLOBINA
Nivelesdelaestructuradeprotenas
I:secuenciade
aminocidos
II:Estructura3D
Estabilizadapor
PuentesdeHidrgeno
Decadenaprincipal
(establecidosporel
Grupoamidaformado
Porelenlacepeptdico.
Puentes hidrgeno
intramoleculares(alfa
hlice);Puentes
hidrgeno
intermoleculares
(lmina beta plegada
III:Estructura3Ddeuna
Cadenapolipeptdica
Completa.Involucraarreglosde
EstructuraII(estructurasuper-II)
einteraccionesdecadena
lateral,
mediantepuentesdeHidrgeno,
interaccioneshidrofbicas,
interaccionesinicas(puentes
salinos)yeventualmente,
puentesdislfuro.
IV:Ensambledecadenas
Polipeptdicasenuncomplejo
Funcional.Todaslasinteracciones
PresentesenIIIpuedenestar
PresentesenIV
PROPIEDADES CIDO-BASE
Lasprotenastienenuncomportamientoanfteroyestolashace
capacesdeneutralizarlasvariacionesdepHdelmedio,yaque
puedencomportarsecomouncidoounabaseyportanto
liberaroretirarprotones(H+)delmediodondeseencuentran
Solubilidadyfuerzainica
Lasprotenassonsolublesenagua
cuandoadoptanunaconformacin
globular.
Lasolubilidadesdebidaalos
radicales(-R)libresdelos
aminocidosque,alionizarse,
establecenenlacesdbiles(puentes
dehidrgeno)conlasmolculasde
agua.
As,cuandounaprotenase
solubilizaquedarecubiertadeuna
capademolculasdeagua(capa
desolvatacin)queimpidequese
puedauniraotrasprotenaslocual
provocarasuprecipitacin
(insolubilizacin).Estapropiedades
laquehaceposiblelahidratacinde
lostejidosdelosseresvivos.
Precipitacinporsalado.
Elexcesodesal
secuestraelaguade
hidratacin
Salting-In, y Salting-out
Enunmedio poco salino,lasolubilidaddelasprotenas
aumentaalincrementarlaconcentracindesales.
Esteefectoseconocecomosalting in yseexplicamediante
lateoradeDebye-Hckel.
Segnseaadensalesalmedio(oloqueeslomismo,
segnaumentamoslafuerzainicadelmedio),losionesen
questassedisocianrodeanalasprotenas,interaccionando
consusgruposionizables,evitandoasqueseestablezcan
interaccionesatractivasentrelascadenaslateraleso
extremoscargadosdelasprotenas;esdecir,sedificultala
aglomeracindelasprotenasyportantosuprecipitacin.
Enestascondiciones,lasolubilidadaumentaal
incrementarselafuerzainicadelmedio.
Salting-In, y Salting-out
Consideremosahoraunmedio con altas
concentraciones de sal.
Enestascondiciones,larepulsinentrecargasdelmismo
signosereduceylasprotenassesolvatanmuchopeoralir
aumentandolaconcentracindesal.
Alsolubilizarlasal,susionesserodeandemolculasde
agua,limitandolasmolculasdeaguadisponibles
parasolubilizarlasprotenas.
As,alpotenciarselasinteraccionesprotena-protenafrente
alasinteraccionesprotena-disolvente,lasprotenas
precipitarnsegnaumentelafuerzainicadelmedio
(disminuyesusolubilidad).
Aesteefectoseledenominaefecto salino o salting out.
Salting-In, y Salting-out
DESNATURALIZACIN DE
PROTENAS
Prdidadelaestructura3Ddeuna
protena.
Cambianlaspropiedadesfsicas,qumicas
ybiolgicas.
Seproduceportratamientoconagentes
fsicosyagentesqumicos.
Desnaturalizacin
de la RNasa
Renaturalizacin
de la RNasa
Denaturacin.
perdida de las estructuras cuaternaria, terciaria y
secundariadeunaprotena
no se altera la estructura primaria
Ejplo.huevoduro
HIDROLISIS. escisin en aminocidos (ruptura de un
enlacecovalenteporadicindeagua).
AGENTES DESNATURALIZANTES
Acidosybasesfuertes.
Disolventesorgnicos(alcoholes,
cetonas,cloroformo).
Detergentes(SDS).
Agentesreductores(mercaptoetanol).
Compuestospolaresneutros(urea,
guanidina).
Salesaelevadaconcentracin.
Aumentodetemperatura.
Agresinmecnica(agitacin,
trituracin).
PROCESOS REVERSIBLE
puentes disulfuro
DENATURACIN
urea + mercaptoetanol
PLEGAMIENTO o
RENATURACION
(se retiran los
agentes
denaturantes)
cistenas
puentes disulfuro
DENATURACION IRREVERSIBLE
1. CALOR:
Rompetodaslasinteraccionesdbiles.
2.pHEXTREMOS:
Cambialacargadelosradicalesde
aminoacidosionizables,alterndoselosenlaces
enqueparticipan.
MTODOS DE SEPARACIN DE
PROTENAS.
Porsutamao:dialisisy
ultrafiltracin.
Porsusolubilidad:precipitacin.
Porsucargaelctrica:Electroforesis,
Cromatografa
a. Por su tamao
a)Dilisis
b) Ultracentrifugacin
Dilisis
Procesodeseparar molculas de una solucin por
diferencia del ndice de difusin a travs de una
membrana semipermeable.
Unasolucindevariostiposdemolculasespuestaenun
bolsosemipermeablededilisis(acetatodecelulosauotro).
Elbolsodedilisisselladosecolocaenunenvaseconuna
solucindiferente,oaguapura.
Lasmolculaslosuficientementepequeascomopara
pasaratravsdelosporos(amenudoagua,salesyotras
molculaspequeas)tiendenamoverseenladireccindela
concentracinmsbaja.
Molculas ms grandes (amenudoprotenas,ADN,o
polisacridos)quetienedimensionessignificativamente
mayoresqueeldimetrodelporosonretenidasdentrodel
bolsodedilisis.
Dilisis
b. Por su solubilidad
Precipitacin Salina.
Sonsolublesenaguaconconformacinglobular.
La solubilidad es debida a los radicales (-R) libres de aminocidos que,
establecenenlaces(puentesdehidrgeno)conmolculasdeagua.
Separacinporsupuntoisoelctrico
a)Cromatografa de intercambio
inico
b)Electroforesis
Ambossoncasosdecromatografas
deintercambioinico.
PROCESOSCONPROTEINAS
Curtido
Queratina.
Curtiembre.
Elcurtidoeselprocesoqumico
medianteelcualseconviertenlos
pellejosdeanimalesencuero.
Elproceso consiste en reforzar la
estructura proteica del cuero
creando un enlace entre las cadenas
de ppticos.
Lapielanimalsecomponedetres
capasdiferenciadas:laepidermis
(capaexterior),eltejidoconjuntivo
(capaderms)yeltejidosubcutneo.
Duranteeltratamientodelapiella
dermisdebesepararsedelasotras
ETAPAS:
Derivera.
curtido
A.- Preparacin.
(procesos de rivera)
EnlaetapadeRivera
serecibelapiel(en
sangreoseca), se
hidrata, se le quita
el pelo y la
endodermis,
formada por
protenas y grasa;
se aumenta el
espacio
interfibrilar y se
eliminan las
impurezas
presentes.
B.- Curtido
Enestasegundaetapaelobjetivoesevitar que las
protenas de la piel se pudran.
Comprende:desencalado,purga,piqueladoycurtido.
El desencalado.preparacindelaspielesparala
curticin,mediantelavadosconagualimpia,tratandode
reducirlaalcalinidadyremoviendolosresiduosdecaly
sulfurodesodio.Seutilizanaguasquecontienensulfato
deamonioycidos.
Piquelado.
Enelpiqueladoloscuerosseponenenunentornoacido
formadoporclorurosdicoyacidosulfrico,hastapH3.5-1.8
.
Elacido es necesario por que los agentes curtientes de
cromo no son solubles en condiciones alcalinas, al
contrario,ensolucionesalcalinaslassalesdecromo
reaccionanrpidamenteconlasfibrasdelcolgeno,porlo
quepodraproducirseunasobrecurticinenlasetapas
externasdificultandoladifusinalascapazinternas.
(Germillac,2004).
Lavelocidaddedifusindeloscomponentesdelpiquelado
puedeaumentarseincrementadolatemperaturadelsistema,
perohayriesgodeprovocarlahidrlisisacidadelaprotena
(a36C).Estasoperacionesnoseaplicanenelcurtido
vegetal(contanino).
El curtido.
Seadicionansustanciasorgnicas(sintticasonaturales);
oinorgnicas(minerales)paraquereaccionenconlas
protenasdelapiel.
Loscurtientesorgnicosmsusadosson:acacia,
mimosa,quebracho,castao,ycascalote.Todosellos
contienencompuestosorgnicosaromticos,conocidos
comotaninos.
Loscurtientesinorgnicossonsalesqueliberanmetales
solublesquesehidrolizanysemantienenensolucin.
Elcurtidomineraleselmasusadoytpicamentese
usasalesdecromotrivalente(porejemplo:sulfatode
cromoy/oxidocrmico,Cr2O3)conuna
concentracinquevarade1,5a8porcientodeCr2O3.
Elinsumoseagregaenformadesulfatodecromo
hastacompletarelcurtido,enelqueseprovocala
reaccinentrelosgruposcarboxilo(-COOH)del
colgenoconelcromo
Cuandoelcromoseintroduceenlapiel,reaccionacon
lasprotenasformandocompuestosdecoordinacin
muyestablesylatemperaturadecontraccindelapiel
aumenta.
Sulfato de cromo
Acabado. Elacabadodelcuerowetblue,incluyeoperaciones
mecnicasyaplicacindeunacapadecubricinalasuperficiedel
cuero.
Elablandadoesunaoperacinmecnicadebatidoqueseutiliza
parahacerelcueromssuave.
Paramejorarelaspectofinal,elladodeflordelcueroseesmerila
utilizandouncilindrodeesmerilado