Nucleoide

Citoplasma
Membrana
celular

Cpsula

Flagelo

Pili

Pared
celular

Reino Animalia

Clasificacin
tradicional

Reino Plantae

Tres Reinos:
Sistema de Haeckel
(1894)
Protistas atpicos

Reino
Protistas

Protozoa
Protophyta

Reino Planta
Reino Animal

Dominio
Prokarya

Esquema de
Margulis: dos

dominios
y 5 reinos

(1988-1996)

Reino Bacteria
Reino Protoctista
Reino Fungi

Dominio
Eukarya

Reino Plantae
Reino Animalia

Cuatro
Subdominios
(Mayr 1990)

Dominio
Prokaryota

Subdominio Eubacteria
Subdominio Archaebacteria

Dominio
Eukaryota
Subdominio Protista

Subdominio
Metabionta

Reino Metaphyta (Plants)

Reino Fungi
Reino Animalia

Sistema de Copeland: cuatro

Reinos (1956)

Reino Mychota
Reino Protoctista

Reino Plantae

Reino Animalia

Reino Monera

Reino Protista

Reino Plantae

Whittaker: Cinco
Reinos (1969)

Reino Fungi

Reino Animalia

Tres Dominios (Woese 1990)

Dominio Bacteria
Dominio Archaea
Dominio Eucarya

Cavalier-Smith 1998
Suprareinos y Seis Reinos

Superreino Prokaryota
Reinos Bacteria
Superreino Eukaryota
Reino Protozoa
Reino Animalia
Reino Fungi
Reino Plantae
Reino Chromista

La lnea verde indica origen bacteriano de los

cloroplastos
La lnea roja indica origen bacteriano de las
mitocondrias

DOMINIOS: Caracteres que

los definen

BACTERIA

ARCHEA

EUKARYA

Clulas

procariotas

eucariotas

Ncleo con

NO

SI

Membranas
lipdicas
organelas

ribosomas

enlazados
por ster,
no
ramificados

enlaces eter,
ramificado
NO

enlazados
por ster,
no
ramificados
SI

70S

80S

La taxonoma es la ciencia de la clasificacin, agrupa y separa los

organismos vivos de acuerdo a sus caractersticas fenotpicas o
genticas. Para propsitos de clasificacin, los organismos usualmente
son reconocidos en rdenes superiores, familias, gneros, especies y
subespecies.
Es una ciencia ARTIFICIAL,
ARTIFICIAL influida por los avances en las
tcnicas.
SE DIVIDE
1.

CLASIFICACION

2.

NOMENCLATURA

3.

IDENTIFICACION

Es la ordenacin de los microorganismos en grupos o taxones en

funcin de semejanzas mutuas o de parentesco evolutivos

El objetivo es el de ser ESTABLE, OBJETIVA Y PREDICTIVA

Es la asignacin de un nombres especfico a los grupos taxonmicos de

acuerdo a criterios y normas preestablecidas y adminitidas
internacionalmente

Es la parte prctica de la taxonoma, dado que permite encuadrar un

determinado organismo en un grupo taxonmico previamente
establecido

Las distintas categoras taxonmicas se definen por las propiedades y

caractersticas que poseen las bacterias que las integran.

Los datos reciben el nombre de caracteres taxonmicos.

taxonmicos E incluyen
caracteres fenotpicos, genticos y quimiotaxonmicos.
quimiotaxonmicos

FENOTPICOS

1) MORFOLGICOS
2) BIOQUMICAS/FISIOLGICAS
3) SEROLGICAS
4) FAGOTIPIA
5) PRUEBAS DE INHIBICIN

GENTICOS

1 ) ADN / ARN: contenido de G+C, hibridacin

ADN-ADN, secuenciacin del ARNr

QUIMIOTAXONMICOS
1) MEMBRANA CITOPLASMTICA: cidos grasos, tipos de
lpidos polares, presencia de cidos miclicos
2) PARED CELULAR: tipos de peptidoglucano, presencia de
cidos teicoicos
3) PROTENAS: comparacin perfil protenas, secuencia de
aminocidos

T
A
X

ENFOQUE
CLSICO

O
N
O

TAXONOMA
NUMRICA

ENFOQUE GENTICO O
MOLECULAR

Usa las caractersticas bioqumicas, morfolgicas y culturales, as como

las susceptibilidad a los antibiticos y compuestos inorgnicos, para
determinar el grado de similitud entre organismos.

Se calcula luego un coeficiente o porcentaje de similitud.

similitud

Se construye un dendrograma o matriz de similitudes entre los

organismos.

Ejemplo de codificacin de datos

Estados
Caracterstico
s

Cepa A Cepa B Cepa C Cepa D

10

11

12

Coeficiente %S dispuesto de manera arbitraria

10

11

12

100 50

48

56

84

49

39

51

52

51

53

48

50 100 50

85

51

53

43

51

93

49

48

94

48

50 100 52

50

34

32

86

52

93

89

50

56

85

52 100 57

54

39

58

93

54

52

89

84

51

50

57 100 51

41

52

53

52

56

59

49

53

34

54

51 100 89

80

55

82

87

53

39

43

41

39

41

89 100 29

43

29

39

44

51

51

85

58

52

80

29 100 80

88

78

51

52

93

52

93

53

55

43

80 100 51

50

89

10

51

49

93

54

52

82

82

29

88 100 81

49

11

53

48

89

52

56

87

39

78

50

81 100 48

12

48

94

50

89

59

53

44

51

89

49

48 100

2
12

94

85

89

93

89

93

50

50

52

52

10

49

49

54

51

93

11

48

48

52

50

89

81

51

51

58

80

86

88

78

53

53

54

55

34

82

87

80

43

44

39

43

32

29

39

29

89

50

48

56

52

48

51

53

51

49

39

51

59

57

53

50

52

56

56

51

41

84

12

10

11

%S agrupados

DENDROGRAMA
GRUPO
50

60

70

80

90

100

C freundii

C diversus

Citrobacter

Escherichia coli
GNERO Y ESPECIE

1,0

0,92 1,0

3
4

0,81 0,77
0,27 0,31

1,0
0,29

1,0

0,43 0,41

0,45

0,30

1,0

0,38 0,42

0,44

0,32

0,72

1,0

Bacteria

El significado ideal de la identificacin y clasificacin debe

ser comparar la secuencia de cada secuencia de genes en una
cepa dada, con la secuencia de genes para cada especie conocida.

El mtodo que se usa es la hibridizacin.

hibridizacin

Este mtodo puede ser usado para medir el nmero de secuencias

de DNA que dos organismos cualesquiera tienen en comn y para
estimar el porcentaje de divergencia dentro de las secuencias de DNA
que estn relacionadas pero no son idnticas.

VENTA
JAS D
CLASI
EL
FICAC
ION G A
ENETI
CA
BRINDA UN CONCEPTO MS UNIFICADO
DE ESPECIE
ES MS OBJETIVA Y ESTABLE
SE PUEDEN ORGANIZAR ESQUEMAS DE
IDENTIFICACIN FIDEDIGNOS
INDICA CMO EVOLUCIONARON LOS
MICROORGANISMOS Y CMO PUEDEN
AGRUPARSE

ESPECIE

Grupo taxonmico bsico

Menos definido que para organismos superiores
Rasgos morfolgicos no tan importantes
Puede ser considerada como una coleccin de cepas que
muestras
muchos
rasgos
en
comn
y
difieren
considerablemente de otras cepas
Una CEPA de una especie es considerada como CEPA TIPO
(comparar)

SUBESPECIE

Basada en variaciones fenotpicas y genotpicas

menores, pero constantes. Es la categora ms baja
aceptada oficialmente

CATEGORAS
INFRASUBESPECIE
Nombre preferido

Sinnimo

Cepas que tienen

biovar

biotipo

prop bioqumicas o fisiolgicas

especiales

serovar

serotipo

prop antignicas distintivas

patovar

patotipo

prop patognicas para ciertos

animales

fagovar

fagotipo

morfovar

morfotipo

lisis por ciertos fagos

rasgos morfolgicos
especiales

TIPOS DE CLASIFICACIN

1) FENTICAS O FENOTPICAS
2) FILOGENTICAS O FILTICAS

Contenido en G + C de microorganismos.
%C+G

Organismo

%C+G

Organismo
Procariotas

Staphylococcus

30-38

Bacillus

32-62

Streptococcus

33-44

Caulobacter

63-67

Thiobacillus

52-68

Chlorobium

49-58

Treponema

25-54

Clostridium

21-54

Algas

Escherichia

48-52

Chalmydomonas

60-68

Micrococcus

64-75

Tetrahymena

19-33

Mycobacterium

62-70

Moho mucoso

Mycoplasma

23-40

Dictyostelium

Nitrobacter

60-62

Hongos

Proteus

38-41

Amanita muscaria

57

Pseudomonas

58-70

Candida albicans

33-35

Salmonella

50-53

Animales

30-50

Plantas superiores

30-50

Spirillum

38

22-25

Contenido en G + C de estirpes de bacterias

que pertenecen a la misma especie

Especie de Pseudomonas Nmero de

estirpes
estudiadas

Moles por ciento

de C + G

P. aeruginosa

11

67,2+1,1

P. acidovorans

15

66,8+1,0

P. testosteroni

61,8+1,0

P. cepacia

12

67,6+0,8

P. pseudomellei

69,5+0,7

P. putida

62,5+0,9

Se comparan macromolculas que se comportan como

cronmetros evolutivos.
Sus caractersticas son:
1.

distribucin universal

2.

realizar la misma funcin en todos los seres vivos

3.

sus secuencias deben permitir la identificacin de

regiones de homologa y heterogeneidad
4. la tasa de cambio de la secuencia de la
macromolcula debe estar en correlacin con la
distancia evolutiva

EL USADO ES EL ARNr, Y DENTRO DE ELLOS EL 16S

A. TINCIN: Gram, AAR, Cpsula

B. MTODOS BIOQUMICOS: actividad enzimtica, medios selectivos
C. MTODOS SEROLGICOS: aglutinacin en porta, ELISA, IFI
D. TIPIFICACIN POR BACTERIFAGOS: altamente especficos (placa)
E. SECUECIACIN DE AMINOCIDOS
F. PERFIL DE CIDOS GRASOS
G. COMPOSICIN DE BASES DEL DNA: % de G+C
H. HIBRIDIZACIN DEL DNA

CULTIVO PURO

MORFOLOGA DE COLONIA Y GRAM

CARACTERSTICAS DE
CRECIMIENTO

PROPIEDADES
BIOQUMICAS

PROPIEDADES
ANTIGNICAS

CARACTERSTICAS GENTICAS O MOLECULARES

PORCENTAJE DE G+C

HIBRIDACION

ESTABILIDAD TRMICA

DIFICULTADES EN LA
IDENTIFICACIN

Asegurarse que se trabaja con un cultivo PURO

Trabajar desde categoras mayores a menores
APLICAR EL SENTIDO COMN EN CADA PASO
Usar el menor nmero de pruebas
Comparar el aislamiento con cepas tipo o de
referencia

DIFICULTADES EN LA
IDENTIFICACIN

CUANDO NO SE LOGRA IDENTIFICAR EL

AISLAMIENTO:
Controlar pureza
Asegurarse que se han realizado las pruebas
apropiadas
Controlar que los mtodos sean confiables
Que se han usado correctamente las distintas claves y
tablas

Diagnstico

Investigaciones

Clnico

No microbiolgicas
Tomar correctamente
Rotular y embalar adecuadamente
Almacenar y transportar correctamente

No teidos o
teidos con Gram u
otra tincin
Caracterstica de colonia,
morfologa, hemlisis, pigmento,
etc.
Por difusin en
discos
o MIC

Serologa

Tecnologas
de DNA

CLASIFICACION DEL DOMINIO BACTERIA (Bergey 2001)

El Manual Bergey categoriza a las bacterias en taxones basados en la secuencia
de ARNr
Por otra parte lista caractersticas identificatorias de las bacterias tales como:
morfologa celular, coloracin de Gram, requerimientos de oxgeno

las bacterias del phylum Proteobacterias son Gram negativas

Alfa Proteobacterias: los integrantes de este sub-phylum crecen
con niveles bajos de nutrientes (oligotrficos), algunos poseen
prostecas (prolongaciones celulares) . Incluye a fijadores de
nitrgeno, quimioautotrofos y quimioheterotrofos
Beta Proteobacterias: los integrantes de este sub-phylum habitan
en el agua y suelo. Algunos son patgenos humanos, incluyen
quimioautotrofos y quimioheterotrofos. Bordetella, Burkholderia,
Neisseria

Gama Proteobacterias: incluye los ordenes Pseudomonadales,

Legionellales, Vibrionales, Enterobacteriales, Pasteurellales,
Francisella

Delta Proteobacterias: incluye los gneros Myxococcus y

Bdellovibrio, parsitos de otras bacterias y el gnero Desulfovibrio

Epsilon Proteobacterias: incluye los patgenos humanos

Campylobacter y Helicobacter

Bacterias Gram negativas No-proteobacterias

Las phyla de bacterias Gram negativas no relacionadas filogeneticamente a

Proteobacteria se clasifican en varios phyla de Gram negativas no
Proteobacterias

1. El phylum Cyanobacteria corresponde a los fotoautotrofos que utilizan la

luz como fuente de energa y CO2 como fuente de carbono y producen
O2 durante la fotosntesis

2. Los quimioheterotrofos incluyen Chlamydia (phylum Planctomyces),

Bacteroides (phylum Bacteroides), Fusobacterium (phylum
Fusobacteria) y Treponema, Borrelia y Leptospira (phylum Spirochetes).
Muchos de ellos patgenos humanos

El Manual Bergey divide a las bacterias Gram Positivas de

acuerdo a su contenido de G+C

1. Bacterias Gram Positivas de alto contenido de G+C (phylum Actinobacteria)

incluye el importante gnero Mycobacterium y los gneros filamentosos
Actinomyces y Streptomyces, formadores de conidiosporas. Los no
formadores Nocardia y Frankia tambin se incluyen aqu. Corynebacterium,
Propionibacterium

2. Bacterias Gram Positivas de bajo contenido de G+C (phylum Firmicutes)

incluye a las bacterias del suelo, las lcticas y numerosos patgenos. Los
rdenes Clostridiales (Clostridium), Bacillales (Bacillus) Lacobacilalles
(Staphylococcus, Streptococcus, Listeria y Lactobacillus). Tambin incluye a
Micoplasmas (todava clasificados como Gram negativos), pero como se tien
dbilmente por su falta de pared, se incluyen entre las bacterias Gram
positivas de bajo contenido de G+C

Las bacterias fotosintetizadoras verdes (sulfreas y no sulfreas) y las prpuras

(sulfreas y no sulfreas) son fotoautotrofas gram negativas que usan energa
luminosa y CO2 como fuente de carbono y no producen O2 (anoxignicas). Se las
clasifica por una parte dentro de dos sub-phyla diferentes de las Proteobacterias
y por otra dentro de las no Proteobacterias

El estudio cientfico de los tipos y diversidad de

organismos y de cualquiera y todas las relaciones
entre ellos " (Simpson, 1961)

REINOS

Animalia

1753

C. Linnaeus

2 Reinos
Plantae

1800s E. Haeckel

3 Reinos

Animalia
Plantae
Protista

REINOS
Animalia
Plantae
1969 H.R. Whitaker 5 Reinos

Protista
Fungi
Monera
Eukaryotes

1977 C. Woese 3 Reinos

Eubacteria

Archaebacteria

REINO
DIVISIN I: Gracilicutes
CLASE I: Scotobacteria
CLASE II: Anoxyphotobacteria
CLASE III: Oxyphotobacteria
DIVISIN II: Firmicutes
CLASE I: Firmibacteria
CLASE II: Thallobacteria
DIVISIN III: Tenericutes
CLASE I: Mollicutes
DIVISIN IV: Mendosicutes
CLASE I: Archaobacteria

Procaryotae

REINO
Animalia

REINO
Procaryotae

Phylum: Cordata

Gracilicutes

Clase: Mammalia

Scotobacteria

Orden: Primates

Spirochaetales

Familia: Hominidae
Gnero: Homo
Especie: sapiens

Spirochaetaceae
Treponema
pallidum

Las Proteobacterias son uno de los principales grupos de bacterias.

Patgenas y de vida libre, e incluyen muchas de las bacterias responsables
de la fijacin del nitrgeno.Gram negativas, con una pared celular formada
principalmente de lipopolisacridos. Muchas se mueven utilizando flagelos.
La mayora de las proteobacterias son anaerobias, pero hay muchas
excepciones. La nutricin es usualmente hetertrofa,pero hay grupos que

realizan fotosntesis. Las proteobacterias se dividen en cinco grupos, usualment

considerados clases, segn los estudios de las secuencias de ARNr.
Estos grupos se denominan segn las letras griegas de alpha a epsilon

Proteobacterias alpha
Las proteobacterias alpha abarcan la mayora de los gneros fototrofos,
pero tambin varios gneros que metabolizan componentes C1,
simbiontes de plantas (por ejemplo, rhizobia) y de animales y un
grupo de patgenos peligrosos, Rickettsiaceae. Por otra parte, se
piensa que los precursores de las mitocondrias de la clulas
eucariotas se han originado en este grupo bacteriano.

Proteobacterias beta
Las proteobacterias beta abarcan varios grupos de las bacterias aerobias
o facultativas que son a menudo altamente verstiles en sus capacidades
de degradacin, pero tambin contienen gneros quimiolitotrficos
y algunos fototrofos. Las Proteobacterias beta juegan un papel importante en la
fijacin de nitrgeno en varios tipos de plantas, oxidando amonio para producir
nitrito, un producto qumico importante para la funcin de las plantas.
Muchas de ellas se encuentran en muestras ambientales, tales como aguas residuales
o el suelo. Especies patgenas dentro de esta clase son Neisseriaceae
(que causa gonorrea y meningoencefalitis) y las especies del gnero Burkholderia.

Proteobacterias gamma
Las proteobacterias gamma abarcan varios grupos de bacterias importantes para
la ciencia y la medicina tales como Enterobacteriaceae, Vibrionaceae y
Pseudomonadaceae.
Este grupo incluye varios patgenos importantes, como por ejemplo, Salmonella
(enteritis y fiebre tifoidea), Yersinia (peste), Vibrio (clera), Pseudomonas aeruginosa
(infecciones del pulmn en pacientes hospitalizados o con fibrosis qustica).

Proteobacterias delta
Abarcan un grupo de gneros predominante aerobios, myxobacteria, que
forman cuerpos fructferos y un grupo de gneros estrictamente anaerobios,
que contienen la mayor parte de las bacterias reductoras de sulfato y de las
bacterias reductoras de sulfuro junto con otras bacterias anaerobias con
diferente fisiologa.

Proteobacterias epsilon
Comprenden solamente unos pocos gneros, principalmente Wolinella, Helicobacter y
Campylobacter,que tienen forma helicoidal. La mayor parte de las especies conocidas
habitan en el tracto digestivo de seres humanos y animales y proporcionan servicio como
simbiontes (Wolinella en el ganado vacuno) o son patgenos (Helicobacter en el
estmago, Campylobacter en el duodeno). Tambin se han recuperado numerosas
secuencias ambientales de respiraderos fros e hidrotermales.