Protenas: rdenes de

estructura superiores
Captulo 5, Harper, 28 edicin
Versin 2011

Importancia biomdica

La forma sigue a la funcin. La funcin de las protenas est

relacionada con su estructura tridimensional. De los enlaces
intramoleculares depende la estructura tridimensional de la
protena.
Inicas o electrostticas.
Puentes de hidrgeno entre aminocidos polares.
Interacciones hidrofbicas : los grupos apolares se agrupan ya que
el agua tiende a excluirlos.
Fuerzas de Van der Waals : atraccin mutua entre tomos muy
cercanos.
Puentes disulfuro: unin covalente entre grupos -SH de dos
Cistenas.

Las deficiencias genticas obstaculizan la maduracin de

protenas como la enfermedad de Creutzfeld-Jacob, encefalopata
espongiforme bovina y escorbuto.

Conformacin y configuracin de las

protenas
Configuracin es la relacin geomtrica entre un grupo
dado de tomos (D aminocidos y L aminocidos).
Conformacin de una protena: Relacin espacial de
cada tomo de una molcula. Es la forma
tridimensional caracterstica de una protena en su
estado nativo. La maduracin ocurre con las
modificaciones postraduccionales.
La conformacin tridimensional es la que confiere a
cada protena su actividad biolgica exclusiva. Esta
conformacin, por su parte, depende de la secuencia
especfica de aminocidos de sus cadenas
polipeptdicas.

Clasificacin de las protenas

Simples (queratina colgena) y conjugadas
Fibrosas o extendidas (colgena) y globulares o
compactas (hemoglobina y mioglobina)
Protenas conjugadas: Son protenas unidas
a un componente no protico
Protena + in metlico = metaloprotena
Protena + nucletido = nucleoprotena
Protena + glucosa = glucoprotena
Protena + pigmento = cromoprotena
Protena + lpido = lipoprotena

Los cuatro rdenes de la estructura de la

estructura de protenas
Las protenas se construyen usando principios modulares:
aminocidos-enlaces pepiticos, plegado y maduracin.
Estructura primaria: la secuencia de aminocidos en una cadena
polipeptdica.
Estructura secundaria: el plegado de segmentos de poliptidos
cortos (3 a 30 residuos de aa) y contiguos hacia unidades de
manera geomtrica.
Estructura terciaria: es el montaje de unidades estructurales
hacia unidades funcionales de mayor tamao (dominios).
Estructura cuaternaria: el nmero y los tipos de unidades
polipetdicas de protenas oligomricas y su distribucin espacial.

Estructura primaria
Es la ms simple estructuracin de protenas.
Corresponde a una cadena lineal de aminocidos
unidos por enlaces peptdicos. Pueden contener
puentes disulfuro.
Se ha determinado que al primer resduo de los
aminocidos se le denomina amino terminal y al
ltimo se le denomina carboxilo terminal.

ESTRUCTURA

SECUNDARIA

Est construida a base de la secuencia de la

cadena primaria
Formacin en plegamiento Hlice alfa y lamina
plegada beta.
Las cadenas se estabilizan por enlaces de H
entre grupos carbonilo y N H del esqueleto
polipeptidico.

HELICE ALFA
Es una forma compacta de las protenas
Estructura rigida en forma de varilla formada
cuando una cadena polipeptidica se retuerce.
Es necesario que exista un grupo N H para
formar los enlaces de hidrgeno intracadena que
son cruciales en la estructura de helice alfa.
En muchas hlices alfa predominan grupos
hidrofbicos en un lado del eje de la hlice e
hidroflicos en el otro (hlices anfipticas.
En los diagramas esquemticos se representan
como bucles.

La hlice alfa
La hlice alfa termodinmicamente es ms estable
como est configurada por sus puentes de hidrgeno.
El esqueleto polipetdico est torcido por una
cantidad igual alrededor de cada carbono alfa con un
ngulo fi de aproximadamente -57 y un ngulo psi
de alrededor de -47 .
La prolina no puede formar puente de H, por lo que
slo puede estar en el primer giro.
La capacidad anfiptica forma un poro que permite
que molculas polares pasen a travs de membranas
celulares hidrofbicas.

el ngulo phi (f) es la rotacin en torno al

enlace Ca-N ( -57)
el ngulo psi (y) es la rotacin en torno al
enlace C-Ca (-47)

54nm

Cada vuelta de
helice existen 3.6
residuos de
aminoacidos

LAMINA PLEGADA BETA

Formadas cuando se alinean de lado 2 o ms
segmentos de cadenas polipeptidicas en zigzag y los
grupos R apuntan en direcciones opuestas. Se
estabilizan por los puentes de hidrgeno.
No es tan compacta como las hlices alfa.
2 TIPOS :
Paralelas: cadenas polipeptidicas en la misma direccin.
Antiparalelas: cadenas en direccin contraria, mas
estables debido a que el enlace de H esta colineal.
En los diagramas esquemticos se representa como
flechas que apuntan en la direccin amino hacia el
carboxilo terminal.

Enlace de
H en linea

Asas y flexiones
Una protena puede tener hlices alfa y lminas beta y
otros segmentos cortos de AA con caractersticas
conformacionales extentidas con giros y flexiones.
Unen estructuras secundarias en reas adyacentes,
incluso para dar vuelta en 180 .
La prolina y la glicina estn presentes en giros beta.
Las asas son regiones que contienen residuos con
conformacin irregular que desempean funciones
clave en la catlisis, unin a DNA, sitios fcilmente
accesible o eptopos para reconocimiento y unin a
anticuerpos.

Colgena
Es un ejemplo de lmina beta. Es la protena ms
abundante del cuerpo.
Existen varias clases de colgenas y son el
principal componente del tejido conectivo tales
como el cartlago, tendones, matriz del hueso, de
la crnea del ojo.
Contienen 35% Glicina, 11% Alanina, y 21%
Prolina e hidroxiprolina.

Estructura terciaria

Estructuras terciarias

Estn formadas por estructuras secundarias y

primarias. Presentan un arreglo tridimensional en
forma globular interactuando uniones de tipo de
atraccin electrosttica, puentes de hidrgeno,
interaccin de cadenas no polares, puentes salinos,
fuerzas de Van der Waals y puentes disulfuro e
interacciones hidrofbicas.

Forman dominios (subunidades). Un dominio es una

seccin de estructura protenica que desempea una
tarea qumica o fsica particular como la unin de un
sustrato u otro ligando.

Se conocen protenas de uno, dos, tres, cuatro o ms

dominios. Otros dominios tienen otras funciones.

Mltiples factores estabilizan las estructuras terciaria y

cuaternaria

Estructura cuaternaria

Estructuras cuaternarias

Estn formadas por estructuras terciarias,

secundarias y primarias. Son agrupamientos de
varias cadenas polipetdicas en dominios.

Se clasifican en monomricas, dimricas,

trimricas o multimricas.

La hemoglobina es una protena tetramrica.

Analoga del telfono y los niveles de

estructuracin

La estructura tridimensional se determina

mediante cristalografa con rayos X o por
medio de espectroscopa con NMR
Con la cristalografa bajo condiciones ptimas de
pH, temperatura y sales, se cristalizan las
protenas a identificar, se congelan y se irradian
con rayos X monocromticos.
Entre mayor pureza tiene la protena, puede
fcilmente cristalizarse y conservarse en
polietilen glicol. La imagen se registra en una
placa fotogrfica.

Espectroscopa por resonancia nuclear

magntica.
Esta herramienta analtica se usa para
detectar y diferenciar entre los ncleos de los
tomos de una molcula. Se puede usar para
realizar anlisis qumicos especficos o para
determinar la estructura de especies orgnicas
e inorgnicas. Es un mtodo instrumental
altamente especializado que cada vez tiene
ms aplicaciones.
Mide la absorbancia de energa
electromagntica de radiofrecuencia por
ciertos ncleos atmicos (H1, C13, N15 y P31).

PLEGADO DE PROTENAS
La urea y cloruro de guanidina
causan desnaturalizacin y prdida
de la estructura terciaria.
Por ejemplo, 8 mol/L urea. Estos
reactivos son llamados agentes
desnaturalizantes.
La conformacin natural de una
proteina es favorecida desde el
punto de vista termodinmica.
El plegado es modular.
Protenas auxiliares ayudan al
plegado. Las protenas Chapern
participan en el plegado de ms de
la mitad de las protenas de
mamferos.

El plegado es un plegado dinmico, lo hacen miles de veces, el desdoblamiento

no es aleatorio y al hacerlo retienen contactos y regiones que facilitan el
replegado.

En las protenas disulfuro isomerasa, los enlaces disulfuro entre poliptidos,

estabilizan las estructuras terciaria y cuaternaria.
La coniguracin cis es en particular frecuente en giros beta.

Perturbacin de la conformacin de la
protena puede tener consecuencias
patolgicas

Las encefalopatas espongiformes transmisibles, o

enfermedades por prin, son enfermedades
neurodegenerativas mortales caracterizadas por
cambios espongiformes, gliomas astrocitos y prdida
neuronal originada por el depsito de agregados
protenicos insolubles en clulas neuronales.
Ejemplos la enfermedad de Creutzfeld-Jacob en seres
humanos y la enfermedad de las vacas locas en el
ganado.
Las enfermedades por prin pueden transmitirse
mediante la protena sola sin afeccin del DNA o el
RNA.

Patologas afectadas por plegamiento

Enfermedad de Alzheimer: Plegado errneo de la protena

amiloide en beta, pasando de un estado rico en hlice alfa
soluble a un estado abundante en hoja beta que se
autoagrega.

Talasemia Beta:
Son defectos genticos que alteran la sntesis de la
subunidad alfa. Un chapern que estabiliza a la cadena, que
en ausencia se precipita la hemoglobina.

Colgena y maduracin
postraduccional
Muchas protenas se sintetizan como proprotenas. La tripsina y
la quimotripsina son ejemplos tpicos.

La colgena es una protena fibrosa de secuencias de

aminocidos repetitivos de funcin estructural con un alto grado
de resistencia a la traccin.
La colgena forma una triple hlice torcida a la izquierda. Se
forma a partir de tres fibras de 1000 AA cada una denominadas
tropocolgeno. Al madurar forma una varilla alargada.
Se sintetiza como un precursor de menor tamao como
procolgena. Trastornos nutricionales y genticos pueden
alterar la maduracin del colgeno, como cuando se presenta el
escorbuto por deficiencia de vitamina C. Provoca sangrado de
encas, inflamacin de articulaciones, cicatrizacin inadecuada.
Otra enfermedad es el sndrome de Ehler-Danlos