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cellulaire
cours E. Grelier 1
Plan
I. Techniques de séparation et de
purification cellulaire
II. Méthodes d’étude de la morphologie
des cellules : techniques d’examens
microscopiques
III. Méthodes d’étude de la composition
biochimique des cellules
IV. Méthode d’étude du métabolisme
cellulaire
V. La culture cellulaire
cours E. Grelier 2
I. Techniques de
séparation et de
purification cellulaire
cours E. Grelier 3
I. Techniques de séparation et
de purification cellulaire
1. Séparation des cellules d’un tissu
Photographie au microscope optique (grossissement de 400 x) d'un tissu épithélial simple pavimenteux péritonéal humain
http://biology.clc.uc.edu/Fankhauser/Labs/Bio_Lab113/Tissues/Human_Histology.html
d’où
-> nécessité d’un traitement pour dissocier les liaisons intercellulaires et
pouvoir étudier les cellules isolées (sauf cas du sang).
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I. Techniques de séparation et
de purification cellulaire
1. Séparation des cellules d’un tissu
1ière étape : Destruction de la matrice
extracellulaire et des jonctions intercellulaires
• Traitement des tissus par des enzymes
protéolytiques (trypsine, collagènase)
• Traitement des tissus par des agents chélateurs des
cations divalents impliqués dans les ponts
intercellulaires (EDTA : Ethylène Diamine Tétra
Acétate)
cours E. Grelier 5
I. Techniques de
séparation et de
purification cellulaire
2. Purification
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I. Techniques de séparation et
de purification cellulaire
2. Purification: adhérence et gradient
cours E. Grelier 7
I. Techniques de séparation et
de purification cellulaire
2. Purification: exemple
Séparation des lymphocytes à partir d’une suspension de cellules spléniques en
gradient de Ficoll
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I. Techniques de séparation et
de purification cellulaire
2. Purification: cytomètre de flux
Cytométrie de flux vidéo cytométrie
• Cellules alignées en flux
• Examen individuel de chaque cellule par un rayon LASER lui affectant
• des paramètres spécifiques (Taille, Granularité,…)
• une charge électrique
• Tri des fractions par déviation des cellules chargées au niveau de plaques
Variante : FACS (Fluorescent Activated Cell Sorting) utilisant
• Même principe avec
• marquage préalable des cellules par un conjugué fluorescent (Ac couplé à un
fluorochrome)
• détection de cette fluorescence
• tri selon le même principe que précédemment.
• Technique
• extrêmement spécifique,
• rapide
• automatisable
• nécessitant un appareillage sophistiqué et coûteux de
cytomètre/ordinateur/logiciel
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Arrivée de la suspension à analyser grâce à une légère
surpression dans une tubulure qui assure le centrage
hydrodynamique du jet
*La diffusion aux grands angles (90°) de la lumière traversant la cellule donne des informations sur la forme,
la structure et le volume de la cellule et de son noyau tandis quecours
la diffusion aux petits angles de la lumière
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diffractée par des petites particules donne des renseignements sur la granularité cytoplasmique.
Un exemple d’analyse avec un
cytomètre de flux : l’analyse des
cellules sanguines
Voir vidéo sur l’intérêt dans l’étude de
l’évolution de l’infection par le VIH : (à partir de 13 min 47)
http://www.canal-u.tv/video/science_en_cours/la_cytometrie_en_flux.36
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I. Techniques de séparation et
de purification cellulaire
2. Purification: chromatographie d’affinité
• Connaissance d’une molécule de surface spécifique du type cellulaire à trier
• Lectines : protéines d’origine végétale se fixant avec une grande affinité à des
groupements glucidiques spécifiques rencontrés au niveau des glycoprotéines
présentes à la surface des cellules
• Anticorps spécifiques des cellules d’intérêt
• Couplage de cette molécule à diverses matrices (billes de plastique ou de latex)
placées dans une colonne
• Dépôt de la suspension cellulaire à trier sur la colonne ainsi formée
• Fixation des cellules d’intérêt
• Récupération par
• agitation modérée
• changement de pH
• changement de force ionique
• pour casser les liaisons faibles formées entre ligands.
Technique
• spécifique,
• relativement peu onéreuse (régénération de la colonne)
• nécessitant un compromis efficace pour éluer toutes les cellules retenues pour avoir un bon
rendement sans pour autant les altérer.
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I. Techniques de séparation et de
purification cellulaire
2. Purification: chromatographie d’affinité
http://espacesciences.com/Techniques/sepmol/Chromato/
ndev/coursepmol.htm
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I. Techniques de séparation et de
purification cellulaire
2. Purification: Tri immunomagnétique
Tri immunomagnétique
Principe de cette technique très semblable à celui
de la chromatographie d’affinité Incubation
• Connaissance d’une molécule de surface spécifique
du type cellulaire à trier
• Utilisation contre cette molécule d’un anticorps
couplé à une bille métallique à base de fer.
• Incubation de la suspension cellulaire avec cet
anticorps
Retenue
• Dépôt de cette suspension sur une colonne placée
dans un champ magnétique crée par un aimant.
• Retenue des cellules marquées
• Récupération de ces cellules après retrait de
l’aimant
Technique
• très spécifique,
• rapide
• d’un bon rendement. Élution
• assez onéreuse (colonnes à usage unique).
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II. Méthodes d’étude de la
morphologie des cellules :
techniques d’examens
microscopiques
1. Grossissement et
résolution
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Nécessité du grossissement
Cellule végétale
Virus/ribosome
Macromolécule
Cellule animale
Molécule
Bactérie
Atome
1 cm 1 mm 100µm 10 µm 1 µm 100 nm 10 nm 1nm 0,1 nm
Œil nu
Microscope photonique
Microscope électronique
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II - Techniques d’examen microscopique
1. Grossissement et résolution
Grossissement du microscope =
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II - Techniques d’examen microscopique
1. Grossissement et résolution
Le pouvoir de résolution est
• une propriété instrumentale,
• une valeur absolue et théorique
• la meilleure résolution atteignable pour un instrument particulier et
dans des conditions d’observation optimum
La résolution est
• une valeur dépendant des conditions expérimentales d’observation
• égale ou inférieure au pouvoir de résolution
• la possibilité de distinguer des points rapprochés d’objets
distincts
La limite de résolution est la plus petite distance séparant deux points
reconnus comme objets distincts
• 75 µm pour l’œil nu
• 0,25 µm pour les meilleurs microscopes photoniques
• 0,002 µm pour les microscopes électroniques à transmission
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II - Techniques d’examen microscopique
1. Grossissement et résolution: exercices
Calcul de d : limite de résolution λ = longueur d’onde du faisceau lumineux
d = 1/PR = c λ / n sin α n = indice de réfraction du milieu
α = angle de demi ouverture de l’objectif
c = constante = 0,61
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II - Techniques d’examen microscopique
1. Grossissement et résolution: exercices
Indiquer si des objets distants de 3 µm, 300 nm, 3000 Å peuvent être discernés
pour le matériel utilisé suivant : un bon microscope photonique équipé d’un oculaire
x10 et d’un objectif à immersion x 100 et d’une limite de résolution de 2,5 µm .
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II. Méthodes d’étude de la
morphologie des cellules :
techniques d’examens
microscopiques
2. Préparations pour
l’observation microscopique
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II - Techniques d’examen microscopique
2. Préparation pour l’observation microscopique
Schémas de principe des microscopes
Photonique Électroniques à transmission (MET) à balayage (MEB)
Source d’électrons :
Source de photons : filament chauffé soumis
lampe à une forte ddp
Grille de cuivre
Lame support support objet
objet transparent transparent
Bobines déflectrices
donnant un faisceau
Objectif(s)
Objectif mobile d’électrons
réglables
balayant l’objet
Image vidéo
Vide
Oculaire
Projectif
Détecteur
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II - Techniques d’examen microscopique
2. Préparation pour l’observation microscopique
1. en cas de microscopie à lumière
cours E. Grelier 23
II - Techniques d’examen microscopique
2. Préparation pour l’observation microscopique
1. en cas de microscopie à lumière
cours E. Grelier 24
II - Techniques d’examen microscopique
2. Préparation pour l’observation microscopique
1. en cas de microscopie à lumière
On récapitule :
Fixation pour
consolider
Inclusion pour
durcir l’échantillon
Microtomie pour
couper
Coloration pour
le contraste
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II - Techniques d’examen microscopique
2. Préparation pour l’observation microscopique
1. en cas de microscopie à lumière
Etape 1: la fixation
Elle peut être chimique: Elle peut être physique:
avec des fixateurs la congélation (qui doit
coagulants (pour les être rapide): c’est la
tissus) ou non coagulants meilleure technique.
(cytologie).
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II - Techniques d’examen microscopique
2. Préparation pour l’observation microscopique
1. en cas de microscopie à lumière
Etape 2: l’inclusion
l'eau des cellules est remplacée
par de la paraffine chaude qui
durcit en refroidissant.
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II - Techniques d’examen microscopique
2. Préparation pour l’observation microscopique
1. en cas de microscopie à lumière
Etape 3: la coupe
On utilise un microtome : rasoir d’acier
Après inclusion à la paraffine : coupes de 2 à 5 μm,
Après congélation : coupes de 5-10 μm.
http://www.youtube.com/watch?v=1lY1CDKfj
1M
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II - Techniques d’examen microscopique
2. Préparation pour l’observation microscopique
1. en cas de microscopie à lumière
La coloration
Colorants vitaux Colorants non vitaux
Ils ne tuent pas les cellules mais sont Ils tuent la cellule et nécessitent
peu nombreux une fixation de la cellule au
Ex: rouge neutre préalable.
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II - Techniques d’examen microscopique
2. Préparation pour l’observation microscopique
2. En cas de microscopie électronique
a/ Préparation
Vidéo
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II - Techniques d’examen microscopique
2. Préparation pour l’observation microscopique
2. En cas de microscopie électronique
On récapitule :
Fixation pour
consolider
Déshydratation
Obtention
de contraste
cours E. Grelier 31
II - Techniques d’examen microscopique
2. Préparation pour l’observation microscopique
2. En cas de microscopie électronique
cours E. Grelier 32
II - Techniques d’examen microscopique
2. Préparation pour l’observation microscopique
2. En cas de microscopie électronique
cours E. Grelier 33
II - Techniques d’examen microscopique
2. Préparation pour l’observation microscopique
2. En cas de microscopie électronique
- Technique de l'ombrage = vaporisation sous vide des métaux avec une direction
faisant un angle faible avec le plan de la préparation (= sous incidence rasante). Les
vapeurs métalliques viennent se déposer sur la membrane-support et à la surface des
objets, mais chaque objet forme un obstacle au dépôt métallique. On obtient ainsi un effet
d'ombre sur la membrane support.
.
Fibriline en forme d’étoiles
regroupées en chaîne. C’est un
constituant du cartilage
http://temsamprep.in2p3.fr/fiche/fiche.php?l
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Filament d’adn déroulé ang=fr&fiche=32
II - Techniques d’examen microscopique
2. Préparation pour l’observation microscopique
2. En cas de microscopie électronique
http://temsamprep.in2p3.fr/fiche/fiche.php?l
cours E. Grelier 35
ang=fr&fiche=32
II - Techniques d’examen microscopique
2. Préparation pour l’observation microscopique
2. En cas de microscopie électronique
- Technique de coloration négative : on place les objets dans une solution aqueuse
d'acide phosphotungstique et on dépose une gouttelette de cette suspension sur une grille
recouverte d'une membrane-support.
En séchant l’acide phosphotungstique forme entre les structures un écran que les
électrons ne peuvent traverser.
Les électrons traversent les structures que l’on veut observer: image en négatif.
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II - Techniques d’examen microscopique
2. Préparation pour l’observation microscopique
2. En cas de microscopie électronique
cours E. Grelier 37
II - Techniques d’examen microscopique
2. Préparation pour l’observation microscopique
2. En cas de microscopie électronique
cours E. Grelier 38
II - Techniques d’examen microscopique
2. Préparation pour l’observation microscopique
2. En cas de microscopie électronique
cours E. Grelier 39
II - Techniques d’examen microscopique
2. Préparation pour l’observation microscopique
2. En cas de microscopie électronique
e. La cryofracture
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II - Techniques d’examen microscopique
2. Préparation pour l’observation microscopique
La cryofracture
cours E. Grelier 41
II - Techniques d’examen microscopique
2. Préparation pour l’observation microscopique
La cryofracture
cours E. Grelier 42
II - Techniques d’examen microscopique
2. Préparation pour l’observation microscopique
La cryofracture
cours E. Grelier 43
une image obtenue par
cryodécapage montrant
l'organisation membranaire
de la cellule (à gauche, le
noyau, à droite des nappes
de réticulum
endoplasmique).
cours E. Grelier 44
II. Méthodes d’étude de la
morphologie des cellules :
techniques d’examens
microscopiques
3. Microscopie photonique
cours E. Grelier 45
II - Techniques d’examen microscopique
3. Microscopie photonique
Rappel: Schémas de principe du microscope photonique
Source de photons :
lampe
Condenseur
Lame support
objet transparent
Oculaire
Oeil
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3. Microscopie photonique
Types particuliers de microscopies photoniques: le microscope
à contraste de phase
Intérêt: possibilité
d’observer des cellules
vivantes et leur
mouvement en
microcinématographie
accélérée
cours E. Grelier 47
3. Microscopie photonique
Types particuliers de microscopies photoniques: le microscope
à épifluorescence
cours E. Grelier 48
3. Microscopie photonique
Types particuliers de microscopies photoniques: le microscope
à épifluorescence
cours E. Grelier 49
3. Microscopie photonique
Types particuliers de microscopies photoniques :
le microscope à épifluorescence
cours E. Grelier 50
II. Méthodes d’étude de la
morphologie des cellules :
Techniques d’examens
microscopiques
4. Microscopie électronique
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4. Microscopie électronique
Principe
cours E. Grelier 52
4. Microscopie électronique
* Inconvénients :
1/ Les ë ne se propagent que dans le vide très poussé ce qui empêche toute
observation sur le vivant ;
2/ La pénétration des ë dans la matière est très faible, donc les coupes doivent
être très minces (de l'ordre de 0,06 à 0,09 μm ~ 0,1 μm pour 2 à 5μm en
microscopie photonique) ; on utilisera un ultramicrotome.
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4. Microscopie électronique
Schémas de principe des microscopes
Électroniques à transmission (MET) à balayage (MEB)
Source d’électrons :
filament chauffé soumis
à une forte ddp
Condenseur
Grille de cuivre
support objet
transparent
Bobines déflectrices
donnant un faisceau
Objectif(s)
mobile d’électrons
réglables
balayant l’objet
Image vidéo
Vide
Projectif
Détecteur
Objet non
Écran fluorescent
transparent
Plaque photographique
cours E. Grelier 54
4. Microscopie électronique : Le MET
Vidéo
cours E. Grelier 55
4. Microscopie électronique: Le MEB
Les échantillons sont bombardés par un faisceau d'ë, mais seuls sont
utilisés pour la formation de l'image, les ë qui sont réémis par la
surface de l'échantillon.
A la différence du microscope électronique par transmission, il est
donc possible d'étudier des échantillons massifs dont seule la
surface est observée.
Vidéo MEB
cours E. Grelier 56
III. Méthodes d’étude de la
composition biochimique
des cellules
1. Techniques de
fractionnement cellulaire
cours E. Grelier 57
III – Méthodes d’étude de la composition biochimique des cellules
1. Techniques de fractionnement cellulaire
cours E. Grelier 58
III – Méthodes d’étude de la composition
biochimique des cellules
1. Techniques de fractionnement cellulaire
Éclatement de la cellule
• Techniques
cours E. Grelier 59
III – Méthodes d’étude de la composition
biochimique des cellules
1. Techniques de fractionnement cellulaire
cours E. Grelier 60
III – Méthodes d’étude de la composition
biochimique des cellules
1. Techniques de fractionnement cellulaire
cours E. Grelier 61
III – Méthodes d’étude de la composition biochimique des cellules
1. Techniques de fractionnement cellulaire
cours E. Grelier 62
III – Méthodes d’étude de la composition
biochimique des cellules
1. Techniques de fractionnement cellulaire
cours E. Grelier 63
III – Méthodes d’étude de la composition
biochimique des cellules
1. Techniques de fractionnement cellulaire
Séparation des organites par ultracentrifugation différentielle
Cellules vivantes Broyage Homogénat
Surnageant
Surnageant
Centrifugation
1000 g 10 min
Centrifugation
20000 g 20 min
Culot : Noyaux et débris
Centrifugation
80 000 g 60 min
Culot : mitochondries, lysosomes et peroxysomes
cours E. Grelier 64
III – Méthodes d’étude de la composition
biochimique des cellules
1. Techniques de fractionnement cellulaire
• gradient préformé
• gradient autoformé
cours E. Grelier 65
III – Méthodes d’étude de la composition
biochimique des cellules
1. Techniques de fractionnement cellulaire
Séparation des organites par centrifugation sur gradient de densité préformé
Protocole
Dépôt d’une fine couche de l’homogénat à la
surface du gradient contenu dans le tube à
centrifuger : solution de saccharose ou de
glycérol dont la concentration varie de façon
régulière et décroissante du bas vers le haut du
tube, variation linéaire et continue ou bien
discontinue et par paliers.
Centrifugation à vitesse élevée pendant
quelques heures.
Migration des particules dans le gradient jusqu’à
une position d’équilibre qui correspond à sa Lysosomes (1,12 g/mL)
densité
Obtention d’anneaux le long du tube Mitochondries (1,18 g/mL)
(centrifugation zonale) qui peuvent être
récupérés séparément par aspiration.
Technique Peroxysomes (1,23 g/mL)
permettant d’obtenir une séparation des
constituants cellulaires en une seule étape
d’un grand degré de pureté.
ne permettant de manipuler que de petits
volumes de matériel biologique et constituant
donc une technique uniquement analytique.
cours E. Grelier 66
III – Méthodes d’étude de la composition biochimique des
cellules
1. Techniques de fractionnement cellulaire
Séparation des organites par centrifugation sur gradient de densité autoformé
Technique mise au point par Svedberg (1923) pour déterminer des masse moléculaires et appliquée à la biologie par le physiologiste belge
Albert Claude (Prix Nobel 1974) pour isoler les microsomes
Détermination de Coefficient de Sédimentation exprimé en unités Svedberg S défini comme la vitesse de sédimentation (m/s) par unité
d’accélération (m/s2) et équivalent à 10-13s
cours E. Grelier 67
III – Méthodes d’étude de la composition
biochimique des cellules
1. Techniques de fractionnement cellulaire
Séparation des organites par centrifugation sur gradient de densité autoformé
3-
Densité croissante
cours E. Grelier 68
III. Méthodes d’étude de la
composition biochimique
des cellules
2. Marquage
cours E. Grelier 69
III – Méthodes d’étude de la composition
biochimique des cellules
2. Marquage
http://bioimage.free.fr/his_image/elastique_1_10.htm
cours E. Grelier 70
III – Méthodes d’étude de la composition
biochimique des cellules
2. Marquage
http://bioimage.free.fr/his_image/fibres_de_reticuline.htm
cours E. Grelier 71
III – Méthodes d’étude de la composition
biochimique des cellules
2. Marquage
http://bioimage.free.fr/his_image/pas_glandes_muqueuses_oesophage_5.htm
cours E. Grelier 72
III – Méthodes d’étude de la composition
biochimique des cellules
2. Marquage
http://bioimage.free.fr/his_image/bronches_200.htm
cours E. Grelier 73
III – Méthodes d’étude de la composition
biochimique des cellules
2. Marquage
http://bioimage.free.fr/hem_image/sidero8g.htm
cours E. Grelier 74
III – Méthodes d’étude de la composition
biochimique des cellules
2. Marquage
http://bioimage.free.fr/hem_image/peroxps7g.htm
cours E. Grelier 75
III – Méthodes d’étude de la composition
biochimique des cellules
2. Marquage
Marquage spécifique par des conjugués (marqueurs fixés sur des anticorps)
Fluorochromes
Isotopes radioactifs
Enzymes (peroxydase ou phosphatase alcaline)
Granules sécrétoires de
Glucagon mis en évidence dans
cellules gastriques mis en
des cellules pancréatiques par
évidence par un anticorps
un anticorps antiglucagon
antigastrine reconnu par un
reconnu par un conjugué (anti
conjugué (anti Ig couplé à la
Ig couplé à l’or colloïdal) MET
ferritine) MET
cours E. Grelier 76
IV. Méthode d’étude du
métabolisme cellulaire
1. Isotopes radioactifs
cours E. Grelier 77
IV. Méthode d’étude du métabolisme cellulaire
1. Isotopes les plus utilisés
• Notion d’isotopes
• éléments chimiques ayant le même nombre d’électrons que les éléments
naturels mais différant par la masse de leur noyau.
• pouvant être instables : radioactifs car subissant des désintégrations
libérant des électrons ou des radiations détectées :
• par un compteur Geiger (mesure de l’ionisation produite par les radiations dans un
gaz)
• par un compteur à scintillation (mesure d’éclairs lumineux provoqués dans un
liquide scintillant)
• par son action sur le bromure d’argent d’une émulsion photographique que les
radiations réduisent en argent métallique et qui est ensuite développée sous
forme de taches visibles.
• principaux radio-isotopes utilisés en biologie
• 3H (acides minés, oses, nucléotides)
• 14C (acides aminés, nucléotides)
• 32P (nucléotides)
• 22Na
• 42K
• 125I.
cours E. Grelier 78
IV. Méthode d’étude du
métabolisme cellulaire
2. Principe
cours E. Grelier 79
IV. Méthode d’étude du métabolisme cellulaire
2. Principe
cours E. Grelier 80
IV. Méthode d’étude du
métabolisme cellulaire
3. Détection de la
radioactivité des
préparations biologiques :
l’autoradiographie
cours E. Grelier 81
IV. Méthode d’étude du métabolisme cellulaire
3. L’autoradiographie
Coupe de cellule
Marquage radioactif
•
Noyau
Autoradiographie permettant la
localisation de composés Émulsion
photographique
radioactifs dans des cellules
entières ou des coupes de tissus.
• Exposition de cellules vivantes à
un pulse rapide d’un composé
radioactif. Atome
• Lavage, fixation puis traitement radioactif
Grain
pour l’observation en microscopie d’argent
photonique ou électronique.
•
Trajet des
Dépôt sur la préparation d’une électrons
mince couche d’émulsion
photographique et incubation.
• Développement de l’émulsion
• Localisation de la radioactivité par Grain d’argent
la position des grains d’argent
cours E. Grelier 82
IV. Méthode d’étude du métabolisme cellulaire
3. L’autoradiographie
Autoradiographie en microscopie
électronique d'une cellule épithéliale
provenant d’un animal auquel de la
thymidine tritiée a été administrée quatre
jours auparavant.
L’incorporation de thymidine tritiée dans le
noyau, résulte d’une synthèse d’ADN
utilisant cette base nucléotidique. Elle
signe l’apparition d’une cellule nouvellement
formée.
cours E. Grelier 83
V. Culture cellulaire
1. Conditions à respecter
cours E. Grelier 84
V. Culture cellulaire
1. Conditions à respecter
cours E. Grelier 85
V. Culture cellulaire
cours E. Grelier 86
V. Culture cellulaire
2. Intérêts des cultures cellulaires
cours E. Grelier 87
V. Culture cellulaire
3. Différents types
cellulaires utilisés
cours E. Grelier 88
V. Culture cellulaire
3. Différents types cellulaires utilisés
cours E. Grelier 89
V. Culture cellulaire
3. Différents types cellulaires utilisés
cours E. Grelier 90
V. Culture cellulaire
3. Différents types cellulaires utilisés
• Cellules hybrides
• obtenues par fusion chimique ou physique et possédant,
dans un premier temps, deux noyaux séparés appelées
hétérocaryons .
• donnant après mitose des cellules hybrides dans laquelle
tous les chromosomes se rassemblent pour former un
unique noyau.
• Technique de culture des hybridomes utilisée dès 1976
pour développer la production industrielle d’anticorps
monoclonaux après formation d’un hétérocaryon entre
• Un plasmocyte (LB différencié) sécréteur d’anticorps spécifiques
• une cellule de myélome (cancer du tissu conjonctif où les cellules cancéreuses
sont de nature plasmocytaire)
cours E. Grelier 91