Unidad 3.

Nutricin, metabolismo, crecimiento y control de microorganismos

Objetivos Conocer -Las caractersticas de los principales grupos nutricionales de microorganismos, su crecimiento y control -Las diferentes aplicaciones de la microbiologa -Las peculiaridades metablicas de los microorganismos y su diversidad -Las pautas del crecimiento microbiano y los factores que lo influyen -Los agentes antimicrobianos ms comunes y sus mecanismos de accin Asimilar -El mantenimiento adecuado de cultivos puros de microorganismos solo es posible con la prctica de tcnicas aspticas -El metabolismo microbiano es enormemente verstil y plstico Capacidad -Prepara cultivos y manejar varias tcnicas de esterilizacin -Realizar tcnicas bsicas de recuento de bacterias -Aislar microorganismos -Actualizar su formacin y necesidades en microbiologa a travs del manejo herramientas bioinformticas

UNIDAD 3.- NUTRICIN, METABOLISMO, CRECIMIENTO Y CONTROL DE LOS MICROORGANISMOS Tema 8.- Conservacin de la energa. Visin general del metabolismo. Oxidacin de molculas orgnicas (Degradacin de glucosa a piruvato. Fermentaciones. Ciclo del cido ctrico) Respiracin aerbica (Transporte electrnico y fosforilacin oxidativa). Respiracin anaerbica. Oxidacin de molculas inorgnicas (desnitrificacin y oxidacin de azufre). Catabolismo. Fotosntesis. Anabolismo.

Conservacin de la energa

Flujo de energa y carbono en trminos generales: Los procesos empleados por los organismos para obtener energa y trabajo qumico son la base del funcionamiento de los ecosistemas. Los organismos auttrofos transforman el CO2 en molculas complejas que son empleadas por otros organismos como fuente de energa y/o carbono.

Conservacin de la energa

La moneda energtica celular

ATP empleado para transferir energa desde los sistemas de conservacin de energa celulares hasta los sistemas que llevan a cabo el trabajo celular

El ciclo energtico de la clula

Respiracin aerobia Respiracin anaerobia Fermentacin Fotosntesis

Trabajo qumico Trabajo mecnico Transporte

Conservacin de la energa

G = H - T S

G incremento de energa libre cantidad de energa disponible para realizar un trabajo H incremento de entalpa (contenido de calor) T temperatura en Kelvin S incremento de entropa

G = -nF E0 A mayor diferencia entre E0 del donador y E0 del aceptor ms negativo ser Go

Conservacin de la energa

Energa y flujo de electrones en el metabolismo

el flujo de electrones desde un potencial ms negativo a uno ms positivo libera energa la energa de la luz es empleada durante la fotosntesis para generar compuestos con potencial redox negativo

Transportadores de electrones

NAD: nicotinamida adenina dinucletido NADP: nicotinamida adenina dinucletido fosfato

Conservacin de la energa

Transportadores de electrones
FAD (Riboflavina) flavin adenina dinucleotido FMN (Comprende solo la parte del FAD rodeada con el crculo) flavin mononucleotido riboflavina fosfato coenzyme Q (CoQ) una quinona tambin llamada ubiquinone

citocromos emplea hierro para transferir electrones el hierro es parte del riboflavin grupo hemo

Visin general del metabolismo

Visin general del metabolismo

metabolismo todas las reacciones qumicas que tienen lugar en la clula catabolismo ruptura de molculas grandes y complejas en molculas ms pequeas la energa liberada es en parte empleada para la realizacin de trabajo anabolismo sntesis de molculas complejas a partir de molculas simples empleando energa

Fuentes de energa

Aceptores de electrones en los procesos qumiotrofos

los electrones liberados durante la oxidacin de las fuentes de energa qumica deben ser aceptado por otro compuesto (aceptor) los microorganismos se diferencian segn los aceptores que emplean o son capaces de emplear

aceptores exgenos de electrones

Visin general del metabolismo

Metabolismo quimioorganotrfico
fermentacin
la fuente de energa es oxidada y degradada empleando aceptores endgenos de electrones frecuentemente tiene lugar en condiciones anaerbicas la energa disponible en el proceso es limitada

respiracin aerbica
la fuente de energa es oxidada y degradada empleando oxgeno como aceptor exgeno electrones rinde gran cantidad de energa, principalmente a travs del transporte electrnico

respiracin anaerbica
la fuente de energa es oxidada y degradada empleando otras molculas distintas al oxgeno como aceptor exgeno electrones puede rendir gran cantidad de energa (dependiendo de la diferencia de potencial redox entre la fuente de energa y el aceptor de electrones) principalmente a travs del transporte electrnico

Visin general del metabolismo

Esquema general del catabolismo aerbico

proceso de tres etapas grandes molculas (polmeros) pequeas molculas (monmeros) oxidacin inicial y degradacin a piruvato oxidacin y degradacin del piruvato a travs del ciclo de los cidos tricarboxlicos (ciclo TCA)

El ATP se forma principalmente mediante fosforilacin oxidativa

numerosas fuentes de energa son canalizadas a travs de rutas degradativas comunes

Visin general del metabolismo

La fuente de energa orgnica tiene dos funciones

se oxida para desprender energa suministra carbono y compuestos primarios para el anabolismo

rutas anfiblicas funcionan tanto como rutas anablicas y catablicas

Degradacin de la glucosa a piruvato

Tres rutas comunes glucolisis ruta de las pentosas fosfato Ruta de Entner-Doudoroff

Degradacin de glucosa a piruvato

Glucolisis

Tambin denominada EmbdenMeyerhof en procariotas y eucariotas tiene lugar en la matriz citoplsmica

la adicin de fosfato ceba la bomba

etapa de oxidacin genera NADH molculas de alta energa se emplean para sintetizar ATP mediante fosforilacin a nivel de sustrato

Reaccin general de la glucolisis

glucosa + 2ADP + 2Pi + 2NAD+ 2 piruvato + 2ATP + 2NADH + 2H+

Degradacin de glucosa a piruvato

Ruta de las Pentosas fosfato

tambin llamada ruta de las hexosas monofosfato funciona simultneamente como ruta glicoltica y como ruta de EntnerDoudoroff funciona aerbicamente y anaerbicamente es una ruta anfiblica
Produce NADPH, que es necesario para la biosntesis
Reacciones de transformacin de azcares. Generan azucares necesarios para la biosntesis.

Oxidaciones

Los azucares pueden tambin ser degradados posteriormente

glucosa-6-P + 12NADP+ + 7H2O 6CO2 + 12NADPH + 12H+ Pi

Degradacin de glucosa a piruvato

Ruta de Entner-Doudoroff
Emplea reacciones de la ruta de la glucolisis y de las pentosas fosfato
rendimiento por molcula de glucosa: 1 ATP 1 NADPH 1 NADH

Reacciones de la ruta de las pentosas fosfato

Reacciones de la ruta glucoltica

Fermentaciones

Fermentaciones
oxidacin del NADH producido en la glucolisis el piruvato o algn derivado es empleado como aceptor endgeno de electrones el ATP se forma por fosforlacin a nivel de sustrato Previene la formacin de radicales superxido perxido de hidrgeno radicales hidroxilo

Tipos principales fermentaciones

1. Fermentacin alcohlica: El etanol es el producto final de la fermentacin 2. Fermentacin lctica: el cido lctico forma parte de los productos finales de la fermentacin Fermentacin homolctica: El cido lctico es el producto final mayoritario Fermentacin heterolctica: El cido lctico no es el producto final mayoritario Los productos finales son entre otros, el lactato, etanol y CO2, Fermentacin cido-mixta: etanol y cidos (frmico, lctico, etc.): Fermentacin butanodilica: butanodiol y CO2 Fermentacin butrica: butirato Fermentacin propinica: propionato y CO2

Fermentaciones

Fermentacin alcohlica Fermentacin homolctica Bebidas alcohlicas, pan, etc.

Fermentadores heterolcticos

Deterioro de alimentos

Productos de la fermentacin cido mixta de Escherichia coli

yogurt, chucrut, pepinillos.

test rojo de metilo detecta cambios de pH en los medios a causa de la fermencin cido mixta

Fermentaciones

Fermentacin butanodilica

Fermentacin de aminocidos

Prueba de VogesProskauer detecta el intermediario acetoin

Las pruebas del rojo de metilo y la de Voges- Proskauer son importantes para distinguir miembros patgenos de la familia Enterobacteriaceae

Reaccin de Strickland oxidacin de un aminocido empleando un segundo aminocido como aceptor de electrones

Ciclo de los cidos tricarboxlicos

Ciclo de los cidos tricarboxlicos

tambin llamado ciclo del cido ctrico o ciclo de Krebs completa la oxidacin y degradacin de la glucosa y otras molculas comn en bacterias aerobias, protozoos de vida libre, la mayora de las algas y hongos es una ruta anfiblica proporciona esqueletos de carbono para la biosntesis Las cianobacterias la tienen incompleta

Resumen : por cada molcula de acetilCoA oxidada, el ciclo de los cidos tricarboxlicos genera: 2 molculas de CO2 3 molculas de NADH una FADH2 una GTP

Ciclo de los cidos tricarboxlicos

Etapa de oxidacin forma NADH y FADH2

esta energa permite la condensacin del grupo molcula acetilo con el de alta oxalacetato energa

etapa de descarboxilacin y oxidacin

fosforilacin a nivel de sustrato

Degradacin y oxidacin completas

GTP

tambin forma NADH

Transporte electrnico respiratorio

Transporte electrnico respiratorio y fosforilacin oxidativa

solo 4 molculas de ATP son sintetizadas directamente de la oxidacin de la glucosa a CO2 la mayora del ATP se forma cuando el NADH y el FADH2 (formados durante la oxidacin de la glucosa) son oxidados en la cadena de transporte electrnico y los electrones transferidos a un aceptor terminal de electrones

La cadena de transporte electrnico respiratorio

serie de transportadores de electrones que operan juntos para transferir electrones desde el NADH al FADH2 a un aceptor terminal de electrones los electrones fluyen desde los transportadores con menor E0 (ms negativos) a los transportadores con mayor E0 (ms positivos) a medida que se transfieren electrones se libera energa parte de la energa liberada se emplea para hacer ATP mediante fosforilacin oxidativa hasta 3 molculas de ATP por molcula de NADH, empleando oxgeno como aceptor de electrones proporcin P/O = 3 Para el FADH2 la proporcin P/O es 2 es decir 2 molculas de ATP por molcula de FADH2

Transporte electrnico respiratorio

Localizacin de la cadena de transporte electrnico

En eucariotas se sita en la membrana interna mitocondrial En procariotas se sita en la membrana plasmtica Tambin se observa respiracin en la membrana tilacoidal de los cloroplastos (clororespiracin) y de los procariotas fotosintticos

Transporte electrnico respiratorio

Espacio entre membranas

Transporte electrnico mitocondrial

Tiene lugar en la membrana interna mitocondrial

Matriz

Las reducciones que conllevan la captacin de un protn (ej. reduccin de ubiquinona o O2 por Fe2+) se realizan en la matriz y las reducciones que conllevan el desprendimiento de un protn (ej. reduccin de Fe3+ con ubiquinol ) se realizan en el espacio entre membranas Esto genera un gradiente de protones entre ambos lados de la membrana

la mayor diferencia de E0 es entre el NADH y el O2 mayor cantidad de energa liberada

Transporte electrnico respiratorio

Cadena de transporte electrnico en procariotas

se localiza principalmente en la membrana plasmtica tiene numerosos parecidos con el transporte electrnico mitocondrial y algunas diferencias transportadores de electrones diferentes puede estar ramificado puede ser ms corto puede tener menor proporcin P/O Cadena de transporte electrnico en E. coli

ruta ramificada rama superior fase estacionaria y poca aireacin

P/O:0.67

rama inferior fase exponencial y mucha aireacin

P/O:1.3

Transporte electrnico respiratorio

Metanol Formaldehdo

Cadena de transporte en la respiracin de nitrato

Algunas bacterias como Paracoccus denitrificans alternan las respiracin de oxgeno (en aerobiosis) con la de nitrato (en anaerobiosis)

Aerobiosis

El primer tipo de respiracin es preferente ya que se obtiene mayor cantidad de energa y permite mayor variedad de donadores de Anaerobiosis electrones En la respiracin anaerobia se admiten mayor nmero de aceptores La composicin de la cadena de transporte de electrones vara segn respire O2 , NO3 , NO , 2 La bacteria adapta los transportadores
Nitrato Nitrito Primera alternativa Segunda alternativa

xido ntrico Nitrgeno

gases

Oxido nitroso

Ejemplo de respiracin anaerbica

Desnitrificacin

Fosforilacin oxidativa

Fosforilacin oxidativa
Hiptesis qumiosmtica la explicacin ms ampliamente aceptada de la fosforilacin oxidativa propone que la energa liberada durante el transporte de electrones se emplea para establecer un gradiente de protones y carga a travs de la membrana este gradiente se denomina fuerza proto motriz (PMF)

La PMF impulsa la sntesis de ATP

el transporte electrnico establece la PMF

la ATP sintasa emplea el flujo de protones a favor de gradiente para hacer ATP

Fosforilacin oxidativa

Fosforilacin oxidativa

Inhibidores de la sntesis de ATP

bloqueantes inhiben el transporte de electrones a travs de la cadena de transporte electrnico desacoplantes permiten el flujo de electrones pero lo desconectan de la fosforilacin oxidativa muchos de ellos permiten el movimiento de iones, incluidos protones, a travs de la membrana sin la activacin de la ATP sintasa elimina los gradientes de pH e iones algunos de unen a la ATP sintasa e inhiben directamente su actividad

Importancia de la Fuerza Protomotriz (PMF)

(PMF)

Fosforilacin oxidativa

Rendimiento en ATP en la glucolisis y la respiracin aerbica

la respiracin aerbica proporciona mucho ms ATP que la fermentacin Efecto Pasteur disminucin de la velocidad a la que se metaboliza el azcar cuando el microorganismo pasa de condiciones anaerbicas a condiciones aerbicas se debe a que el proceso aerbico genera ms ATP por molcula de azcar Rendimiento en ATP de la oxidacin aerbica de glucosa en clulas eucariotas Rendimiento en ATP la cantidad de ATP producida durante la respiracin aerbica vara segn las condiciones de crecimiento y el tipo de cadena transportadora de electrones

aEl

rendimiento en ATP se calcula asumiendo una proporcin P/O de 3.0 para el NADH y 2.0 para el FADH 2

Respiracin anaerbica

Respiracin anaerbica

emplea aceptores finales de electrones distintos del O2

generalmente rinde menos energa que la aerbica ya que el E0 del aceptor de electrones es menos positivo que el E0 del O2 Algunos aceptores de electrones empleados en la respiracin

reduccin disimilatoria de nitrato emplea nitrato como aceptor final de electrones desnitrification reduccin de nitrato a nitrgeno gas en el suelo provoca la prdida de fertilidad

Oxidacin de molculas inorgnicas

Oxidacin de molculas inorgnicas

llevada a cabo por los quimiolitotrofos Rendimiento energtico de las oxidacines los electrones son empleadas por los quimiolitotrofos desprendidos por la fuente de energa transferidos a un aceptor terminal de electrones a travs de una cadena de transporte el ATP se sintetiza mediante fosforilacin oxidativa Quimiolitotrofos representativos y sus fuentes de energa

Oxidacin de molculas inorgnicas

Bacterias nitrificantes
6 e 2 e oxidan el amonio a nitrato NH3 NO2- NO3-

requiere dos gneros diferentes Nitrosomonas (oxida NH3 a NO2 -) y Nitrobacter (oxida NO2- a NO3 -)

Transporte de electrones en Nitrosomonas

el ATP se sintetiza mediante fosforilacin oxidativa

Nitrosomonas

se oxida a NH2OH (hidroxilamina) y consume H+

el O2 tambin es el aceptor final de e y consume ms H+

Oxidacin de molculas inorgnicas

Transporte de electrones en Nitrobacter Nitrobacter lleva un transporte de electrones desde el NO2 al O2 para generar un gradiente de protones y ATP (parte derecha de la figura). Parte de los protones se emplean tambin para mover los electrones en sentido descendiente del gradiente de potencial de reduccin desde el NO2 al NAD+ (parte izquierda)

NO2 - NO3

Oxidacin de molculas inorgnicas

Visin general del ciclo del nitrgeno

asimilacin de nitrgeno tambin la reduccin disimilatoria

desnitrificacin fijacin de nitrgeno

nitrificacin

Oxidacin de molculas inorgnicas

Bacterias oxidantes de azufre

El ATP puede ser sintetizado tanto por fosforilacin oxidativa a travs de la oxidacin directa de sulfato a sulfito como por fosforilacin a nivel de sustrato a travs de la formacin de APS (adenosina 5-fosfosulfato

No confundir con la reduccin asimilatoria de sulfato en la que tambin se forma APS

Oxidacin de molculas inorgnicas

Flexibilidad metablica de los quimiolitotrofos

muchos pueden pasar de un metabolismo quimiolitotrofo a uno quimioorganotrofo muchos pueden pasar de un metabolismo auttrofo (va ciclo de Calvin) a una metabolismo hetertrofo

Crecimiento auttrofo de los quimiolitotrofos

El ciclo de Calvin requiere NADH como fuente de electrones para la fijacin de CO2 muchas fuentes de energa empleadas por los quimiolitotrofos tienen un E0 ms positivo que el NAD/NADH emplean el transporte electrnico inverso para generar NADH a partir de ATP

Catabolismo

Catabolismo de carbohidratos y reservas intracelulares

numerosos y diferentes carbohidratos pueden servir como fuente de energa los carbohidratos pueden ser adquiridos del exterior o de reservas internas Carbohidratos monosacaridos se convierten en azucares que se incorporan en la ruta glicoltica disacaridos y polisacaridos son fragmentados por hidrolasas y fosforilasas Reserva de polmeros se emplea como fuente de energa en ausencia de nutrientes externos ej.:, glucgeno y almidn roto por fosforilacin (glucosa)n + Pi (glucosa)n-1 + glucosa-1-P glucosa-1-P se incorpora en la glicolisis ej., PHB (polihidroxibutirato) PHB acetil-CoA acetil-CoA se incorpora al ciclo de Krebs

Catabolismo

La -galactosidasa es muy empleada como gen marcador o informador en biotecnologa

Anlogos de la lactosa La mayora de estos compuestos son galactsidos derivados de la lactosa, donde la glucosa ha sido sustituida por algn radical o grupo qumico. Los anlogos de lactosa ms representativos son: IPTG (isopropil--D-tio-galactsido): suele utilizarse como inductor artificial del opern lac, ya que es capaz de unirse al represor LacI, pero no es un sustrato para la -galactosidasa y no puede ser metabolizado por la bacteria. Adems, el IPTG es transportado eficientemente al interior de la bacteria en ausencia de la permeasa, con lo que su entrada es independiente de la expresin del gen lac I. ONPG (orto-nitrofenil--D-galactopiransido): es un sustrato de la galactosidasa que, al ser hidrolizado, produce un compuesto (ortonitrofenol) que presenta un intenso color amarillo. El ONPG es muy utilizado en los ensayos in vitro de -galactosidasa, en los que se puede obtener la concentracin de galactosidasa en funcin de la intensidad del color amarillo, medida por absorbancia a una longitud de onda de 420 nm. X-gal (5-bromo-4-cloro-3-indolil--D-galactsido): es otro sustrato de la galactosidasa que, al ser hidrolizado, produce un compuesto (indoxil) que en contacto con el aire se transforma en ndigo insoluble, el cual presenta un intenso color azul. Es utilizado como indicador de expresin de la galactosidasa en colonias bacterianas creciendo en placa. Aquellas colonias que estn expresando la enzima se tornarn de un color azul ms o menos intenso en funcin de la cantidad de enzima que estn expresando.

Catabolismo

Catabolismo de lpidos
triglicridos fuente habitual de energa hidrolizados a glicerol y cidos grasos por lipasas el glicerol se degrada va glicoltica los cidos grasos se oxidan a travs de la ruta de la -oxidacion

Ruta de la -oxidacin

Se incorpora al ciclo de Krebs o se emplea para la biosntesis

A la cadena de transporte electrnico

Catabolismo

Catabolismo de protenas y aminocidos

proteasa hidroliza protena a aminocidos desaminacin remueve los grupos amino de los aminocidos los cidos orgnicos resultantes se convierten en piruvato, acetil-CoA o algn intermediario del ciclo de Krebs pueden ser oxidados va ciclo de Krebs pueden ser empleados para la biosntesis
La desaminacin sucede frecuentemente va transaminacin transferencia del grupo amino de un aminocido al -cetoglutarato

Fotosntesis

Fotosntesis

Conversin de la energa luminosa en energa qumica reacciones que requieren luz

la energa de la luz es convertida en energa qumica

reacciones que se observan tambin en la oscuridad

la energa qumica es empleada para reducir CO2 y sintetizar componentes celulares

Gram positive Heliobacterium Acidobacteria (Type I) Non chlorophyll based photosynthesis Fotosntesis oxignica eucariotas y cianobacterias (Archaeal Halophiles)
Fotosntesis anoxignica todas las dems bacterias

Glaucocystophyta

Fotosntesis

Tipos de fotosntesis en los seres vivos

Fotosntesis en la que se emplea compuestos cloroflicos Fotosntesis oxignica: Desprenden oxgeno. Presente en los organismos eucariotas fotosintticos y las cianobacterias. Contiene fotosistema I (P700, Chla) y fotosistema II (P680, Chla). Fotosntesis anoxignica: No desprenden oxgeno Centro de reaccin de tipo I (homlogo al fotosistema I): (P840; BChl-a ): Heliobacterias, Acidobacterias y bacterias verdes del azufre Chlorobium tepidum Centros de reacin de tipo II (homlogo al fotosistema II): (P870; BChl-a) bacterias verdes filamentosas no del azufre como Chloroflexus aurantiacus y bacterias prpuras como Rhodopseudomonas viridis

Fotosntesis en la que no se emplean compuestos cloroflicos (Halobacterium) proteorhodopsin-based phototrophy is a globally significant oceanic microbial process (Beja et al Nature 2001, PR genes are distributed among a variety of divergent marine bacterial taxa, including both - and -proteobacteria. (de la Torre et al PNAS 2003)

Fotosntesis

Reacciones luminosas en eucariotas y cianobacterias

clorofilas pigmentos principales pigmentos accesorios transfieren la energa luminosa a la clorofila

Las diferentes clorofilas tienen diferentes mximos de absorcin

Fotosntesis

Los pigmentos accesorios absorben a diferentes longitudes de onda que la clorofila ampliando el intervalo de longitudes de onda que son capaces de captar los organismos

Fotosntesis

Organizacin de los pigmentos

Antenas redes altamente organizadas de clorofilas y pigmentos accesorios la luz absorbida es rpidamente transmitida a un par especial de clorofilas situadas en el centro de reaccin fotosinttico estas clorofilas estn directamente implicadas en el transporte electrnico fotosinttico Fotosistemas antenas y sus clorofilas del centro de reaccin Estructura cristalina del centro de reaccin del fotosistema I de la cianobacteria Thermosynechococcus elongatus

Vista superior de un trmero de fofosistema I

Pigmentos del fofosistema I

Fotosntesis

Cianobacterias (Oxyphotobacteria)
transporte electrnico fotosinttico en las cianobacterias

Fotosntesis

Fotosntesis oxignica
Flujo de electrones PMF ATP

Transporte electrnico cclico genera ATP Transporte electrnico nocclico genera ATP+NADPH

Fotosntesis

Reacciones luminosas en bacterias verdes y prpuras

El par especial de clorofilas que forma el centro de reaccin absorbe a mayores longitudes de onda en bacterias prpuras y verdes por ello la energa que capta es menor (la energa de una onda electromagntica es inversamente proporcional a su longitud de onda) .

PNAS, Volume 98 Number 5, 27 February 2001

Fotosntesis

Se encuentra en las heliobacterias y las bacterias verdes del azufre. Contiene tres grupos sulfoferro y no tiene pigmentos accesorios distintos a los situados en las protenas que forman el centro de reaccin. Heliobacteria (la nica bacteria Gram positiva descrita hasta el momento que lleva a cabo la fotosntesis) contiene un solo tipo de centro de reaccin fotosinttico que est relacionado (es homlogo) con el fotosistema I de los organismos que llevan a cabo fotosntesis oxignica. Al contrario que este fotosistema I, el fotosistema de Heliobacteria tienen dos subunidades idnticas (el centro de reaccin es homodimrico).

Centro de reaccin de tipo I

Bacterias verdes del azufre: (Chlorobium tepidum): Bacterias Gram negativas anaerbicas que llevan a cabo un metabolismo fotoauttrofo anoxignico. Son de color verde y oxidan compuestos como el H2S y los emplean como fuente de electrones. Como resultado forman depsitos de azufre elemental, de ah su nombre

Fotosntesis

Centro de reaccin de tipo II

Se encuentra en las bacterias prpuras y las bacterias verdes no del azufre. Contiene dos quinonas (QA y QB) en el centro de reaccin. Las clorofiloprotenas que absorben la mayor parte de la luz no forman parte de los pptidos en los que se encuentra el centro de reaccin.

fuente de electrones para la generacin de NADH mediante flujo de electrones inverso

Estructura cristalina del centro de reaccin fotosinttico de la bacteria purpura Rhodopseudomonas viridis

Fotosntesis

Fotosntesis no cloroflica

La bacteriorodpsina es una bomba de protones impulsada con la energa de la luz. Contiene 7 hlices transmebranales con un cofactor de retinal. Se encuentra en numerosos procariotas entre los que se encuentra la arqueobacteria Halobacterium salinarium en la que bombea protones que son empleados para sintetizar ATP.

Fotosntesis

Regulacin de la fotosntesis, transiciones de estado

Los fotosistemas cooperan en la captacin de luz para mantener un balance adecuado en la sntesis de ATP y poder reductor. Cuando el fotosistema II esta ms excitado que el fotosistema I y no de puede mantener un flujo constante de electrones desde el H2O a la ferredoxina o se requiere ms ATP que poder reductor, los pigmentos antena del fotosistema II se desplazan hasta el fotosistema I para aumentar la luz que capta y, por consiguiente, el flujo electrnico a travs de este. Esto se denomina transicin al estado II. Cuando se excita preferentemente el fotosistema I el sistema antena se desplaza al

Flujo inverso de electrones

Flujo de electrones inverso

E0 , ms positivo E0, ms negativo

El ATP o la fuerza protomotriz se emplea para impulsar el flujo de electrones inverso Es particularmente importante cuando la diferencia de potencial entre el donador de electrones y el aceptor final no es suficiente para sintetizar ATP Por ejemplo cuando el donador es el Fe2+ y el aceptor es el O2

Anabolismo

Anabolismo

Sntesis de molculas complejas y estructuras celulares recambio degradacin continua y resntesis de compuestos celulares la velocidad de biosntesis est aproximadamente equilibrada con la velocidad de catabolismo requiere energa

Anabolismo

las rutas catablicas y anablicas no son idnticas a pesar de compartir numerosos enzimas permite una regulacin independiente en eucariotas, las reacciones anablicas y catablicas se localizan en compartimentos diferentes permite a estas rutas operar simultneamente pero de forma independiente

Anabolismo

Ciclo de Calvin

en eucariotas tiene lugar en el estroma de los cloroplastos en las cianobacterias, en algunas bacterias nitrificantes y tiobacillos puede tener lugar en los carboxisomas cuerpos de inclusin que contienen ribulosa -1,5-bifosfato carboxilasa (rubisco) tiene 3 fases Fase de carboxilacin: la rubisco cataliza la adicin de CO2 a la ribulosa-1,5-bifosfato (RuBP), dando lugar a 2 molculas de 3fosfoglicerato La fase de reduccin: el 3-fosfoglicerato es reducido a gliceraldehido 3 fosfato

La fase de regeneracin: se forman carbohidratos (como glucosa y fructosa) y se regenera RuBP

6CO2 + 18ATP + 12NADPH + 12H+ + 12H2O glucose + 18ADP + 18Pi + 12NADP+

Anabolismo

Regulacin del ciclo de Calvin (Thioredoxin )

Cuando hay energa (luz) hay ferredoxina reducida Cuando hay ferredoxina reducida hay tiorredoxina reducida La tiorredoxina reducida activa las enzimas implicadas en la fijacin de CO2

Anabolismo

Gluconeognesis se emplea para sintetizar glucosa o fructosa a partir de precursores no carbohidratos la mayora de los azucares se sintetizan a partir de ellos ej. azucares unidos a nuclesidos difosfato que son importantes para la sntesis de otros azucares, polisacridos y la pared celular bacteriana es funcionalmente inversa a la glicolisis 7 enzimas son compartidos 4 enzimas son especficos de la gluconeognesis

Sntesis de azucares y polisacridos

Anabolismo

Sntesis de polisacridos tambin implica a azucares unidos a nuclesidos difosfato ej. la sntesis de glucgeno y almidn UTP + glucosa 1-P UDP-glucosa + PPi (glucosa)n + UDP-glucosa (glucose)n+1 + UDP

Anabolismo

Asimilacin de fsforo
Fosfato inorgnico (Pi) se incorpora en ATP mediante: fotofosforilacin fosforilacin oxidativa fosforilacin a nivel de sustrato esteres de fosfato orgnico hidrolizado por fosfatasas, desprenden Pi

Anabolismo

Asimilacin de azufre

Reduccin asimilatoria de sulfato

APS

azufre orgnico obtenido en forma de metionina y cistena suministrado por fuentes externas o reservas internas sulfato inorgnico reduccin asimilatoria de sulfato el sulfato se reduce a H2S y despus de emplea para la sntesis de cistena Sulfato activado

diferente de la reduccin disimilatoria de sulfato, en la que tambin se forma APS y el sulfito acta como donador de electrones Formacin de cisteina se emplean dos procesos
1) H2S + serina cisteina + H2O 2) serina + acetil-CoA O-acetilserina + Co-A O-acetilserina + H2S acetato + cisteina

Oxidacin de molculas inorgnicas

Recuerdo: reduccin disimilatoria de azufre

El ATP puede ser sintetizado tanto por fosforilacin oxidativa a travs de la oxidacin directa de sulfato a sulfito como por fosforilacin a nivel de sustrato a travs de la formacin de APS (adenosina 5-fosfosulfato

No confundir con la reduccin asimilatoria de sulfato en la que tambin se forma APS

Anabolismo

Asimilacin de nitrgeno
Las dos fuentes de nitrgeno ms comnmente empleadas son amonio y nitrato El nitrato se incorpora a travs de la reduccin asimilatoria de nitrato La reaccin secuencial de nitrato a amonio se lleva a cabo con la participacin de las enzimas
Nitrato reductasa Nitrito reductasa

La fuente de poder reductor tambin puede ser ferredoxina reducida en lugar de NADPH

Anabolismo

La incorporacin de amonio se realiza a travs de dos mecanismos principales -ruta reductiva de aminacin/transaminacin (sistema Glutamato deshidrogenasa, GDH)

-sistema glutamina sintetasa/glutamato sintasa (GOGAT)

Anabolismo

Fijacin de Nitrgeno

reduccin de nitrgeno atmosfrico (N2) a amonio catalizado por la enzima nitrogenasa se encuentra nicamente en unas pocas especies de bacterias requiere gran cantidad de energa y debe realizarse en ausencia de O2 El O2 inhibe la nitrogenasa por ello solo puede realizarse en ambientes o formas celulares muy concretos (heterocistos, ndulos de leguminosas) Algunas bacterias aumentan la respiracin de O2 de tal forma que la concentracin intracelular no inhibe la nitrogenasa

Anabolismo

La sntesis de aminocidos
numerosos intermediarios de la glicolisis, pentosas fosfato, y ciclo de los cidos tricarboxlicos se emplean como sustratos para la sntesis de esqueletos carbonados a estos se les incorpora el amonio, frecuentemente mediante transaminacin

Sntesis de purinas, pirimidinas y nucletidos

purinas (adenina y guanina) bases nitrogenadas cclicas que se componen de dos anillos pirimidinas (uracilo, citosina y timina) bases nitrogenadas cclicas que se componen de un solo anillo nuclesido = base nitrogenadapentosa nucletido = nucleosido-fosfato Se sintetizan mediante rutas complejas en la que diferentes molculas dan lugar al esqueleto carbonado final

Anabolismo

Sntesis de lpidos
cidos grasos primero se sintetizan y despus se aade a otras molculas para formar otros lpidos como triaclgliceroles y fosfolpidos

Sntesis de cidos grasos

catalizado por la cido grasos sintetasa implica la actividad de protenas transportadoras de grupos acil, acyl carrier protein (ACP)

Anabolismo

Sntesis de peptidoglicano proceso complejo con mltiplas etapas primero se forman las unidades repetidas de peptidoglicano en el citoplasma implica el empleo de uridina difosfato y bactoprenol como transportador las unidades repetidas son posteriormente transportadas a travs de la membrana por el bactoprenol las unidades repetidas se unen a las cadenas crecientes de peptidoglicano los entrecruzamientos se forman por transpeptidacin

La bacitracina inhibe el paso del bactoprenol

La penicilina inhibe el entrecruzamiento del pentapeptdo y provoca que las autolisinas degraden la pared celular

La vancomicina inhibe el entrecruzamiento peptdico