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Genética y Biología Molecular en

Bioquímica
Flujo de la información genética esta basada
en secuencias biologicas

DNA CCTGAGCCAACTATTGATGAA
GENOMA
Genotipo
transcripción
Flujo
EPIGENETICA ?
de la
información RNA CCUGAGCCAACUAUUGAUGAA
TRANSCRIPTOMA
traducción

Proteína PEPTIDE
PROTEOMA
Fenotipo
Eventos que determinaron y caracterizaron al
material hereditario
1866 Gregor Mendel Publico sus resultados sobre los factores de la herencia.

1868 descubrimiento de la nucleina (DNA) Friedrich Miescher

En 1902 Archibald Garrod describe la ALCAPTONURIA como


“inborn errors of metabolism”, error congénito del metabolismo.
Primera enfermedad descrita como ligada a la herencia.
Enfermedad Autosomica recesiva.

1902 Walter Sutton Interrelaciona la citología y el Mendelismo (morfología & herencia). Cromosomas
son unidades hereditarias. Esta teoría también fue desarrollada por Theodor Boveri

En 1908, Hardy–Weinberg describe el principio de genética de población, en el cálculo de la


frecuencia de desordenes autosomicas recesivas
En 1928, Fred Griffith
describió el llamado
fenómeno de
transformación
de neumococos.

Neumococos R derivados del


tipo II vivos junto con un
inoculo del tipo III S
inactivados por calor

live S strain
En 1944 se demostró que el principio
transformante descrito por F Griffith era
el DNA

Oswald Avery

Colin McLeod

Maclyn McCarty
1950 Erwin Chargaff Determino que los organismos vivos presentan una razón constante entre Adeninas con
Timinas y Guaninas con Citocinas.

1951 Rosalind Franklin Obtuvo las fotografias de difracción de rayos X del DNA

Rosalind Franklin

Maurice Wilkins
1952 Martha Chase y Alfred Hershey empleando bacteriofagos marcados con 35S y 32P
demostraron que el DNA es una molécula hereditaria
1953 Francis Crick y James Watson resolvieron la estructura tridimensional del DNA.
1958 Matthew Meselson y Frank Stahl empleando isotopos demostraron la propiedad
semiconservativa de la replicación del DNA.
Flujo de la información del Genotipo al Fenotipo
Expresión de genes:Transcripción y traducción ocurren simultaneamente en
procariotes

5’ 3’

3’ RNA 5’

Pol.
Ribosome
mRNA Ribosome
5’
Flujo de la información del Genotipo al Fenotipo
Expresión de genes en eucariotes

Citoplasma
DNA

Transcripción
RNA
Procesamiento de RNA

mRNA G AAAAAA G AAAAAA

Exportación
Nucleo
Estructura génica mostrando reguladores de la expresión genética
PROCARIOTES

Represor Operador Gen A Gen B

5´ 3´

ATG TAA ATG TAA ATG TAA


Secuencia -10
Spacer
Secuencia -35 Inicio de la
transcripción
EUCARIOTES Región
flanqueante
Región flanqueante
Exon I Exon II Exon III
Intron I Intron II
5´ 3´
GC GC GT AG GT AG
box box ATG TAA
CAAT TATA AATAA
box box
Inicio de transcripción
En sistemas eucariotes:
Elementos Cis-actuantes es una
secuencia especial de DNA que puede
afectar la expresion de un gen.

start

B A structural gene
Factores Trans-actuantes

DNA a

mRNA
A b

protein A A
Información genética
• Genoma – La colección de la
información genética de un
organismo.

• Cromosomas – Unidad de almacenaje


de los genes.

• Gen – Unidad básica de la


información genética. Los genes
determinan los caracteres
hereditarios

• DNA - es el acido nucleico que


contiene las instrucciones genética
especificas para el desarrollo de las
formas de vida celular
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Genoma Humano
• 2 cromosomas sexuales (X,Y):
XY – hombres.
XX – mujeres.

• 22 pares de cromosomas
autosomicos.

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Genética Medica
Patrones generales de herencia observados:

• Autosomica recesiva
• Autosomica dominante
• Recesivo ligado a X
• Dominante ligado a X
• Codominante
• Mitocondrial

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Autosomica recesiva
• La enfermedad
aparece en niños
hombres y mujeres
de padres no
afectados que son
portadores,
• Fibrosis quistica

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Bases moleculares del albinismo (enfermedad autosómica recesiva)
Autosomica dominante
• Aparecen hombres y
mujeres afectados en cada
generación del arbol
fenotipico (pedigree).
• Madres afectadas o padres
afectados trasmiten la
caracteristica a sus hijos e
hijas.
• e.g., enfermedad de
Huntington.

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Recesiva Ligada a X
• Por lo general los hombres
muestran la afección.
• Todas las hijas de un padre
afectado son portadoras.
• Ninguno de los hijos de un
padre afectado muestra el
desorden o es portador.
• e.g., hemofilia

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Dominante ligado a X
• Los padres afectados pasan
el desorden a sus hijas pero
no a sus hijos .
• Una madre afectada pasa la
condicion a la mitad de sus
hijas e hijos
• e.g. Sindrome del cromosoma
X fragil

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Herencia Codominante

• Dos diferentes versiones de alelos


de un gen pueden ser expresados. Y
cada version hace una proteína
ligeramente diferente
• Ambos alelos influyen en la genetica
o determinan la caracteristica de
una condicion genetica.
• E.g. ABO locus
Antígeno
A

Glóbulos rojos de una Anticuerpos Anti-A


persona tipo A Aglutinación de
gl. rojos tipo A
Antígeno
B
No hay
aglutinación de
gl. rojos tipo B
Glóbulos rojos de una Anticuerpos Anti-A
persona tipo B

Glóbulos rojos de una Anticuerpos Anti-A Aglutinación de


persona tipo AB gl. rojos tipo AB 23
Base bioquímica de los grupos ABO
N-acetilgalactosamina
adicionada al precursor

Antígeno A;
alelo A ( IA) reacciona con
anticuerpos anti-A

alelo O (i)
Antígeno H; no
reacciona con
anticuerpos anti-A
Carbohidrato precursor ni anti-B
alelo B ( IB)

Los alelos A y B Galactosa adicionada Antígeno B;


producen transferasas al precursor reacciona con
anticuerpos anti-B
distintas (que
modifican de distinta
manera la galactosa
terminal del
compuesto precursor)
y el alelo O no
produce ninguna. N-acetilglucosamina Galactosa N-acetilgalactosamina Fucosa
Tipo sanguíneo Genotipo El alelo i es nulo, es incapaz de
producir cualquier forma del
A IAIA o IAi
antígeno. Alelos A y B son
B IBIB o IBi dominantes sobre el alelo i. Alelos
A y B son codominantes entre sí.
AB IAIB
O ii

Grupo O es donante universal (no


contiene antígenos ni A ni B).
Grupo AB es receptor universal
(no produce anticuerpos contra el
antígeno A ni el antígeno B).
Mitocondrial
• Se aplica a genes del DNA
mitocondrial
• Desordenes mitocondriales
pueden aparecer en cada
generación de una familia y
pueden afectar a hombres y
mujeres, pero los padres no
transfieren mitocondrias a
sus hijos.
• E.g. Neuropatia optica
hereditaria de Leber (LHON)

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Bases moleculares de los desordenes genéticos

Alelo nulo: aquel que


lleva a la ausencia del
producto génico normal (ej
m6) o a la desaparición
fenotípica de la función
normal (ej m2 y m3).

Los alelos nuevos formados por mutación pueden resultar en la


pérdida total o parcial de la función, o de la ganancia de más función
o incluso adquisición de una nueva función a nivel proteico.
Alelismo múltiple: existencia de varios alelos conocidos de un gen.
Serie alélica: conjunto de alelos de un gen.

Ej. PKU: enfermedad autosómica recesiva generada por el procesamiento anormal


del aa fenilalanina por parte de la enzima fenilalanina hidroxilasa (PAH).

Estructura de la
PAH y las
mutaciones
encontradas
Ej. Anemia falciforme humana

Origen
Tipo de Hb
presente Genotipo Fenotipo

SyA HbSHbA Portador


Anemia
S HbSHbS falciforme

A HbAHbA Normal

Migración
Respecto a la anemia: alelo
HbA es dominante.
HbAHbA: Normal. Los gl. rojos no se deforman nunca. Respecto a la forma de los
HbSHbS: Anemia grave, a menudo mortal. La Hb anormal glóbulos rojos: existe
causa que los gl. rojos adquieran forma de hoz. dominancia incompleta de
HbA
HbSHbA: No se produce anemia. Los gl. rojos se deforman
sólo a concentraciones de O2 anormalmente bajas. Respecto a la síntesis de Hb:
hay codominancia.
Diagnostico genético
Tipos de enfermedades genéticas
Gene único (mendeliano)
Patrón hereditario claro
Alto riesgo a familiares
Multifactorial
Desorden común
El patrón hereditario no es claro
Bajo o moderado riesgo a familiares
Cromosomicos
En su mayoría raras
Patrones no claros de herencia
Usualmente de bajo riesgo a familiares
Mutaciones somaticas
Causa de neoplasia
Razones más comunes para el análisis citogenético

postnatal
• Los recién nacidos con defectos congénitos
• Los niños con problemas de aprendizaje
• Los niños con rasgos dismórficos
• reordenamiento cromosómico familiar en familiares
• Infertilidad
• abortos involuntarios recurrentes

prenatal
• Anomalías en la ecografía
• Aumento del riesgo de síndrome de Down (edad de la madre o
busqueda bioquímico)
• hijo con una anomalía cromosómica
• Un padre lleva a una anomalía estructural cromosómica
Razones para el análisis genético molecular
• Cystic fibrosis
• Haemoglobinopathies
• Duchenne and Becker muscular dystrophy
• Myotonic dystrophy
• Huntington disease
• Fragile X syndrome
• Spinal muscular atrophy
• Spinocerebellar ataxia
• Hereditary neuropathy (Charcot-Marie-Tooth)
• Familial breast cancer (BRCA 1 and 2)
• Familial adenomatous polyposis
Estructura genómica
Mapeo genético
Técnicas genéticas, cruces o pedigrees
Calculo de la distancia basada en la frecuencia de
recombinación.
Mapeo Físico
Evaluación directa de la posición relativa de una secuencia
característica en pares de bases

Las distancias del


mapa genetico
son solo
aproximaciones
de las distancias
reales a lo largo
del cromosoma
Análisis genéticos : Búsqueda de marcadores genéticos

Estructura Cromosomica de eucariotes

Eukaryotic Genomes

Unique Sequence Repetitive Sequence

Highly Repetitive Middle Repetitive

Satellite DNA Tandem Repeats Interspersed


(Centromeres/Telomeres) Retrotransposons

Multicopy Genes Mini-satellites Micro-satellites SINES LINES


Short Large
interspaces interspaces
element element
rRNA genes VNTRs Dinucleotides Alu L1
Polimorfismo
• Marcadores moleculares
• Uni locus (buenos porque son estáticos se
mapea un gen en una posición sobre el
cromosoma)
• Multilocus (buenos para el análisis completo
del genoma y análisis filogenético)
• Marcadores Moleculares:
• Basados en la hibridación DNA-DNA
– RFLP VNTR
• Basados en PCR
– Usando primers específicos STR
• Basados en PCR y cortes por enzimas de
restricción
– AFLP
• Basados en puntos de mutación en el DNA
– SNP detectados por SSCP, DNA chip, secuenciamiento
• Diagnostico basado en detección de ácidos
nucleicos

• Amplificacion ADN
• Hibridacion ADN
Forensic Genetics:
Useful Genetic Loci

Jobling and Gill (2004) Nature Reviews Genetics 5:739-751


• PNA FISH
• Evolución de una sonda de nucleótidos a una sonda de
acido nucleico peptídico PNA es un oligomero sintético
que imita la estructura del DNA o el RNA, la carga
negativa del esqueleto azúcar fosfato es remplazada
por una molécula sin carga N-(2 aminoetil) glicina al
cual se une la base nitrogenada por un enlace metilen
carbonil
• Son menos susceptibles de inhibición por impurezas en
diferentes muestras clínicas a comparación de los
métodos basados en amplificación
STR and VNTR Typing:
PCR Amplification of Repeat Loci

Molecular Biology of the Cell, 4th Edition, pg511


STR and VNTR Typing:
Mendelian Inheritance of Repeat Loci
Repeats
Parents

Progeny
Typing a Forensic Sample

Molecular Biology of the Cell, 4th Edition, pg511


Forensic STR Profile Comparison:
How Many Loci are Needed?
Nine Repeat Loci and Sex

What is a probability match and what does it mean?


Polimorfismo por SNP
Polimorfismo con arreglos de DNA

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