BIOQUIMICA

TEMA 3

Aminoácidos: estructura , clasificación y

propiedades
Enlace peptídico: estructura y propiedades
de los peptidos
Péptidos de interés biológico
Niveles de organización de proteínas
Funcion de las proteinas:
.fibrosas
.globulares
 AMINOACIDOS
unidad basica que quimicamente contiene una función amina y otra
ácido
Los aminoácidos en solución:
A pH neutro: son predominantemente iones dipolares
(ZWITERION), en vez de no iónico
El grupo amino está protonizado (-NH3 )
El grupo carboxilo está disociado (-COO¯ )
En solucion acida: En solucion alcalina
El grupo carboxilo no esta El grupo carboxilo esta ionizado
ionizado(-COOH) (-COO- )
El grupo amino esta ionizado (NH3+ El grupo amino no ionizado (-NH2)
)
ESTADO DE IONIZACIÓN COMO
FUNCIÓN DEL pH
CLASIFICACION DE LOS AMINOACIDOS
SEGÚN SUS CADENAS LATERALES
 CLASIFICACION DE LOS AMINOACIDOS:
EN FUNCION DE LA POLARIDAD DE SUS GRUPOS R

AA con cadenas
laterales sin carga a
pH fisiologico:
tienen cadenas
laterales constituidas
por grupos alquilo
Gli,Ala,Val,Leu,Isol
 CLASIFICACION
DE LOS
AMINOACIDOS:
AA con anillo:Fen,Tir,Trip
R= Hidroxi-metil R= etanol R= tiometil

benceno ,fenolico indol:

AA con grupos hidroxialcoholico:

Ser,Thr;Cys
 CLASIFICACION
DE LOS
AMINOACIDOS:
AA.monoamino dicarboxilicos:
Asp,Glu.
A pH fisiologico los grupos acido car
boxilico de la cadena lateral estan des
pro tonados y por lo tanto cargados (-)

Acidos monocarboxilicos dibasicos:

Lys ,Arg, His
El grupo R contiene uno ó dos atomos
de N que actuan como base al unir un
proton.
Tanto el grupo guanidino de la Arg
como el amino de Lys
estan protonados a pH fisiologico
por lo tanto estan en su forma
cargada
CURVAS DE VALORACION DE LOS
AMINOACIDOS
Y
VALORES DE PK
pKa de un grupo:

Es el valor del pH al cual la

concentracion del grupo pro
tonado es igual a la concen
tracion del grupo no protona
do

Ec. Henderson-Haselbach

pH= pk+ log Sal

Acido

Cuando el ácido está

semiconvertido en sal
 PUNTO ISOELECTRICO :pI
• Es el pH en el cual el aa tiende a adoptar una forma
dipolar neutra,con tantas cargas (+) como (-):carga
neta cero
• El pI,es el pH en el que la molecula se disocia por
igual en ambos sentidos.

• Se obtiene de la semisuma de:

• pI= pK1+pK2/2

• Asi, para la Gli (pK1=2.22 y pK2=9.86) es de 6.04

CURVA DE TITULACION DE LA GLICINA
(alfa aminoácido)
Las especies ionicas que predominan
en puntos clave en la titulación,
se señalan encima de la grafica

Es considerado como ACIDO

DIBASICO en su forma
totalmente protonada ya que
puede donar 2 H+ en su
titulación.
Esta titulación con NaOH
comprende 2 fases:

1. H3 N+ CHR COOH + OH
H 3N+ CH RCOO- + H2O

2. +H 3N+ CH R COO- + OH
--- H 2N CH R COO-- + H2O
CURVA DE TITULACION DE GLICINA 0.1 M A 25º C

Las regiones de máximo nivel

“tampón”corresponden a los
recuadros centrados alrededor
de pK1 = 2,34 y pK2 = 9,60

pI: El valor de pI es una

constante y es el promedio de
los dos valores de pKa que
determinan los limites del
zwiterion

A pH 5.97 la mayoria de las

moleculas estarian en la forma
de iones hibridos y no se
desplazarian en ningun polo
en un campo electrico
CURVA DE VALORACION DE
LA ALANINA
DISOCIACION DEL ACIDO GLUTAMICo

Forma total Tiene carga neutra Tiene una Tiene dos cargas
mente protona (una (+) y otra (-) carga (-) (-)
da Tiene carga
neta (+)

Cuando el aa contienen otros grupos acidos ò basicos,el poder amor

tiguador gana posibilidades.
Asi,tiene 3 grupos disociables cuyos pK son:
pK1=2.1, pK2=3.9 y pK3 = 9.8
PUNTO
ISOELECTRICO

pK1+Pk2 aproximad 3.0

La proporcion de
moleculas en la forma IV
( 2 cargas -)
es tan pequeña que
puede considerarse
como despreciable a la
hora del calculo del pI
 DISOCIACION DE LA ARGININA

Forma totalmente tiene 1 carga es neutra tiene 1 carga (-)

Protonada neta (+) tiene 1 carga +
y 1 carga -

Presenta dos grupos basicos y uno acido ,donde el

pK1=2,2, pk2=9.2 y pK3=12.5
pka
PEPTIDOS:ESTRUCTURA Y FUNCION
ESTRUCTURA DE UN PENTAPEPTIDO

Tir
Leu

Ala
 PÉPTIDOS DE INTERES BIOLOGICO

Hormonas:
Ocitocina (nonapéptido),
Vasopresina (nonapéptido),
Somatostatina (tetradecapéptido)
Antibióticos:
Valinomicina (decapéptido)
Gramicidina (decapéptido)
Ambos son péptidos cíclicos, que contienen aminoácidos de
la serie D, además de otros aminoácidos no proteicos.
 PEPTIDOS PROTEICOS
• Bradicina (nonapeptido) y Calidina (decapeptido
• Agentes hipotensores liberados de proteinas plasmati cas y actuan
sobre el musculo liso)

• Oxitocina y Vasopresina ( dos nonapeptidos ciclicos se cretados

como hormonas de la pituitaria

• La Ocitocina : estimula la contraccion del musculo ute rino en las

mujeres embaradas y la contracion de los musculos lisos de las
glandulas mamarias

• La Vasopresina :estimula la contriccion de los vasos sanguineos

,aumenta la presion sanguinea y tiene un efec to antidiuretico al
estimular la reabsorcion del agua en los riñones.
NANOPEPTIDOS CON ACCION HORMONAL
HN Cis Tir Ile
HN Cis TIR Fen
S
S
S
S
Cis Asn Gln
Cis Asn Gln
Pro Leu Gli ( C-NH2)
Pro Arg Gln (C NH2)
0
0
OCITOCINA .

VASOPRESINA.
Gramimicidina S
Penicilina bencinica
Aspartame
 PÉPTIDOS DE INTERES BIOLOGICO ( Cont.)

Neurotrasmisores:
Encefalinas (pentapéptido),
Endorfinas (pentapéptidos).
Sustancia P (undecapéptido).
Agentes vasoactivos:
Angiotensina II ( octapéptido).
Bradiquinina (nonapéptido).

Cofactores enzimáticos
Glutation: tripéptido que actúa como cofactor
en algunas reacciones redox.
• Angiotensina I: un decapeptido que se deriva
del extremo N terminal de una α-globulina
especifica del plasma producida en el higado y
reconocida como el sustrato de la renina.La
renina es una enzima proteolitica producida en
el riñon y secretada al plasma

• Angiotensina II :un octapeptido con una mayor

actividad vasopresora

• Ambos peptidos elevan la presion sanguinea

por su potente actividad vasoconstrictora
ANGIOTENSINOGENO Asp-Arg-Val-Tir-Ile-His
Pro-Fen-His-Leu-Leu-Prot
Renina
Leu,Proteina

ANGIOTENSINA I Asp-Arg-Val-Tir-Ila-His
Pro-Fen-His-leu Decapeptido
Enzima convertidora
de la angiotensina
(ECA) His,-Leu

ANGIOTENSINA II Asp.Arg-Val-Tir-Ile-His
Pro-Fen Octapeptido

Aminopeptidasa
Asp

ANGIOTENSINA III Arg-Val-Tir-Ile-His

Pro-Fen
 GLUTATION
• Tripeptido: ϒ-glutamil cisteinil glicina
• Es un peptido simple y el más abundante en los
sistemas biológicos
 FUNCIONES.
- Esencial en el hombre para la actividad de varias enzi
mas y de la insulina.
- Ayuda a mantener la integridad y funcionabilidad de
los eritrocitos
- Participa al transporte de los aa a traves de las menbra
nas celulares.
- Participa en el mantenimiento del estado de oxidación
del Fe++
 GLUTATION
GLUTAMIL-CISTEINIL-GLICINA
H3N O

00C-CH-CH2-CH2-C-NH-CH-C-NH-CH-COO-

H2C O

SH
Glutation oxidado
Glu Cis Gli
S
S
Glu Cis Gli
Proteínas
 CLASIFICACION DE LAS
PROTEINAS SEGÚN SU FUNCION
Transporte
Reserva
Movimiento
Hormonal
Inmunologica
Estructural
Homeostatica
Enzimatica
 NIVELES DE ORGANIZACIÓN DE PROTEÍNAS

1. Estructura Primaria
2. E. Secundaria
3. E. Terciaria
4. E. Cuaternaria

1. E.PRIMARIA:
Se refiere a la secuencia de aminoácidos unidos por enlaces
peptídicos e incluye los enlaces disulfuro

Ser-Ala-Met-Cys-Pro-Leu-Lys-His-Val-Ala-Ala-Ala
Estabilizada por
dos enlaces in
 Secuencia de aminoacidos de la insulina bobina
estabilizada con dos enlaces intracatenarios y uno
intercatenario de disulfuro

Cadena A 21

Cadena B

30
FORMACION DE CISTINA
2.-E. SECUNDARIA:
Se refiere a las disposiciones regulares y repetitivas en el
espacio, de residuos de aminoácidos adyacentes en una
cadena polipeptídica.

Existen unas pocas clases básicas de estructura

secundaria, siendo las más importantes la hélice  y la
conformación 

Las cadenas laterales que son capaces de actuar como

donadoras en los puentes de H son: Tir (-O-H), Tre (-O-H)
Ser (-O-H), Trip (=N-H), Hist (=N-H), Cist (-S-H)
 Proteínas
2. Secundaria:

a. hélice alfa (estructura helicoidal)

1. es elástica
2. presente en proteínas
fibrosas como pelo,
piel, uñas
3. Estabilizada por puen-
tes de hidrógeno a lo
largo de la hélice
 Proteínas
2. Secundaria:

a. lámina plegada beta –

1. No es elástica
2. Presente en proteínas
como seda, fibroína
3. Estabilizada por puentes de
hidrogeno a lo largo de la
lámina o entre laminas
Esta formada por dos o mas
cadenas polipeptidicas.
ca
 Proteínas
3. E. TERCIARIA:
Forma general que toma toda la cadena polipetídica.Es la
estructura tridimensional completa.
Cuatro factores determinan eso:
a. puentes de hidrógeno
b. enlaces iónicos
c. interacciones hidrofóbicas
d. puentes disulfuro

La conformación es filamentosa, formándose proteínas insolubles

de función estructural, p.ej. la queratina, o conformación globular,
apareciendo proteínas solubles con función dinámica, p.ej los
enzimas.
 MIOGLOBINA
•
Mioglobina
His proximal

His distal
Proteina globular
conjugada y oli
gomerica

Estructuralmente
es un tetramero
compuesto de
dos cadenas alfa
(141 aa ) y dos
cadenas betta
(146 aa )

Cada cadena
esta asociada a
un Hem
E.CUATERNARIA : HEMOGLOBINA

 Cada molecula
tiene 4 cadenas
peptidicas

 Cda cadena
tiene un grupo
hem

 Cada grupo Hem

une una
molecula de 02
 Proteínas

Interacción entre dos o más

cadenas polipeptídicas.
Cada cadena peptidica se llama
monomero y el conjunto se
llama dimeros trimeros,
tetrameros,polimeros
Ocurren las mismas
interacciones descritas
anteriormente
ESTRUCTURA CUATERNARIA
DIMERO
ESTRUCTURA CUATERNARIA
TETRAMERO
 ESTRUCTURA
Y
DESNATURALIZACION
Las proteínas pueden inactivarse mediante calor,
cambios de pH, agitación, perdiendo su estructura 2ª, 3ª
ó 4ª

Desnaturalización: Ruptura de los enlaces peptídicos

mediante hidrólisis. Puede ser reversible e irreversible.

Quizá su propiedad más característica es su

especificidad, lo que quiere decir que cada especie,
incluso los individuos de la misma especie, tienen
proteínas distintas que realizan la misma función. Ello es
debido a que se forman a través del mensaje genético:
DNA —› RNA —› Proteína.
 Proteínas

1. Cambios en estructura terciaria altera actividad biológica

a. pH
b. calor
c. uso de substancias químicas

todas éstas causan desnaturalización: usualmente irreversible

ejemplo: albúmina

2. Anemia falciforme: valina substituye ácido glutámico

Cristalografía
de Rayos X
 CLASIFICACION
• Holoproteinas o proteinas simples
Proteinas fibrosas
Proteinas globulares
Heteroproteinas ó proteinas conjugadas
Cromoproteinas o pigmentos
Glucoproteinas
Lipoproteinas
Nucleoproteinas
Fosfoproteinas
Hemoglobina
 COLAGENO
• Proteina fibrosa Es la proteina más abundante de los
vertebrados .Principal constituyente del tejido conjuntivo
.Forma aproximdamente un 30% de la proteina del
cuerpo
• Esta concentrada en tejidos que soportan peso:
Cartilago,huesos
• Tejidos que trasmiten fuerza:
Tendones,ligamentos
• Tejidos de proteccion:
Dermis,fascias
• Organos y visceras del organismo:
Higado,bazo,pulmón,visceras
CONVERSION DE PROLINA EN 4-HIDROXIPROLINA
Conversion de lisina en 5-hidroxilisina
FORMACIOÓN DE ENLACES
CRUZADOS EN EL COLAGENO
 Residuo de lisina

Segundo residuo Residuo de

de lisisna allisina

Base de Schiff que une dos cadenas

Lisina norleucina
Enlace de entrecruzamiento del colageno via condenzación
aldólica entre dos residuos de al-lisina

Allisina Allisina
(aldehido) (enol)

Condenzacion
aldolica
El colágeno es una glicoproteina
 Traduccion en
el ribosoma

Hidroxilacion
de Pro y Lys

Liberacion del
ribosoma y
adicion de
azucares
Formacion de
la triple helice

Secrecion de
la celula

Eliminacion de
los dominios N y
C terminales

Desaminacion de
residuos de Lys
para formar
aldehido y
formacion de
enlaces cruzados
 Distribucion de los enlaces cruzados en el
colágeno (intramoleculares e intermoleculares)
 Manifestaciones Clinicas Sindrome de
EHLERS-DANLOS

El sindrome asocia una hiperlaxitud ligamentosa (con doble movilidad)

y una hiperelasticidad cutanea
Tramos sin estructura definida entrecruzados con desmosina
1.-
Un par de helices se
enrollan entre si para
formar el ovillo
enrollado a izquierda
2.- Dos ovillos
enrollados vuelven a
unirse para formar la
protofibrilla de 4
moleculas
3. Ocho protofibrillas
se unen
Para formar
microfibrilla
HEMOPROTEINAS

Hemoglobina
y
Mioglobina
 MIOGLOBINA
Proteina del musculo encargada
del almacenamiento y difusion
del O2 en los tejidos.
Estructuralmente es un monóme
ro.constituida por 153 aa,segmen
tados en 8 alfa-helices ( A - G)

Contiene un solo grupo Hem,con

Fe++ en el centro de la molecula

El Fe++ esta cordinado con 4 N

de los anillos pirrolicos,con un N
imidazol de la His (Hist F8)
y un atomo de O2

Una Fen e Val le dan estabilidad

a l grupo Hem
• La curva dcooperatividad La curva desarrolla
el alosterismo y
cooperatividad
Cinetica Michaeliana y Sigmoidea de la Mioglobina
y Hemoglobina
 2-3-DPG( 2-3 difosfoglicerato)
• El aumento del P50,al parecer es debido al incremento del 2-
3 DPG sustancia presente en el eritrocito como parte del pro
ceso glucolítico.
• La capacidad del 2-3-DPG de disminuir la afinidad del eritro
cito por la Hb,reside en que se fija en las cadenas beta de ,la
Hb .Asi,1 mol de Hb desoxigenada se combina con un mol de
2-3DPG .En efecto:
• HbO2 + 2-3-DPG Hb-2-3-DPG + 02
• De lo anterior,cualquier incremento en la concentracion de 2-
3-DPG desplaza la reaccion hacia la derecha,haciendo que
se libere más 02
• El significado fisiologico de esta menor afinidad,es evidente,la
Hb puede liberar el 02 con mayor facilidad y a Pa02 relativa
mente más altos.
 EFECTO DEL 2-3-BIFOSFOGLICERATO (2,3-BPG
Saturacion de 02,% SOBRE LA ATURACION DE LA HEMOGLOBINA

P02.mmHg
•

• GRACIAS