BIOINFORMÁTICA

Biologia Marinha e Biotecnologia/ESTM

3ºAno

15 TP + 30 P + 6 OT

Patrícia Abrantes
patricia.abrantes@estm.ipleiria.pt
Gabinete 18
Segunda-feira: 11h00-12h00
Quinta-feira: 11h00 – 13h00
 Programa da Unidade Curricular
1. Bases de dados biológicos: bases de sequências de ácidos
nucleícos e proteínas. Ferramentas e bases de dados da EBI e
NCBI, entre outras.

2. Ferramentas de análise de sequências e prospecção de dados.

3. Alinhamento de sequências, sequências homólogas, programas

BLAST e FASTA.

4. Identificação de motivos.

5. Predição de genes e anotação genómica.

6. Análise estatística de sequências proteícas.

 Avaliação
• Teórico-prática – 60% da nota final

teste final – nota mínima superior a 9,5 valores

CONTÍNUA

• Prática – 40% da nota final

Participação e assiduidade às aulas – 40%
Nota mínima
Elaboração de relatórios/exercícios - 40% superior a 9,5
valores
Discussão de artigos científicos – 20%

Nota Final = 60%(Nota do Teste) + 40%(componente prática)

 Avaliação
• Teórico-prática – 60% da nota final (nota mínima superior a 9,5 valores)
EXAME

• Prática – 40% da nota final

Avaliação escrita e oral (nota mínima superior a 9,5 valores)

Nota Final = 60% Exame + 40% Avaliação escrita e oral

 Bibliografia
• Lesk, A. (2005). Introduction to Bioinformatics, Oxford, Oxford
University Press.

• Baxevanis, A. & Ouellette, B. (2004). Bioinformatics: A Practical

Guide to the Analysis of Genes and Proteins, 3rd edition, Wiley-
Interscience.

• Jones, N. & Pevzner, P. (2004). An Introduction to Bioinformatics

Algorithms, Cambridge, The MIT Press.

• Mount, D. (2004). Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis,

2nd edition, New York, Cold Spring Harbor Laboratory Press.

• Pevsner, J. (2003). Bioinformatics and Functional Genomics, John

Wiley & Sons.
 Calendarização das aulas
FEVEREIRO
I 17– 20 TP N.1
II 23 – 27 CARNAVAL CARNAVAL
MARÇO
III 2–6 TP N.2 Aula Prática N.1
IV 9 – 13 TP N.3 Aula Prática N.2
V 16 – 20 TP N.4 Aula Prática N.3
VI 23 – 27 TP N.5 Aula Prática N.4
ABRIL
VII 30 – 3 TP N.6 Aula Prática N.5
VIII 6–8 TP N.7 Aula Prática N.6
IX 13 – 17 FÉRIAS FÉRIAS
X 20 – 24 TP N.8 Aula Prática N.7
XI 27 – 1 TP N.9 Aula Prática N.8
MAIO
XII 4–8 TP N.10 Aula Prática N.9
XIII 11 – 15 SEMINÁRIO SEMINÁRIO
XIV 18 – 22 TP N.11 Aula Prática N.10
XV 25 – 29 TP N.12 Aula Prática N.11
JUNHO
XVI 1– 5 TESTE TESTE
XVII 8 – 12 FÉRIAS FÉRIAS
XVIII 15 – 19 TP N.13 Aula Prática N.12
Avaliação UC