A inibição da transcrição de genes e o processamento alternativo são processos
distintos que contribuem para a diferenciação celular ou seja para uma
funcionalidade celular específica. No primeiro caso, poder-se-á dizer que num mesmo indivíduo, os genes que estão ativos e são transcritos, não são necessariamente os mesmos em todas as células: numas células há inibição e expressão de uns genes, enquanto noutras há inibição e expressão de outros genes. O processamento alternativo, por seu lado, refere-se à produção, a partir de um mesmo gene, de diferentes moléculas de mRNA. Ambos os processos levam à produção de conjuntos de proteínas diferentes, em células que desempenharão funções também diferentes.