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GENETICA BACTERIANA

Gentica
Disciplina que estudia los mecanismos por los
cuales los caracteres pasan de un organismo a
otro
La gentica microbiana es importante por
diversas razones
Esta compuesto por ADN, llamado tambin
Genforo, Cromosoma procariotico.
En algunos tambin elementos mas pequeos
denominados Plsmidos.
El gen es la base del funcionamiento celular y la
investigacin bsica en la gentica microbiana
Los microorganismos son sistemas relativamente
simples para estudiar los fenmenos genticos y en
consecuencia son empleados como herramienta en
los intentos de descifrar los mecanismos genticos
Los microorganismos se emplean para aislar y
duplicar genes especficos provenientes de otros
organismos con tcnicas llamadas clonamiento
celular
Los microorganismos producen muchas sustancias de
valor industrial como antibiticos y las
manipulaciones genticas pueden emplearse para
aumentar los rendimientos y mejorar los procesos de
fabricacin
Muchas enfermedades son producidas por
microorganismos y los caracteres genticos se
encuentran detrs de estas funciones perjudiciales.
Comprendiendo la gentica de los microorganismos
que producen enfermedad, se puede controlar ms
fcilmente su proliferacin en el cuerpo y evitarla.
Estructura de los genes en procariotas y
eucariotas

El genoma bacteriano consta de una sola molcula


circular de DNA cerrada covalentemente distribuida
en el interior de la clula
El genoma eucaritico consta de varios segmentos
lineales de DNA que se encuentra en cromosomas
individuales en el ncleo celular. Cada cromosoma
eucaritico consta de una sola molcula de DNA
unidas a protenas llamadas histonas
En contraste a los procariotas, la transcripcin
y traduccin estn separados en los
eucariotas, la transcripcin se realiza en el
ncleo y las molculas de RNA se trasladan al
citoplasma para la traduccin
Los genes de los eucariotas se encuentran con
frecuencia fragmentados, regiones no
codificantes parciales separan las regiones de
codificacin
Exones.
Regin de codificacin
Intrones.
Regiones no codificantes
Tanto los intrones como los exones se
transcriben en RNA y el RNAm funcional se
forma ms tarde por eliminacin enzimtica
de las regiones no codificantes
ELEMENTOS GENTICOS
Partcula o estructura que contiene material
gentico.
Se han identificado diferentes tipos de elementos
genticos y aunque el principal de ellos es el
cromosoma.
Otros que tienen funciones muy importantes en el
desempeo del gen tanto en los procariotas como
eucariotas.
Las dos propiedades ms importantes de los
elementos genticos son:
Su capacidad de autorreplicacin
Sus propiedades codificadoras genticas
Cromosoma
La organizacin cromosmica de los eucariotas
implica una caracterstica que no se encuentra en los
procariotas: genes partidos
Elementos genticos no cromosmicos
Se han reconocido diversos elementos genticos que
no son parte del cromosoma
VIRUS
Elemento gentico ya sea de DNA o RNA que
controlan su propia replicacin y transferencia de
una clula a otra.
Plsmidos
Pequeas molculas circulares de DNA que estn presentes y
se replican por separado de los cromosomas.
Los plsmidos difieren de los virus:
No causan daos celulares (generalmente son benficos)
Los virus tienen formas extracelulares, los plsmidos no.
Aunque los plsmidos han sido reconocidos en algunos eucariotas, se
han encontrado en la mayor parte en procariotas. Algunos plsmidos
son vectores genticos excelentes.
Mitocondrias y cloroplastos.- Elementos genticos no
cromosmicos que se encuentran en los eucariotas
Cromosoma nucleoide

DNA doble cadena

Rango de tamaos:

~750 kb in Mycoplasma spp

5000 kb (5 Mb) en Escherichia coli

10 Mb en Streptomyces spp
Cromosoma

Nmero:

Generalmente un cromosoma,

pero algunas especies tienen dos cromosomas.

Burkholderia pseudomallei (3.6 and 2.4 Mb)

Rhodobacter spheroides (3 and 1Mb)

MEGAPLSMIDOS? MINICROMOSOMAS?
Plsmidos
Una o ms molculas de ADN circular pequeo adems del
cromosoma.
Elemento gentico que se replica con independencia del
cromosoma del hospedador son circulares o lineales.
Cromosoma
Constituido por una sola molcula circular cerrada de forma
covalente . Algunas bacterias poseen ADN cromosmico lineal
ejm: Escherichia coli posee 4700 pares de kilobases.
El tamao del ADN bacteriano es superior al de los virus pero
inferior al de los eucariotas.
Nucleoide
ADN agregado de la clula procariota que no posee ribosomas.
Episomas
Son plsmidos que pueden integrarse en el
cromosoma bacteriano y su replicacin queda bajo el
control del cromosoma.
Estos elementos genticos se clasifican de acuerdo
con la informacin gentica codificada por su ADN
ejm:
El factor F del plsmido conjugativo confiere fertilidad y
posee genes que codifican la sntesis de los pilis sexuales
Los plsmidos R constan de 2 componentes ; FTR ( factor
de transparencia de resistencia ) y uno o varios
determinantes r ( que codifican la informacin necesaria
para la resistencia antimicrobiana)
Cromosoma

Generalmente ADN circular y superenrollado


( en contraposicin a los cromosomas eucariotas lineales)

Ej: E. coli, Bacillus subtilis, Salmonella typhimurium,


Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae

pero lineales en algunas especies de Streptomyces y


Agrobacterium, espiroquetas y
Borrelia burgdorferi
Annu.Rev. Genet.2004. 38: 771-791. Bentley and Parkhill
Plsmidos

Material gentico estable, replicacin


independiente, la mayora ADN circular doble cadena
superenrollado

pero
plsmidos lineales en Streptomyces, Borrelia
burgdorferi
plsmidos simple-hebra de ADN en Myxococcus
xanthus
Plsmidos

Nmero de copias de plsmido:

Plsmidos pequeos (5-10 kb) 50-100 copias/cl (1000


en algunos plsmidos de Streptomyces)

plsmidos grandes (50-200 kb) 1-10 copias/cl

-Limitado rango de hospederos


-Algunos plsmidos promiscuos de amplio rango de
hospederos
Plsmidos

Los plsmidos son elementos genticos accesorios y codifican para


funciones adaptativas:

conjugacin
resistencia a antibiticos :
- degradacin enzimtica (penicilina)
- modificacin enzimtica (cloranfenicol)
- permeabilidad alterada en membranas (tetraciclina)
- alteracin de la diana (streptomicina)
- actividad metablica alternativa (sulfonamida)
virulencia (invasin, produccin de toxina)
simbiosis
degradacin de sustratos
Cromosoma de
E. coli

100 minutos o 4.639.221 pb


88% 4288 ORF
+ 1% tRNA, rRNAs
+ 0.5% secuencias repetidas no codificantes
+ 10% secuencias regulatorias
Distintos tipo de islas genmicas

Confieren al organismo una mayor adecuacin a determinadas condiciones de vida.

Vida libre en el medioambiente Islas ecolgicas


Vida en un hospedero como saprfito Islas saprofticas
Vida en un hospedero como simbionte Islas simbiticas
Vida en un hospedero como patgeno Islas de patogenicidad (PAI)

Las islas de patogenicidad codifican para factores de virulencia

ADHESINAS SISTEMAS DE SECRECIN


INVASINAS TOXINAS
CPSULAS SISTEMAS DE CAPTACIN DE HIERRO
Evolucin de las islas de patogenicidad

LEE (EPEC),
progreso evolutivo

SPI-1 (Salmonella)

5-
PAI (UPEC) Integracin
al genoma
* bsico con
HPI (Y. 4- Delecin adaptacin
enterocolitica) * de codones
de genes
inactivados
*
VPI (V. cholerae)
HPI (Y. pestis) 3- Mutacin
en gen mob

2- Mutacin
en gen int

tRNA 1-
Integracin
Genoma de fago o
plsmido
bsico

tiempo
Genmica comparativa
Species bp genes
Haemophilus influenzae 1,830,137 1,743
Campylobacter jejuni 1,641,481 1,708
Mycobacterium tuberculosis 4,115,291 3,924
Neisseria meningitidis 2,184,406 2,121
Escherichia coli 4,639,221 4,288

Funciones: 20% metabolismo, 10% transporte, 10% regulacin y replicacin, 5% estructural, 5%


sntesis protenas,
50% desconocidos!
Comparacin de Genomas de cepas patgenas:
Caractersticas del DNA

El cido desoxirribonucleico (DNA) es el


material gentico de todos los organismos y
cerca de la mitad de los virus.
El DNA lleva la informacin necesaria para
dirigir la sntesis de protenas y adems es
capaz de autoduplicarse.
Cdigo Gentico

Se producen 64 combinaciones diferentes (compuestas de 3


nucletidos) basados en los 4 nucletidos conocidos.
Cada combinacin codifica para uno de los 20 amino cidos
conocidos, adems de la seal de pare y seal de comienzo.
El cdigo es universal, esto es todos los organismos utilizan el
mismo cdigo para hacer sus protenas.
Sin embargo, se observan algunas excepciones en los hongos,
protozoarios y el DNA mitocondrial. Ya que varios codones
codifican para ms de un amino cido, se dice que el cdigo
es degenerado.
Duplicacin del DNA

El DNA se copia de forma precisa durante su


sntesis o duplicacin.
En las clulas de todos los organismos
vivientes, el DNA debe ser duplicado antes de
que la clula pueda dividirse.
Transcripcin del DNA

La expresin de la informacin codificada en la


secuencia de bases del DNA comienza con la
sntesis de una molcula de RNA, que es una
copia de la secuencia de DNA que constituye
un gen.
Proceso de Transcripcin
Se define como la transferencia de
informacin que se encuentra en el DNA a una
molcula de RNA.
Traducccin del DNA

Es la ltima fase de la expresin gnica o


sntesis de protenas. La informacin gentica
en el mRNA se traduce a una protena.
Recombinacin Gentica en Bacterias

Las bacterias se multiplican principalmente


por fisin binaria, lo cual no permite la
recombinacin gentica. Sin embargo, los
microorganismos poseen 3 mecanismos para
que el intercambio de material gentico se
efecte. Estos mecanismos son
transformacin, transduccin y congujacin.
Transformacin

La transformacin consiste en la obtencin


por parte de una clula receptora de un
fragmento de DNA y la incorporacin de esta
molcula al cromosoma de esta clula en una
forma heredable.
Transduccin del DNA

La transduccin es la transferencia de genes


de una bacteria a otra por medio de un virus.
Transduccin generalizada

Ocurre durante el ciclo ltico ( donde el fago


rompe la bacteria) de los fagos y es capaz de
transferir cualquier parte del genoma
bacteriano.
Transduccin especializada

En la transduccin especializada, la partcula


viral modificada transporta porciones
especficas del genoma bacteriano.
Conjugacin

La conjugacin consiste en la unin de dos


bacterias de la misma o diferentes especies
para la transferencia del material gentico.
Mutaciones
Las mutaciones son cambios en una o ms de
los nucletidos del DNA.
Pueden ser causadas por radiaciones,
sustancias qumicas, condiciones ambientales
extremas y otras causas.
Las mutaciones producen nuevas formas de
un gen, y por consiguiente nuevas variaciones
sobre las cuales puede actuar la seleccin
natural.
Tipos de mutaciones:

Delecin: Es la prdida de uno o varios


nucletidos del DNA. Ejemplo: CGTACGTA por
CTACGTA.
Insercin: Es la adicin de uno o varios
nucletidos en la molcula del DNA.
Si la insercin es de un nucletido donde no
altera el amino cido a ser codificado, la
mutacin pasa desapercibida. Ejemplo:
CGTACGTA por CGGGTACGTA, en este caso se
afectar la protena.
Inversin
Es el cambio de posicin de varios nucletidos
en la molcula. Se altera la informacin
gentica. Ejemplo: CGTACGTA por CGCATGTA.
("frameshift")
Corrida de lectura aqu se inserta o se pierde
uno o varios nucletidos, como resultado toda
la informacin del gen
Se pierde ya que se sustituyen unos amino
cidos por otros.
Ejemplo: CGT ACG TAC GTA por
CGA CGT ACG TAC
Traslocacin
Esta mutacin ocurre cuando segmentos
de nucletidos se separan y se unen en otro
lugar del cromosoma.

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