INTRODUCCIÓN A LA BIOQUÍMICA

Bioquímica (química de la vida) es la ciencia que estudia las sustancias que componen
a los seres vivos y las reacciones que sufren estas sustancias para dar lugar a los
procesos fisiológicos tales como crecer, alimentarse, reproducirse, almacenar y utilizar
energía.

El oxígeno, carbono, hidrógeno y nitrógeno constituyen alrededor del 99% de la masa

de la mayoría de las células. Estos elementos forman con facilidad enlaces covalentes
mediante reparto de pares de electrones y pueden reaccionar unos con otros para
formar un gran número de compuestos covalentes diferentes.

El carbono, nitrógeno y oxígeno son elementos ligeros, pero capaces de formar

enlaces covalentes muy fuertes. Entre ellos forman esqueletos de estructuras simples
como un pequeño carbohidrato o complejas como una molécula genética. Así mismo
pueden unirse a otros átomos como el azufre o diversos grupos funcionales
adquiriendo funciones diversas.

Las biomoléculas están formadas principalmente de enlaces carbono-carbono gracias

a la configuración tetraédrica de los pares electrónicos compartidos alrededor de cada
átomo de carbono.

-Bioquímica estructural: estudia la composición química, estructura, conformación y

configuración de las materias que componen los seres vivos.
-Bioquímica metabólica o dinámica: estudia funciones, transformaciones,
reacciones de la molécula que forman partes de la materia viva y los mecanismos que
la regulan.
-Bioquímica molecular (genética molecular): se ocupa de estructura y dinámica en
moléculas encargadas de transmitir la información genética. Ácidos nucleicos.

1.1. Jerarquía de la organización molecular de las células

- Precursores: Son elementos y compuestos químicos simples como el dióxido

de carbono, agua y nitrógeno atmosférico. Poseen bajo peso molecular y se
convierten gracias a intermediarios metabólicos en biomoléculas sillares o
estructurales.

- Biomoléculas sillares estructurales: Denominadas también monómeros. Tienen

un peso molecular intermedio. A este grupo pertenecen los monosacáridos,
aminoácidos, mononucleótidos y ácidos grasos. Son los componentes de las
macromoléculas.

- Macromoléculas: o polímeros. Tienen un peso molecular alto, por ejemplo las

proteínas, los ácidos nucleicos.

- Supramacromoléculas: Resultan de la asociación de diferentes clases de

macromoléculas, por ejemplo las lipoproteínas, los ribosomas, que resultan de
la acción de fuerzas no covalentes (débiles) como los enlaces de hidrógeno,
las interacciones hidrofóbicas y las interacciones de Van der Waals.

- Orgánulos: Núcleos, mitocondrias, cloroplastos, e inclusiones

intracitoplasmáticas (lisosomas, vacuolas).
1.2. Biomoléculas primordiales

Las macromoléculas están constituidas por un grupo pequeño de moléculas sillares,

que reciben el nombre de biomoléculas primordiales, elementos con los cuales, el
organismo animal, sintetiza sus estructuras propias. Estas biomoléculas son: 20
aminoácidos, 5 bases nitrogenadas, 1 o más ácidos grasos, 2 azúcares, el alcohol
glicerina y la amina colina.

Hasta la fecha se han identificado una gran cantidad de compuestos sillares que,
probablemente, derivan de las biomoléculas primordiales. Es así que se conocen más
de 150 aminoácidos diferentes, que derivan de los 20 fundamentales; 70 azúcares
sencillos que derivan de la glucosa.

Aunque se han identificado moléculas con un grado de complejidad muy alto, como
hormonas, antibióticos, alcaloides, etc se ha demostrado que también derivan de las
biomoléculas primordiales; es así que los terpenos derivan del ácido acético, que a su
vez es el producto de degradación de la glucosa y de los ácidos grasos. Por otra parte
la mayoría de los alcaloides derivan de los aminoácidos.

1.3. ORIGEN DE LAS BIOMOLÉCULAS

Se cree que los primeros organismos vivientes aparecieron sobre la tierra hace 4000
millones de años (Precámbrico), cuando la atmósfera estaba compuesta por una
mezcla de gases: amoniaco, metano y vapor de agua. Sobre esta atmósfera primitiva,
según Oparín, interactuaron procesos químicos y físicos, principalmente energía solar,
para producir compuestos orgánicos simples, como aminoácidos y azúcares.

Miller sometió una mezcla gaseosa de metano, amoniaco, agua e hidrógeno a chispas
eléctricas a 80ºC. Con este procedimiento obtuvo glicocola, alanina, ácido aspártico,
ácido glutámico, ácido fórmico, propiónico, láctico y succínico.

Posteriormente se sometió a la acción de energía radiante a una mezcla de nitrógeno,

hidrógeno, monóxido de carbono y dióxido de carbono obteniéndose aminoácidos y
otras moléculas orgánicas.

Con el fin de demostrar cómo se sintetizó los fosfolípidos de las membranas celulares
Hargreaves y col usaron glicerol, ácidos grasos o aldehidos y fosfatos, los cuales por
acción de una solución salina, temperatura y sonicación formaron vesículas.

Goldacre propone que los lípidos formaron, junto con las proteínas, láminas sobre las
superficies de las aguas que, por acción del viento, fueron capaces de cerrarse sobre
sí (liposomas) y al hacerlo atraparon componentes del ambiente que más tarde
iniciaron la diferenciación del interior protocelular.

Tanto Oparín, con sus membranas de proteínas y carbohidratos, como Fox, con sus
microesferas, lograron estructuras protocelulares que muestran envolturas con
capacidades de permeabilidad selectiva que les confieren características de
“crecimiento” y “división” o “gemación” (protometabolismo)

De acuerdo a DeDuve las bicapas lipídicas y los polipéptidos hidrofóbicos participaron

en la construcción de las primeras envolturas celulares, conformando membranas
rudimentarias totalmente porosas impermeables solamente a polinucleótidos y
polipéptidos.
En cuanto a las moléculas de la herencia se puede suponer que dado que la
estructura del RNA ribosomal parece ser la misma en todos los organismos, su
antigüedad podría ser de ese mismo orden.

Como una respuesta al riesgo de hinchamiento y lisis, probablemente, se originaron

las proteinas de membrana, entre las que se encuentran los transportadores que
facilitan el movimiento de solutos hidrosolubles a través de la bicapa lipídica.

Las biomoléculas sillares estructurales que forman parte de las estructuras biológicas
fueron seleccionadas entre un grupo de compuestos orgánicos muy grande, por su
idoneidad para conferir a las células una capacidad de supervivencia.
AGUA Y PH

EL AGUA

Los organismos vivos del tipo de los que se encuentran en la Tierra son
absolutamente dependientes para su existencia del agua. La importancia del agua
para las células vivas refleja tanto sus propiedades químicas como las físicas. Así,
debido a su elevado punto de ebullición, el agua permanece en estado líquido sobre la
mayor parte de la superficie terrestre durante la mayoría de las estaciones. Por otra
parte, debido a que el hielo es menos denso que el agua líquida (a 0º C), el hielo flota
sobre el agua líquida y el agua se congela direccionalmente desde la superficie hacia
el fondo. Por consiguiente, el hielo es un aislante excelente; durante el invierno, una
capa de hielo en la superficie de un estanque sirve de manta protectora frente al frio
extremo para los seres acuáticos.

MOLÉCULA SIMÉTRICA
El agua es una molécula simétrica, cuyo ángulo de enlace H – O – H es 104.5º.
Espacialmente, si el átomo de oxígeno se ubicase en el centro de un tetraedro, los
dos pares de electrones sin compartir y los dos átomos de hidrógeno apuntarían a los
vértices. Una molécula de agua puede formar un máximo de cuatro en laces de
hidrógeno, en dos de los cuales los átomos de hidrógeno actúan de dadores, y en los
otros dos, cada par de electrones sin compartir del átomo de oxigeno actúa de aceptor
de hidrógeno.

ENLACES DE HIDRÓGENO
Son los responsables de las propiedades del agua líquida, incluido su elevado calor
latente de vaporización y su polarización. El agua líquida está constituida,
estructuralmente, por un conjunto de agrupamientos oscilantes de moléculas de agua,
en continua ruptura y formación, en los cuales cada molécula esta unida mediante
enlaces de hidrógeno a un máximo de otras cuatro moléculas de agua.

Los compuestos iónicos se disuelven en agua, modificando la estructura de ésta. Los

iones desestructurantes producen la ordenación de una capa de moléculas de agua en
su inmediata vecindad, pero aumentan la desorganización de las moléculas del resto
del disolvente. Los hidrocarburos y otras moléculas apolares son insolubles en agua.
El agua forma estructuras tipo jaula alrededor de las sustancias apolares, y esta
exclusión de moléculas apolares causada por el agua se conoce como efecto
hidrofóbico, que provoca un ordenamiento de las moléculas de agua energéticamente
desfavorable.

El agua representa entre el 60 al 90% del peso total de los seres vivos. El contenido
de agua de un organismo está en relación con la edad y con la actividad metabólica
que desempeña. Es mayor en el embrión (90 a 95%) y disminuye progresivamente en
el adulto. También varía en los diferentes tejidos en relación con el metabolismo.
El agua celular es el componente que se encuentra en mayor cantidad, sirve como
solvente natural para los iones minerales y otras substancias y también como medio
de dispersión para la estructura coloidal del citoplasma. El agua es indispensable para
la actividad metabólica, ya que los procesos fisiológicos se producen exclusivamente
en un medio acuoso.
El agua corporal total (ACT) constituye el agua existente en el organismo distribuido en
diferentes compartimientos; en los varones oscila entre 55 a 65% del peso corporal.
En las mujeres el ACT es 10% menos. Pero esta proporción varía en función a la
edad y proporción de tejido magro.
El ACT se halla distribuida en dos grandes compartimientos: Agua del líquido
intracelular (LIC) que representa las dos terceras partes y el agua del líquido
extracelular (LEC) que representa la otra tercera parte del ACT.
El LIC es el agua que se encuentra en las células limitada por la membrana celular y
sirve para que la célula: 1) genere, almacene y utilice energía, 2) se regenere, 3) se
replique y 4) efectúe funciones especiales.
El LEC se distribuye entre el plasma y los compartimientos intersticiales: líquido
intersticial, plasma sanguíneo, líquido cefaloraquideo, líquido de las glándulas, líquido
articular, pericárdico, pleural, peritoneal y el transcelular, que no participa en la
dinámica de líquidos ni en el intercambio.
El agua en la célula se presenta en dos formas: agua libre (95%) y agua ligada (5%).
COMPOSICIÓN DE LOS LÍQUIDOS CORPORALES: 60%
LEC 20%(PLASMA Y INTERSTICIAL) LIC 40%
 + +
Na .............................. Na ...........................
.......142mEq/l ................10mEq/l
+ +
K ................................ K .............................
...........4mEq/l ..............140mEq/l
+ +
Ca .............................. Ca ...........................
.........2.4mEq/l ..........0.0001mEq/l
- -
Cl Cl
.................................... .................................
....103mEq/l ..............4mEq/l
- -
HCO3 HCO3
.................................... .................................
28mEq/l .......10mEq/l
Fosfatos...................... Fosfatos...................
............4mEq/l ..................75mEq/l
Glucosa....................... Glucosa...................
.........90 mg/dl ............0 a 20 mg/dl
Aminoácidos............... Aminoácidos............
..........30 mg/dl ................200 mg/dl

Estructuralmente está formada por dos átomos de Hidrógeno y uno de Oxígeno. La

forma de representarla es H2O, pero en solución se la encuentra en forma disociada
H+ y OH-.
El término “pH” (potencial de hidrogeniones) sirve para expresar la concentración de
H+ (hidrogeniones); el pOH sirve para expresar la concentración de OH- (Oxhidrilos).
2.1. Importancia biomédica
Un principio biológico fundamental indica que la constancia del “medio interno” debe
preservase dentro de límites relativamente estrechos si se quiere conservar la salud.
Esto se aplica a la distribución global del agua corporal total (ACT), pH y la
concentración de varios electrolitos: Na, K, Ca, Mg y PO4. Por esta causa es
importante conocer: la estructura de la molécula de agua, peso molecular, distribución
electrónica, composición, distribución en el organismo, mecanismos inherentes al
movimiento a través de membranas celulares y condiciones de regulación y reposición
en estados de pérdida de agua (deshidratación)
Las propiedades físicas del agua se utilizan como un punto de referencia para otros
elementos, por ejemplo congela a 0ºC.
2.2. Propiedades físicas del agua
1. Estado físico: sólida, líquida y gaseosa
2. Color: incolora
3. Sabor: insípida
4. Olor: inodoro
5. Densidad: 1 g/ml a 4ºC
6. Punto de congelación: 0ºC
7. Punto de ebullición: 100ºC (a nivel del mar)

2.3. Ácidos y Bases

Estos términos han sufrido varias modificaciones a través del tiempo. Para
Arrhenius, un ácido es una sustancia que dona protones y una base, la que dona
hidroxilos. De acuerdo a Bronsted y Lowry, ácido es cualquier sustancia que dona
protones a otra sustancia y base, cualquier sustancia que acepta protones.
Finalmente, de acuerdo a Lewis, ácido es un compuesto o elemento químico que
tiene afinidad por los electrones aportados por la base; y la base es una sustancia
que tiene pares electrónicos no compartidos.

Acido y base fuertes, son aquellas sustancias capaces de ionizarse casi en su

totalidad (ejemplo ácido clorhídrico) o, por lo menos en una gran proporción, como
el ácido sulfúrico. Ácido y bases débiles, son los que se ionizan en una muy
pequeña proporción.

2.4. pH

El pH es una expresión del grado de acidez o alcalinidad de una solución.

Matemáticamente es igual al logaritmo de la concentración de iones hidrógeno con
signo negativo, o al logaritmo de la inversa de la concentración del ión hidrógeno.
El rango de pH normalmente varía de 0 a 14.
BIOMOLÉCULAS Y CÉLULAS

CÉLULAS

La unidad fundamental de la vida es la célula. La moderna teoría celular puede

reducirse a cuatro principios fundamentales:
1. Las células forman toda materia viva
2. Todas las células provienen de otras células
3. La información genética que se necesita durante la vida de las células y la que
se necesita para la producción de nuevas células se transmite de una
generación a la siguiente.
4. Las reacciones químicas de un organismo, esto es, su metabolismo, tienen
lugar en las células

El comprender las dimensiones de las biomoléculas y de las células es importante

para el estudio de la Bioquímica.

UNIDADES DE LONGITUD EMPLEADAS EN BIOQUÍMICA

Unidades del SI (Sistema Internacional)

Milímetro mm 10-3 m
Micrómetro µm 10-6 m
Nanómetro nm 10-9 m

Antiguas unidades
Micra µ micrómetro (SI)
Milimicra mµ nanómetro (SI)
Angstrom Á 10-1 nanómetros (SI)

Estas unidades de longitud nos dan una idea de los tamaños relativos de las células y
de sus constituyentes:
Aminoácido: 0.8 nm
Hemoglobina: 6.4 nm
Ribosoma: 25 nm
Mitocondria: 500 nm de ancho por 1500 nm de largo
Cloroplasto 2000 nm de ancho por 5500 nm de largo
Escherichia coli 500 nm de ancho por 1500 nm de largo
Molecula de agua 0.4 nm

Una molécula de agua, el disolvente biológico, tiene un diámetro de unos 0.4 nm. Los
aminoácidos (los constituyentes de la proteínas) son mayores que las moléculas de
agua; miden 0.6 a 1.2 nm de longitud. En ADN tiene unos 2 nm de ancho, la
hemoglobina tiene un diámetro de 6.4 nm. Los ribosomas están compuestos por unas
50 proteínas diferentes y por varias moléculas de RNA, el diámetro de un ribosoma es
de unos 25 nm. Una mitocondria mide aproximadamente 1 µm de longitud. Un
cloroplasto es 5 veces mas grande que una mitocondria.

LOS ORGANELOS DE LA CÉLULA.

Nucleo: rodeada por una membrana.Esta rodeada por dos membranas una interna y la otra externa que a su
Pared celular.

 Deja pasar libremente las sustancias que atraviesan las membranas

 Impide que la célula estalle para la acumulación de agua.

Membrana celular plasmática.

 Rodea toda la célula y mantiene su integridad

 es una membrana semipermeable o selectiva esto indica que solo pasan algunas sustancias.
 Regula el paso de sustancias hacia el interior de la célula y viceversa

Citoplasma.

 Se ubica entre la membrana celular y el núcleo.

Mitocondria.

 Forma elíptica se encuentra delimitada por una doble membrana.

 Posee un material genético propio como el ADN.
  Puede adoptar diferentes formas asta siempre rodeados por dos membranas.

Cloroplasto.

 Son organelos que se encuentran solo en células que están formadas a plantas y algas verdes.
 Poseen su propio material genético llamado ADN plasticidad.
 En su interior se encuentra la clorofila que se encuentra la clorofila (pigmento verde y otros pigmen

Ribosomas.

 Formados por proteínas y ARN.

 Son pequeños por pus-culos que se encuentran libres en el citoplasma.
 No están rodeados por membrana.

Aparato de golgi.
  Esta delimitado por una sola membrana y formada por una serie de sacos membranosos aplanados d

Lisosomas.

 Esta directamente asociados a los procesos de digestión intracelular.

 Esta rodeada por una membrana de forma esférica.

Centriolos.

 Están formados por 9 paredes de filamentos periféricos y dos centrales.

 Células animales.

Vacuola.

 Son vacuolas o bolsas membranosas

 Su funcion es almacenar temporalmente alimentos, agua, desechos y otros materiales.
Retículo endoplasmatico liso.

 No tiene ribosomas y se considera relacionado a diferentes procesos de síntesis de productos tales c

Peroxisomas.

 Organelo formado por una sola membrana de forma esférica por lo general
 Se encuentra en célula animales y vegetales.
 Participan en la degradación de ácidos grasosos y aminoácidos.

Microtubulos.

 Encargados del transporte intracelular.

 Se hallan celulosas eucariontas.
 Intervienen en diversos procesos celulares que involucran desplazamientos de vesículas.
El transporte trans-membranal se produce cuando las moléculas atraviesan totalmente la membrana de

la célula. La difusión facilitada (o el transporte facilitado) es un proceso de difusión transmembranal que

se produce en todas las células eucariotas. Es además una forma de transporte pasivo, donde las

moléculas pasan a través de la bicapa de fosfolípidos, con la ayuda de las proteínas de transporte. Estas

proteínas canales pueden abrirse y cerrarse con el voltaje del ion, proveniente de un impulso del sistema

nervioso, que pasa a través del axón.

Este canal permite el paso de moléculas más grandes que en el transporte activo ya que pasan a través

de las proteínas atraídas por el ion que hace que entren en el citoplasma. Estas moléculas grandes

suelen ser glucosa o aminoácidos. Sin embargo, debido a la naturaleza hidrófoba de los lípidos que

componen las membranas de la célula, si no fuera por la proteína de transporte, las moléculas solubles en

agua (glucosa, etc.) y los iones no podrían pasar a través de la membrana, ya que serían demasiado

grandes.

La proteína del transporte implicada es trans-membranal, es decir, atraviesa totalmente la membrana y

está formada por un canal interno hidrofílico que permite el paso de moléculas a través de ella.

En comparación con transporte activo, la difusión facilitada no requiere energía (ATP) y además no va en

contra del gradiente de concentración. La difusión facilitada puede ocurrir en poros y canales bloqueados.

Los poros nunca se cierran, pero los canales bloqueados se abren y se cierran en respuesta a estímulos

nerviosos. Las proteínas del transporte que participan en la difusión facilitada son similares a las enzimas.

Las proteínas del transporte también tienen un límite de solutos que pueden transportar.