Cintica Qumica y Biolgica

Catlisis Enzimtica

Prof. Jorge A. Aguilar Pineda

Taller de Excel

Prof. Jorge Aguilar

UNIDAD III III. Catlisis Enzimtica

3.1

Actividad cataltica de las enzimas.

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Actividad cataltica de las enzimas

En los diversos compartimientos celulares transcurre un gran nmero de reacciones qumicas que proporcionan a la clula la energa y componentes necesarios para su mantenimiento. La velocidad en las que stas reacciones deben ocurrir supera en mucho a la velocidad en las que las mismas reacciones ocurren en un laboratorio a las mismas condiciones de los organismos vivos. Entonces, cmo es que las clulas pueden sobrevivir bajo stas condiciones?
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Actividad cataltica de las enzimas

La naturaleza es sabia: para ello fabric sus propios catalizadores, las enzimas, molculas que son capaces de acelerar las reacciones en rdenes de 106 a 1014 veces ms rpido.

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Estructura de las enzimas.

En la mayora de los casos, las enzimas son protenas de estructura terciaria o cuaternaria, aunque se ha observado que otras molculas, como las ribozimas (molculas de RNA), presentan tambin actividad cataltica.

Estructura cristalina de la ribozima L1

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Caractersticas generales de las enzimas

- No sufren modificacin al final de la reaccin. - No cambian la constante de equilibrio de una reaccin qumica. - Son muy especficas. - Aceleran varios rdenes de magnitud la velocidad de la reaccin respecto a la reaccin no catalizada. - Actan en condiciones moderadas de presin y temperatura.
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Catalizan reacciones qumicas necesarias para la sobrevivencia celular Sin las enzimas los procesos biolgicos seran tan lentos que las clulas no podran existir. Las enzimas pueden actuar dentro de la clula , fuera de sta, y en el tubo de ensayo.

E + S ESEP E + P
E E E E

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Sin enzima Con enzima

E+S

La Ea de la hidrlisis de la urea baja de 30 a 11 kcal/mol con la accin de las enzimas, acelerando la reaccin 1014 veces El aumento de temperatura necesario para producir la reaccin no catalizada seria de 529C

E+P
Tiempo de la reaccin

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Modelo comparativo de la disminucin de la energa de activacin por la accin de la enzima.
Enzima

Substrato

1) La reaccindisminuye 2) La enzima no se produce pues hace de o elimina la energa falta una energa de y activacin necesaria activacin para que la reaccin transcurre transcurra espontneamente. espontneamente.

Producto

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Al igual que los catalizadores, el perfil energtico de la reaccin es modificado por la accin de la enzima sobre el sustrato.

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Tanto la enzima como el catalizador aceleran la velocidad de una reaccin qumica. Una enzima puede transformar molculas de sustrato/ segundo 1000

Las enzimas tienen 3 propiedades que los catalizadores NO tienen

Especificidad por el sustrato. Se inactivan por desnaturalizacin. Pueden ser reguladas.

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Nomenclatura y Clasificacin.

Histricamente (antes de adoptarse una nomenclatura sistemtica) a las enzimas les asignaron nombres especficos (pepsina, tripsina, etc.). Posteriormente se adopt el criterio de darles un nombre incluyendo la terminacin asa (catalasa, ureasa, ribonucleasa, etc.). En la actualidad, se ha elaborado una nomenclatura sistemtica relacionada con el sistema de clasificacin adoptado para su estudio.
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Actualmente se clasifican en seis grandes grupos:

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Las enzimas se unen a los reactivos (sustratos) reduciendo la energa de activacin Cada enzima tiene una forma nica con un sitio o centro activo en el que se une al sustrato Despus de la reaccin, enzimas y productos se separan. Las molculas enzimticas no han cambiado despus de participar en la reaccin

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Las enzimas cumplen su papel cataltico gracias a: Fijacin estereoqumicamente complementaria del substrato Transformacin cataltica del mismo En ambas funciones participan: Cadenas laterales de los aminocidos Grupos o molculas no proteicas: Grupos prostticos Iones metlicos Cofactores

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Los siguientes hechos: Especificidad de la reaccin enzimtica Carcter heterogneo de la catlisis enzimtica

Han llevado a postular la existencia de un Centro Activo en la molcula de enzima, capaz de: Fijar especficamente al substrato Transformarlo catalticamente.

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3.1.1 Sitio Activo.

Conocido tambin como centro activo, es la zona tridimensional de la enzima en la cul se une el sustrato para que la reaccin se produzca.

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Enzima

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Sustrato
Sitio activo

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El sitio activo propiedades: cumple las siguientes

- Supone un porcin relativamente pequea del volumen total de la enzima.

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- Es una entidad tridimensional.

- Se unen a los sustratos relativamente dbiles.

por

fuerzas

- Son hoyos o hendiduras de las que suele quedar excluida el agua, salvo que sea un componente de la reaccin

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Complementariedad geomtrica Complementariedad de cargas,

uniones inicas

Modelos: Encaje inducido Llave cerradura. Estado de transicin

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3.1.2 Diferentes mecanismos relacin enzima-sustrato.

de

la

Para explicar la actividad cataltica de las enzimas se ha propuesto un mecanismo general, en dos etapas:

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1. El sustrato se une a una regin concreta de la enzima (centro activo). - Un sitio de unin formado por los aminocidos que estn en contacto directo con el sustrato. - Un sitio cataltico formado por los aminocidos directamente implicados en el mecanismo de la reaccin . 2. Una vez formados los productos la enzima puede comenzar un nuevo ciclo de reaccin.

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SITIO ACTIVO
Concepto: Sitio de unin.
Sitio cataltico.

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Modelos de mecanismos en reacciones enzimticas

Modelo de Llave y Cerradura (Emil Fischer)
Sustrato y enzima se acoplan de forma estereospecfica, de la misma manera que una llave se ajusta a su cerradura. Modelo aceptado durante mucho tiempo; hoy se considera insuficiente al no explicar algunos fenmenos de la inhibicin enzimtica.

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1. El modelo llave cerradura.

Actividad cataltica de las enzimas Ajuste Inducido (Modelo de Koshland).

Es el modelo ms aceptado actualmente. Sugiere que el centro activo debe tener una disposicin espacial, precisa y especfica de ciertos grupos de la enzima que al interaccionar con el sustrato se adaptan y ajustan segn la estructura de dicho sustrato.

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Actividad cataltica de las enzimas 2.- El modelo del ajuste inducido.

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Una enzima puede unir dos sustratos en su sitio activo

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