Bioinformtica

Informtica em Biodiversidade

O docente: Autores:
Paulo Fazendeiro PhD
Domingos C. Dionisio M8248;

Domingos F. Oliveira M8246

Orlando J. Cawende M8247
 Tpicos
Introduo
Problema da investigao
Objetivos
Justificao (relevncia do tema)
Metodologias (como foi feito O estudo)
Organizao do projeto
Estado da arte
Histria da informtica em biodiversidade
Ferramentas aplicados em informtica em biodiversidade
Discusso
Desafios para A informtica em biodiversidade
Concluso
Referncias bibliogrfica

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 O que ?
a variedade de vida na Terra em todos os
diferentes nveis de organizao
biolgica. Em menor escala, a
biodiversidade pode ser usada para
descrever a variedade na composio
gentica de uma espcie, e em uma escala
maior, ela pode ser usada para descrever a
variedade de tipos de ecossistemas (site
study.com, 2017).

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 Introduo
O desenvolvimento econmico, nas ltimas dcadas, tem acelerado
o processo de destruio do ecossistema, aumentando a demanda
por ferramentas de apoio tomada de deciso no que se refere
conservao da biodiversidade.
Tal facto uma realidade nos dias de hoje e desta forma tem
surgidos novas reas de investigao que procuram dar respostas a
esses problemas.
A Biologia e a Informtica tm andado de mo dadas, prova disso
as diversas reas que tm surgido. reas com algoritmos genticos
e evolutivos, biologia computacional, redes neurais artificiais,
gentica computacional e ecologia matemtica, so hoje vrias
dessas denominaes que tipicamente fazem uma interao entre a
Informtica e a Biologia para tentar dar resposta aos diversos
problemas que esto no foro da biodiversidade e desta forma
permitir maior disponibilidade e partilha de dados.

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 Problema da investigao
Pergunta central da investigao
Que papel tem a informtica no armazenamento de informaes sobre a
biodiversidade e o ecossistema?

Questes para investigao

Qual a importncia das diversas colees de histria natural para o
estudo da biodiversidade?
Quais so as ferramentas informtica que so utilizadas para o
armazenamento de informaes sobre biodiversidade.
Ser importante implementar um sistema de informao para
armazenamento de dados sobre a biodiversidade em angola (futuro)?

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 Objetivos
Objetivo geral
Realizar um estudo sobre o contexto da Informtica em Biodiversidade,
como uma rea fundamental no contexto mundial, de modo a garantir a
manuteno dos servios do ecossistema.

Objetivos especficos
Evidenciar a importncia das colees de histria natural para o estudo
da biodiversidade.
Apresentar algumas ferramentas informtica que so utilizadas para o
armazenamento de informaes sobre biodiversidade.
Implementar um sistema de informao para armazenamento de dados
sobre a biodiversidade em angola (futuro).

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 Relevncia do tema
O planeta tem passado por uma crise de sustentabilidade decorrente da
dificuldade em se estabelecer um equilbrio entre o desenvolvimento
econmico e social e a conservao do meio ambiente e da biodiversidade
segundo BRUNDTLAND (1987) citado por VEIGA, (2012).

A degradao da biodiversidade ou diversidade biolgica, pode afetar a

sociedade e o planeta de forma geral. Segundo SCHNASE (2007) citado por
VEIGA (2012), a biodiversidade e os ecossistemas so responsveis por nos
fornecer ar puro, gua potvel, alimento, vesturios, abrigos e frmacos.

Veiga (2012), ainda diz que as aes de conservao e de uso sustentvel da

biodiversidade para que sejam efetivas, necessrio avaliar e monitorar de
maneira integrada e contnua o status do risco de perda de recursos, por
meio da coleta, armazenamento, anlise, simulao, visualizao e
intercmbio de um volume expressivo de informaes.

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 como foi feito o estudo ?
A consulta de literaturas de vrios autores com
conhecimento do tema na atualidade e
antecedentes do mesmo tema.

Na consulta, tais materiais foram encontrados

vrios artigos que tratam sobre a informtica em
biodiversidade e as ferramentas utilizadas para o
armazenamento da informao sobre a
biodiversidade e o ecossistema.

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 Organizao do projeto
O presente trabalho est constitudo por 3
captulos, distribudos da seguinte forma:
Estudo da Arte: procurou-se falar sobre os principais
conceitos, histria e sobre alguns artigos que abordam
a temtica de informtica para biodiversidade.
Discusso: importncia da informtica em
biodiversidade e nos ecossistemas, quais ferramentas
so utilizadas.
Concluses do Trabalho: nossas contribuies e as e
propostas para trabalhos futuros.

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11
 Histria
Segundo a WIKIPDIA (2017) a informtica em biodiversidade surgiu com
as primeiras construes das bases de dados taxonmicas
computadorizadas no incio da dcada de 70.

Nos finais de 1990 teve um maior progresso com o desenvolvimento

sequenciais de ferramentas de pesquisas distribudas, incluindo o Analista
de Espcies da Universidade de Kansas, a North American Biodiversity
Information Network NABIN, CONABIO no Mxico e outros o
estabelecimento do Global Biodiversity Information Facility em 2001 [2].

Segundo a correspondncia reproduzida por Walter Berendsohn o termo

"Biodiversity Informatics" foi cunhado por John Whiting em 1992 para
cobrir as atividades de uma entidade conhecida como Canadian Biodiversity
Informatics Consortium, um grupo envolvido na fuso de informaes sobre
biodiversidade bsica com economia ambiental e informaes geoespaciais
sob a forma GPS E SIG.

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 Ferramentas aplicados em
informtica em biodiversidade
Na ltima dcada foram desenvolvidas ferramentas que permitem
fazer inferncias sobre a diversidade e abundncia de espcies em
biomas e regies distintas.

A digitalizao de registos de museus e herbrios est em

andamento em todo o mundo, e inmeras bases de dados de
biodiversidade on-line tm sido criadas para servir como
repositrios de dados.

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 GBIF Portal de
biodiversidade

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 Biodiversity Information
Standards

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 Servios de georreferenciao
em biodiversidade

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 Discusso
... gostaramos agora de prever resultados de sade pblica e
ecolgicos num futuro prximo, infelizmente, atualmente
ainda no temos as tecnologias para fazer...

Se quisermos acompanhar a nossa necessidade de

informao de qualidade sobre os sistemas vivos do nosso
planeta, devemos produzir mecanismos que possam gerir de
forma eficiente petabytes de uma nova gerao de dados de
satlite de alta resoluo e observao da Terra.

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 Desafios para a informtica
em biodiversidade
Segundo um relatrio de um Workshop, onde estiveram representantes da
NSF, USGS, NASA sobre Biodiversidade e Informtica de Ecossistemas, h
claramente reas em que a cincia da computao e a pesquisa em
tecnologia da informao podem ser avanadas com grande benefcio social
e cientfico focalizando os desafios na biodiversidade e no domnio do
ecossistema [13]:
aquisio e converso de dados;
anlise e sntese de dados;
disseminao de dados.
... surgem outras oportunidades derivadas das primeiras, que passam pela
utilizao de novas ferramentas desenvolvidas pela informtica,
ferramentas essas que passam pela utilizao de Data Mining, Cloud
Computing, Computao Mvel, Realidade Virtual, Robtica e outras que
podero surgir...

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 Concluso
Relacionado aos diversos esforos que se tem feito para a proteo
do ecossistema, onde a utilizao de ferramentas informticas,
possui um desempenho eficiente para o processamento, tratamento
e armazenamento de informaes.
Novos servios, e ferramentas modernas como a computao em
cloud, realidade virtual, robtica e no s, pode ser alocado maior
informaes em poucos minutos, garantido melhor estudos e
pesquisas no ramo.
A informtica joga um papel fundamental para a resoluo de
diversos problemas no ambito da biodiversidade e novas
ferramentas e servios pode ajudar de que maneira a otimizar
melhor os recursos que o nosso ecossistema nos apresenta, dando
maior impulso para que os decisores se preocupem mais, j que
do mesmo que toda a vida neste planeta depende.

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 Referncias Bibliogrfica
1. GBIF Global Biodiversity Information Facyility. Estabelecer um N de Participante do GBIF Eficaz: Conceitos e consideraes
gerais. Disponvel em Disponvel online em http://www.gbif.org/resource/82231. Acesso ao 02 de Maio de 2017.
2. Portal Wikipdia, Informtica em Biodiversidade. Disponvel em https://en.wikipedia.org/wiki/Biodiversity_informatics. Acesso
aos 02 de Maio de 2017.
3. VEIGA, Allan Koch. Um estudo sobre qualidade de dados em biodiversidade: aplicao a um sistema de digitalizao de ocorrncias
de espcies. Disponvel em http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/3/3141/tde-03052012-120914/pt-br.php. Acesso aos 02 de
Maio de 2017.
4. DECK, John, BARKER, Katharine e outros. Clarifying Concepts and Terms in Biodiversity Informatics. Disponvel em
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3746421/pdf/sigs.3907833.pdf. Acesso aos 03 de Maio de 2017.
5. JNIOR, Etienne Amrico Cartolona. Proposta de um sistema de informao orientado a servios sobre a biodiversidade de
abelhas. Disponvel em http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/3/3141/tde-23092009-151526/en.php. Acesso aos 03 de Maio
de 2017.
6. WHITAKER, Melissa R. L., JIRON, Joey and MAASS, Bryan. Developing Mobile Tools for Biodiversity Informatics and Natural
History Education. Disponvel em http://naturalhistorynetwork.org/wp-content/uploads/2014/12/Whitaker-etal. v8.29-33.pdf.
Acesso aos 04 de Maio de 2017.
7. MOZZHERIN, Dmitry. LEARY, Patrick e outros. Reusable biodiversity informatics tools. Disponvel em
www.vliz.be/imisdocs/publications/300275.pdf. Acesso aos 04 de Maio de 2017.
8. CHAURASIA, Girdhari L. and KUMARI, Vineeta. Biodiversity Conservation and Management: Tools and Techniques. Disponvel
em http://www.isca.in/IJENS/Archive/v4/i2/13.ISCA-IRJEvS-2014-163.pdf. Acesso aos 04 de Maio de 2017.
9. Portal IMasters. Conexo e rplica de dados em banco de dados distribudos heterogneos Parte 01. Disponvel em
https://imasters.com.br/banco-dedados/postgresql/conexao-e-replicacao-de-dados-em-banco-de-dados-distribuidosheterogeneos-
parte-01/?trace=1519021197&source=single. Acesso aos 05 de Maio de 2017.
10. Portal Wikipdia. Lista de bases de dados sobre biodiversidade. Disponvel em
https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_biodiversity_databases. Acesso aos 05 de Maio de 2017.
11. Portal GBIF. What is GBIF. Disponvel em http://www.gbif.org/what-is-gbif. Acesso aos 05 de Maio de 2017.
12. Portal TDWG. About Us Biodiversity Information Standards (TDWG). Disponvel em http://www.tdwg.org/about-tdwg/. Acesso
aos 06 de Maio de 2017.
13. MAIER, Dave; LANDIS, Eric; CUSHING, Judy; FRONDORF, Anne; SILBERSCHATZ, Avi; and SCHNASE, John L. Research
Directions in Biodiversity and Ecosystem Informatics. Disponvel em http://web.cecs.pdx.edu/~maier/BDEIdraft.pdf. Acesso aos
07 de Maio de 2017.
14. http://study.com/academy/lesson/what-is-biodiversity-definition-and-relation-to-ecosystem-stability.html
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Muito obrigado
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