Bioqumica

Metabolismo Catabolismo e Anabolismo

Como retirar energia do ambiente?
Como sintetizar molculas (biomolculas)?

Curso
1- Viso estrutural que so acares, protenas, lipdios e cidos
nuclicos.
2- Viso Energtica. Termodinmica.
3- Metabolismo do nvel celular ao de rgos e tecidos, e de
organismos
Associar Fisiologia, Biomol, Nutrio e Ambiente

Como possvel a separao do meio externo do meio

Interno?
Compartimentalizao?
Quais as Bases Fsicas e Qumicas?

A partir deste experimentos- Miller (teoria de Oparin) ficou

estabelecido a formao de vrios outros compostos como:
-Aminocidos
-cidos Nuclicos e
-cidos Graxos ......... Chave para a formao de colides
Colides = Emulses leo em gua ou gua em leo

Separa as coisas Hidroflicas de Hidrofbicas..

Coacervados so partculas coloidais (nanmetros)

~ 1 nm at ~ 1000 nm
O que deve ter na interface Gota gua???

Estrutura e Propriedades de
H2 O
-ngulo de ligao
-polaridade
-tenso superficial
-dissoluo de espcies
-coesividade

H2O o nico Lquido inorgnico que ocorre naturalmente na Terra.

Ocorre naturalmente nos trs estados Slido, Lquido e Vapor

Existe no planeta antes da Vida. A Vida segundo nossos conceitos H2O

Ciclo Hidrolgico (Combusto, Fotossntese) Ouro do prximo sculo

Slido Lquido (s aumento de desordem? Por que densidade de 0 4

0
C?

Gs Lquido (s aumento de densidade?)

Lquido de 0 `a 100 0C. Por que faixa to alta?

Entre as propriedades ditas anmalas de

H2O lquida. Esto aquelas que as
diferenciam de outros lquidos. H2O como
slido tb diferente de outros slidos.
Como gs um dos mais leves,
Como lquido muito denso,
Como slido pouco denso,
A vida depende destas propriedades
anmalas.
-Alta coeso alto ponto de fuso, alta
capacidade trmica. Contribuem para
regulao trmica
- Alto calor latente de evaporao
..resistncia evaporao. Excelente
solvente para compostos inicos e polares.

Anomalias de gua (mais importantes)

1. Alto ponto de fuso H-pontes no slido
2. H2O alto ponto de ebulio. H-pontes no lquido

Como Lquido gua muito mais denso

que o esperado!!!

E como Slido muito mais leve que o

esperado!!!!

Gas

Liquid

Solid

Emulsion!
Phase Separate!

Gmix >> Gseparado

Add surfactant

Qual o estado de polmeros naturais em gua?

Protenas?
DNA, RNA?
Lipdios?
Qual deve ser a viscosidade () destas solues ?
Qual o efeito de sais?
Como devem ser o estado dos chamados Gis?

pOH = -log[OH-]

the negative log of the hydroxide ion molarity

pKw = -log Kw

the negative log of the water ion product , Kw

pKa = -log Ka

the negative log of the acid dissociation constant, Ka

pKb = -log Kb

the negative log of the base dissociation constant, Kb

cidos e Bases - Bronsted

HA + H20 <---> H3O+ + AKa = [H3O+]*[A-]/[HA]

Comosese
mede
pH???
Como
mede
pH?

ACID + BASE = SALT + WATER

Titration curve for weak acid/strong base. (Figure by MIT OCW.)

Polyprotic Acid-Strong Base

Derivation of the first Henderson-Hasselbach Equation

Como seria uma curva de titulao de um

polipeptdeo?

Qual o pH do sangue? E quais espcies atuam como tampo?

QBQ 4020N
aula 2

Objetivo Principal Metabolismo!!!!

Clulas Podem ser Ensinadas!!!!
Ex. Leveduras lcool

Precisa aprender qual a Fonte:

Brasil Cana de Acar
USA Milho!!
Qual a Diferena???

Ver Scientific America Br de Agosto

Capim Biodiesel

 necessrio otimizar condies de fermentao pH, condies

De contorno, fronteira. Quais nutrientes?
Quais condies o conjunto de enzimas so expressos?
Serve tambm para doenas, trabalhos de msculo condicionamento
Fsico etc.
Nossa inteno compreender como a mquina celular, tecidual, por
rgos e por Organismos se comportam !
No aprendizado de Genes e Bilo.Molecular, buscamos aprender como
Atuar em nvel Gentico.
Incio do curso Qual o cenrio? H2O Propriedades:
Polaridade
Proticidade
cidos-Bases
Cargas de molculas Interaes Eletrostticas
Pontes de H, Van der Valls etc..

Quais so os Blocos Construtores??

Amino cidos Proteinas ENZIMAS!!!
Lipdios Membranas, Reserva Energia
Acares Estruturas, Reconhecimento, Energia
cidos nuclicos Material Gentico

Ainda que muito se fale de Genomas (sopa de letrinhas)

O quente so os ENZIMAS!!!
Permite acelar at 108 x velocidade de reaes...
Controle de fluxos
METABOLISMO ENZIMAS

Conhecemos ~500 AAs,

Somente 20 constituem essenciais
Valina, Leucine, Isoleucine, Alanina, Arginina,
Glutamina, Lisina, Aspartico Glutamatico,
Prolina, Cisteine, Treonina, Methionina,
Histidina, Phenylalanina, Tyrosina,
Triptofano, Asparagina, Glicina, Serina
= Essenciais

Alimentao protica fornece AAs livres que so remontados

para formar protenas do corpo

Em 1806, 10 amino acid descoberto do aspargo asparagine.

Aps cisteine, glicine, and leucine de clculo urinrio, gelatina

msculo e algodo. Por cerca de 1935 todos AAs conhecidos

6M HCl
Protena AAs livres

 Amino-cidos

20 AA essenciais

Aminocidos Hidrofbicos 1

Aminocidos Hidrofbicos 2

Aminocidos Carregados

AA polares 1

AA polares2

AA Hidrofbicos

O pKa do cido Actico 3HC-COOH 4.5,

O pKa do R-NH3+ 10

Por que os pKas dos grupos carboxila e Amnio

dos AAs so menores? ~2, e ~9 respectivamente?

AAs em protenas so via de regra L !

Ser a vida Quiral???
Ser que tem a ver com a sntese de protenas
RNAm????

Reao de Ninhidrina

UV-Vis espectro, 280 nm

Mtodos identificar aas

Aminas 1rias Violeta

Aminas 2rias Amarelo (Prolina)

Excepto pelo Triptofano os outros AAs so pouco fluorescentes

Porm existem associaes que levam a fluorescncia
O que fluorescncia ????

Estrutura tri-D de proteinas, note a proteina escrita do N terminal

(esquerda) para o C terminal (direita).
A sequncia nica Sequncia 1ria.

Composio: Hidrolisa com HCl 6M Sabe quantos AAs tem!

Separa em colunas ou acende!
E a Sequncia 1ria??

Reage no N-terminal, repete processo vrias vezes

Hoje em dia sntese e gerao de protenas +/- fcil

Proteoma!!!