Este documento describe varios métodos para la detección de organismos genéticamente modificados, incluyendo la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), PCR múltiple, PCR en tiempo real, electroforesis en gel, microarreglos, ácidos nucleídicos peptídicos y resonancia de plasmones de superficie. El documento explica cómo cada método funciona y sus ventajas e inconvenientes.
Este documento describe varios métodos para la detección de organismos genéticamente modificados, incluyendo la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), PCR múltiple, PCR en tiempo real, electroforesis en gel, microarreglos, ácidos nucleídicos peptídicos y resonancia de plasmones de superficie. El documento explica cómo cada método funciona y sus ventajas e inconvenientes.
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Este documento describe varios métodos para la detección de organismos genéticamente modificados, incluyendo la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), PCR múltiple, PCR en tiempo real, electroforesis en gel, microarreglos, ácidos nucleídicos peptídicos y resonancia de plasmones de superficie. El documento explica cómo cada método funciona y sus ventajas e inconvenientes.
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Los nuevos métodos para la detección de residuos de
organismos genéticamente modificados (OGM ) El incremento de productos derivados de OGM que han sido lanzados al mercado El aumento de demandas por parte de los consumidores para que se establezcan regulaciones mas estrictas en el etiquetado de estos productos Regulaciones para productos que contengan mas de 0.9% de soya (Roundup Ready) y maíz Bt-176 En ingredientes específicos para aditivos y saborizantes derivados de cultivos GM REACCIÓN EN CADENA DE LA POLIMERASA Conocida como PCR es una técnica de biología molecular desarrollada en 1986 por Kary Mullis Es obtener un gran número de copias de un fragmento de ADN particular partiendo de un mínimo En teoría basta partir de una única copia de ese fragmento original o molde Reactivos: Para realizar la técnica se necesitan ± Los 4 desoxirribonucleósidos-trifosfato (dNTP), para polimerizar nuevo ADN ± Dos cebadores o iniciadores oligonucleótidos que son, cada uno, complementarios a una de las dos hebras del ADN ± Iones divalentes. Se suele usar (Mg2+), También se puede emplear (Mn2+) ± Iones monovalentes, como el potasio ± Una solución tampón ± ADN polimerasa o mezcla de distintas polimerasas 70 °C ± ADN molde ± Termociclador, el aparato que va a mantener la temperatura necesaria Ciclo de amplificación: La técnica se basa en la replicación del ADN 1.- Desnaturalización 2.- Hibridación 3.- Elongación
Figura 1: Pasos básicos de la PCR (de Andy Vierstracte 1999)
PCR multiplex PCR en la cual se amplifica más de una secuencia en una misma reacción. Emplea dos o más pares de cebadores en único tubo con el fin de amplificar simultáneamente múltiples segmentos de ADN Consiste en combinar una única reacción todos pares de cebadores ± Sus ventajas Obtiene la información de varios en una sola reacción Menor cantidad de molde para el análisis Menor cantidad de reactivos Rápida construcción de base de datos La PCR múltiple en microbiología clínica. Los cebadores y el programa de temperaturas utilizado, es necesario tener en cuenta varias premisas: a) Escoger o diseñar oligonucleótidos que no interaccionen entre sí, es decir, que no formen oligómeros b) Que tengan temperaturas de anillamiento similares c) Que cada pareja amplifique una única secuencia diana d) Que generen ampliaciones de tamaño suficientemente diferente como para poder ser separados y diferenciados tras la amplificación. PCR en tiempo real o PCR cuantitativa (qPCR) Los procesos de amplificación y detección se producen de manera simultánea en el mismo vial cerrado Detección por fluorescencia se puede medir durante la amplificación la cantidad de ADN La emisión de fluorescencia producida en la reacción es proporcional a la cantidad de ADN formado La PCR a tiempo real pueden ser de dos tipos: agentes intercalantes y sondas específicas marcadas con fluorocromos. ± Técnicas basadas en fluorocromos: Permite cuantificar sólo una secuencia por reacción Ventaja de utilizar cebadores normales para su realización Es mucho más económica que la que usa sondas específicas ± Técnicas basadas en sondas específicas : Utilizan una sonda unida a dos fluorocromos que hibrida en la zona intermedia entre el cebador directo (forward) y el inverso (reverse) Presenta una transferencia energética de fluorescencia por resonancia (FRET). No se produce cuando la sonda está dañada y los dos fluorocromos están distantes Esto permite monitorizar el cambio del patrón de fluorescencia Utilización de Gel de Electroforesis Capilar con Fluorescencia de Láser inducido Consiste en la separación de los productos de PCR por geles de electroforesis Son teñidas con bromuro de etidio, grabando la imagen utilizando un digitalizador de imagen La cuantificación de los fragmentos de ADN El análisis CGE permite la detección de los diversos transgenes amplificados ± Sus desventajas Son poco reproducibles y precisos Requieren grandes cantidades de muestra y mucho tiempo Limitada de los geles de electroforesis impone restricciones en el diseño de estándares internos UV en geles de electroforesis capilar (CGE) tiene poca sensibilidad fluorescencia por láser inducido (LIF) en CGE incrementa dramáticamente el límite de detección Micro arreglos
La tecnología de micro arreglos puede
incrementar la facilidad y velocidad del análisis de los productos de PCR. Es un sistema analítico que permite la detección simultánea de muchas secuencias de ácidos nucleídos en una muestra. Las sondas en el arreglo son hibridados con el marcador fluorescente para productos de PCR acidos nucleídos peptídicos (PNAs) Son análogos de los oligonucleicos Diferencia de ácidos nucleídos no contienen pentosa ni grupo fosfato Con esta tecnología se puede construir micro arreglos y poder identificar el gen consecutivo Lectin y la región genéticamente modificada ± Ventaja : Es establecer enlaces con cadenas de ADN Los PNAs son más eficientes y forman híbridos más estables que los oligonucleótidos, Los PNAs tiene una secuencia altamente especifica. Resonancia de plasmones superficiales(SPR) Está basado en biosensores capases de desempeñar un análisis de interacción bioespecifica (BIA) en tiempo real Es una técnica óptica que detecta y cuantifica cambios en el índice de refracción en una superficie del chip sensor En el cual los ligandos son inmovilizados, permitiendo la detección de biomoleculas (analitos) interaccionando con el ligando Si la cadena simple de ADN es marcado con biotina, la tecnología SPR puede monitorear fácilmente el acoplamiento ADN-ADN en tiempo real